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  • 位點特異性重組的整合酶和IHF的介紹

    在att上都有特定的結合位點,體外實驗也證明這兩種蛋白質結合在attDNA的特定位點上。每一次重組過程需要20-40個整合酶分子及約70個IHF分子。故可能這兩種蛋白質不僅是作為酶(發揮催化作用),而且在每次重組中都要形成某種復合物結構。通過缺失實驗,證明attP至少要約250bp長,太短將使其功能喪失,而attB則較短,包括核心(core)在內約23bp長即有功能。長250bp的整個attP可繞在整合酶分子的周圍,類似核小體的結構,其中含有約8個整合酶的單體,每個的分子量約為40000。attB和attP中有相同的15bp的核心序列。整合酶與兩個核心都相結合。如果兩個核心中有一個的順序有所改變,則重組的效率將大為降低。但是如果兩個核心序列發生了相同的改變,則順序交換仍能進行。可見整合酶不但要求特異的序列,而且要求兩個核心序列有同源性。 然而,如果λ前病毒受到誘導(induction),則整合作用將被逆轉。此過程稱為切出(......閱讀全文

    位點特異性重組的整合酶和IHF的介紹

      在att上都有特定的結合位點,體外實驗也證明這兩種蛋白質結合在attDNA的特定位點上。每一次重組過程需要20-40個整合酶分子及約70個IHF分子。故可能這兩種蛋白質不僅是作為酶(發揮催化作用),而且在每次重組中都要形成某種復合物結構。通過缺失實驗,證明attP至少要約250bp長,太短將使其

    關于位點特異性重組的整合介紹

      λ噬菌體編碼λ整合酶(integrase)。這個酶能指導噬菌體DNA插入E.coli染色體中。這種插入作用是通過兩個DNA分子的特異位點進行重組,將兩個環狀DNA分子變成一個大環。在噬菌體感染的早期即有大量整合酶產生,故幾乎所有被感染的細胞都發生整合作用。這種作用可用體外模型來進行實驗。用四種成

    關于位點特異性重組的整合和切出的介紹

      attB由稱為BOB’的序列組成,而attP由POP'組成。O是核心序列,是attB和attP所共同的。而其兩側的序列是B,B’和P,P’,被稱為臂。噬菌體DNA是環狀的,重組時被整合入細菌染色體中,成為線性序列。前病毒的兩側是兩個新的雜種att位點,左側稱為attL,由BOP’組成,而

    關于位點特異性重組的特點介紹

      ①這種交換是可逆的,原先存在的DNA順序全部被保存下來,并無丟失;  ②噬菌體和細菌的DNA之間有一段很短的同源序列,重組交換必須通過其中的一個特定的核苷酸。這兩個特點也就是位點特異性重組的共同特點。

    位點特異性重組的簡介

      位點特異性重組(site-specific recombination)是遺傳重組的一類。這類重組依賴于小范圍同源序列的聯會,重組也只發生在同源的短序列的范圍之內,需要位點特異性的蛋白質分子參與催化,重組的蛋白不是rec 系統而是int 等,如噬菌體l 的定點插入。重組時發生精確的切割、連接反應

    關于位點特異性重組的基因的表達調控介紹

      如果一個DNA分子上兩個特異位點之間發生重組,其后果有兩種可能性:兩個位點之間的節段或被丟失,或被顛倒。有些生物能夠利用這種重組倒置來控制基因的表達。因為DNA的一正一倒兩種排列法可以相應地表達兩種不同的蛋白質,細胞就可根據需要作出選擇。奇怪的是,利用這種機制所調節的蛋白質往往都位于生物的體表。

    位點特異重組的重組機制介紹

      位點特異性重組本質上是兩個重組位點的四股DNA發生兩次切割和兩次連接的過程,所需的關鍵成分是重組酶( recombinase),此外還需要一些蛋白因子。這里以入噬菌體DNA與大腸桿菌DNA整合而進入溶原狀態為例,介紹位點特異性重組機制(圖2-33)。  1.第一次切割重組酶(又稱入噬菌體整合酶,

    簡述位點特異性重組的最終結果

      其結果是G(+)和G(-)噬菌體對不同株E.coli有不同的特異性。在G(+)方向,基因S和U表達,其產物使噬菌體可吸附在E.coliK12上,但不能吸附在E.coliC上,反之,在G(-)方向,基因S’和U’表達,噬菌體可吸附在E.coliC上,而不能吸附在E.coliK12上。各蛋白質的分子

    關于位點特異重組的重組效應簡介

      位點特異性重組既可以發生在一個DNA分子中,也可以發生在兩個DNA分子間。重組酶識別位點有方向性,所以重組時兩個重組位點的排列有方向性。  1.插入 當位點特異性重組發生在兩個閉環DNA之間或一個閉環DNA與一個線性DNA之間時,重組的結果是DNA插入(即整合),并且插入之后在兩端形成同向重復序

    染色體整合位點的概念

    中文名稱染色體整合位點英文名稱chromosomal integration site定  義染色體上能接納外源遺傳物質的位點。應用學科遺傳學(一級學科),細胞遺傳學(二級學科)

    關于位點特異重組的簡介

      位點特異性重組(sile-specific recombinalion)是指發生在特定的DNA序列之間的片段交換,序列之間不要求有同源性。位點特異性重組發生于包括基因表達調控、胚胎發育過程中的程序性基因重排、免疫球蛋白基因的重排、一些病毒DNA和質粒復制周期中發生的整合與解離等過程中。

    GeneCopoeia基因克隆技術相關研究

    與PCR、qPCR等技術一樣,作為分子實驗室必備手段,分子克隆技術被廣泛用于多樣的基因功能研究。所謂分子克隆指的是在體外將核酸分子插入病毒、質粒或其他載體分子,構成遺傳物質的新組合,使之進入宿主細胞內并獲得持續穩定增殖能力和表達。?基因克隆技術的發展經歷3個階段,第一階段為經典的T4 DNA連接酶介

    關于位點專一重組的基本介紹

      λ噬菌體感染大腸桿菌后,或是進入裂解生長,或是進入溶原生長。當噬菌體裂解宿主細胞的功能受到抑制,噬菌體DNA整合進宿主染色體并隨宿主染色體而進行復制,或作為一個獨立的郊猶?/SPAN>(如P22)。這稱為溶原性(lysogeny),這類噬菌體稱為溶原性噬菌體(lysogenic phage)。當

    Gateway的原理

    Gateway也可以被視為一種克隆操作平臺:把目的基因克隆到入門載體(Entry Vector)后,就不用依賴限制性內切酶,而靠載體上存在的特定重組位點和重組酶,高效、快速地將目的基因克隆到其它的受體載體(Destination Vector,目的載體)上。Gateway的原理也是建立在噬菌體DNA

    限制[性酶切]位點的定義和應用

    中文名稱限制[性酶切]位點英文名稱restriction site定  義限制性內切酶在DNA雙鏈上所識別的一些特殊序列。在分子生物學和基因工程中常用的Ⅱ型限制性內切酶識別的多為4、6或8對核苷酸的雙鏈回文序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    酶的活性位點的作用

    酶的活性位點通常是蛋白質表面一個能夠讓底物結合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通過不同的相互反應結合位點上與現存的氨基酸結合,如:氫鍵、離子鍵、范德華力相互作用或偶極-偶極相互作用。例如,底物可能通過氫鍵結合在絲氨酸殘基上,也可通過離子鍵結合在天冬氨酸殘基上,或通過范德華力結合在苯丙氨酸殘基上。這些結合

    酶的活性位點的定義

    酶的活性位點通常是蛋白質表面一個能夠讓底物結合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通過不同的相互反應結合位點上與現存的氨基酸結合,如:氫鍵、離子鍵、范德華力相互作用或偶極-偶極相互作用。例如,底物可能通過氫鍵結合在絲氨酸殘基上,也可通過離子鍵結合在天冬氨酸殘基上,或通過范德華力結合在苯丙氨酸殘基上。這些結合

    位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗

    位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 pMQ402 試劑、試劑盒

    位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗

    實驗材料 pMQ402試劑、試劑盒 阿拉伯糖苯甲基磺酰氟Ni-NTA 瓊脂糖結合緩沖液清洗緩沖液洗脫緩沖液透析緩沖液儀器、耗材 超聲破碎器冷凍離心機實驗步驟 3. 方法此處列出的方法概括了為定點突變而做的氨基酸位點選擇(見 3.1)、為在細菌細胞中表達而做的 MutH 蛋白突變 ( 見 3.2 )

    位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗

    實驗材料pMQ402試劑、試劑盒阿拉伯糖苯甲基磺酰氟Ni-NTA 瓊脂糖結合緩沖液清洗緩沖液洗脫緩沖液透析緩沖液儀器、耗材超聲破碎器冷凍離心機實驗步驟3. 方法此處列出的方法概括了為定點突變而做的氨基酸位點選擇(見 3.1)、為在細菌細胞中表達而做的 MutH 蛋白突變 ( 見 3.2 ) 和 Mu

    關于整合酶的基本介紹

      整合酶(Integrase)是幫助逆轉錄病毒把攜帶病毒遺傳信息的DNA整合到宿主的DNA的酶。通常由病毒自身攜帶,并且不存在于宿主細胞,所以可以作為抗病毒藥物的一個合適靶標。  研究人員也許找到了對付艾滋病病毒(HIV)的新方法,那就是抑制一種被稱為“整合酶”的HIV酶,研究人員正在試驗一種新的

    凝血酶切割位點的定義

    中文名稱凝血酶切割位點英文名稱thrombin cleavage site定  義基因工程表達系統中融合蛋白常用的連接序列,凝血酶處理可將融合蛋白中目的蛋白與非目的蛋白的肽段分離,最適切割位點是:P4-P3-P2-Arg↓-P1′-P2′,式中P4和P3為疏水氨基酸,P1′和P2′為非酸性氨基酸,↓

    限制[性酶切]位點保護試驗的方法和應用

    中文名稱限制[性酶切]位點保護試驗英文名稱restriction site protection experiment定  義當一段DNA被某些蛋白質(如轉錄因子、組蛋白等)結合后,這段DNA上的限制性酶切位點就不會被相應的限制性酶切開。因此將待研究的DNA與蛋白質一起保溫,再用該DNA鏈上已知的限

    概述位點專一重組的相關信息

      溶原狀態同裂解狀態是可以轉換的。當λ噬菌體DNA整合在宿主基因組中,則進入溶原狀態;當噬菌體DNA從宿主基因組中切離下來,則轉入裂解狀態。這種整合和切離,都是通過DNA和細菌DNA特定的附著位點之間的重組來實現的。大腸桿菌DNA上的att(attach)位點記為attλ或attB,長度為23 b

    特異性位點的DNA甲基化的檢測方法

    相關專題1 甲基化敏感性限制性內切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法這種方法利用甲基化敏感性限制性內切酶 對甲基化區的不切割的特性,將DNA消化為不同大小的片段后再進行分析。常使用的甲基化敏感的

    氯霉素乙酰轉移酶的活性位點的介紹

      1、氯霉素結合位點  氯霉素結合與定位在亞基交界面的一個深深的袋子結構中。盡管形成袋子結構的大多數氨基酸位于形成交界面的其中的一個亞基中,在催化中起關鍵作用的195位的組氨酸卻位于另外的一個亞基。氯霉素的苯環與29位亮氨酸,31位半胱氨酸,160亮氨酸,172位異亮氨酸的側鏈結合,其二氯基團和1

    蛋白酶的分類及作用位點

    ?蛋白酶分類作用位點已知抑制物氨基肽酶金屬蛋白酶帶有自由氨基的L-氨基酸氨基末端;不能分解由X-Pro、·D或·Q組成的肽鍵2,2,雙吡啶,1.1()-菲咯啉菠蘿蛋白酶巰基蛋白酶無特異性α2巨球蛋白,TPCK,TLCK,烷化羧肽酶A鋅金屬蛋白酶帶有自由氨基酸的L—氨基酸羧基端;不能分解R、P或羥脯氨

    蛋白酶的分類及作用位點

    蛋白酶分類作用位點已知抑制物氨基肽酶金屬蛋白酶帶有自由氨基的L-氨基酸氨基末端;不能分解由X-Pro、·D或·Q組成的肽鍵2,2,雙吡啶,1.1()-菲咯啉菠蘿蛋白酶巰基蛋白酶無特異性α2巨球蛋白,TPCK,TLCK,烷化羧肽酶A鋅金屬蛋白酶帶有自由氨基酸的L—氨基酸羧基端;不能分解R、P或羥脯氨酸

    關于整合酶的蛋白背景介紹

      人免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)包括HIV-1和HIV-2兩種,其中HIV-2主要分布于非洲西部,而HIV-1則廣泛分布于世界各地,是引起全世界AIDS流行的病原。HIV復制周期中的整合過程是將HIV-1 DNA整合入宿主DNA的過程,也是HIV

    關于整合酶的醫療機理介紹

      在抗艾滋病的機理上,S—1360是通過抑制艾滋病病毒的整合酶來控制病毒對細胞的感染。整合酶、逆轉錄酶和蛋白酶是艾滋病病毒感染細胞并進行復制所必需的3種酶,現存的所有抗艾滋病藥物都是破壞逆轉錄酶或蛋白酶功能的,對整合酶卻“秋毫不犯”。因此,研制公司稱S-1360實現了一個機理上的突破,它擴大了抗艾

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