Nature解答Cas9基因組編輯核心謎題
有一種蛋白在細菌免疫系統中起著至關重要的作用，并正快速成為一種很有用的遺傳工程工具。現在有關這一蛋白的一個中心問題已經獲得了解答。來自勞倫斯伯克利國家實驗室和加州大學伯克利分校的研究人員，確定了這一叫做Cas9的細菌酶在病毒感染過程中是如何在RNA序列的引導下識別和降解外源DNA，以及在動物和植物細胞中誘導位點特異性遺傳改變的。通過結合單分子成像和大量的生化試驗，該研究小組證實Cas9的基因組編輯能力是通過稱作為“PAM”( protospacer adjacent motif)的短DNA序列來實現的。 該研究的領導者、生物化學家Jennifer Doudna 說：“我們的研究結果揭示了PAM的兩個主要功能，解釋了它對于Cas9能夠靶向和切割與導向RNA相匹配的DNA序列如此至關重要的原因。在外源DNA的靶向位點附近存在PAM，而宿主基因組的這些靶向位點則缺乏PAM，使得Cas9能夠精確區分必須降解的非自身DN......閱讀全文
新算法TRFill解決生物基因組重復序列組裝難題
近日，中國農業科學院農業基因組研究所農業基因組學技術研發與應用創新團隊開發出了一種新算法——TRFill，解決了現有工具無法完全填補基因組間隙的難題，顯著提升了基因組質量。相關研究成果發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上。 動植物基因組的許多區域存在大量高度重復的DNA片段
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
寵物到強大入侵生物－小龍蝦基因組序列揭秘緣由
一個新物種如何在短時間內崛起，基因組測序可以提供線索。英國《自然·生態與進化》雜志5日在線發表的一篇論文，首次報告了美洲龍紋螯蝦的基因組序列，有助于揭示這種單性繁殖的動物，如何在短短20年間就從德國寵物貿易的寵兒，變為馬達加斯加的強大入侵生物。 美洲龍紋螯蝦在上世紀90年代首次被發現。據資料稱
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月，在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序，它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先，這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列；其次，這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前，人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
安捷倫推出新產品完善靶向序列捕獲系統
安捷倫科技推出新一代測序樣品制備、靶向富集和自動化方案，完善靶向序列捕獲系統????2010 年 11 月 3 日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日發布新一代測序產品的新成員——，繼續保持快速的新產品推出步伐。SureSelect XT 在成熟可靠的 SureS
生物物理所揭示基因組重復序列Alu調控轉錄新機制
7月12日，中國科學院生物物理研究所薛愿超團隊在《自然》（Nature）上，在線發表了題為Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究論文。 轉錄調控在維持細胞功能和正常發育過程中起著關鍵作用。其中，增
Nature子刊：用于百萬級生物樣本庫的基因組序列分析工具
人類的疾病易感性和生理特征等常見性狀的差異，往往由DNA序列變化造成，這些DNA片段缺失、增加、異位等變化被統稱為遺傳變異。全基因組關聯研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通過比對大量人群的遺傳信息，利用統計學檢測遺傳變異和性狀之間關聯性的方法。西湖大學
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?（記者張夢然）美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具，用于組裝來自各種物種的真正完整（即無縫）的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
安捷倫推出最新人全外顯子靶向序列富集工具
安捷倫科技公司與維康信托基金會桑格研究院和 Gencode 研究團隊合作開發了用于新一代測序的最新人全外顯子靶向序列富集工具? ?? ?? 2010 年 8 月 4 日，加利福尼亞州圣克拉拉市和英國劍橋市 — 安捷倫科技公司（NYSE：A）今日推出用于新一代 DNA 測序的?SureSel
安捷倫科技推出SureSelect激酶組靶向序列捕獲試劑盒
安捷倫科技推出用于生物標記物發現的表達激酶組研究的靶向序列捕獲系統該系統可幫助研究人員尋找新的癌癥療法和藥物靶標 2010年10月，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日推出SureSelect激酶組靶向序列捕獲試劑盒，幫助研究者實現針對表達激酶（激酶組）的新一代測序研究
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日，記者從中國科學院水生生物研究所獲悉，該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成，相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹，該研究采用鳥槍法測序策略，分別對一
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃（OGP）團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道，加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中，對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因，從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一，提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖，但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上，兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列，以及小麥染色體3B基因組序列，另外兩個研究小組
《Genome－Research》：根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型，與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性，破壞宿主細胞膜和粘附的能力，粘附到人體組織的能力，是許多細菌病原體的主要毒力因子，包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，自從上世紀40
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列（論文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示，該病毒與此前在
安捷倫推出高靈敏度NGS－靶向序列捕獲解決方案
安捷倫科技公司推出全新的高靈敏度 NGS 靶向序列捕獲解決方案全新解決方案可簡化工作流程并消除測序誤差 2017年7月19日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所： A）今日宣布推出最新的新一代測序 (NGS) 文庫制備解決方案 Agilent SureSelectXT HS，這是一款完整的靶向序列
安捷倫科技在杭州建成新的靶向序列捕獲生產線
2021年8月4日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布，公司已在位于浙江杭州的安捷倫生物建成了新一條 SureSelect 產品組合生產線。 作為二代測序（NGS）檢測產品的行業領導者，安捷倫為客戶的常規應用開發定制基因組合。交付周期是安捷倫極為看重的因素，其影響著公司為客戶所提
首個完整人類基因組序列公布
? 由美國國家人類基因組研究所、加利福尼亞大學圣克魯斯分校、華盛頓大學等機構研究人員領銜的國際科研團隊3月31日公布了首個完整、無間隙的人類基因組序列。與這項重大成果相關的6篇論文當天發表在美國《科學》雜志上。美國國家人類基因組研究所在一份公報中表示，人類基因組含有約30億個DNA（脫氧核
《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日，深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜，這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后，我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只，這一研究成果將對于挽救和保護朱
科學家完成辣椒全基因組序列測定
由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文，今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表，標志著辣椒基因組序列成功解碼，我國辣椒基礎性研究取得重大進展，進入分子育種階段。 美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學
蠶“姑娘”終于有了完整的基因組序列
西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列，并揭示鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化的新機制。日前，相關研究成果在線發表于《科學進展》。雌蠶。課題組供圖雄蠶。課題組供圖在昆蟲中，性染色體組成以XX/XY系統為主，而鱗翅目昆蟲性染色體組成與大部分昆蟲不同，
三篇Nature－Methods：定位基因組的調控序列
科學家們利用染色質對DNase消化和Tn5轉座的敏感性，對基因組的調控序列進行定位和解讀。 近來越來越多的證據顯示，許多遺傳學差異并非直接影響基因，而是改變控制基因開/關的調控序列。近期Nature Methods雜志上發表了三篇文章，介紹了在基因組中定位調控序列的新技術，闡述了進行數