泛癌癥T細胞單細胞圖譜相關成果發表
北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-Infiltrating T Cells”的研究論文。結合單細胞基因表達譜和T細胞受體序列，研究者系統地刻畫了腫瘤浸潤性T細胞的異質性和動態性，并系統地比較了癌癥類型之間的異同。 T細胞是最關鍵的抗腫瘤免疫細胞，其中毒性T細胞是殺傷癌細胞的最主要細胞類群。腫瘤浸潤T細胞中含有應答腫瘤抗原的T細胞。然而伴隨著腫瘤發生發展過程，這些T細胞往往分化為功能失調狀態，即T細胞耗竭。調節腫瘤浸潤T細胞的治療方法已經取得了顯著的臨床效果，但在不同癌癥類型之間差異很大。越來越多的證據表明不同癌種的腫瘤微環境對塑造T細胞的組成和狀態發揮著重要作用。單......閱讀全文
泛癌癥T細胞單細胞圖譜－相關成果發表
北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
中國科學家發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
T細胞單細胞圖譜的研究框架和主要發現。（張澤民供圖） 12月17日，北京大學生物醫學前沿創新中心教授張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在《科學》上發表了泛癌癥T細胞圖譜。結合基因表達譜和T細胞受體序列，研究者系統刻畫了腫瘤浸潤性T細胞的異質性和動態變化，并系
《科學》：北大團隊發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天，《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果，研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法，完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜，揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況，鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系，為
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天，《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果，研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法，完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜，揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況，鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系，為
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天，《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果，研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法，完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜，揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況，鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系，為肺
Science：構建腫瘤浸潤T細胞的泛癌單細胞圖譜
靶向腫瘤特異性T細胞的癌癥免疫療法已使許多癌癥患者受益，但是針對不同類型的癌癥的臨床療效差異很大。腫瘤浸潤T細胞經常進入功能失調狀態，這一現象被廣泛稱為T細胞衰竭（T cell exhaustion），而效應T細胞的抗腫瘤功能受多種因素調節，包括調節性T細胞（Treg細胞）的存在。T細胞的狀態和
《細胞》：單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了來自一個成人男子91個
《自然》發布重要單細胞RNA圖譜：首張小腸細胞圖譜
我們腸道上皮是人體內多樣性最高，最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一，組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能，還有影響它的疾病，麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞，完成了一
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
PNAS：單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表文章，介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法，他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型，并確定神經元的亞型。他們還觀察了
2016值得關注的技術：綜合單細胞圖譜
《Nature Methods》盤點2015年度技術，選出了最受關注的技術成果：單粒子低溫電子顯微鏡（cryo-EM）技術。 除此之外，也整理出了2016年最值得關注的幾項技術，分別為：細胞內蛋白標記（Protein labeling in cells）、細胞核結構（Unraveling nuc
Cell：單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明，單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群，并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術
單細胞分析揭示癌癥異質性
2013年度基因組生物學大會(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美國紐約冷泉港實驗室召開。這是基因組學領域最大的會議之一，吸引了多個著名研究所的大牛參加。會議主題包括高通量基因組學和遺傳學、復雜性狀的遺傳學、功能和癌癥基因組學、計算基因組學、進化基因組學以
Nature：單細胞分析力撐癌癥干細胞理論
麻省總醫院MGH、Broad研究所的研究人員在單細胞水平上對腦瘤進行基因組分析，首次在人類腦瘤樣本中鑒定到了癌癥干細胞及其分化后代。這項重要的研究成果十一月二日發表在Nature雜志上。少突膠質細胞瘤是一種生長緩慢但無法治愈的腦瘤。“我們提出了強有力的證據，證明癌癥干細胞是少突膠質細胞瘤的主要生長源
單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化，給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說，結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤，在某些情況下，會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展，但只有少數人從免疫治療中獲益，原因尚不清楚。 免
人類胸腺單細胞圖譜助力腫瘤免疫治療
胸腺是T細胞的分化、發育和成熟的場所，是組成免疫系統的重要器官。到目前為止，還不清楚在整個生命過程中，人體胸腺中的早期免疫前體細胞如何發育為T細胞。盡管已通過各種動物模型對胸腺進行了廣泛的研究，但是還未有詳細的人類胸腺細胞圖譜得以報道。 由來自VIB炎癥研究中心（VIB Center for
迄今最完整胚胎發育單細胞圖譜發布
科技日報北京8月4日電 （實習記者張佳欣）科學家以果蠅為模型生物，構建了迄今為止最完整、最詳細的動物胚胎發育單細胞圖譜。這一發表在最新一期《科學》雜志上的成果，利用了來自100多萬個各個發育階段的胚胎細胞數據，代表了多個層面的重大進步，有助于科學家探索突變如何導致不同的發育缺陷，以及了解人類基
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”，不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性，可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中，每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性，腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式（即“代謝重編程”）來適應不同的微環境，以滿足其對能量
Nature子刊：癌癥單細胞測序新技術
只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫，你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點，從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似，生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜，然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。 發布在7月22日《自然生物技術》(
新型單細胞測序方法可有效追蹤癌癥免疫細胞
澳大利亞加文醫學研究所的科學家開發了一種新的單細胞測序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），該方法兼備高通量、靶向、長讀長和單細胞測序特征，能夠高準確度和靈敏度的識別全長抗原受體序列，追蹤與癌癥免疫反應相關的免疫細胞。7
單細胞水平揭示造血干細胞擴增的動態圖譜
造血干細胞具有自我更新和分化的生物學特征，既可以維持其自身在造血組織中的恒定數量，又能向紅系、粒系、巨核系和淋巴系等多種血細胞分化。造血干細胞移植廣泛應用于白血病、再生障礙性貧血、骨髓增生異常綜合征等臨床血液系統惡性腫瘤的治療，然而，造血干細胞來源不足，限制其廣泛應用。因此，如何模擬體內造血干細
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
獼猴大腦皮層單細胞空間分布圖譜發布
由860億個神經元組成的人類大腦，就像一座結構精巧的迷宮。為了繪制出這座迷宮的地圖，腦科學家們將目光聚焦在獼猴——這種與人類最接近的靈長類模式動物上，它的大腦包含超過60億個神經元。 7月12日23時，由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）聯合華大生命科學研究院、臨港實驗室
獼猴大腦皮層單細胞空間分布圖譜發布
由860億個神經元組成的人類大腦，就像一座結構精巧的迷宮。為了繪制出這座迷宮的地圖，腦科學家們將目光聚焦在獼猴——這種與人類最接近的靈長類模式動物上，它的大腦包含超過60億個神經元。 7月12日23時，由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）聯合華大生命科學研究院、臨港實驗室
Nature－immunoloy：新冠肺炎患者的單細胞免疫圖譜
研究人員應用單細胞測序技術全面揭示了輕中型、重型新冠肺炎患者及其從發病期到康復期機體整體免疫學變化特征、機制和規律。 今年年初，新冠肺炎疫情在世界范圍內快速暴發。根據世界衛生組織最新統計數據顯示，截止到2020年8月11日，新冠肺炎在全球已導致累計近2000萬確診病例和超過73萬死亡病例，平
Cell：繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被