《自然》獲得首創性全基因組RNAi庫
來自奧地利科學院維也納分子生物學研究院（Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences）的研究人員以果蠅為研究對象，利用一套完整的基因組序列數據，從達到了88%覆蓋率的蛋白編碼基因中獲得了全基因組范圍內特異組織 RNAi轉基因文庫，這在之前并未完成過。這一研究得到的數據庫有助于對功能的喪失進行快速的基因篩選，使得科學家基本上有可能在生物體的生命過程中的任何階段在任何一種組織中或細胞中來研究基因功能。 原文檢索：Nature 448, 151-156 (12 July 2007) |doi:10.1038/nature05954; Received 28 February 2007; Accepted 22 May 2007A genome-wide transgenic RNAi library for conditional g......閱讀全文
科學家呼吁關注全球基因組數據庫污染
樣品處理有可能是導致DNA數據庫廣泛污染的最主要原因 2月16日發表在《公共科學圖書館·綜合》（PLoS ONE）期刊上的一份研究報告稱康涅狄格大學的遺傳學家Mark Longo及同事發現由頂級公共測序機構提供的測序結果構建的基因組數據庫中的大約1/5的細菌、植物和非靈長類動物基因
世界最大的自閉癥基因組數據庫公布
自閉癥，或稱為自閉癥譜系障礙，是指包括了社會技能、重復行為、語言和非語言交流、以及與眾不同的優勢或差異等多表征型障礙。我們現在得知，自閉癥分好多亞型，大多數由遺傳和環境共同作用造成。據估計，每68名兒童中就有一人患有自閉癥。雖然，目前自閉癥的干預方法很多。但是大多數缺乏循證醫學的證據。尚無最優治
基因組多樣性和祖源信息數據庫
?? 11月3日，中國科學院上海生命科學研究院（人口健康領域）計算生物學研究所徐書華課題組的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日，深圳市寶安中醫院（集團）副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統，各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系，其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試
本報訊 日前，中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺（hevea.catas.cn）上線運行，并在國際橡膠研究與發展委員會（IRRDB）各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試，數據庫平臺各項指標保持穩定，運行可靠，達到
橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試
日前，中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺（hevea。catas。cn）上線運行，并在國際橡膠研究與發展委員會（IRRDB）各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試，數據庫平臺各項指標保持穩定，運行可靠，達到預期效果。
基因組所發布全轉錄組關聯研究知識庫
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的全轉錄組關聯研究知識庫正式上線。該研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”為題在
武漢科研團隊破譯并公布蓮基因組數據庫
近日，武漢市園林科學研究院和中科院武漢植物園攜手研發出破譯荷花遺傳密碼的蓮基因組數據庫。日前，該數據庫在國際知名學術期刊公布，供各國荷花研究人員免費共享。 據介紹，水生植物蓮是地球上最早出現的開花植物之一。研究發現，早在約1.4億年前蕨類植物和恐龍稱霸地球的時代，在北半球許多水域已有蓮的分布。
《自然》：2種瘧疾寄生蟲基因組序列測定
瘧疾裂殖子 一個由美英等國科學家組成的國際研究小組近日測定了兩種致命瘧疾寄生蟲的基因組序列。這兩種瘧疾寄生蟲分別名為Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被認為是感染人類的一個主要瘧疾病原體，而P. vivax則會致人極度虛弱，
“基因組編輯核酸酶”當選《自然》年度研究方法
? 《自然—方法學》視頻介紹“基因組編輯核酸酶” 《自然》雜志子刊《自然—方法學》在最新一期推出了2011年度研究方法專刊，評選出了本年度研究方法——基因組編輯核酸酶（Gene-editing nucleases）。專刊包括社論、新聞特寫、評論、視頻等內容；同時，還評出其他8個值得關注的研
草莓基因組研究取得成果－|《自然遺傳學》
《自然-遺傳學》本周在線發表的一篇論文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該基因組為了解這一廣受歡迎的水果的起源和演化歷史提供了新見解。八倍體草莓的演化史。Edger et al. 八
基于同源基因簇的水稻泛基因組綜合數據庫建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室教授張建偉課題組聯合國內外高校與科研機構在《自然—通訊》與《分子植物》連續發表兩篇研究論文。這兩項工作以代表亞洲稻群體結構的
微縮化技術在宏基因組測序建庫中的應用
2020年伊始，突如其來的新冠疫情牽動著每個人的心。自武漢衛健委首發肺炎疫情情況通報后的短短一個星期，新型冠狀病毒就在實驗室中被檢出，并獲得了該病毒的全基因組序列。如此快速地確定病原體搶占研究先機，宏基因組測序技術功不可沒。?宏基因組學(Metagenomics)，以環境樣品中的微生物群體為研究對象
迄今最大哺乳動物基因組庫為進化提供新見解
當21世紀初，小鼠、人類、大鼠和黑猩猩的完整基因組首次發表后，遺傳學家通過比較基因序列為了解哺乳動物進化打開了大門。為什么一些哺乳動物嗅覺特別靈敏？為什么有些哺乳動物要冬眠？為什么一些哺乳動物的大腦發更大？20年后的今天，由美國麻省理工學院、哈佛大學等單位的科學家牽頭的大型國際研究項目——“Zoon
北京基因組所開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
北京基因組所的腦疾病知識庫BrainBase正式上線
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的腦疾病知識庫BrainBase正式上線。相關研究成果以BrainBase: a curated knowledgebase for brain diseases為題，在線發表在Nucleic Acids Resear
我國發布首個柑桔全基因組變異數據庫
近日，《園藝研究》（Horticulture Research）在線發表了中國農業科學院柑桔研究所構建完成的柑桔全基因組變異數據庫CitGVD（http://citgvd.cric.cn/home），這是第一個園藝類作物全基因組變異數據庫。 柑桔是全世界最重要的商業水果作物之一。當前，柑桔類物
Cell：不讓基因沉默的RNAi途徑
“這項研究的獨特之處在于――之前，我們知道RNAi能用于調控基因，或者完全關閉基因。而這項研究中，我們發現的是一種通過piRNA途徑，保護基因不被沉默的RNAi機制，這種機制能作為一種保護形式，讓基因得以表達。” ――Darryl Conte Jr.博士 生物機體采用了多種戰略方法來
首個山羊基因組圖譜在《自然?生物技術》雜志發表
2012年12月24日，由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成的首個山羊全基因組圖譜在《自然?生物技術》(Nature Biotechnology)雜志在線發表。本研究采用新一代測序技術(NGS)與全基因組酶切圖譜(Whole-genome mapping)技術相結
《自然—生物技術》：美教授“自繪”個人基因組圖譜
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一臺機器、3個人、5萬美元，美國斯坦福大學教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自繪”個人基因組圖譜的經歷說明，這項“游戲”已不再是誰也玩不起的了。 斯坦福大學8月10日發表聲明說，夸克在兩名同事的幫助下，利用一臺冰箱大
《自然》：中美科學家聯合繪出番木瓜基因組草圖
記者從南開大學了解到，中美科學家在世界上首次繪制完成一株轉基因經濟作物的全基因組圖譜。這篇名為《轉基因熱帶水果植物——番木瓜的基因組草圖》的成果發表在4月24日出版的國際權威科學雜志《自然》上。?這項轉基因經濟作物的全基因組圖譜研究成果，對農作物育種、農業生產和人類對轉基因植物的認識具有極其重要的意
《自然—方法學》發表媲美基因組測序速度的組裝算法。
10年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 12月10日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 論文作者、中國農業科學院農業
北京基因組所阿爾茲海默癥基因知識庫ALzBase正式上線
阿爾茲海默癥（Alzheimer’s disease,AD）是一種在老年人人群中常見的神經退行性疾病，目前無有效治療手段。人們對AD致病機理方面的研究也沒有取得突破性的進展。為了能夠更好地助力AD相關的研究，中國科學院北京基因組研究所雷紅星研究組通過整合不同來源的數據，以阿爾茲海默癥擾動基因為核
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
通過RNAi使基因特異性沉默
RNA interference (RNAi) is a phenomenon in which the introduction of double-stranded RNA (dsRNA) into a diverse range of organisms and cell types caus
2016國家自然科學基金：基因組編輯技術
來自國家自然科學基金委員會的消息，8月17日國家自然科學基金委員會公布了2016年國家自然科學基金申請項目評審結果，其中面上項目16934項、重點項目612項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16112項、地區科學基金項目2872項、海外及港澳學者合作研究基
我國科學家完成小麥A基因組測序，成果在《自然》發表
小麥是全球最重要的糧食作物，養活了世界上40%的人口，但其龐大且復雜的基因組一直是國際研究的難題。近日，我國科學家成功完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制，對小麥的遺傳改良和分子設計育種等具有重要意義。這一成果今天（10日）凌晨在國際學術刊物《自然》上在線發表。 科研人員通過對烏拉爾
《自然》最新：古基因組研究揭示瑪雅人祭祀儀式細節
中新網北京6月13日電 (記者 孫自法)國際著名學術期刊《自然》最新發表一篇考古學論文稱，一項研究通過對古代個體的DNA分析，發現了瑪雅古城奇琴伊察埋葬祭祀儀式的更多細節。研究結果還展示了瑪雅地區延續至今的基因傳承。本次研究的卡斯蒂略金字塔(El Castillo)又稱庫庫爾坎神廟，是奇琴伊察最大的
《自然》最新：古基因組研究揭示瑪雅人祭祀儀式細節
國際著名學術期刊《自然》最新發表一篇考古學論文稱，一項研究通過對古代個體的DNA分析，發現了瑪雅古城奇琴伊察埋葬祭祀儀式的更多細節。研究結果還展示了瑪雅地區延續至今的基因傳承。本次研究的卡斯蒂略金字塔(El Castillo)又稱庫庫爾坎神廟，是奇琴伊察最大的建筑之一，其建筑風格反映了其遙遠的政治聯