Comparativeproteomic analysis of the shoot apical meristem in maize between aZmCCT-associated near-isogenic line and its recurrent parent.文獻來源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27468931研究背景:ZmCCT,是影響植物光周期反應非常重要的一個基因。對于玉米而言,長期光照會延遲其開花的時間。本篇文章是在蛋白質組學層面探討一下玉米種光照周期性的分子機制。樣本來源:頂端分生組織(SAM),來源于ZmCCT-positive株系NIL-cml vs. ZmCCT-negative株系H4技術路線:iTRAQ,三個生物學重復研究結果:1. 共鑒定出5259個蛋白質,386個差異蛋白質。這些差異......閱讀全文
摘要:同位素標記相對和絕對定量(iTRAQ)技術是近年來最新開發的一種新的蛋白質組學定量研究技術,具有較好的定量效果、較高的重復性,并可對多達四種不同樣本同時進行定量分析。研究人員采用iTRAQ蛋白質定量技術加速蛋白質的定量研究,當然這門新興的工具仍然需要進一步的完善。 &nb
1、什么是iTRAQ? iTRAQ技術,即同位素相對標記與絕對定量技術。該技術可對復雜樣本、細胞器、細胞裂解液等樣本進行相對和絕對定量研究,具有較好的定量效果、較高的重復性。由于其能夠同時對多達8種樣品進行標記分析,故在生命科學的各個領域得到了廣泛的應用。2、iT
大家好,我是黃博,吉凱一小兵,蛋白質組學實驗狗。今天的故事是一個作文從沒及格過的悶騷理科男(我一直是這么定位自己的)是如何被陳博內個大尾巴狼生生逼來寫文章的故事,真的是有血、有淚、有shi!情節需要,中間可能會穿插一些技術方面的內容,請各位自動忽略。 那是一個月黑風高的晚上,本人和大尾巴狼
2013年12月8日,第四十期質譜沙龍活動在北京朝陽醫院順利舉辦,來自北京師范大學、北京朝陽醫院、中科院微生物所、空軍總醫院的百余名專家學者齊聚一堂共同參加了此次沙龍活動。AB SCIEX公司市場部 李春波
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人激動
上期分享的蛋白組學內容,是不是有些小伙伴還繞在云里霧里呀?這次,小編用實例說話,幫您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量,顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化
2008年12月21日下午,質譜沙龍第十五期活動在第二炮兵總醫院遠程會診中心會議室舉行。來自發酵研究院、清華大學、二炮總醫院、朝陽醫院、北大醫學院、北醫三院、安貞醫院、解放軍307醫院、中科院植物所、AB公司的各位專家、老師、學生20余人。
“那iTRAQ的原理是什么,有哪些優勢?”“iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)技術由美國AB SCIEX公司研發,最早于2004年美國質譜年會上被提出,是一種基于體外等重同位素標記的相對定量技術。該技術利用同
在“蛋白組學在臨床科研中的應用”這一系列的文章中,我們分享了眼科、內分泌、心血管、神經等方面的研究思路。今天我們來介紹一個非常重要的,并且離不開蛋白質組學研究的一個學科——免疫方向的科研套路,哦不,是思路。話不多說,滿滿干貨! 第一篇, &nb
在“蛋白組學在臨床科研中的應用”這一系列的文章中,我們分享了眼科、內分泌、心血管、神經等方面的研究思路。今天我們來介紹一個非常重要的,并且離不開蛋白質組學研究的一個學科——免疫方向的科研套路,哦不,是思路。 話不多說,滿滿干貨! 第一篇, 強直性脊椎炎 雜志:Cts-Cli
腫瘤標志物是能夠反映腫瘤存在的化學物質,其存在或量變可提示腫瘤的性質,借此了解腫瘤的組織發生、細胞分化、細胞功能,幫助腫瘤的診斷、分類、預后判斷以及治療指導。本文介紹了應用iTRAQ試劑和MALDI-TOF/TOF找尋退行性神經間質瘤生物標志物的方法。 本實驗旨在應用iTRAQ試劑和MAL
在“蛋白組學在臨床科研中的應用”這一系列的文章中,我們分享了眼科、內分泌、心血管、神經等方面的研究思路。今天我們來介紹一個非常重要的,并且離不開蛋白質組學研究的一個學科——免疫方向的科研套路,哦不,是思路。 話不多說,滿滿干貨! 第一篇, 強直性脊椎炎 雜志:Cts-Cli
中國飲食文化博大精深,《舌尖上的中國》向世界展示了我們這個完美的吃貨民族。一道成功佳肴,食材挑選有著非常嚴格的標準。在醫學基礎研究領域,實驗與做菜亦有共通之處,做飯時如果偷懶,用煮過面條的湯煮餛飩,餛飩的賣相口感觀感都大為降低。實驗也如此,一是一,二是二,必要精確審慎,更不可以偷懶,變通條件。偷工減
根據世界衛生組織發布的數據,心血管疾病一直是人類健康的“第一殺手”,但是相比于各種惡性腫瘤,這個“殺手”在科研領域卻低調很多。究其原因,沒有細胞模型,動物模型并不能完美的模擬心血管疾病發生發展的過程等等,都導致了心血管疾病的基礎科研相對薄弱。但是對于臨床醫生,除去關心機制,我們更應該通過科研去解
1.為什么通過elisa、WB能檢測到的蛋白在itraq實驗中沒有檢測到? 人血漿中的蛋白是有上萬種的,而一般質譜只能檢測到五六百種,也就是說只占了其中的百分之幾,這是普遍現象,說明咱們的方法是不存在問題的;其次,ELISA/WB與質譜相對來說靈敏度不一樣,前者具有放大效應,因為其間會用
根據世界衛生組織發布的數據,心血管疾病一直是人類健康的“第一殺手”,但是相比于各種惡性腫瘤,這個“殺手”在科研領域卻低調很多。究其原因,沒有細胞模型,動物模型并不能完美的模擬心血管疾病發生發展的過程等等,都導致了心血管疾病的基礎科研相對薄弱。但是對于臨床醫生,除去關心機制,我們更應該通過科研去解
根據世界衛生組織發布的數據,心血管疾病一直是人類健康的“第一殺手”,但是相比于各種惡性腫瘤,這個“殺手”在科研領域卻低調很多。究其原因,沒有細胞模型,動物模型并不能完美的模擬心血管疾病發生發展的過程等等,都導致了心血管疾病的基礎科研相對薄弱。但是對于臨床醫生,除去關心機制,我們更應該通過科研去解決臨
慢性腎病病人一般會出現很多的并發癥,其中大多數腎損傷晚期病人都患有嚴重的高血壓。鹽是慢性腎病和高血壓發病的主要致病因素之一,但其中的病理機制仍然不清楚。本文利用蛋白質組和磷酸化蛋白質組聯合分析的技術,對慢性腎病并發高血壓的病理機制進行了全面系統性的分析。 Proteomic and p
慢性腎病病人一般會出現很多的并發癥,其中大多數腎損傷晚期病人都患有嚴重的高血壓。鹽是慢性腎病和高血壓發病的主要致病因素之一,但其中的病理機制仍然不清楚。本文利用蛋白質組和磷酸化蛋白質組聯合分析的技術,對慢性腎病并發高血壓的病理機制進行了全面系統性的分析。 Proteomic and p
8月13日,國際學術期刊Cell Discovery 在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所中科院計算生物學重點實驗室(馬普計算生物學研究所)邵振課題組研究論文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit
1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都
一、Label-free定量Label-free定量,顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free技術又可分為基于譜圖數(Spectra Co
譯文:細胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能驗證。遙想當初,很多老師意氣風發砸錢做芯片,數據堆積如山,一臉懵逼。然而如今世風日下,基因芯片灌水發文章很難上5分,怎么將課題繼續下去?其實芯片數據結合蛋白質組學可以玩出新花樣,比如下面這篇:Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5
4月12日,AB Sciex 公司在分析測試百科網成功舉辦了題為“AB Sciex 電噴霧質譜在蛋白質組學中的應用”的網絡視頻講座。AB Sciex 亞太應用支持中心的靳文海博士首先為大家簡單介紹了蛋白質組學和質譜技術發展方向,接下來重
體內標記 對于in vivo標記,人們通常用化學標記的營養物喂養細胞,讓它們摻入新合成的蛋白、核酸或代謝物。之后收獲細胞,分離出這些分子,從整體上查看細胞行為,或利用抗體或其他捕獲試劑來研究某個蛋白。 蛋白質組研究人員常用的方法是SILAC,即細胞培養中氨基酸的穩定同位素標記。兩
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發的多肽體外標記定量技術。這兩種技術采用2-10種穩定同位素標簽,通過特異性 標記多肽的
我是陳大雄,生物狗一枚,實驗之余最大的樂趣是看電影。最近我有個疑問: 國外很多城市有專門的華人聚集點,稱之為唐人街。 那么,為什么要叫"唐"人街,而不叫華人街、秦人街? 有一種常見的說法是: 唐朝當時實在是太牛X了,發展太猛了。 老外們一個個都懵逼了,甚至到了明朝, 國外還把和中國有
申請課題缺創新點?撰寫論文沒思路?急著畢業時間緊?別怕,對于吉凱,一切都是套路!更有甚者,對于宇宙終極難題:“屌絲如何逆襲白富美?”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前,在生物學研究領域,有一個白富美叫基因組學(Genomics),她有一項強大的技能:DNA測序,憑借這項技能,她完
老美大當家的奧大叔似乎并不愿悄悄離去,在其任期最后一年又搞了個大動作。年初,奧叔在對國會發表的國情咨文中宣布將發起一項尋找癌癥治愈療法的“登月計劃”,并任命二當家的拜登為該項目負責人。此外還有兩項分別由個人(陳頌雄)和醫院(美國MD安德森癌癥中心)發起的癌癥“登月計劃”,可見老美此次是傾全國之力
梭子蟹廣泛分布在韓國,日本,中國和東南亞的沿海水域。這種物種棲息在河口和沿海水域。 在中國,它是一種主要的食用蟹種和重要的漁業資源,也是中國重要的養殖物種。目前關于梭子蟹的研究已經很廣泛,但關于其遺傳背景信息的研究亟待深入。目前為止,關于梭子蟹蛋白質組學的研究比較少。 在這項研究中,中國水產科