DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
科技日報北京3月18日電 英國《自然》雜志近日在線發表了一項癌癥研究成果，歐洲科學家研發了一種全新機器學習程序，通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”技術可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤，對于癌癥的治療至關重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。 為了解決這個問題，德國癌癥研究中心科學家斯蒂凡·普菲斯特及其同事開發了一個機器學習程序，它可以對甲基化數據進行分類。甲基化是甲基分子附著到DNA上從而改變DNA內信息可用性的過程。這個過程不僅會自然發生在細胞功能正常發揮期間，使每個細胞獲得一個特有的“甲基化指紋”，它也會發生在疾病（如癌癥）中。因此，甲基化可以揭示有關腫瘤類型的信息，“告訴”人們這些腫瘤由什么類型的細胞形成。 研究團隊開發出來的程序經過訓練后，可以使用“甲基化指紋”鑒定91種腫瘤。訓練采用的參照數據，來自約2800名癌癥患者。研究人員在1104例已經經過人工......閱讀全文
DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
? 英國《自然》雜志近日在線發表了一項癌癥研究成果，歐洲科學家研發了一種全新機器學習程序，通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”技術可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤，對于癌癥的治療至關重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。 為了解決這個問題，德國癌癥研
DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
科技日報北京3月18日電 英國《自然》雜志近日在線發表了一項癌癥研究成果，歐洲科學家研發了一種全新機器學習程序，通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”技術可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤，對于癌癥的治療至關重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。
DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
英國《自然》雜志近日在線發表了一項癌癥研究成果，歐洲科學家研發了一種全新機器學習程序，通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”技術可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤，對于癌癥的治療至關重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。 為了解決這個問題，德
－DNA甲基化：癌癥共有的“指紋”
8月26日在線發表在Genome Medicine上的一篇文章中，研究人員說他們發現了多種癌癥中都存在的普遍特異性變化，DNA甲基化標記，它們幫助控制基因的開、關以及最終細胞的行為。這種DNA上可逆的化學標記就是表觀遺傳學。 約翰霍普金斯醫學院的Andrew Feinber
DNA－指紋的概念高變區DNA與DNA指紋
人的衛星DNA?或稱隨體DNA?是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重復所構成的。重復片段的組成和拷貝數在不同的個體及基因組的不同位置上不一樣。提取不同個體的基因組DNA 后，用其切點能識別序列為4 個堿基而又不切割該重復片段的限制性內切酶在重復片段的兩側切割基因組DNA ，然后將樣品進行
DNA指紋法
DNA Fingerprinting?(David F. Betsch)the theory, procedures and applications??·?????????DNA Fingerprinting (Polyarylamide Gel) (Caltech)BAC DNA sample
Nature:甲基化指紋技術有助于改善腦腫瘤的診斷
根據近日在線發表于《自然》的一項研究，研究DNA甲基化數據可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤對于癌癥的治療至關重要。但在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。為解決這個問題，海德堡德國癌癥研究中心的Stefan Pfister及同事開發了一個機器學習程序，它可以對甲基
科學家發現DNA甲基化物可用于腫瘤的敏感檢測和分類鑒定
近日，加拿大大學健康網絡公司和多倫多大學等科學家在Nature雜志上發表了題為“Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes”的文章，報道了一種基于免疫沉淀的可以敏感地檢測低
日本確認移植角膜內皮細胞安全有效
英國《自然》雜志近日在線發表了一項癌癥研究成果，歐洲科學家研發了一種全新機器學習程序，通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”技術可以改善腦腫瘤的診斷。 正確診斷腫瘤，對于癌癥的治療至關重要。但是，在已知的約100種腫瘤中，中樞神經系統腫瘤尤其難以準確鑒定出來。 為了解決這個問題，德
甲基化試驗有助于區分原發腫瘤類型
未知性癌癥（CUP）在轉移性腫瘤患者中占比10%，然而這些癌癥的原發腫瘤位置通常無法確定。由于無法分辨究竟是哪種腫瘤類型，這些患者的生存率很低。 “傳統方法只能鑒定30%不明病灶的轉移性腫瘤的原發腫瘤位置，一些分子生物學方法可以提高這一比例，但往往造價昂貴，并且，所使用的RNA樣本比較脆弱容易
DNA甲基化在腫瘤發生中的作用
越來越多的研究表明，在腫瘤形成過程中包含兩大類機制。一個是通過DNA核苷酸序列改變而形成突變，即遺傳學機制。腫瘤作為一種遺傳學疾病在分子生物學領域已經得到證實。另外一個就是表觀遺傳學(epigenetics)機制，即不依賴DNA序列改變導致基因表達水平的變化，它在腫瘤形成過程中的作用越來越受到重視。
DNA指紋的技術原理
DNA指紋的圖像在X光膠片中呈一系列條紋，很像商品上的條形碼。各種分析方法均以DNA的多態性為基礎，產生具有高度個體特異性的DNA指紋圖譜，由于DNA指紋圖譜具有高度的變異性和穩定的遺傳性，且仍按簡單的孟德爾方式遺傳，成為最具吸引力的遺傳標記。DNA指紋圖譜，開創了檢測DNA多態性（生物的不同個體或
DNA指紋的發現歷史
1984年10月星期一，上午9:05分，英國萊斯特大學年輕的生物學家亞歷克·杰弗里斯（Alec Jeffreys）在做實驗時出現了靈光一現的時刻。他發現了每個人的DNA是不同的。盡管人與人之間的DNA的空間結構差異不大，但在DNA序列的某些區域，存在一些會重復的序列，而每個人重復的次數是不同的。
DNA指紋的基本介紹
DNA指紋指具有完全個體特異的DNA多態性，其個體識別能力足以與手指指紋相媲美，因而得名。可用來進行個人識別及親子鑒定，同人體核DNA的酶切片段雜交，獲得了由多個位點上的等位基因組成的長度不等的雜交帶圖紋，這種圖紋極少有兩個人完全相同，故稱為"DNA指紋"。
DNA指紋圖譜分析[DNA－Fingerprinting－]
一. 實驗目的1. 掌握DNA指紋圖譜技術的概念、原理和基本操作過程2. 學習DNA的限制性酶切的基本技術3. 掌握瓊脂糖凝膠電泳的基本操作技術，學習利用瓊脂糖凝膠電泳測定DNA片段的長度，并能對實驗結果進行分析。二. 實驗原理1984年英國萊斯特大學的遺傳學家Jefferys及其合作者首次將分離的
甲基化干擾法鑒定與蛋白結合的DNA位點
放射性標記DNA探針的制備l??????聚丙烯酰胺凝膠的制備1．按照（三）中操作流程灌制非變性聚丙烯酰胺凝膠。將10×TBE稀釋成0.5×的工作濃度。聚丙烯酰胺的工作濃度取決于待測DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝膠，小于100bp的片段應灌制6～8％的凝膠。?l??????DN
DNA指紋的操作方法
從生物樣品中提取DNA（DNA一般都有部分的降解），可運用PCR技術擴增出高可變位點（如VNTR系統，串聯重復的小衛星DNA等）或者完整的基因組DNA，然后將擴增出的用DNA酶切成DNA片斷，經瓊脂糖凝膠電泳，按分子量大小分離后，轉移至尼龍濾膜上，然后將已標記的小衛星DNA探針與膜上具有互補堿基序列
DNA指紋的主要特點
1．高度的特異性：研究表明，兩個隨機個體具有相同DNA圖形的概率僅3×10^-11；如果同時用兩種探針進行比較，兩個個體完全相同的概率小于5×10^-19。全世界人口約50億，即5×10^9。因此，除非是同卵雙生子女，否則幾乎不可能有兩個人的DNA指紋的圖形完全相同。2．穩定的遺傳性：DNA是人的遺
DNA指紋的操作方法
從生物樣品中提取DNA（DNA一般都有部分的降解），可運用PCR技術擴增出高可變位點（如VNTR系統，串聯重復的小衛星DNA等）或者完整的基因組DNA，然后將擴增出的用DNA酶切成DNA片斷，經瓊脂糖凝膠電泳，按分子量大小分離后，轉移至尼龍濾膜上，然后將已標記的小衛星DNA探針與膜上具有互補堿基
高變區DNA與DNA指紋的關系
人的衛星DNA?或稱隨體DNA?是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重復所構成的。重復片段的組成和拷貝數在不同的個體及基因組的不同位置上不一樣。提取不同個體的基因組DNA 后，用其切點能識別序列為4 個堿基而又不切割該重復片段的限制性內切酶在重復片段的兩側切割基因組DNA ，然后將樣品進行
Nature長文報道基于DNA甲基化的中樞神經系統腫瘤分型
腫瘤的正確診斷對于后期治療至關重要。在過去的一個世紀中，CNS腫瘤的分類主要是依據對組織發生的認識，人們可以根據腫瘤與某種起源細胞的相似性和推定的分化水平對其進行分類。一般而言，組織學上的特征主要取決于顯微鏡下蘇木精-伊紅染色特征、相關蛋白的免疫組織化學表達以及超微結構的特點【1】。 2016
“好奇”號首次成功鑒定火星“礦物指紋”
美國航天局(NASA)宣布，火星漫游車“好奇”號已經完成了對火星土壤礦物學的初期實驗。結果顯示，火星土壤和美國夏威夷火山源周圍的風化玄武巖土壤相似。 “好奇”號于美國東部時間8月6日在火星蓋爾隕石坑中心山脈的山腳下成功著陸，不久前才取得了火星土壤樣本，本次是首次對該樣本進行礦物學鑒定。印第
微生物鑒定方法代謝指紋法
目前常見的微生物鑒定原理有以下幾種：1. 酸堿反應：細菌代謝碳水化合物，一般產生酸性物質；分解蛋白質或氨基酸，則產生堿性物質，根據不同細菌的理化性質不同，測定細菌的分解底物導致PH值變化而產生的不同顏色，來判斷菌種。2. 酶譜分析：根據細菌生長產生酶的特性，在測定底物中加入基質。使其與細菌生長過程中
快速指紋鑒定食品中的香精成分
目的 使用一種無需進行樣本萃取、過濾、稀釋和色譜分離的簡單而快速的技術對食品中的香精成分進行成功鑒定。 背景 對包括嗅覺、味覺和口感在內的各種感官有吸引作用的香精是促成食品成功銷售的最重要因素之一。每個食品制造商都創造并保持自己的風味特征，從而與競爭者的產品區別開來。不同食品中
微生物鑒定方法代謝指紋法
目前常見的微生物鑒定原理有以下幾種：1. 酸堿反應：細菌代謝碳水化合物，一般產生酸性物質；分解蛋白質或氨基酸，則產生堿性物質，根據不同細菌的理化性質不同，測定細菌的分解底物導致PH值變化而產生的不同顏色，來判斷菌種。2. 酶譜分析：根據細菌生長產生酶的特性，在測定底物中加入基質。使其與細菌生長過程中
微生物鑒定方法——代謝指紋法
目前常見的微生物鑒定原理有以下幾種：1. 酸堿反應：細菌代謝碳水化合物，一般產生酸性物質；分解蛋白質或氨基酸，則產生堿性物質，根據不同細菌的理化性質不同，測定細菌的分解底物導致PH值變化而產生的不同顏色，來判斷菌種。2. 酶譜分析：根據細菌生長產生酶的特性，在測定底物中加入基質。使其與細菌生長過程中
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測，并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有：GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
分子生態學詞匯?DNA指紋
DNA指紋指具有完全個體特異的DNA多態性，其個體識別能力足以與手指指紋相媲美，因而得名。可用來進行個人識別及親子鑒定，同人體核DNA的酶切片段雜交，獲得了由多個位點上的等位基因組成的長度不等的雜交帶圖紋，這種圖紋極少有兩個人完全相同，故稱為"DNA指紋"。
關于DNA指紋的技術原理介紹
DNA指紋的圖像在X光膠片中呈一系列條紋，很像商品上的條形碼。各種分析方法均以DNA的多態性為基礎，產生具有高度個體特異性的DNA指紋圖譜，由于DNA指紋圖譜具有高度的變異性和穩定的遺傳性，且仍按簡單的孟德爾方式遺傳，成為最具吸引力的遺傳標記。 DNA指紋圖譜，開創了檢測DNA多態性（生物的不