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    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(二)

    3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析,與線性RNA相比,環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外,極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差,同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率相關。這種相關性排除了對應親本來源的線性轉錄本的影響,種種跡象表明這種特異性表達的circRNA與前列腺癌的發生發展密切相關。為了評估這些特異性circRNA的功能重要性,選取前列腺癌細胞系中數量最多的2000個環狀RNA進行shRNA功能缺失篩選,位點靶向于反式剪切序列,然后對這些環狀RNA敲除細胞系進行全轉錄組測序,同時耗盡其中的線性RNA以保證篩選的有效性,結果表明這些特異性的circRNA對細胞的增殖產生明顯的促進作用,而不是線性RNA。4. circCSNK1G3的功能特征環狀RNA分子circCSNK1G3非常特殊,其環狀......閱讀全文

    Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制!

      2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci

    云序生物環狀RNA研究文章匯總

      環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達

    全轉錄組測序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA

    1. 文章主題:環狀RNA通過靶向miRNA調控的信號傳導促進結直腸癌的轉移發表期刊:Journal of pathology影響因子:5.942發表時間:201906實驗方法:全轉錄組測序實驗樣本:結直腸癌組織肝轉移是結直腸癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全轉錄組測序在CRC肝轉移的小鼠模

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    又傳喜訊云序客戶一次測序兩項成果影響因子合計10分!

      感恩有你,一路同行,新年快樂!   感恩有你,一路同行!2019年伊始,云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候!一元復始,萬象更新!轉眼間我們迎來了2019年,站在新時代新的歷史起點,回望剛剛過去的2018年,不斷創新收獲碩果豐盈;展望2019,任重道遠卻

    2020年環狀RNA高分文章怎么發?

      環狀RNA作為最新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20%,

    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(一)

    2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ

    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究

      在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物,HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA,circRNA作為一種新型環狀RNA,具有共價閉合環狀結構,在組織和血液中具有

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    云序RNA修飾技術余義勛課題組植物m1A修飾調控機制的運用

      導讀   RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用,m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修飾在植物中的研究還非常少。   近日,Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The

    METTL3調控m6A甲基化修飾對小鼠脂肪細胞發育的重要作用

      今 天我們為大家解讀一篇今年4月3日發表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修飾對小鼠脂肪組織發育的影響。   棕色脂肪組織(BAT)通過線粒體產生并耗散熱量,對機體起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后發育,正是它們獲得這些功能的關

    揭秘m6A修飾新功能 -- 調控染色質狀態和轉錄活性

      文章導讀   m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。   2020年1月17日,美國芝加哥大學何川,中科院

    環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

      環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉

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    揭示Y染色體上LncRNA TTTY15促進前列腺癌細胞的增殖和遷移

      前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作為男性發病率第二的癌癥,嚴重影響了患者生殖健康和生活質量。由于前列腺癌受多種基因調控,且目前缺乏相關機制方面的深入研究,治療效果往往不甚理想。隨著高通量技術的發展,使研究PCa相關分子標志物基因和作用機制成為可能。目前,已有報道指出許多明星Ln

    睪丸間質細胞(LCs)m6A修飾提供新治療靶點在不育癥治療

      m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代謝和翻譯,以及在細胞分化、胚胎發育和壓力應答等過程中起重要作用。這一次,研究重大發現m6A修飾在“人類繁衍”中也發揮著重大意義,該方向的發現將會吸引著更多的科研工作者探究在m6A與“不孕不育”的密切聯系。云序生物一

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    m6A修飾的YTHDF1與介導EIF3C對卵巢癌進展的影響

      m6A是真核生物中最常見的一類RNA修飾,能夠在多種生物過程中發揮重要作用,例如癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等。2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子的輝煌。2020年1月何川教授團隊再次帶領m6A登上頂級期刊Science,預示著m6A等RNA修飾

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    去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用

      表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成,還有文章探究過其在急性白血病中的作用,但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在Molecular

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    m6A RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用

      最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。   圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMe

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    揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排

      在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤

    Nature Genetics 揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排

      在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    RNA甲基化研究深度剖析(一)

    一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。

    RNA甲基化研究深度剖析

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