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    用PCR來制備編碼隨機肽的雙鏈DNA文庫實驗

    試劑、試劑盒 限制性內切酶和緩沖液滅菌雙蒸水Tris-HCl生物素標記的 PCR 引物儀器、耗材 鏈霉抗生物素蛋白磁性珠瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑滅菌雙蒸水(ddH20)10 mmol/LTris-HCl,pH8.02. 酶和酶緩沖液限制性內切酶和緩沖液(見第 9 步)10XVent 緩沖液VentDNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸生物素標記的 PCR 引物,長度至少 15bp,5'末端進行了生物素修飾(見圖 26-1)。編碼 12 個氨基酸的 NNK 庫。庫的設計如圖 26-1(a) 所示。合成的鏈含有一個隨機多肽庫,它們的 3'末端和 5‘末端都加了一個特定的側翼序列,作為引物結合的位點,并且含有限制性內切酶的識別位點,以方便將文庫 DNA 克隆進合適的載體系統。側翼序列長度至少應該有 15bp,并且設計時應該有 3 個標準:......閱讀全文

    分子生物學常用實驗技術(page 2)

    一、RNA 制備   模板mRNA 的質量直接影響到cDNA 合成的效率。由于mRNA 分子的結構特點,容易受RNA 酶的攻擊反應而降解,加上RNA 酶極為穩定且廣泛存在,因而在提取過程中要嚴格防止RNA 酶的污染,并設法抑制其活性,這是本實驗成敗的關鍵。所有的組織中均存在RNA 酶,人

    分子生物學常用實驗技術(page 3)

    分子雜交技術    互補的核苷酸序列通過Walson-Crick 堿基配對形成穩定的雜合雙鏈分子DNA 分子的過程稱為雜交。雜交過程是高度特異性的,可以根據所使用的探針已知序列進行特異性的靶序列檢測。雜交的雙方是所使用探針和要檢測的核酸。該檢測對象可以是克隆化的基因組DNA,也可以是細胞總DN

    核糖體失活展示系統實驗

    核糖體失活展示系統             實驗材料 RTA 基因

    常用的分子生物學基本技術

    核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性,它已成為分子生物學中最常用的基本技術,被廣泛應用于基因克隆的篩選,酶切圖譜的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下(適宜的溫室度及離子強度等)可按堿基互補原成雙鏈。雜交的

    核糖體失活展示系統實驗

    實驗材料 RTA 基因試劑、試劑盒 結合(或漂洗)緩沖液生物素瓊脂糖洗脫緩沖液儀器、耗材 RNeasy?mini 試劑盒實驗步驟 這里介紹的方法概括了表達載體的構建以及篩選功能蛋白的 RIDS 循環系統的構建。3.1 RIDS 表達載體的構建首先,需要準備含編碼 T7 啟動子、蛋白質文庫、連接子

    核糖體失活展示系統實驗

    實驗材料RTA 基因試劑、試劑盒結合(或漂洗)緩沖液生物素瓊脂糖洗脫緩沖液儀器、耗材RNeasy?mini 試劑盒實驗步驟這里介紹的方法概括了表達載體的構建以及篩選功能蛋白的 RIDS 循環系統的構建。3.1 RIDS 表達載體的構建首先,需要準備含編碼 T7 啟動子、蛋白質文庫、連接子、RTA 和

    分子雜交

    一、雜交通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交可在DNA與DNA、RNA與RNA或RNA與DNA的

    分子雜交技術(一)

    一、概述  前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交

    分子雜交技術(一)

    一、概述  前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交

    細菌學診斷新技術

     隨著現代科學技術的不斷發展,特別是免疫學、生物化學、分子生物學的不斷發展,新的細菌診斷技術和方法已廣泛用于食品微生物的鑒別。傳統的細菌分離、培養及生化反應,已遠遠不能滿足對各種病原微生物的診斷以及流行病學的研究。近年來國內外學者不斷努力,已創建不少快速、簡便、特異、敏感、低耗且適用的細菌學診斷方法

    分子生物學常用實驗技術(page 1)

    第一章質粒DNA 的分離、純化和鑒定 第二章DNA 酶切及凝膠電泳 第三章大腸桿菌感受態細胞的制備和轉化 第四章RNA 的提取和cDNA 合成 第五章重組質粒的連接、轉化及篩選 第六章基因組DNA 的提取 第七章RFLP 和RAPD 技術 第八章聚合酶鏈式反應(PCR)擴增和擴增產物克隆 第九章分

    細菌學診斷中的新技術

    隨著現代科學技術的不斷發展,特別是免疫學、生物化學、分子生物學的不斷發展,新的細菌診斷技術和方法已廣泛用于食品微生物的鑒別。傳統的細菌分離、培養及生化反應,已遠遠不能滿足對各種病原微生物的診斷以及流行病學的研究。近年來國內外學者不斷努力,已創建不少快速、簡便、特異、敏感、低耗且適用的細菌學診斷方法,

    新一代高通量測序技術SOLiD簡介

       目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation

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    高通量測序技術SOLiD簡介

    目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligat

    分子雜交技術(四)

    六、核酸分子雜交實驗因素的優化  (一)探針的選擇  根據不同的雜交實驗要求,應選擇不同的核酸探針。在大多數情況下,可以選擇克隆的DNA或cDNA雙鏈探針。但是在有些情況下,必須選用其它類型的探針如寡核苷酸探針和RNA探針。例如,在檢測靶序列上的單個堿基改變時應選用寡核苷酸探針,在檢測單鏈靶序列時應

    分子雜交技術(四)

    六、核酸分子雜交實驗因素的優化  (一)探針的選擇  根據不同的雜交實驗要求,應選擇不同的核酸探針。在大多數情況下,可以選擇克隆的DNA或cDNA雙鏈探針。但是在有些情況下,必須選用其它類型的探針如寡核苷酸探針和RNA探針。例如,在檢測靶序列上的單個堿基改變時應選用寡核苷酸探針,在檢測單鏈靶序列時應

    一文讀懂分子診斷技術、PCR技術、基因測序技術

      分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗

    逆轉錄PCR(RT-PCR)

    實驗四 逆轉錄PCR (RT-PCR )【實驗目的】1.了解用逆轉錄PCR 法獲取目的基因的原理。2.學習和掌握逆轉錄PCR 的技術和方法。【實驗原理】聚合酶鏈式反應(PCR)過程利用模板變性,引物退火和引物延伸的多個循環來擴增DNA序列。因為上一輪的擴增產物

    盤點:分子診斷常用技術50年的沿革與進步

      一、基于分子雜交的分子診斷技術  上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了

    RNA提取和RT-PCR

    真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟

    分子標記

    內容:一、遺傳標記 二、DNA分子標記 三、染色體原位雜交 四、DNA分子標記的應用 長期以來,植物育種中選擇都是基于植株的表型性狀進行的,當性狀的遺傳基礎較為簡單或即使較為復雜但表現加性基因遺傳效應時,表型選擇是有效的。但水稻的許多重要農藝性狀為數量性狀,如

    PCR儀的用途及使用方法

     PCR的用途及使用方法真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉

    PCR儀的用途及使用方法

    PCR儀的用途及使用方法真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼

    利用核苷酸交換和剪切技術進行DNA碎裂和定向進化實驗

    利用 DNA 混編模仿自然進化過程是優化 DNA 和蛋白質性質的常用方法。這里我們介紹這類方法的一個新進展,即利用標準的聚合酶鏈反應(PCR)放大基因文庫時與其他 4 種標準 dNTP—起摻入 dUTP 作為確定 DNA 碎裂位點的交換核苷酸。本實驗來源「現代蛋白質工程實驗指南」〔德〕K.M.阿恩特

    高通量測序技術的原理及各平臺優勢和實踐應用的分析

      隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以

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      隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以

    NGS檢測試劑生產應獲得《醫療器械生產許可證》

      為加強第二代測序技術檢測試劑的規范和指導,進一步保證和提高相關產品的質量,8月8日,中國食品藥品檢定研究院(中檢院)組織制定了《第二代測序技術檢測試劑質量評價通用技術指導原則》(下稱《指導原則》)。  該文件是中檢院發布的首個質量評價技術指導原則,旨在對產品設計、研發及驗證的各關鍵環節進行規范,

    中檢院發布二代測序試劑質量評價通用原則

      一.前言  本指導原則主要針對第二代測序(next generation sequencing,NGS)技術檢測試劑(以下簡稱“NGS檢測試劑”)產品質量提出指導性要求,涉及基本原則、主要原材料、檢測流程及性能評價等方面。  本指導原則是對企業和檢驗人員的指導性文件,但不包括注冊審批所涉及的行政

    RNAi相關術語

    1.RNAi :(RNA interference)RNA干擾一些小的雙鏈RNA可以高效、特異的阻斷體內特定基因表達,促使mRNA降解,誘使細胞表現出特定基因缺失的表型,稱為RNA干擾(RNA interference,RNAi ,也譯作RNA干預或者干涉)。它也是體內抵御外在感

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