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    分析比產生更快?中國“智”造全基因組組裝算法

    10年前,Illumina基因組測序技術進入市場時,前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今,第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 12月10日,《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 論文作者、中國農業科學院農業基因組研究所博士阮玨與美國哈佛大學醫學院博士李恒,將這個新的第三代測序數據組裝算法稱為Wtdbg。第三代測序的尷尬 20年前,破譯人類遺傳密碼還是極具挑戰的大科學工程,當時的人類基因組測序計劃與曼哈頓原子彈計劃、阿波羅計劃并稱為三大科學計劃。 如今,完成一個人的全基因組測序已經是普通實驗室甚至家庭都可以負擔起費用的“平常事”。用第三代測序技術完成個體全基因組測序僅需一天,費用也已經低于5萬元。 2011年,PacBio公司正式宣布第三代單分子測序開始商業化。 相比于第二代測序每個序列的幾百堿基對測序讀長,第三代測序的平均讀長達......閱讀全文

    與巴基斯坦科學基金會合作研究項目初審結果發布

       2016年度國家自然科學基金委員會與巴基斯坦科學基金會合作研究項目初審結果的通知  經公開征集,2016年度國家自然科學基金委員會(NSFC)與巴基斯坦科學基金會(PSF)共收到合作研究項目申請191項。根據我委相關規定,經過初步審查,并與巴方核對清單,確定有效申請為168項,現將通過初審的項

    單堿基基因編輯研究進展速覽

      本文中,小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展,分享給大家!  【1】Nat Commun:科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬

    對話Life Tech:Ion Proton臺式基因組測序儀

      著名的生物技術公司Life Technologies(納斯達克股票代碼:LIFE)3月28日宣布,在中國推出新的臺式基因測序儀:Ion Proton?。借助該技術產品,只需 1000 美元即可在一天時間內完成個人全基因組測序。    這一新型測序儀采用了新一代半導體測序技術。此前推出的同樣基于這

    2018TOP10基因測序公司 Illumina雄踞榜首 華大基因位列第三

      在成功實現1000美元基因組測序的5年后,測序行業正在朝著新的目標前進:將基因組測序的成本進一步降低至100美元,甚至10美元。  在2018年,最接近100美元目標的是Veritas Genetics公司,該公司去年11月將其999美元的myGenome Standard全基因組測序服務(包括

    海洋所科研人員繪制完成牡蠣全基因組序列圖譜

      近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜,標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉,目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖

    2019中國生命科學20大進展榜單出爐 除了顏寧還有誰?

      經過1500位左右的讀者投票,最后iNature編輯部得到了2019年中國生命科學領域20大進展,其中結構有2項,植物3項,生物機理研究4項,新方法/技術/動物模型6項,生物醫學5項。  結構:顏寧團隊Cav通道結構,這些結構為未來針對Cav通道病的藥物發現奠定了基礎;  中科院生物物理所饒子和

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

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    JP摩根健康大會丨華大智造發布百萬基因組整體解決方案

      美國當地時間1月13日,在第38屆摩根大通醫療健康會議(JPMorgan Healthcare Conference)期間舉辦的Healthcare Cross-border Partnering論壇上,華大集團副總裁張永衛博士重磅發布華大智造百萬基因組整體解決方案。據悉,該方案致力于為百萬級別

    世界防治結核病日?梳理肺結核診斷方法進展

      今年3月24日是第22個世界防治結核病日,今年的結核病日的宣傳主題是“社會共同努力,消除結核危害”。世界上三分之一的人口被認為感染上結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB),即導致肺結核(TB)的細菌,但是只有一小部分人會患上有癥狀的疾病。即便他們當中只有10

    周曉光:MALDI誕生30年小記

      基質輔助激光解吸電離(也就是通常所說的MALDI)于1987年首次由Hillenkamp 及Karas提出,如今已經30年。從那時起,通過應用這一“軟電離”技術與飛行時間質譜(MALDI -TOF MS)的結合,成功地實現了為生物大分子提供快速和高度可靠檢測手段的目的,同時也為生命科學領域提供了

    多篇研究共同解讀近期單細胞測序重磅級研究成果

      本文中,小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果,與大家一起學習!  【1】Cell:開發出空間單細胞測序技術,有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎  doi:10.1016/j.cell.2017.12.007  在一項新的研究中,來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳

    Tecan帝肯發布2019年財報 全年收入6.4億瑞士法郎增7.2%

    分析測試百科網訊,帝肯Tecan公司發布2019年財報。2019年銷售收入6.368億瑞士法郎,相比去年5.938億增7.2%,公司毛利潤2.973億瑞士法郎,毛利率46.7%,凈利潤7320萬瑞士法郎,凈利潤率11.5%。2019年研發費用5985.7萬瑞士法郎,研發占比為9.4%。公司收入主要來

    2012年度中國高校十大科技進展揭曉

      2012年度“中國高等學校十大科技進展”在12月18日舉行的教育部科學技術委員會全會上揭曉。  2012年度高校這十大科技進展是:安徽醫科大學主持的全基因組外顯子測序分析發現汗孔角化癥、掌跖角化癥和少毛癥致病基因研究,北京大學主持的強激光場下原子分子隧道電離研究,哈爾濱工業大學主持的先

    華大智造發布“桌面”測序儀等3款產品 構建測序“生態”

    2019年10月25日于深圳召開的第十四屆國際基因組學大會(ICG-14)上,華大智造發布三款新產品,分別是其自主研發的新型“桌面”一站式測序解決方案、便攜式單細胞組學產品及CoolMPS高通量測序試劑套裝。新產品聚焦便攜式、智能化、自動化等未來發展方向,打破傳統測序的時間、空間、人員限制,進一步滿

    新一代測序技術的先鋒-SOLiD系統

    2008年12月  作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一,測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術,基因序列就無法確定,酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起,生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank;

    萬元全基因組測序在望 全新分析平臺登場

    今年早期,ABI公司應用SOLiD 3系統領先的寡核苷酸連接和檢測技術對人類基因組進行了測序,費用低于6萬美元。這臺新儀器的技術改進使更高的樣品和數據通量成為可能,從而有望進一步降低基因組測序的費用。例如,更廉價的基因組數據有望加速疾病關聯和生物標志物的發現,從而改善診斷和疾病處理,支持與個人最佳治

    消費級基因檢測興起,行業洗牌加速

      從基因檢測下游服務行業拓展至上游設備行業,中國的基因檢測企業存在感越來越強。欣喜之余不可忽視的是,當前基因測序公司對于醫療實際場景缺乏深入了解,臨床信息與基因數據脫節,政策監管風險如同一只遲遲不落下的靴子,這些都是這個行業無法回避的痛點。  在華大基因董事長汪建的眼中,基因檢測似乎“無所不能”。

    破譯中國人基因密碼:“中國十萬人基因組計劃”將4年完成

      我是誰?我從哪里來?我將到哪兒去?這一終極哲學命題,有多種不同的解答視角。從基因角度給出的答案,無疑是非常重要的一種。近一段時間,有關基因領域的新聞將基因檢測、基因編輯、癌癥的靶向治療等原本屬于生物醫學領域的專業話題,一下子變成了公眾話題。人們對于基因的好奇在于:基因是如何影響人類的長相、身高、

    2億美元“精準醫療計劃”賣的是啥藥?

      近期的醫學網絡熱詞,莫過于“精準醫療”了,因為給它做廣告的是美國總統奧巴馬,而在奧巴馬身后,是現任NIH(美國國立衛生研究院)的主任Francis Collins和NCI(美國國家癌癥研究所)的所長Harold E. Varmus兩位大牛。這兩位人物管理著美國醫學研究最主要的研究領域。如此高調、

    盤點全球各國政府主導的人類基因組測序計劃

      美國科學家于1985年率先提出人類基因組計劃,1990年正式啟動,美國、英國、法國、德國、日本和中國科學家都參與了這一預算達30億美元的人類基因組計劃。之后,2000年6月26日,六國科學家共同宣布,人類基因組草圖的繪制工作已經完成。在這場規模宏大、影響世界的基因測序項目落幕后,全球內陸續又有不

    基因領域:最重要的是讀懂“天書”

      左手技術,右手資本,毫無疑問,基因科技已經成為生命科學領域最熱門的寵兒。  從最近十幾年的發展來看,人類基因測序技術的發展已經超越了“摩爾定律”:上世紀啟動的“人類基因組計劃”項目計劃花費30億美元,用十三年時間完成一個人類全基因組的測序,繪制出人類基因組圖譜。但到了今天,使用最新一代高通量測序

    基因夢工廠里那些年輕人:沒上大學就做研究

      世界總會讓年輕人占領。   曾經和喬布斯一起演講的小天才Thomas Suarez今年還在讀初中,現在他在名叫MakerBot的機器人創業公司研究3D打印機。而出生于1997年的鄒奇奇,8歲出版了12萬字故事集《飛揚的手指》轟動美國,2013年登上TED時她已有“女權主義者”標簽和贏得諾貝

    基因組測序發現鳥類和人類本質上具有相同的語言基因

      北京時間12月15日消息,據科學日報的報道,美國杜克大學神經學生物學家埃里希·賈維斯(Erich Jarvis)的辦公室里全是鳥類書籍,但他成為飛行類動物家族樹專家并非因為對有羽毛鳥類的獨特興趣,而是對人類大腦如何理解和產生言語的著迷導致他開始研究鳥類。“我們早已知道鳥類的歌唱行為類似于人類的言

    陳洪淵:原始性創新是21世紀分析化學面臨的最根本挑戰

      “創新”是推動科學技術與社會進步的法寶,是科教興國的靈魂, 也是國家民族振興的靈魂。本文從幾個方面談談關于如何推動分析化學發展與創新的一點思考和淺見,與同仁們一起探討。     理念上更新促進原始性創新   毫無疑問,創新是科學技術和社會生產發展的需要,它將推動分析化學的發展和變

    基因大數據走向臨床應用,哪些問題要克服?

      為了推動基因組研究在臨床中的應用,多個國家層面的大規模研究項目已經開啟。2014年英國發起了10萬人基因組計劃,美國和中國也宣布了百萬人基因組數據相關計劃。許多區域性的大數據計劃也在進行中。例如,賓夕法尼亞州的蓋辛格健康系統(GeisingerHealth System)和紐約的再生元制藥公司合

    突破耐藥基因組測序缺陷 靶向測序對抗耐藥菌新契機

      自以抗生素為代表的抗菌劑問世以來,細菌對人類健康的危害得到了極大的控制。然而進入21世紀后,情況好似走入了另一個極端——由于抗生素濫用所致的耐藥菌的出現以及廣泛傳播。這是由于在藥物的選擇壓力下,敏感菌株被抑制或殺滅,天然耐藥或獲得性耐藥菌株則繼續生存、繁殖和克隆傳播,導致細菌的耐藥性增高。  細

    2017CMEF“王牌對王牌”:這些重磅新品不能錯過!

      作為亞太地區覆蓋醫療器械全產業鏈,集產品技術、服務創新與貿易,學術交流、教育與學習為一體的行業綜合服務平臺,中國國際醫療器械博覽會(簡稱CMEF醫博會)受萬眾矚目!2017年CMEF春博會匯聚了來自全球28個國家和地區的4100家企業。  在每年的CMEF上,總不乏大牌的身影。一些名企甚至將其作

    Science:重磅!西安交大葉凱團隊成功破譯罌粟基因組

      在一項新的研究中,來自中國西安交通大學、上海海洋大學;英國約克大學、威康基金會桑格研究所;澳大利亞太陽制藥私人有限公司的研究人員破譯出罌粟(opium poppy)基因組的DNA密碼,揭示出這種植物產生用于制造重要藥物的藥用化合物的關鍵步驟。這一發現可能為科學家們提高這種藥用植物的產量和抗病性鋪

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    常用生物軟件(windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。 ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件,不僅可以進行圖像分析,還可以進行數據處理,方便protocol的管理功能強大,商業版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0

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