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1.Pathway功能分析及顯著性判斷 對差異表達基因進行Pathway功能分析，并計算Pvalue進行顯著性判斷，Pvalue越小，表明該pathway變化越顯著，并可對每條Pathway通路圖進行展示，同時在相應的位置標注差異表達基因。 2.Pathway中基因相關性分析 根據每兩個基因共出現在同一pathway中的次數統計，繪制基因共相關點線圖，進而得到不同pathway上基因的關聯情況。在分析工具上點擊“celldifferentiation”，在“TermInformation”中描述了細胞分化術語的基本信息，包括樹形及與父結點、子節點關系。 對于未知基因名的序列，可以用序列直接檢索GO數據庫。點擊AmiGO首頁上方的“BLAST”，進入檢索界面。在檢索框輸入氨基酸或核酸序列或上傳序列文件，檢索工具能自動識別并相應地選擇BLASTP或BLASTX來與數據庫中的序列進行比對。以大腸桿菌DNA聚合酶Ⅱ基因polB為......閱讀全文
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
“核心刊物”迎來了新期刊：科學通報，中國科學C輯:生命科學，這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的，我國學術期刊中的知名品牌，被國內外各主要檢索系統收錄，如國內的《中國科學論文與引文數據庫》（CSTPCD）、《中國科學引文數據庫》（CSCD）等；美國的SCI、CA、EI，英
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體，是胚珠經過受精以后形成的結構，在植物生命周期中處于關鍵位置。種子主要由種皮、胚和胚乳組成。其中胚乳是大多數開花植物雙受精后產生的組織，一般為三倍體（每個細胞核有三套染色體），胚乳中含有豐富的營養物質，是人類消耗熱量的主要來源。 基因組印跡是一種表觀遺傳基因
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基因型-表型關系仍
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基
伯豪客戶利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝 對于很多小伙伴們，特別是醫院的工作人員，除了每天繁忙的門診工作之外，還需要擠出時間來做科研，發文章。這真是一件又苦又累又燒腦筋的工作。有沒有辦法即簡單，又快速地發表還可以的影響因子（3分以上）的文章呢？小編告訴您，是可以的。那么，需要滿足哪幾
lncRNA芯片應用于通過脂肪肝模型中分子特異性表達研究非酒精性脂肪肝發生機制利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝對于很多小伙伴們，特別是醫院的工作人員，除了每天繁忙的門診工作之外，還需要擠出時間來做科研，發文章。這真是一件又苦又累又燒腦筋的工作。有沒有辦法即簡單，又快速地發表還可以的影響因子（3
重度抑郁癥(major depressive disorder, MDD)是一種環境與遺傳因素共同作用導致多個基因功能失調的復雜疾病, 近期來自西南大學認知與人格教育部重點實驗室的研究人員采用多腦區以及基因集合的分析模式, 搜集了前人研究中13個來源于不同腦區的、包含患者與對照組腦轉錄組數據的數
2008年12月 作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一，測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術，基因序列就無法確定，酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起，生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank；
在血液中循環的細胞具有多種功能，在成年人機體中，其來自于骨髓中的祖細胞，祖細胞中DNA序列的突變會引發血細胞發育的改變，有時候會導致癌癥發生；由于技術限制，科學家們在闡明祖細胞突變對血細胞發育的影響上面對一定的挑戰，近日，研究者Nam等人在Nature雜志上發表文章指出，他們開發了一種新方法能夠
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一，受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱，Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的，是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
自2006年在全世界第一個實現單細胞全基因組測序，華人科學家張鹍教授在單細胞測序領域的研究一直處于全球領先地位。2018年11月，張鹍教授團隊因在單細胞研究領域的杰出貢獻，榮獲美國國立衛生研究院（NIH）兩項共計1400萬美元的研究基金，用于構建單細胞水平的人體器官3D圖譜，推動精準醫學進入單細
1. 神經母細胞瘤eccDNA整體統計研究人員聯合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服務）技術，與開創性的生物信息學算法相結合，首次在神經母細胞瘤（一種主要發生在兒童的致命腫瘤）中進行詳細的環狀DNA序列分析。本研究中分析了93名兒童的神經母細胞瘤組織樣本，結果顯示，每個
野生大豆（Glycine soja）是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通
野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代
野生大豆（Glycine soja）是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通量測
肺癌是我國也是世界上發病率和死亡率最高的惡性腫瘤【1】，五年存活率不足20%【2】。肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小細胞肺癌中最普遍存在的分型，大約占所有惡性肺腫瘤的一半【3】。LUAD最普遍的風險因素是吸煙，其他的風險還包括暴露在致癌物以及戶外空氣污染等等【4
基因表達過程依賴于轉錄因子、染色質調控因子和染色質等生物大分子在布朗運動過程中的隨機碰撞，因此，即使是基因型和分化類型完全相同的細胞在相同環境下也存在基因表達的差異，被稱為基因表達噪音。研究基因表達噪音，對研究干細胞增殖分化、個體發育、病原菌的抗藥性以及農作物的穩產有著重要的意義，而其在人類早期
中國科學院生態環境研究中心環境化學與生態毒理學國家重點實驗室汪海林研究組在維生素C(Vc)與DNA甲基化調控的研究上取得重要進展。他們發現 Vc可顯著增強DNA羥化酶Tet(ten eleven translocation)氧化5-甲基胞嘧啶的活性，進而促進DNA去甲基化作用。其相關研究
導 讀 基于質譜的蛋白質組學使得對阿爾茨海默癥(AD)的蛋白質組和蛋白質翻譯后修飾(PTM)的深入剖析成為可能。在這里，我們回顧了AD蛋白質組學研究的歷史和近期的進展以及局限。作為遺傳圖譜的補充，蛋白質組學研究不僅驗證了典型的淀粉樣蛋白和tau通路，而且還發現了蛋白質網絡中的新組成部分，如RN
前言：近年來，異常RNA修飾與腫瘤發生的關系引起了廣泛關注。作為一種廣泛存在的修飾，DNA和RNA中的5-甲基胞嘧啶(m5C)已被發現數十年。DNA m5C修飾在腫瘤發生中的作用已被廣泛研究。然而，關于RNA m5C修飾在腫瘤發生中的作用知之甚少。NSUN2是哺乳動物中主要的m5C修飾甲基轉
2019年10月21日，北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院白凡課題組與美國亞利桑那大學姚廣課題組合作在《美國國家科學院院刊》（PNAS）上發表題為“Graded regulation of cellular quiescence depth between prolife
結直腸癌在全球范圍內是發病率第三、致死人數第四的惡性腫瘤（Beattie et al., 2005）（Carey, 2017； Church, 2016）。結直腸腺瘤是結直腸癌的癌前病變，根據組織學形態可以分為低級別腺瘤和高級別腺瘤，從低級別腺瘤到腺癌的序列發生需要10年以上時間。因此，深入解析
基因型的環境交互(genotype by environment interaction, GEI)對研究復雜的生物性狀是必不可少的。然而，對人類而言，由于環境數據采集的困難以及環境影響效果弱，難以鑒定GEI效應相關的基因型。近日，來自昆士蘭大學的研究人員通過對大量樣本的分析推導出基因型和表型
2018年4月10日《PNAS》雜志在線發表了朱冰課題組的研究論文“Roles of the CSE1L-mediated nuclear import pathway in epigenetic silencing”。該研究發現CSE1L作為細胞中經典入核轉運途徑中的重要蛋白，是維持部分甲基化
個體化醫療正越來越受到臨床醫學界的重視，而生物標志物是實施個體化醫療的基礎。生物標志物(Biomarker)是近年來隨著免疫學、分子生物學和基因組學技術的發展而提出的一類與細胞生長、增殖、疾病發生等有關的標志物；能反映正常生理過程或病理過程或對治療干預的藥物反應，在早期診斷、疾病預防、藥物靶點確
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列比較已經開始