基因組育種大數據計算新工具“天權”發布
近日，國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）發表了華中農業大學動物遺傳育種團隊開發的基因組育種大數據計算新工具HIBLUP，中文名為“天權”。相關論文被期刊評為“突破性進展”論文。 該研究系統分析了已有遺傳評估算法特點，針對現有算法在處理快速增長的基因組育種大數據時面臨的瓶頸問題，首創基于V矩陣的“HE+PCG”策略，可完全避免遺傳評估計算過程中的大矩陣求逆，開發出更適合基因組育種大數據時代的高性能計算新工具HIBLUP。與現有工具相比，“天權”計算速度最快且消耗內存最少，而且基因分型個體在群體中占比越大，優勢愈明顯。此外，“天權”軟件功能豐富、操作便捷，可運行于Windows、Linux、macOS等平臺，并且全面適配國產Kunpeng（鯤鵬）生態。 遺傳評估是育種的基礎，隨著基因組育種時代的來臨，育種數據規模快速增長，評估算法的計算速度已成為育種中的關鍵限制因素。遺傳評估主要包括方差......閱讀全文
華大參與：復雜宏基因組數據的新分析法
當前分析宏基因組數據的大多數方法，都依賴于與參考基因組的對比，但是許多環境中的微生物多樣性遠遠超過了參考數據庫所覆蓋的范圍。將復雜的宏基因組數據從頭劃分為特定的生物學實體（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一個未解決的問題。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
5大玩家競逐下一代基因測序數據游戲
【導語】美國化學學會(ACS)出版的新聞周刊C&EN以基因測序為主題發表了封面文章“下一代基因測序是一場數據游戲”，文中指出：2013年基因測序市場規模為13億美元，其中Illumina市場占有率為71%；被賽默飛世爾收購的Life Tech居第二；羅氏排名第三；另外文中還公布了影響用戶購買測線
2014大數據與數據科學進展主題論壇在京舉行
12月27日，2014年大數據與數據科學進展主題論壇在京舉行。包括徐宗本等5位院士在內的來自學界、商界和政府部門的60多名專家學者參加了論壇，圍繞今年國際上大數據與數據科學的最新進展和面臨的挑戰展開了研討。 本次論壇由中國計算機學會主辦，中國計算機學會大數據專家委員會、中科院虛擬經濟與數據科學
2022大數據科技傳播獎揭曉
由中國科技新聞學會、湖南省科協、衡陽市人民政府聯合開展的2022年大數據科技傳播獎評選活動近日揭曉，共評出特殊貢獻獎7名，作品獎9件，團體獎13個，個人獎28名。本次評選活動經郭華東、李蘭娟、褚君浩等院士擔綱的大數據科技傳播獎評審委員會嚴格評選審定，依照《大數據科技傳播獎獎勵辦法》規定，評選中國工程
三大數據展現南水北調工程效益
新華社北京8月25日電 題：三大數據展現南水北調工程效益新華社記者劉詩平8月25日，南水北調中線穿黃工程通過水利部主持的設計單元工程完工驗收。至此，南水北調東、中線155個設計單元工程全部通過水利部完工驗收。據統計，如今南水北調工程累計調水超過560億立方米、受益人口超過1.5億人，充分展現了這一工
谷歌致力于基因數據市場，整合Tute Genomics基因數據庫
谷歌希望憑借人類基因組云端服務Google Genomics在基因組研究市場占有一席之地，如今，公司正忙于用最好的工具來填滿這個工具箱。 Google Genomics是谷歌2013年推出的一項云端服務，幫助大學實驗室和醫院等機構將患者或科研對象的生物基因儲存到云端上，推進人類基因組信息的存
基因測序技術大升級
? DNA就像是漆黑的夜里螢火蟲發的光，第二代測序技術無法辨別每一只螢火蟲，所以就把上千只螢火蟲放在同一個袋子里，才能收集到它們的光。但第三代技術卻可以辨別每一只螢火蟲，而且可以同時測量很多個DNA片斷。 日前，南方科技大學生物系副教授賀建奎與另外幾名中美科學家聯合在生物醫學雜志BioRxiv上
缺乏數據使用指導原則，基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道，但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性，另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來，這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
郭華東：大數據+大科學=大發現
中科院遙感與數字地球所所長 郭華東院士 “大數據是財富，是資源，是科研的戰略高地。大數據正在改變人們的研究方式，是人類認識自然和行星地球的新鑰匙。” 這是中國科學院院士、中科院遙感與數字地球所所長郭華東于日前在北京召開的大數據與科學發現國際研討會上做出的判斷。從數據發展歷史看，19世紀70年代
美國推進癌癥基因數據共享
美國麥利亞德基因公司(Myriad Genetics)擁有關于乳腺癌和卵巢癌的兩個基因的專利，這讓它們壟斷乳腺癌檢測的行業多年。雖然美國最高法院在去年六月已經對這兩個基因的專利做了無效判決，但該公司仍然掌握這獨有的130萬份的檢測數據。這些信息則使得麥利亞德公司在檢測結果解釋上有巨大優勢。但是遺
基因芯片數據的分析方法
研究背景：基因芯片可以通過探針和熒光標記對某個時間點生物體的全部基因表達量進行檢測，探針代表的基因熒光強度通過儀器轉換成基本數據。這些數據的背后隱藏著很多的生物學意義，這就需要我們通過生物信息學的方法去分析和挖掘。不同實驗設計方案產生的海量芯片數據，其分析方法和思路都大同小異，這里分享一個多組實驗設
大數據：助力判定癌癥驅動基因！
目前已知超過100個新的癌癥驅動基因，幫助解釋了怎樣的腫瘤驅動會造成：相同的癌癥基因導致不同的病患！ 在一項由Sanford Burnham Prebys醫學發現研究所(SBP)引導下的協作研究中,研究人員結合兩個公開的“組學”數據庫創建一個新的目錄“癌癥驅動者”。當癌癥驅動基因的改變造成癌癥
群眾基因數據：揭示疾病病因
本月月初，來自40個國家的研究人員和提倡者成立了一個全球聯盟來開啟安全共享的基因組和臨床數據庫，目的是為了在這個時代結束時可以使人類能夠利用遺傳數據。 英國政府，凱薩醫療機構及美國共同努力收集和整理了大量的遺傳數據。但是隨著全球的聯盟，有一天臨床醫生可以廣泛使用遺傳數據，全世界的研究者可以
基因芯片數據的分析方法
研究背景：基因芯片可以通過探針和熒光標記對某個時間點生物體的全部基因表達量進行檢測，探針代表的基因熒光強度通過儀器轉換成基本數據。這些數據的背后隱藏著很多的生物學意義，這就需要我們通過生物信息學的方法去分析和挖掘。不同實驗設計方案產生的海量芯片數據，其分析方法和思路都大同小異，這里分享一個多組實驗設
6大亮點！12所“雙一流”高校就業數據大起底
談起應屆畢業生就業的話題，雙一流人才的去向是其中一個備受矚目的風向標。 日前，清華、北大等12所雙一流高校陸續發布了《2021年畢業生就業質量報告》。在剛剛過去的一年，面對疫情形勢反復、行業政策調整等種種變局，應屆研究生的就業方向產生了一些刻著鮮明“時代烙印”的新變化。 而對大多數高校畢業生
醫療大數據何去何從 聽聽幾位大咖的前瞻
當大數據遇上醫療，到底會產生怎樣的火花？11月28-29日，2015中國醫療健康大數據峰會暨智慧醫療專家委員會年會在京召開，來自醫療界、產業界的專家學者們齊聚一堂，暢聊醫療大數據激起的改變以及日后的無限可能。 貴州省衛計委衛生信息中心主任嚴剛：建起國內首個大數據中心 國家發改委于2011年提
嵌入式大容量數據存儲解決方案
方案簡介隨著高性能嵌入式微處理器價格的逐漸降低以及芯片級存儲介質的存儲密度的提高，采用以高性能嵌入式微處理器為系統核心，結合大容量存儲芯片，實現高性能、低功耗、低成本、小體積的嵌入式大容量數據存儲，具有無可比擬的優勢…詳細信息：成功案例某單位艦載信息黑匣子消防主機監控與采集終端應用背景隨著32位嵌入
COD測定時數據不準，偏差大的原因
數據不準，偏差大：1、選用儀器的低量程檔測量；2、氯離子的影響，如果水樣中氯離子超過1000mg/L，可將水樣稀釋后測量；如果稀釋后COD濃度很低，可能為試劑的問題，試劑過期或者保存不當變質，或者非原廠試劑；空白樣的問題，空白樣不準確對測量結果影響很大；蒸餾水不純，或者選用其他類型水（如桶裝水、礦泉
谷歌將提供基因數據在線服務
近日，谷歌公司宣布將開始提供由生物醫學研究機構 Broad 研究所開發的DNA 分析軟件的云服務版本。 Broad 研究所是由來自哈佛大學、麻省理工學院和哈佛大學附屬醫院的科學家組成的。該機構的基因組分析工具包GATK，可用于分析基因組測序數據，并已被研究人員和企業下載20000 次。谷
基因數據噪音或可保護患者隱私
大型基因組數據庫對于科學家尋找同疾病相關的遺傳變異來說是必不可少的。不過，對于貢獻了DNA的人來說，這會帶來隱私風險。一項2013年的研究顯示，黑客能利用網絡上公開可用的信息，從被匿名的基因組數據中辨別出人們的身份。 為解決這些擔憂，一個由美國麻省理工學院計算機科學家Bonnie Berger
Science：癌癥基因數據提出技術質疑
據美國國立癌癥研究所的一位病理學家David Levens稱，在PubMed數據目錄上有超過25,000篇關于Myc基因的論文，這種基因與轉移性癌癥有關，但是現在由于一項最新研究成果，因此都需要重新再評估，這項研究指出了Myc的致癌作用比大多數人認為的都要更廣泛，而目前的實驗方法具有缺陷，也
冰島基因公司數據挖掘計劃泡湯
圖片來源：基因解碼公司 因采集冰島人DNA用于發現基因和疾病之間關系而著名的基因解碼公司遇到了一個棘手問題。近日，《科學》雜志報道稱，冰島負責監督數據保密性的國家機構駁回了基因解碼公司的請求——該公司希望可以使用計算機方法分析該國的宗系記錄，以估算28萬名并未同意參與該公司的研究，
基因數據分析的主流軟件
基因組測序在過去的幾年中，許多生物的基因組完成了測序工作，如何對如此龐大的原始序列信息進行分析和應用，正是現在最為棘手的問題。大量的基因預測軟件和在線工具應運而生。如何廣泛而深入地了解并能有的放矢地利用這些工具，已經成為21世紀分子生物學家的必修課。隨著大規模EST和cDNA序列信息的獲取，那些基于
基因數據分析的主流軟件
在過去的幾年中，許多生物的基因組完成了測序工作，如何對如此龐大的原始序列信息進行分析和應用，正是現在最為棘手的問題。大量的基因預測軟件和在線工具應運而生。如何廣泛而深入地了解并能有的放矢地利用這些工具，已經成為21世紀分子生物學家的必修課。隨著大規模EST和cDNA序列信息的獲取，那些基于表達序列同
2020年大數據產業規模將達千億元
大數據作為信息經濟必備的戰略資源，已成為引領信息時代的重要基石，云計算作為信息技術應用和服務模式創新的集合體，是支撐大數據深化應用的基礎平臺。為提升創新創業能力，疏解非首都功能、構建“高精尖”經濟結構，昨日，市政府常務會審議通過《北京市大數據和云計算發展行動計劃（2016-2020年）》。 該
手持式煙氣流速儀大容量數據存儲
一、產品概述DL-6600SG型煙氣流速檢測儀(以下簡稱檢測儀）為便攜式監測儀，廣泛應用于鍋爐、爐窯以及各種排風管道的氣體流速、氣體流量、氣體動壓、靜壓及溫度等參數的測定。二、適用范圍本儀器采用皮托管法測量管道中氣體流速,可對各種鍋爐、工業爐窯以及排風管道的氣體流速、溫度、壓力等參數進行檢測，儀器采
手持式煙氣流速儀大容量數據存儲
一、產品概述 DL-6600SG型煙氣流速檢測儀(以下簡稱檢測儀）為便攜式監測儀，廣泛應用于鍋爐、爐窯以及各種排風管道的氣體流速、氣體流量、氣體動壓、靜壓及溫度等參數的測定。 二、適用范圍 本儀器采用皮托管法測量管道中氣體流速,可對各種鍋爐、工業爐窯以及排風管道的氣體流速、溫度
數據中心電力浪費大 行業有何辦法應對？
電力行業的浪費主要在兩個部分，服務器利用不足和錯誤的激勵方向，后者則主要出現在多租戶數據中心。在多租戶數據中心，激烈的對象應該是能源效率策略制定者以及能源費用支付者，NRDC建議采取措施來加速能源節省步伐及規模。 激勵需要用對地方 雖然多租戶設施被認為比自建設施更具備能源效率，但是NRDC表
大容量恒溫搖床具有強大的數據處理功能
大容量恒溫搖床采用微電腦全智能控制系統，功能強大，抗干擾能力強，可實現晝夜1-24個時間段的溫度和光照度參數的自由組合，達十段編程。 整機靜音設計，靜電噴塑箱體，配有鋼化玻璃觀察視窗，隨時觀察箱內的溫及光照狀況，內置式頂部光照，專用生物光源，光譜特性好，強度高，發熱小，特別適合實驗要求，超溫聲光
數據安全誰來保障？美國：我有4大法寶
7月6日消息，當地時間周二，美國國家標準與技術研究院（NIST）對后量子密碼標準化項目進行第三輪篩選后公布了四項加密算法，目的是在量子計算機成熟到足以破解當前加密技術時仍能確保計算機數據安全。科學家已經證實，如果量子計算機技術持續發展，總有一天能破解現行加密技術。NIST設計和測試后量子密碼技術的目