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    糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究中獲進展

    堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換,當前,有三類堿基編輯器被廣泛應用,包括胞嘧啶堿基編輯器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤堿基編輯器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶堿基編輯器(glycosylase base editor,GBE)。 2020年,中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物技術研究團隊與研究員張學禮帶領的微生物代謝工程團隊開發出GBE,可實現胞嘧啶到鳥嘌呤的堿基顛換,具有糾正3000多個已知致病單核苷酸變異(single nucleotide polymorphism,SNP)的潛力,這或為主要的遺傳疾病如abca4相關性視網膜疾病和X-linked視網膜色素變性等提供治療方案。 為評估GBE在多個位點的編輯情況,提高其應用潛力,研究人員運用高通量細胞建模技術,在哺乳動物細胞中進行6400多個基因組靶點的GBE編輯,建立了人工智能AI機......閱讀全文

    新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化

      在一項新的研究中,來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA

    蛋白質糖基化的檢測實驗——酶脫糖基化

    實驗方法原理用酶或化學脫糖基化、通過選擇性標記或通過凝集素親和層析法是檢測蛋白糖基化常用方法。實驗材料蛋白樣品試劑、試劑盒磷酸鈉緩沖液蛋白溶液β-巰基乙醇NP-40 溶液儀器、耗材SDS-PAGE玻璃器皿植物凝集素柱實驗步驟一、用 PNGaseF(N-多糖酶)處理1. 以 0.1 mol/L 磷酸鈉

    多樣化C to T植物堿基編輯器被開發

      近日,電子科技大學張勇教授、馬里蘭大學YiPing Qi博士、揚州大學張韜教授課題組合作于《Plant Biotechnology Journal》發表了題名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur

    Nature Biotechnology:新研究拓寬堿基編輯器的靶向范圍

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas9是由一種原始的細菌免疫系統改編而成的,它的作用方式是首先在基因組的一個靶位點上切割

    研究基于學習算法優化序列特異性的C-to-G單堿基編輯器

      8月12日,Nature Communications發表了題為Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究論文,該研

    全新「堿基編輯器」:不用「切割」也能精準編輯基因

    原標題:不用「切割」也能精準編輯基因了,華人學者開發全新「堿基編輯器」摘要:CRISPR 基因編輯技術之外的新工具。基因編輯技術有了重大進展。Broad 研究所的華人學者 David Liu 教授的團隊開發出了一種「堿基編輯器」,可以讓細胞內 DNA 的一種堿基通過簡單的化學反應,變成另一種

    深度學習算法優化序列特異性的C-to-G單堿基編輯器

      8月12日,Nature Communications發表了題為Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究論文,該研

    新研究開發出靶向能力和編輯效率得到改善的堿基編輯器

      在一項新的研究中,來自美國布羅德研究所、哈佛大學和波士頓兒童醫院的研究人員利用一種稱為“噬菌體輔助的堿基編輯器連續進化(phage assisted continuous evolution of base editors, BE-PACE)”的系統開發出一種改進堿基編輯器的編輯效率的新方法。相

    新型“堿基編輯器”有助治療遺傳疾病

      一個美國團隊25日在英國《自然》雜志發表報告說,它在基因編輯技術方面取得新進展,可通過一種新型“堿基編輯器”在基因中替換堿基,有助科學家增強對遺傳疾病的理解和開發新療法。  基因是脫氧核糖核酸(DNA)上的片段,而DNA雙鏈螺旋結構由4種化學堿基組成,即腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和

    利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型

      6月28日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors

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