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    測序“垃圾”數據變身寶藏

    基因組測序中曾經被視為是垃圾的數據,現在能夠用來為人們提供重要的疾病線索。St. Jude兒童研究醫院——華盛頓大學兒童癌癥基因組項目的研究人員獨辟蹊徑,在染色體末端DNA重復片段的測序數據中,挖掘到了寶貴的癌癥信息。 染色體末端的DNA重復片段被稱為端粒,此前這種重復片段往往在二代測序研究中被忽視。這是由于二代測序技術難以定位重復片段,為此這類數據常被研究者們視為垃圾。但現在,St. Jude兒童研究醫院的研究人員發現,端粒DNA量的改變與特定癌癥之間存在著關聯,文章發表在最近一期的Genome Biology雜志上。 機體中端粒DNA序列是不變的,但其重復的次數卻是不同的,這直接關系到端粒的長度,而端粒長度限制了細胞分裂的次數。端粒隨著細胞分裂逐漸縮短,直到細胞停止分裂。不過癌細胞能夠繞過端粒的縮短機制持續進行分裂,端粒的維持和延長也是癌細胞不斷分裂增值的標志。 超值的BioTek微孔板檢測儀,......閱讀全文

    什么是支持基因測序發現DNA生命奧秘的源源動力?

      基因檢測是利用科技手段,對基于個體基因、分子、細胞等進行檢測,通過海量生物信息學數據的精準分析,為醫療機構提供疾病診斷的依據,從而在此基礎上為病人提供個性化治療服務;此外,也可以用于疾病風險的預測,還能正確選擇藥物,避免藥物濫用和藥物不良反應。目前,基因檢測在疾病風險預測、臨床診斷輔助、癌癥早篩

    基因測序:如何破解“算的沒有測的快”

       在基因組學研究中,高通量測序是最重要的數據來源。然而,高通量測序技術的飛速發展,在給基因組學研究帶來極大便利的同時,也帶來了“幸福的煩惱”:單次測序數據量的大幅度提升,使得基因組學研究從原來的“測的沒有算的快”,變為如今的“算的沒有測的快”。  厚度超百米的生命天書  基因組的數量非常大。一個

    基因測序前景:上游市場增速放緩 中下游市場潛力巨大

      基因測序服務市場增速快,預計2016年超過測序儀器市場。據Markets&Markets預測,2014-2020年上游市場中測序儀的復合增長率是15.4%。中游測序服務市場重資產、技術附加值低,將是產業鏈中增速最快的,據BCC Research預測2011-2016年復合增長率為29%。

    基因芯片與RNA-seq的比較分析

    基因芯片 vs RNA-seq哪個好 ?最近幾年二代測序(又叫NGS)很火,而且價格越來越便宜,原來都用芯片檢測mRNA、miRNA、LncRNA表達量的,好像不少都換用RNA-seq了。那么,到底選擇哪種更好呢?今天就來回答下這個問題。一句話—— 看研究目的。常見誤區一:測序的準確性高,

    基因芯片與RNA-seq的比較分析

    <p>  最近幾年二代測序(又叫NGS)很火,而且價格越來越便宜,原來都用芯片檢測mRNA、miRNA、LncRNA表達量的,好像不少都換用RNA-seq了。那么,到底選擇哪種更好呢?今天就來回答下這個問題。一句話—— 看研究目的。</p><p>  常見誤區一:&

    納米孔測序重大升級,超高準確度,向臨床診斷邁進!

    近年來,第三代基因測序技術發展迅速,在基因組學研究以及臨床疾病診斷領域備受青睞。該領域上游企業英國Oxford Nanopore Technologies(以下簡稱“ONT”)因其測序技術在樣本處理以及成本等方面占據較大優勢,而受到國內基因測序服務企業的鐘愛。相較于二代測序,三代測序技術擁有單分子無

    華大基因上市啟程!基因測序行業迎來風口

      基因測序能夠提前發現疾病或者找出更多病因的本原,有助于提前診斷或準確診斷,從而預防和治療疾病。此外,基因測序技術突飛猛進,檢測成本大幅下降,已進入商業化階段,對傳統治療方式的改進,使得基因測序未來市場空間廣闊。  增長預期強烈  數據顯示,全球基因測序市場規模已經從2007年的7.94億美元增長

    Geneformics聯手明碼生物科技為全球基因組學大數據“瘦身”

      美國加州森尼韋爾市,2017年2月14日——Geneformics數據系統有限公司(以下簡稱“Geneformics”)宣布攜手藥明康德集團企業明碼(上海)生物科技有限公司(以下簡稱“明碼生物科技”),正式將Geneformics世界領先的基因測序數據技術融入到明碼生物科技的工作流程。Genef

    中國學者發文,介紹三代測序數據計算方法的突破

      9月18日,中山大學中山眼科中心謝志、肖傳樂、謝尚潛,中山大學數據科學與計算機學院陳穎,湖南農業大學羅峰等學者合作在 Nature Methods 雜志上發表了三代基因組測序數據計算方法,解決了該領域的關鍵技術難題。  這一項目負責人謝志教授和主要完成人肖傳樂副研究員表示:以 PacBio 和

    花生轉錄組denovo測序揭示果針發育相關的功能基因

      近日,由廣東省農業科學院作物研究所梁炫強研究員、陳小平博士,山東省農業科學院花生研究所所長禹山林研究員及國際半干旱熱帶作物研究所(ICRISAT)基因組中心負責人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生轉錄組de novo測序的結果發表于Plant Biotechnology

    華大基因測序近700種植物的基因組

       近日,華大基因的研究人員對云南瑞麗植物園內部及周邊近700種植物的基因組進行了測序和分析。這項工作有助于推動地球生物基因組計劃(EBP)以及萬種植物基因組計劃(10KP)。  在華大基因研究院副院長劉心的領導下,研究團隊收集了761個植物樣本,并產生了54 Tb的測序數據,每個物種的平均測序深

    基因測序描繪個體化醫療產業圖譜

      隨著高通量測序技術的引入和“大數據”處理能力的提高,現代醫學正在經歷巨大的變革,由傳統標準化醫療模式向個體化醫療模式轉變。而人類基因組計劃和DNA元素百科全書計劃的完成及腫瘤基因圖譜的繪制,也為“量體裁藥”式的個體化醫療提供了有力工具,醫學領域面臨新的機遇。不過,業內人士表示,盡管市場空間可觀,

    1132.2萬!浙江大學采購高通量基因測序儀、LC-MS/MS等

      分析測試百科網訊 近日,浙江大學高通量基因測序儀、液相色譜串聯三重四級桿質譜儀項目公開招標,此次采購預算金額1132.2萬元(人民幣)。招標詳情如下:  項目名稱:浙江大學高通量基因測序儀、液相色譜串聯三重四級桿質譜儀項目  項目編號:ZUPC-GK-HW-2019033  投標截止時間:201

    Nature對兒童癌癥基因組分析,有望實現兒童癌癥精準治療

      在一項新的研究中,來自美國圣猶大兒童研究醫院等研究機構的研究人員證實患有癌癥的兒童和成年人通常具有不同的發生突變的基因來促進疾病產生,這提示著這些患者可能受益于不同的療法。這一發現強調了對兒童癌癥進行精準醫療的必要性。相關研究結果于2018年2月28日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“P

    賽默飛Ion S5首批數據公布,玩爆前任PGM?系列

      北美時間9月1日,賽默飛發布了兩款最新的NGS系統Ion S5 和Ion S5XL,旨在提供更加簡捷的靶向測序流程。10月29日Ion S5測序儀的首批實驗數據產生于阜外醫院。阜外醫院研究人員選用了主動脈基因疾病組合測序,該基因組合包括15個與主動脈疾病相關的致病疾病,研究人員通過文庫構建——模

    未來幾年全球基因測序市場仍快速增長

            基因測序(DNA測序)產業近些年得到迅猛發展。來自BBCresearch的數據顯示,全球基因測序市場總量從2007年的794.1萬美元增長至2013年的45億美元,預計未來幾年全球市場仍將繼續保持快速增長,2018

    基因測序:數據處理與標準問題仍待解

      【導讀】目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測序行業良莠不齊。這種情況,亟須得到改變。  目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測

    綜述:全基因組時代基因連鎖分析的原則、方法和應用

      許多年來,連鎖分析(linkage analysis)都是對孟德爾疾病和具有家族聚集傾向的復雜性狀進行遺傳作圖(genetic mapping)的主要工具。而近幾年來,隨著研究焦點向常見變異(common variants)的轉移,全基因組關聯研究(genome-wide association

    2020年全球及中國基因測序行業市場分析和前景預測

    1、中國乃至全球基因測序市場規模都在不斷增加從全球的范圍來看,目前測序市場規模增長最快的是亞洲市場,其中中國和印度的市場增長率均超過了20%,是全球增長最快的國家。據有關數據顯示,2018年全球基因測序市場規模達到102.0億美元,其中中國基因測序產業規模達到92.0億元,如果按照美元比人民幣1:7

    專家指南:如何開展基因表達研究(二)

      Q2:您采取哪些質量控制步驟?   Gary Hardiman(加州大學圣地亞哥分校)   對于涉及RNA的應用,利用安捷倫的生物分析儀或類似產品對RNA樣品進行質量控制是必需的,可確保RNA是完整的,沒有降解。對于芯片,cRNA 的生物分析儀分析也很有用,可確保雜交之前均一的轉錄本擴增

    專訪中國醫學科學院腫瘤醫院林東昕院士

      近年來在精準醫療領域的研究和投資熱度不減。尤其是針對癌癥的早期診斷技術的開發如基因篩查等開始受到廣泛的關注,吸引了越來越多的研究者投身其中。對于各類癌癥發生的分子機制以及易感基因的研究則是這項技術的關鍵環節。  中國醫學科學院腫瘤醫院病因及癌變研究室主任林東昕院士是腫瘤病因學領域的資深

    無創產前篩查(NIPT)全球市場格局

      隨著高通量測序市場持續火爆,其重要應用無創產前篩查越來越受到市場的追捧。我國監管部門也采用積極的舉措來規范整個市場,今年2月份中國食品藥品監督管理總局、國家衛生計生委聯合發布《關于加強臨床使用基因測序相關產品和技術管理的通知》叫停基因測序臨床應用。然而,僅僅一個月后,國家衛生計生委又發布了《關于

    產前DNA檢測走紅背后的基因江湖

      經歷了2015年的熱捧,2016年的資本小幅理性回歸,2017年上半年的熱潮趨緩后,泛泛的基因測序將無法持續吸引資本的目光,未來行業熱點在于技術突破,或者商業模式的突破。  (做一次全基因檢測,會產生100多G海量數據,其中能被用于科研與臨床應用的,只是蛋白編碼基因與少量的非蛋白編碼基因,占整體

    專訪賽默飛:Ion S5和Ion S5XL系統,未來一切皆有可能

      測序技術的發展經歷了很長的時間,下一代測序(NGS)技術的發展徹底地改變了人類基因組測序的方式。自實現第一個人類基因組測序以來(項目前后耗時十年時間,投入30億美元),隨著技術的發展,測序所需的費用和時間大幅度降低,NGS的發展為臨床診斷開啟了新的窗口。  北美時間9月1日,賽默飛發布了兩款最新

    打破壟斷,推陳出新!華大基因推出超強基因測序儀T7

      最近,華大發布其自主研發的最新超高通量基因測序儀——“MGISEQ-T7”。華大方面表示,基于華大多年來在核心技術上的自主研發與突破,目前的T7是全球日生產能力最強的基因測序儀,堪稱“超級生命計算機”。據了解,基因測序儀是基因測序產業的上游核心,也是基因測序產業鏈上壁壘最高的部分。測序設備依賴進

    長讀長測序顯優勢 基因組復雜結構變異檢測實現新突破

      基因組結構變異是很多癌癥、遺傳病等疾病的重要誘因。目前基于二代測序技術檢測基因組結構變異存在很大的局限性,而三代測序存在錯誤率較高等多種問題,尤其針對復雜結構變異大多軟件識別能力較差。針對這一問題,近日,在Nature Methods發表的一項最新研究中,研究人員開發了基因組比對工具NGMLR和

    無創產前篩查(NIPT)全球市場格局

    隨著高通量測序市場持續火爆,其重要應用無創產前篩查越來越受到市場的追捧。我國監管部門也采用積極的舉措來規范整個市場,今年2月份中國食品藥品監督管理總局、國家衛生計生委聯合發布《關于加強臨床使用基因測序相關產品和技術管理的通知》叫停基因測序臨床應用。然而,僅僅一個月后,國家衛生計生委又發布了《關于開展

    專訪Illumina公司CEO:中國基因檢測服務市場機會巨大

      “我是專程到中國來的,而且這次是帶了整個的管理團隊到中國來。我們的目的是為了更好地了解并且同我們本地的合作伙伴們進行溝通。”2017年3月22日在陰雨綿綿的上海,Illumina公司CEO Francis deSouza上任后首次到訪中國,“如今,中國和美國應該是全球最大的兩個基因市場,對于Il

    震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!

     震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!   隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低,全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源,但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用,使得基因組數據面臨很多問題。  近

    萬元全基因組測序在望 全新分析平臺登場

    今年早期,ABI公司應用SOLiD 3系統領先的寡核苷酸連接和檢測技術對人類基因組進行了測序,費用低于6萬美元。這臺新儀器的技術改進使更高的樣品和數據通量成為可能,從而有望進一步降低基因組測序的費用。例如,更廉價的基因組數據有望加速疾病關聯和生物標志物的發現,從而改善診斷和疾病處理,支持與個人最佳治

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