llumina宣布推出新型基因分型芯片|支持AllofUs研究計劃
2018年12月6日,來自圣迭戈的消息——Illumina公司(納斯達克股票代碼:ILMN)今天宣布推出新型高密度基因分型芯片Infinium? Global Diversity Array。這款芯片設計源于All of Us研究計劃,專為其開發。All of Us研究計劃是一個具有歷史意義的項目,旨在收集生活在美國的100萬或更多人的數據,加快人類疾病研究步伐并改善健康狀況。All of Us研究計劃是美國有史以來最雄心勃勃的生物醫學研究項目之一,其目標在于建立一個至少有100萬社會各界人士參與的全國性社群,包括歷史上在研究中代表性不足的群體。 9月,All of Us研究計劃向全國三個基因組中心共計撥出2860萬美元的資金。三個中心將從計劃參與者提供的生物樣本中生成基因組數據。最終,這些信息將成為該計劃精準醫學研究平臺的重要組成部分,該平臺是一項國家資源,為各種重要健康問題的研究提供支持。All of Us研究計劃由隸......閱讀全文
llumina宣布推出新型基因分型芯片|支持All-of-Us研究計劃
2018年12月6日,來自圣迭戈的消息——Illumina公司(納斯達克股票代碼:ILMN)今天宣布推出新型高密度基因分型芯片Infinium? Global Diversity Array。這款芯片設計源于All of Us研究計劃,專為其開發。All of Us研究計劃是一個具有歷史意義的項
Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片
2012年11月6日,來自加利福尼亞州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(納斯達克代碼:AFFX)推出了 Axiom? miRNA靶基因分型芯片,唯一一款可在全基因組范圍評估microRNA(miRNA)靶基因位點的高密度基因分型工具。這些新的芯片將實現全面研究,以闡明miRNA調控
Affymetrix推出AxiomBiobank芯片,用于基因分型研究
2012年11月1日,來自加利福尼亞州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(納斯達克代碼:AFFX)今日宣布推出 Axiom? Biobank 芯片,一種內容靈活且性價比很高的功能生物學方案,能夠經濟地對大樣品集合進行基因分型,如生物樣本庫、基因組中心及核心實驗室篩查的樣品。 A
兒童急性淋巴細胞白血病(ALL)的分型
一、FAB的分類1976年FAB協作組根據細胞形態將ALL分為L1、L2、L3三型(Benneett等,1976)。不符合各型條件的細胞不超過10%。小細胞是指直徑小于兩個紅細胞(<12μm)的淋巴系細胞,大細胞是指直徑大于兩個紅細胞(>12μm)淋巴系細胞。二、MIC分類1985年4月由van d
獼猴桃高密度SNP基因分型芯片研發成功
軟棗獼猴桃新種質。中國農科院鄭果所供圖不同基因型的軟棗獼猴桃果實。中國農科院鄭果所供圖不同獼猴桃種質資源的果實。中國農科院鄭果所供圖 近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所獼猴桃資源與育種團隊在《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journal)發表研究論文。研究通過開發獼猴桃
關于Usher綜合癥的USⅠ型介紹
出生時即表現為先天性深度感音神經性聾,前庭反應消失,低頻可有殘余聽力90~100 dB,但250~8 000 Hz不存在聽力島。因語言發育障礙而表現聾啞,傳統的助聽器對這些患者沒有用,大功率耳背式助聽器或調頻式助聽器及遠紅外助聽器對一部分患者有幫助。大多數未用過助聽器的US Ⅰ型患者用手語交流。
用PCR進行基因分型
與許多一次做數百塊Southern blots的研究人員一樣,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)時覺得見效很快,不再需要等幾天才能看到結果,不再需要DNA顯微圖像或者操作紫外線了。隨著技術的不斷進步,RCR使基因組學和轉錄組學發生了翻天覆地的變化,甚至隨著免疫PCR的普及開始進軍蛋白
用PCR進行基因分型2
質譜法原則上,添加到引物末端的核苷能夠直接依據質量,利用通過基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectroscopy,MALDI-TOFMS)直接檢測出來,這是一種不需標
丙型肝炎病毒的基因分型
HCV基因分型還無統一標準,因用于基因分型的部位和采用的技術方法不同,出現了各種基因分型結果,但各種基因型分類方法之間有一定的對應關系,茲舉幾種基因型分類法供參考。 HCV基因型各種分型之間的對應關系 現知歐美國家多數HCV-Ⅰ型感染,而亞洲國家以Ⅱ型為主,Ⅲ型次之。Okomoto報告日本慢
用PCR進行基因分型1
與許多一次做數百塊Southern blots的研究人員一樣,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)時覺得見效很快,不再需要等幾天才能看到結果,不再需要DNA顯微圖像或者操作紫外線了。隨著技術的不斷進步,RCR使基因組學和轉錄組學發生了翻天覆地的變化,甚至隨著免疫PCR的普及開始進軍蛋白
HLA基因分型方法:RFLP法
RFLP法1)常規制備DNA鹽析法1.用淋巴細胞分離液從抗凝血中分離出白細胞。2.每3ml細胞懸液加10ml紅細胞裂解液溶解紅細胞兩次,再加2ml白細胞裂解液溶解白細胞。3.加50μl 10%?SDS和70μl蛋白酶K消化蛋白質,37℃過夜或55℃?3h。4.加0.25體積飽和醋酸鈉溶液,劇烈搖動1
HPV分型基因檢測的簡介
HPV分型基因檢測指的是檢測多種基因型HPV的同時可以對HPV陽性結果進行基因分型的檢測技術。其利用包括PCR-熒光探針法或其他分子生物學方法在內的核酸檢測技術,以特定高危型HPV核酸(包括DNA和RNA)序列為檢測目的,對人宮頸樣本(如人宮頸脫落上皮細胞或分泌物等)進行體外定性檢測的試劑,以確
HPV分型基因檢測的意義
近年來,人類乳頭狀瘤病毒(HPV)的發現及分型為宮頸癌篩查提供了一個全新途徑。1976 年,Zur Hausen H 首次提出人類乳頭狀瘤病毒(HPV)與宮頸癌的發病密切相關。隨后大量流行病學資料及研究已明確顯示 HPV 持續感染是宮頸癌發病的首要條件。絕大多數宮頸癌樣本都可檢出HPV,HPV陰
乙肝HBV基因分型檢測原理
1、全面型別分析? ? 采用Sanger測序法對乙肝病毒進行分型基因檢測。通過提取慢性乙型肝炎患者血液中的病毒DNA,利用特異性引物對HBVDNA中的基因進行PCR擴增。通過對擴增后的目的基因進行測序,將測序信息與NCBI中標準株的序列信息進行比對,可一次性檢出慢性乙型肝炎病毒A、B、C、D
HP分型檢測的分型
幽門螺桿菌(Hp)可以分泌毒素損壞人體細胞,引起炎癥、潰瘍及腫瘤等。依據其分泌毒素的情況不同,可以將其分為產細胞毒素和非產細胞毒素兩大類;能產生毒素的為I型,不能產生毒素的是II型。 不同類型的幽門螺桿菌毒力 Ⅰ型HP由于產生細胞毒素,因此有較強的毒性,與胃十二指腸潰瘍、MALT淋巴瘤及胃癌
小片段法進行基因分型(一)
摘要:????? 背景:用于基因分型的高分辨率熔解曲線技術既簡單又有效。在以熔解為基礎的方法中,探針法是基因分型的黃金標準,可以將等位基因與目標的匹配完全區分開。小片段基因分型法是代替探針的基因分型法。異源雙鏈核酸分子的存在使得檢測純合子變得容易,其熔解峰的形狀有明顯的改變。純合子G/C或A/T的基
小片段法進行基因分型(二)
結果:??????? 圖1顯示的是校正之前的完整的熔解峰顯示。 從低溫和高溫內標及擴增子熔解的中部區分熔解信號。圖1:派生熔解曲線顯示校準和擴增子的熔解峰。左邊和右邊的峰是校準內標的峰。94的熔解剖面圖,接近76℃,從獨立的PCR反應中生成。校準分子沒有對其,純合子的擴增峰沒有清楚的分開。中部最窄且
基因分型定量檢測技術的定義
基因分型定量檢測系統是國際上在傳染病流行病學應用中最廣泛的檢測診斷系統。主要通過基因芯片對HPV、HSV等DNA病毒進行檢測,分析基因表達的類型,了解基因功能,從而指導疾病的診斷、預后、病理分析、治療等各種研究。基因芯片主要用于DNA 突變分析、基因譜差異分析、基因診斷分析和大規模基因類型分析。?基
PYRO測序用于SNP基因分型原理
其實是一種段片段焦磷酸測序技術,在測序引物的引導下,完成段片段(含snp)的測序,從而實現基因分型。缺點:不能檢測長片段,對于重復序列沒有辦法。原理簡介1.測序引物與單鏈,PCR擴增的DNA模板相結合。然后將其與DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、熒光素酶和三磷酸腺苷雙磷酸酶,以及底物APS和熒光素一起孵
什么是基因分型定量檢測系統?
基因分型定量檢測系統是采用的基因芯片技術,用來檢測HPV\HSV等DNA病毒的系統。該系統廣泛應用于傳染病流行病學中,如性傳播疾病(尖銳濕疣、生殖器皰疹)、慢病(腫瘤、高血壓)等。
關于單基因病的分型介紹
1.常染色體疾病(顯性和隱形) 致病基因為顯性并且位于常染色體上。如軟骨發育不全、多指(趾)癥、基因位于X染色體上:抗維生素D佝僂癥等。親代有一患者,后帶發病率一般為50%(如親代為純合體、則后帶發病率為100%,但這種情況較少)。 2.常染色體隱形遺傳病 致病基因為隱性并且位于常染色體上
乙肝HBV基因分型檢測定義
乙肝HBV基因分型檢測是基因擴增檢測實驗室(PCR實驗室)進行的一項檢查,是通過取自患者血液及其他體液、細胞中提取的HBVDNA進行檢測的技術。提取出來的HBVDNA經過擴增基因信息后,通過特定設備對乙肝患者細胞中的HBVDNA分字進行分子信息檢測,分析它所含有各種基因型的情況,從而使患者了解自己對
HPV分型基因檢測的應用前景
近年來 HPVDNA 檢測逐步取代原有的宮頸癌篩查手段,其篩查CIN2+ 病變的敏感度明顯高于細胞學檢查。[7]HPV 檢測檢出宮頸高級別病變的敏感性較單獨細胞學檢測更好,幾乎等同于聯合篩查。高危型HPV檢測作為宮頸癌初篩策略具有較好的成本效能,隨著價值醫學理念的深入,單獨 HPV 檢測作為初篩
基因分型定量檢測技術的原理
基因分型定量檢測系統的核心是基因芯片技術,基因芯片技術是一種大規模集成的固相雜交,其技術要點主要包括芯片的制備、樣品的制備及標記、分子雜交與檢測、生物信息學分析四個方面。基本原理是核酸分子雜交,即應用顯微光蝕刻技術把大量的DNA片段以可尋址的方式,高密度地固定到一小塊載玻片上,利用核酸堿基之間的配對
免提取DNA,輕松搞定基因分型
基因分型是通過使用生物學試驗檢查個體的DNA序列的過程,也是將目標序列與另一個體的序列或參考序列進行比較來確定個體的遺傳構成(基因型)差異的過程。PCR 是一種常見的基因分型方法,用于對樣本的基因型進行擴增和鑒定。但由于基因分型通常需要檢測成百上千份樣品,樣品處理、提取基因組DNA、PCR擴增目的基
乙肝病毒的基因分型
HBV根據抗原決定簇的差異可劃分為4個不同的血清型和9個血清亞型, 通過對HBV全基因序列比較后發現,血清亞型的區分并不能反應HBV基因組的差異。根據HBV全基因核苷酸序列異源性≥ 8.0% 或者S基因區核苷酸序列異源性≥4.0% , 將不同病毒株分為A-H 8個基因型。?? ?HBV基
HLA基因分型方法:PCR-RFLP法
PCR-RFLP法1)提取細胞總DNA方法同前。?2)PCR擴增引物的設計1.引物長度一般為15~30bp,G+C含量應在45%~55%之間。2.應避免連續出現4個以上的單一堿基。3.不能含有自身互補序列。4.兩個引物之間不應有多于4個的互補或同源堿基,不然會形成引物二聚體。5.與非特異擴增序列的同
基因分型定量檢測技術的技術特點
基因芯片技術突出特點是集成化、微型化、自動化,代表了未來分子診斷的發展趨勢。其優點有以下幾個方面:一是高度的靈敏性和準確性;二是快速簡便;三是可同時檢測多種疾病。因此已廣泛應用于DNA序列測定、基因表達譜分析、基因組研究、基因突變檢測及多態性分析、疾病的臨床診斷和預測、藥物研究與開發以及法醫鑒定、工
基因分型定量檢測技術的操作流程
基因分型定量檢測系統的操作流程包括:寡核苷酸探針的合成、固定、雜交和檢測等四個步驟。該系統對于疾病的診斷、預后、病理分析、治療等具有重大意義。
基因分型的新方法被研發
廉價的基因分型方法對現代基因組學至關重要。在最新這篇論文中,研究人員報道了QUILT,它使用低覆蓋率的全基因組序列數據執行二倍體基因型填充。QUILT采用吉布斯采樣將讀數劃分為母本和父本集,并使用大型參考面板促進快速單倍體填充。 研究人員證明了這種劃分在許多兆堿基上是準確的,能夠實現接近理