動物所等異常表觀修飾參與亨廷頓舞蹈病病理研究獲進展
亨廷頓氏舞蹈病是一種常染色體顯性遺傳的神經退行性疾病，其主要病理特征是大腦紋狀體神經元的漸進性死亡。亨廷頓基因突變導致紋狀體神經元選擇性死亡的機制還不清楚，目前也沒有任何治療手段。DNA胞嘧啶的甲基化修飾是一重要的表觀修飾方式，在染色體結構重塑、基因沉默、發育與分化等過程中扮演著關鍵角色。最近有研究結果證實，胞嘧啶的甲基化可被進一步氧化為羥甲基化修飾，有證據顯示胞嘧啶羥甲基化修飾（5hmC）在胚胎發育和胚胎干細胞的增殖分化、神經細胞的分化成熟中有重要作用。關于DNA的5hmC修飾與神經退行性疾病的關系還未見報道。 中科院動物研究所唐鐵山研究員領導的分子神經生物學研究組以酵母人工染色體轉基因舞蹈病（YAC128-HD）小鼠為研究模型，系統分析了不同月齡的疾病模型鼠腦組織和腦組織不同區域的5hmC修飾水平。研究發現，小鼠出生后隨月齡增長，神經細胞的5hmC水平快速上升，在三個月齡達到最高值；隨后隨月齡增加5hm......閱讀全文
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（三）
六、中期染色體標本的變性1.在染色缸中加入大約50mL變性液，將染色缸放于75?76℃水浴中。預熱變性液使其溫度達到（73±2)℃。2.從-20℃冰箱中取出實驗所需的標本，室溫下系列乙醇脫水，各2min。3.室溫干燥片子（5min)，或在實驗室抽風櫥中微風吹過標本使標本干燥。4.在37?40℃電熱板
鴨嘴獸基因組圖譜揭秘獨特的性染色體
鴨嘴獸可能是世界上長得最奇怪的動物。據說，當歐洲學者第一次見到這種鴨子嘴、海貍尾、水獺足的動物時，他們認為這是一場精心設計的騙局。它看上去既像爬行動物又像哺乳動物，還像鳥類。實際上，它屬于稀有的單孔類動物。 鴨嘴獸不僅有一些奇特的身體特征，其新的基因組版本也強調了它一些不尋常的遺傳特性。在上周
科學家得到詳細的惡性膠質細胞瘤細胞基因組數據庫
科學家啟動了腫瘤基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas，TCGA)，打算分析所有組織的腫瘤細胞的基因組。腦組織腫瘤是科學家的第一個目標，因為其挑戰性大回報也最大。 TCGA收集了多形性成膠質細胞瘤(glioblastoma multiforme，GBM)的組
科學家發現小鼠通過染色體聚集辨別氣味
1月9日，美國哥倫比亞大學科研人員在Nature上發表了題為“LHX2 -and LDB1-mediated trans interactions regulate olfactory receptor choice”的文章，發現在小鼠嗅覺感覺神經元中（olfactory sensory neu
北京基因組所等揭示Y染色體表觀信息遺傳機制
表觀遺傳學是與傳統遺傳學相對應的概念。遺傳學以基于DNA序列的中心法則來傳遞遺傳信息，在人群中，遺傳信息在世代之間穩定遺傳，那么表觀遺傳信息是否像遺傳信息一樣可被子代繼承，尚缺少相關有力證據。DNA甲基化是非常重要的表觀遺傳信息，是表觀遺傳學研究的重要內容。目前，鮮少有DNA甲基化在人群中的繼承
人類種了6000年的作物有了染色體級別基因組
大麻又名火麻、漢麻、線麻等，籽用大麻在食品、醫藥、紡織、造紙等多個領域被廣泛使用，是一種重要的工業原料。 9月15日，福建農林大學麻類研究室聯合該校基因組與生物技術中心在《植物通訊》（Plant Communications）上發表了首個染色體級別的籽用大麻參考基因組圖譜。他們在此基礎上解析了
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日，中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝，并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白，為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
破解染色體級別基因組密碼解析栽培菠菜的“前世今生”
上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化歷史的解析。 該研究成果以“基因組解析
動物所等發現舞蹈病神經元線粒體DNA氧化損傷的機制
亨廷頓氏舞蹈病是一種常染色體顯性遺傳的神經退行性疾病，主要表現為運動障礙、認知和精神紊亂，一般在發病后10-15年內死亡。該疾病的病理特征是大腦紋狀體神經元的漸進性丟失，但亨廷頓基因突變導致紋狀體神經元選擇性死亡的機制還不清楚，目前也沒有任何治療手段。前人一系列研究發現，與大腦其他區域
安諾攜手居里研究所再登Nature子刊，揭染色體再活化機制
在雌性哺乳動物胚胎形成過程中，兩條X染色體的其中一條失活，完成劑量補償效應。對于小鼠而言，X染色體失活（XCI）主要分為兩個階段，第一階段父源X染色體（Xp）啟動印記失活，此失活狀態在滋養外胚層細胞（TE）及原始內胚層細胞（PrE）中得以維持，但在囊胚內細胞團（ICM）的外胚層細胞中，Xp會出現
Illumina與美研究所開發基因組二級分析工具－助力變異檢測
Illumina公司和麻省理工學院及哈佛大學Broad研究所近日宣布，他們已經開始共同開發基因組二級分析算法和軟件。兩家機構的頂級數據科學家即將展開合作，將業界領先的開源GATK算法與Illumina DRAGEN?（Dynamic Read Analysis for GENomics）Bio-
Cell：易碎基因雖促疾病－但增加腦細胞多樣性
最近，一項刊登于國際雜志Cell上的研究論文中，來自霍華德休斯頓醫學院（HHMI）的研究人員通過研究在大腦干細胞中鑒別出了27個基因更易于引發特定類型的DNA損傷，這些基因的易碎性或可幫助解釋為何其會在癌癥中經常發生突變或被剔除，以及引發神經精神疾病，但這些基因的易碎性或許也會通過產生多樣化的神
基因組研究揭示復雜染色體重排或為子宮平滑肌瘤主因
子宮平滑肌瘤是一種良性腫瘤，但影響著數百萬女性的健康。對其分子機理的深入理解可為這種腫瘤的預防和治療提供線索。芬蘭腫瘤學會的Miika Mehine等人對此進行了研究，他們發現，一種與染色體破碎重組(Chromothripsis)很類似的復雜染色體重排是許多子宮平滑肌瘤染色體異常的主要原因。
學者發表紫苞芭蕉和朝天蕉首個染色體水平基因組
近日，中國科學院華南植物園副研究員黃慧潤、研究員王崢峰團隊在國家自然科學基金項目的資助下，研究結合Oxford Nanopore和Hi-C測序技術成功組裝并發表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首個染色體水平基因組。相關成果在線發表于《園藝研究》（Horticulture Research）。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
我國科學家發現黃花蒿首個染色體級別基因組圖譜
瘧疾至今仍威脅著人類的健康。黃花蒿是全球普遍使用的抗瘧疾藥物——青蒿素的主要天然資源，保障全球優質廉價的青蒿素原料供應對于全球瘧疾防控有重要價值。但黃花蒿基因組雜合度和重復度很高，致使高質量的黃花蒿基因組組裝成為該領域難題。 在重大新藥創制科技重大專項、國家重點研發計劃“中醫藥現代化研究”重點
微陣列中期分裂相染色體的比較基因組雜交（CGH）－實驗
染色體 CGH 的獨特優點在于它的全基因篩查功能，與檢測單一靶 DNA 劑量改變的低通量方法，如 Southern 分析、PCR 和熒光原位雜交（FISH) 相比，速度顯著提高且省力。目前染色體 CGH 是一種比較完善的分子細胞遺傳學方法，但是它的兩個缺陷限制其作為一種綜合性篩查工具的應用。來源：《
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法進行熒光原位...
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法進行熒光原位雜交（FISH）實驗材料?SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺試劑、試劑盒?固定液乙醇雜交緩沖液標記探針橡膠乳黏劑封固劑實驗步驟 含有重復序列探針的沉淀：大分子量黏粒探針往往含有重復序列，如果在雜交前不能封閉這些序列，將導致嚴重的非特異性雜交
微陣列中期分裂相染色體的比較基因組雜交（CGH）－實驗
實驗方法原理 實驗材料 高分子質量基因組DNA EcoR I 或 Dpn II試劑、試劑盒 SSCcDNA陣列dNTP 混合液 dCTP 酵母 tRNADNA 聚合酶 I儀器、耗材 Qiaquick PCR 純化試劑盒 BioPrime 標記試劑盒Micrcon 30 濾器雜交爐Maxiprep D
“六谷”之一菰米首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ??? ? 中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水
小葉茶染色體級別基因組圖譜聯合研究成果首次完成
近日，生物學預印本服務器（www.biorxiv.org）在線發表了中美科學家聯合研究團隊的最新成果，該團隊采用單分子實時測序（SMRT）和 Hi-C技術，在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”，將組裝獲得的約2.85Gb 的基因組序列掛載到了15 條假染色體上，在國際上
基因組所阿爾茲海默癥染色體區域研究獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室“百人計劃”研究員雷紅星，開展的阿爾茲海默癥染色體區域研究取得階段性進展，其研究論文Chromosome 19p in Alzheimer’s disease: when genome meets transcriptome于8月在J
科學家首次發布銀鯧高質量染色體水平參考基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日，中國科學院海洋研究所在銀鯧基因組學研究方面取得新進展，首次發布了我國重要名貴經濟魚類——銀鯧的高質量染色體水平參考基因組，相關研究成果在《自然》子刊《科學數據》在線發表。銀鯧隸屬
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪進行熒光原位雜交
實驗材料SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺試劑、試劑盒固定液乙醇雜交緩沖液標記探針橡膠乳黏劑封固劑實驗步驟含有重復序列探針的沉淀：大分子量黏粒探針往往含有重復序列，如果在雜交前不能封閉這些序列，將導致嚴重的非特異性雜交背景。人 Cot1 DNA 富含重復序列，可對黏粒的重復序列產生競爭性
單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法進行熒光原位雜交
? ? ? ? ? ? 實驗材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 試劑、試劑
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法熒光原位雜交
? ? ? ? ? ? 實驗材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 試劑、試劑
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪進行熒光原位雜交
? ? ? ? ? ? 實驗材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 試劑、試劑
Cell：染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期，北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell（IF：41.582）在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者對油松進行了
破解了香氣之謎－蠟梅的染色體水平精細基因組圖譜公布
“一花香十里，更值滿枝開。”凌寒怒放的蠟梅，是萬花凋零的寒冬里一道亮麗的風景，其香味濃郁而獨特，成為歷代文人墨客揮筆高歌的對象。蠟梅為何冬季開花？其獨特香味由何而來？蠟梅 華中農大供圖 近日，華中農業大學劉秀群、趙凱歌研究組和金雙俠研究組聯合西南林業大學陳龍清研究組，在《基因組生物學》在線發表
中國獲首個染色體級別橡膠樹參考基因組圖譜－利于育種
從中國科學院昆明植物研究所獲悉，由該所及云南省熱帶作物科學研究所、華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心組成的聯合研究團隊，歷經6年，利用單分子實時測序(SMRT)和Hi-C技術，在國際上首次獲得了達到染色體級別的高質量巴西橡膠樹優良品種GT1的參考基因組序列，并揭示大戟植物基因組的染色體進化