Nature子刊：新技術攻克單分子測序大問題
來自冷泉港實驗室(CSHL)的一位定量生物學家及同事們開發出了一種混合錯誤校正新方法攻克了單分子測序的重大問題，可將長讀(long reads)的準確度提高到99.9%。這一研究成果發布在7月1日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。 領導這一研究的是冷泉港實驗室助理教授Michael Schatz以及馬里蘭大學國家生物防衛分析和反制中心的Adam Phillippy 和 Sergey Koren。 在這篇文章中，研究小組開發了一個軟件包可校正單分子測序新技術中的一個嚴重的問題：它生成的每五個或六個DNA“堿基”就有一個錯誤。高錯誤率是這一新技術主要優點的另一面：它生成了更長的基因組reads，相比于當前使用的其他技術要長100倍，因此可以提供相比當前第二代技術獲得的更為完整的基因組結構圖譜。 利用數學算法，Schatz及研究團隊保留了第三代技術的巨大優勢，消除了它的......閱讀全文
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子進行測序，而目前市場上的主流測序
第三代基因組測序儀問世－實現單分子速讀
據《自然》雜志網站2月8日報道，在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。 研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(
第三代基因組測序儀問世－實現了單分子速讀
?據《自然》雜志網站2月8日報道，在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。???? 研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核
第三代測序技術：PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
單分子測序輕松升級參考基因組
現代基因組學的最大需求之一，就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前，人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序，取得了許多重要的研究成果。 不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap，就目前的數據來說，各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
單分子測序改善微生物基因組組裝
美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章，介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為，單分子測序數據能降低測序費用，并帶來更多完整的基因組，改善微生物基因組數據庫的質量。 隨著測序費用的不斷下降，測序項目的數量也在不斷上升。G
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
第三代測序領軍人物開發新的單分子工具
最近，來自美國華盛頓大學（UW）和Illumina公司的一組科學家，開發出了一種創新性的工具，可直接檢測DNA和酶蛋白之間微妙的單分子相互作用。他們的方法提供了一個新的平臺，可與實時地觀察和記錄這些納米級的相互作用。相關研究結果發表在九月二十八日的《Nature Biotechnology》，研
英研發第三代基因測序技術－用納米孔單分子讀取
基于納米孔的單分子讀取技術，英國牛津納米孔公司成功研發出第三代基因測序技術。該測序技術讀取數據更快、有望大大降低測序成本，改變個人醫療的前景。 當前，基因測序工作費時且昂貴，測序時，分子必須進行多次復制(這一步被稱為擴增)，同時進行熒光示蹤標記，這一過程會帶來錯誤，因此，一個基因要被測序多
測序牛人發布蛋白單分子測序技術
人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。 現在，美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用
單分子測序：基因測序不再遙不可及
如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話，那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組，進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術，在臨床診療上發揮更大的作用。 在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail
單分子測序：基因測序不再遙不可及
在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail，致力于開發一種不超過1000美元的血液檢測，用于多類型癌癥的早期篩查。這種腫瘤DNA測序的主要目的是在無癥狀的個體中診斷各種各樣的癌癥，從而實現提前預防或治療。 隨著技術的不斷進步，
全新測序技術利弊比較之單分子測序
在去年召開的美國微生物學會上，來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言，這場疫情首先在德國北部地區爆發，感染了至少4000人，奪去了超過50人的生命(德國范圍內)，在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。 Harmsen教授在這場疫情
單分子測序：基因測序不再遙不可及
如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話，那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組，進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術，在臨床診療上發揮更大的作用。在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail，致力于
第三代基因測序儀
基因測序儀（即DNA測序儀），是一臺能自動灌膠、自動進樣、自動數據收集分析等全自動電腦控制的測定基因片段的高檔精密儀器。2009年12月3日，中科院北京基因組所與浪潮成立“中科院北京基因組研究所—浪潮基因組科學聯合實驗室”將研發國產第三代基因測序儀。該基因測序儀幾十分鐘就可完成一個人的完整基因組測序
－Pacbio單分子實時測序技術于藥用植物基因組研究應用
藥源短缺成為限制臨床治療和新藥研發的最大瓶頸，因此，開發新的藥物來源途徑是迫切需要解決的問題。利用現代生物技術和次生代謝工程手段是未來生產藥物最有潛力的發展方向。我國藥用植物有1 萬多種，大多數藥用植物遺傳背景不清楚，基因組信息缺乏，遺傳信息和功能基因的研究亦極為薄弱。例如人參屬（Panax）
基因測序技術大升級
? DNA就像是漆黑的夜里螢火蟲發的光，第二代測序技術無法辨別每一只螢火蟲，所以就把上千只螢火蟲放在同一個袋子里，才能收集到它們的光。但第三代技術卻可以辨別每一只螢火蟲，而且可以同時測量很多個DNA片斷。 日前，南方科技大學生物系副教授賀建奎與另外幾名中美科學家聯合在生物醫學雜志BioRxiv上
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長速度
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
第三代基因測序儀應用
該儀器可廣泛用于基因測定，癌細胞的表達普測定、親子鑒定、個體識別、基因檔案、父系鑒定、母系鑒定、種族鑒定、種屬鑒定、傳染病毒的測定及胎兒遺傳缺陷的分析，比如癌細胞有起固有的表達方式，通過測定可得知人體癌細胞的發生和變化情況。另外，國產第三代基因測序儀的研發將極大地拓寬生命科學、生物化學、生物醫藥等領
第三代基因測序儀誕生
近日，由南方科技大學賀建奎團隊自主研發的第三代基因測序儀在深圳誕生，目前已完成小批量樣機生產，待量產后每個人有望擁有個人專屬的“基因身份證”。 該基因測序儀已通過國際科學界評審，并在深圳市食品藥品監督管理局備案，用于高通量測序并獲取樣本序列信息。賀建奎說，第三代基因測序儀能直接讀取最原始的DN
第三代基因測序儀定義
基因測序儀（即DNA測序儀），是一臺能自動灌膠、自動進樣、自動數據收集分析等全自動電腦控制的測定基因片段的高檔精密儀器。2009年12月3日，中科院北京基因組所與浪潮成立“中科院北京基因組研究所—浪潮基因組科學聯合實驗室”將研發國產第三代基因測序儀。該基因測序儀幾十分鐘就可完成一個人的完整基因組
第三代基因測序儀特點
據介紹，使用該國產第三代基因測序儀，完成一個人的基因組測序的測試時間，將由6周縮短為10—15分鐘；測試成本將由10萬—30萬美元降到5000—8000元人民幣。 此外，國產第三代基因測序儀，與第二代測序儀在原理和效能上有本質區別，通過對單分子的操作而減少繁雜的生物學反應，同時結合對海量數據的
第三代基因測序儀意義
具有國際先進水平的國產第三代基因測序儀的研制，將使中國在該領域建立先發優勢，在未來的國際競爭中占據有利位置。這不僅將填補中國在基因測序基礎裝備領域的空白、提升裝備自主化水平，同時也將使國內生命科學研究機構能獲得低成本、高效率的測序工具，更有效地開發和利用中國豐富的基因資源，加速中國基因戰略的發展
第三代基因測序儀應用
該儀器可廣泛用于基因測定，癌細胞的表達普測定、親子鑒定、個體識別、基因檔案、父系鑒定、母系鑒定、種族鑒定、種屬鑒定、傳染病毒的測定及胎兒遺傳缺陷的分析，比如癌細胞有起固有的表達方式，通過測定可得知人體癌細胞的發生和變化情況。另外，國產第三代基因測序儀的研發將極大地拓寬生命科學、生物化學、生物醫藥
第三代基因測序儀特點
據介紹，使用該國產第三代基因測序儀，完成一個人的基因組測序的測試時間，將由目前（2009年）的6周縮短為10—15分鐘；測試成本將由10萬—30萬美元降到5000—8000元人民幣。此外，國產第三代基因測序儀，與第二代測序儀在原理和效能上有本質區別，通過對單分子的操作而減少繁雜的生物學反應，同時結合
第三代基因測序儀意義
具有國際先進水平的國產第三代基因測序儀的研制，將使中國在該領域建立先發優勢，在未來的國際競爭中占據有利位置。這不僅將填補中國在基因測序基礎裝備領域的空白、提升裝備自主化水平，同時也將使國內生命科學研究機構能獲得低成本、高效率的測序工具，更有效地開發和利用中國豐富的基因資源，加速中國基因戰略的發展。也