大連化物所等團隊利用生物分子模擬預測代謝酶新功能
近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員李國輝團隊與中科院分子細胞科學卓越創新中心(上海生物化學與細胞生物學研究所)研究員楊巍維團隊、廣州大學教授王雄軍、復旦大學附屬中山醫院教授李全林等合作,揭示了代謝酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能夠行使蛋白磷酸酶的功能,并證明了FBP1介導的IκBα去磷酸化在結直腸癌發生中起到關鍵作用。 有研究表明,磷酸化可溶性代謝物的代謝酶,可以作為蛋白質激酶磷酸化各種蛋白質底物,進而調節細胞周期、細胞凋亡和許多其他的細胞過程。研究團隊針對這一研究現象,擬先通過理論計算挖掘可作為蛋白質去磷酸化的代謝物磷酸酶。李國輝團隊通過分子對接和分子動力學(MD)模擬對57種代謝物磷酸酶進行了高通量篩選,發現糖異生途徑中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解為果糖6-磷酸(F-6-P)的關鍵代謝酶FBP1,可作為蛋白質磷酸酶。鑒于此,合作團隊進一步通過磷酸化蛋白質組學分析,確定了IκBα是FBP1......閱讀全文
分子生物學蛋白質磷酸化分析技術
在所 有 的 翻譯后修飾中,可逆的磷酸化,幾乎調節著生命活動的整個過程,包括細胞的增殖、發育和分化,神經活動,肌肉收縮,新陳代謝,腫瘤發生等。據統計,哺乳動物細胞內有三分之一以上的蛋白質可以被磷酸化川,蛋白質的可逆磷酸化使得蛋白質組學研究更為復雜。 真核 生 物 細胞蛋白質中主要的磷酸化氨基酸為絲氨
分子生物學蛋白質磷酸化分析技術
在所 有 的 翻譯后修飾中,可逆的磷酸化,幾乎調節著生命活動的整個過程,包括細胞的增殖、發育和分化,神經活動,肌肉收縮,新陳代謝,腫瘤發生等。據統計,哺乳動物細胞內有三分之一以上的蛋白質可以被磷酸化川,蛋白質的可逆磷酸化使得蛋白質組學研究更為復雜。 真核 生 物 細胞蛋白質中主要的磷酸化氨基酸為絲氨
磷酸化和非磷酸化蛋白分子量一樣嗎
理論上講是不一樣的,磷酸基圖大概9.9KD左右,磷酸化后條帶按道理應該發生遷移
去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化
在 T4 多核苷酸激酶的正向反應中,帶有平端、5' 凹端或分子內切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子標記效率低。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理在 T4 多核苷酸激酶的正向反應中,帶有平端、5' 凹端或分子內切口的 DNA 底物比 5'
去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反應中,帶有平端、5' 凹端或分子內切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子標記效率低。 實驗材料
去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化
實驗方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反應中,帶有平端、5' 凹端或分子內切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子標記效率低。實驗材料 T4 噬菌體多核苷酸激酶試劑、試劑盒 乙酸銨EDTA乙醇咪唑緩沖液聚乙二醇儀器、耗材 液體閃爍計數儀Sephadex G-50 離心柱Seph
含5’突出羥基端的DNA分子磷酸化
本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌體多核苷酸激酶的催化下,以放射性標記的形式重新將磷酸加到核酸上,這是一種廣泛應用于?32P 標記探針的技術。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌
含5’突出羥基端的DNA分子磷酸化
實驗方法原理?本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌體多核苷酸激酶的催化下,以放射性標記的形式重新將磷酸加到核酸上,這是一種廣泛應用于 32P 標記探針的技術。實驗材料?T4 噬菌體多核苷酸激酶DNA試劑、試劑盒?乙酸銨EDTA乙醇T4 噬菌體多核苷酸激酶緩沖液儀器、耗材
含5’突出羥基端的DNA分子磷酸化
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌體多核苷酸激酶的催化下,以放射性標記的形式重新將磷酸加到核酸上,這是一種廣泛應用于 32P 標記探針的技術。
生物大分子是什么?脂肪是不是生物大分子?
生物大分子是指生物體細胞內存在的蛋白質、核酸、多糖等大分子。每個生物大分子內有幾千到幾十萬個原子,分子量從幾萬到幾百萬以上。生物大分子的結構很復雜,但其基本的結構單元并不復雜。蛋白質分子是由氨基酸分子以一定的順序排列成的長鏈。氨基酸分子是大部分生命物質的組成材料,不同的氨基酸分子有好幾十種。生物體內
生物大分子是什么?脂肪是生物大分子嗎?
生物大分子是指生物體細胞內存在的蛋白質、核酸、多糖等大分子。每個生物大分子內有幾千到幾十萬個原子,分子量從幾萬到幾百萬以上。生物大分子的結構很復雜,但其基本的結構單元并不復雜。 脂肪不是生物大分子。 脂類是油、脂肪、類脂的總稱。脂肪由C、H、O三種元素組成。 脂肪是由甘油和脂肪酸組成的三酰甘
用交換反應進行5'突出端DNA分子的磷酸化
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 T4 噬菌體多核苷酸激酶催化的交換反應(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一個標記 5' 端 DNA 的快速方法。與正向反應不同的是,它無需 DNA
用交換反應進行5'突出端DNA分子的磷酸化
T4 噬菌體多核苷酸激酶催化的交換反應(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一個標記 5' 端 DNA 的快速方法。與正向反應不同的是,它無需 DNA 去磷酸化。正向反應在略偏酸性(pH 6.4)的咪唑緩沖液中進行,以刺激酶促去
用交換反應進行5'突出端DNA分子的磷酸化
實驗方法原理 T4 噬菌體多核苷酸激酶催化的交換反應(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一個標記 5' 端 DNA 的快速方法。與正向反應不同的是,它無需 DNA 去磷酸化。正向反應在略偏酸性(pH 6.4)的咪唑
生物細胞分子的功能
DNA 是負責遺傳的主要分子,由 A、C、T、G 四種不同的單元依任意的順序排列,例如一個有 10 個單元的 DNA 分子,會有 4 的 10 次方種不同的排列順序,各種生物的遺傳雖然均由 DNA 分子負責,由于排列順序的差異,以致造成相互間極大的不同;RNA 是負責傳遞遺傳訊息的分子,它將 D
生物大分子概況
生物大分子是生物體的重要組成成份,不但有生物功能,而且分子量較大,其結構也比較復雜。在生物大分子中除主要的蛋白質與核酸外,另外還有糖、脂類和它們相互結合的產物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它們的分子量往往比一般的無機鹽類大百倍或千倍以上。蛋白質的分子量在一萬至數萬左右,核酸的分子量有的竟達上百萬。這
生物分子的提取概述
? ? ? ?生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的結構由較強的共價鍵決定。生物大分子中除較強的共價鍵外,還含有較弱的共價鍵和次級鍵,需溫和的條件才能保證生物大分子的活性不被破壞。這兩類生物分子的提取液成分和操作條件差別很大。??????? 生物分子的提取在離心機分離純化的前期。將樣品研磨,
生物分子的提取概述
生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的結構由較強的共價鍵決定。生物大分子中除較強的共價鍵外,還含有較弱的共價鍵和次級鍵,需溫和的條件才能保證生物大分子的活性不被破壞。這兩類生物分子的提取液成分和操作條件差別很大。生物分子的提取在離心機分離純化的前期。將樣品研磨,把被破碎的細胞置于一定的提取液
生物大分子概況
生物大分子是生物體的重要組成成份,不但有生物功能,而且分子量較大,其結構也比較復雜。在生物大分子中除主要的蛋白質與核酸外,另外還有糖、脂類和它們相互結合的產物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它們的分子量往往比一般的無機鹽類大百倍或千倍以上。蛋白質的分子量在一萬至數萬左右,核酸的分子量有的竟達上百萬。這
什么是磷酸化與去磷酸化
磷酸化,將磷酸基團加在中間代謝產物上或加在蛋白質(protein)上的過程。其中除去磷酸基團的酶稱為磷酸酶。 蛋白質磷酸化可發生在許多種類的氨基酸(蛋白質的主要單位)上,其中以絲氨酸為多,接著是蘇氨酸。去磷酸化:磷酸基團的除去,對許多生物起著“開/關”作用。防止質粒載體的自身連接,最常用于質粒進行單
分子生物學概念的發展與檢驗診斷—分子生物學到生物...
分子生物學概念的發展與檢驗診斷—分子生物學到生物... 經過了免疫學的熱潮,20世紀中葉開始興起了又一門新的學科“分子生物學”。人們懷著滿腔熱忱,期待這一學科能夠對那些機理不清的疾病予以新的認識。眾多科學家經過了半個世紀的努力,終于用分子生物學方法整理出一批單基因病等和基因相關的疾病。隨著基因基礎
生物分子的溶劑提取法
一、生物分子的溶劑提取法原理:利用溶劑的溶解作用把所需物質從細胞中轉移出來。二、影響生物分子的溶劑提取效率的因素:? 1、溶劑的性質:根據相似相溶原理。? 2、離子強度:離子強度是影響物質溶解度的主要因素,但離子強度對不同物質溶解度的影響不同,如高離子強度下DNA-核蛋白溶解度增加,低離子強度下RN
生物分子自調節的特點
中文名稱自調節英文名稱autoregulation定 義生物分子調節其自身的活性或表達的現象。如某一個轉錄因子的基因受該基因產物的調節。通過這種作用,一個刺激在小范圍內產生的信號的影響可以維持很久,并產生很大的生理作用。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),信號轉導(二級學科)
什么是生物分子自調節?
中文名稱自調節英文名稱autoregulation定 義生物分子調節其自身的活性或表達的現象。如某一個轉錄因子的基因受該基因產物的調節。通過這種作用,一個刺激在小范圍內產生的信號的影響可以維持很久,并產生很大的生理作用。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),信號轉導(二級學科)
生物大分子的概念
生物大分子是指生物體細胞內存在的蛋白質、核酸、多糖等大分子。每個生物大分子內有幾千到幾十萬個原子,分子量從幾萬到幾百萬以上。生物大分子的結構很復雜,但其基本的結構單元并不復雜。蛋白質分子是由氨基酸分子以一定的順序排列成的長鏈。氨基酸分子是大部分生命物質的組成材料,不同的氨基酸分子有好幾十種。生物體內
什么是生物大分子?
生物大分子是指生物體細胞內存在的蛋白質、核酸、多糖等大分子。每個生物大分子內有幾千到幾十萬個原子,分子量從幾萬到幾百萬以上。生物大分子的結構很復雜,但其基本的結構單元并不復雜。蛋白質分子是由氨基酸分子以一定的順序排列成的長鏈。氨基酸分子是大部分生命物質的組成材料,不同的氨基酸分子有好幾十種。生物體內
生物分子的溶劑提取法
一、生物分子的溶劑提取法原理:利用溶劑的溶解作用把所需物質從細胞中轉移出來。二、影響生物分子的溶劑提取效率的因素:? 1、溶劑的性質:根據相似相溶原理。? 2、離子強度:離子強度是影響物質溶解度的主要因素,但離子強度對不同物質溶解度的影響不同,如高離子強度下DNA-核蛋白溶解度增加,低離子強度下RN
生物大分子的“相變”
編者按:生物大分子的“相變”或者說“相分離”應該說近幾年來生命科學領域里面發展非常迅速的熱門領域。然而很多同行卻表示自己還沒搞清楚“相分離”到底是怎么回事它就已經火了。為什么說火了?除了同行私底下交談關于最新學術進展可以約莫了解一些之外,另一個風向標是觀察以CNS為代表的雜志發表相關論文的情況。截止
生物大分子的特點
生物大分子的特點在于其表現出的各種生物活性和在生物新陳代謝中的作用。生物大分子是構成生命的基礎物質。比如:某些多肽和某些脂類物質的分子量并未達到驚人的地步,但其在生命過程中同樣表現出了重要的生理活性。與一般的生物大分子并無二致。
生物大分子的形成
在原始地球條件下,有兩條路徑可以達到脫水縮合以形成高分子:其一是通過加熱,將低相對分子量的構成物質加熱使之脫水而聚合;其二是利用存在于原始地球上的脫水劑來縮合。前者常常是在近于無水的火山環境中進行,后者則可以在水的環境中進行。生物大分子都可以在生物體內由簡單的結構合成,也都可以在生物體內經過分解作用