水生所蛋白質翻譯后修飾組學研究獲進展
蛋白質的翻譯后修飾,如磷酸化、乙酰化等,是調節蛋白質生物學功能的關鍵步驟,是蛋白質動態反應和相互作用的一個重要分子基礎,也是細胞信號網絡調控的重要靶點。由于翻譯后修飾蛋白質在樣本中含量低且動態范圍廣,其研究極具挑戰性。近期,中國科學院水生生物研究所葛峰研究員學科組在蛋白質翻譯后修飾組學及其功能方面展開了深入的研究并取得了系列進展。 在蛋白質磷酸化修飾方面,該學科組與研究所相關團隊合作,綜合應用最新的蛋白和肽段分離技術、TiO2磷酸肽富集技術和高分辨質譜分析技術,先后研究了磷酸化在藍藻光合作用中的重要作用(Journal of Proteome Research 2013, 12 (4):1909–1923),構建了嗜熱四膜蟲的磷酸化調控網絡(Molecular & Cellular Proteomics 2014, 13 (2): 503 -519),并發現磷酸化修飾在三角褐指藻脅迫響應中起重要作用(Journal......閱讀全文
蛋白質乙酰化修飾的精細調控
近期,國際著名學術期刊《美國國家科學院院刊》在線發表了中國科學技術大學生命科學學院施蘊渝教授與姚雪彪教授研究組的合作成果,文章標題為EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m
科學家重組真核生物tRNA乙酰化修飾活力并實現RNA定點高效乙酰化修飾
4月13日,中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員周小龍團隊,在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上以Activity reconstitution of Kre33 and Tan1 reveals a molecular ruler mechanism in euka
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾,20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中,大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關,如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾,20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中,大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關,如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質及多
磷酸化多肽及其修飾方法
蛋白質磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一種蛋白質翻譯后修飾,20世紀50年代以來一直被生物學家看作是一種動態的生物調節過程。在細胞中,大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關,如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質
水生所蛋白質翻譯后修飾組學研究獲進展
蛋白質的翻譯后修飾,如磷酸化、乙酰化等,是調節蛋白質生物學功能的關鍵步驟,是蛋白質動態反應和相互作用的一個重要分子基礎,也是細胞信號網絡調控的重要靶點。由于翻譯后修飾蛋白質在樣本中含量低且動態范圍廣,其研究極具挑戰性。近期,中國科學院水生生物研究所葛峰研究員學科組在蛋白質翻譯后修飾組學及其功能方
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節,這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映,這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
多肽磷酸化修飾及檢測方法
磷酸化影響著細胞生命的方方面面。在細胞中,大概有1/3的的蛋白質被認為是通過磷酸化修飾的。蛋白質的磷酸化修飾與多種生物學過程密切相關,如DNA損傷修復、轉錄調節、信號傳導、細胞凋亡的調節等。磷酸化蛋白質及多肽的研究可以幫助人們闡述上述過程的機理,進一步認識生命活動的本質。肽谷生物依據自身原料優勢和技
表觀遺傳之組蛋白修飾—組蛋白乙酰化
大家好,我又來啦~~今天給大家放送的是表觀遺傳之組蛋白修飾相關的內容噢,組蛋白修飾也是一個比較復雜的過程,今天呢,我們就給大家講講組蛋白乙酰化及相關的產品。?一 組蛋白修飾?真核生物染色質的基本結構單位是核小體,它由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成,其中組蛋白八聚體包含 2 (H2
磷酸化修飾蛋白質組學共性關鍵技術研究獲突破
近日,廣東省農業科學院農業生物基因研究中心晏石娟團隊聯合加拿大約克大學、德國馬普分子植物生理研究所等研究人員在磷酸化修飾蛋白質組學共性關鍵技術研發方面取得重大突破,首次搭建全自動在線磷酸化蛋白質組學分析技術平臺,解決了磷酸化蛋白質組學研究的一大瓶頸。相關研究以農業生物基因研究中心為第一完成單位在線發
國自然沖刺蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點
每年三月初,都是科研界的“高考”倒計時,因為距離國自然基金申請的截止日期已不到半月。縱觀歷年國自然申請情況,蛋白的翻譯后修飾都是申請中重大研究方向之一。2018年國自然統計表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修飾的相關基金項目,總研究資助金額超過2億。 繼上周的腸道微生物研究方案
國自然沖刺蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點
每年三月初,都是科研界的“高考”倒計時,因為距離國自然基金申請的截止日期已不到半月。縱觀歷年國自然申請情況,蛋白的翻譯后修飾都是申請中重大研究方向之一。2018年國自然統計表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修飾的相關基金項目,總研究資助金額超過2億。 繼上周的腸道微生物研究方案解析后(國自然沖
sumo化與磷酸化修飾聯合分析
隨著質譜技術的不斷進步,大規模修飾組學的方法也越來越成熟,PTM作為生物體內非常重要的生理現象也逐步被揭示出參與各項生命活動。今天我們就一起來學習一篇運用質譜技術對磷酸化修飾和類泛素化修飾鑒定,找出兩種修飾聯合作用對在DNA復制損傷壓力時的響應。該篇文獻來自哥本哈根大學的研究人員于2017年10月發
何謂化學修飾調節
凡通過化學基因的引入或除去,而使蛋白質或核酸共價結構發生改變的現象。化學修飾(chemical modification)調節方式有別于別構調節。它以引起酶分子共價鍵的變化、化學結構的改變而影響酶活性。酶的化學修飾是在另一種酶的催化下完成的,是體內快速調節的另一種重要方式。化學修飾的方式包括磷酸化與
化學性調節具有哪些特點
凡通過化學基因的引入或除去,而使蛋白質或核酸共價結構發生改變的現象。化學修飾(chemical modification)調節方式有別于別構調節。它以引起酶分子共價鍵的變化、化學結構的改變而影響酶活性。酶的化學修飾是在另一種酶的催化下完成的,是體內快速調節的另一種重要方式。化學修飾的方式包括磷酸化與
蛋白質磷酸化修飾的進化與功能相關性研究取得新成果
10月18日,Molecular Biology and Evolution雜志在線發表了中科院系統生物學重點實驗室李亦學研究組與曾嶸研究組、日本國立遺傳研究所Yoshio Tateno教授以及德國國家環境生物學研究中心流行病研究所在中科院系統生物學重點實驗室的進修生Ludwig
水生所四膜蟲蛋白質磷酸化修飾特征等研究獲進展
11月7日,國際蛋白質組學領域刊物Molecular & Cellular Proteomics在線發表了題為Phosphoproteomic analysis of protein phosphorylation networks in Tetrahymena thermophila, a
張麗華發文:N磷酸化修飾蛋白質的富集和鑒定方法
摘要 蛋白質磷酸化修飾在細胞的信號轉導、代謝、發育等生命過程中發揮著重要作用。除了研究較為透徹的發生在絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸側鏈羥基的O-磷酸化修飾之外,近年來,發生在組氨酸、精氨酸和賴氨酸側鏈氨基的N-磷酸化修飾受到了越來越廣泛的關注。然而,由于N-磷酸化修飾具有獨特的P-N鍵結構,導致其化
蛋白質磷酸化
Tyrosine Kinase Assay Using Synthetic Peptides?(T. Miller)Small synthetic peptide substrates are especially well suited for applications such as assay
蛋白翻譯后修飾的基金申請解析與研究注意點(二)
由此可見,泛素化相關基金無論是申請項目數還是金額數均在向磷酸化逼近,甚至從重點項目數看,18年泛素化的項目數已然超過了磷酸化。進一步統計表明,泛素化研究資助項目在醫學部中一共98項,總資助金額高達4700萬元。由此可見,泛素化的相關研究正是科研界的“當紅小生”,基金申請的一大熱點。圖2.國自然基金項
結核桿菌研究新進展:乙酰化修飾圖譜公布
近日,發表于雜志Int J Biochem Cell Biol.上的一篇文章中,來自西南大學和杭州景杰生物科技有限公司的研究者公布了結核分歧桿菌的乙酰化修飾譜圖。近年來科學家都非常有興趣致力于病原微生物的蛋白質翻譯后修飾研究,本文中作者首次全面鑒定了結核分歧桿菌的乙酰化修飾。這也是繼公布首張結合
研究發現全新組蛋白修飾類型——賴氨酸乙酰乙酰化
細胞代謝為生命過程提供能量。同時,代謝物可共價修飾蛋白質來發揮信號傳導功能。雖然許多代謝物在代謝通路中的作用廣為人知,但它們介導細胞信號調控的功能有待探索。酮體(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羥基丁酸)為脂質代謝產物。在葡萄糖缺乏的狀態下,肝臟產生的酮體可用作多種組織的替代能源,且與多種病理生理狀態密
Protein-Cell:病毒感染時翻譯后修飾乙酰化的動態調控
天然免疫應答是機體應對病原微生物入侵的第一道防線,在殺傷病原微生物、清除感染細胞和維持體內穩態等方面發揮關鍵作用。蛋白質翻譯后修飾(protein post-translational modifications,PTMs)廣泛參與調控各種通路中信號分子的激活。非組蛋白乙酰化修飾(non-hi
科學家探討蛋白質翻譯后修飾對肉品質影響
我國生鮮肉加工、貯藏、流通過程存在品質劣變快、損耗高的突出問題。從分子水平揭示生鮮肉品質形成與劣變的代謝通路,精準控制生鮮肉劣變和靶向調控肉品質,是我國肉類產業亟待攻克的重大難題。 中國農科院肉品加工與品質調控創新團隊近十年來聚焦宰后早期能量代謝與蛋白質翻譯后修飾關聯調控肉品質的分子機制,取得系
阿爾茨海默癥與蛋白修飾
阿爾茨海默癥(Alzheimer's disease,簡稱AD)俗稱老年癡呆癥,是一種中樞神經系統退行性疾病,引發患者的認知障礙和記憶能力損害,導致患者日益惡化的生活能力減退和死亡。已故的美國前總統里根,英國的前首相撒切爾夫人等名人均受此病困擾和折磨。 AD的主要病理特征為腦內分布有大量的β-
精確修飾位點譜圖庫的建立與磷酸化蛋白質組的-DIA-解析3
結果顯示,從 DIA 數據中提取、定量到 6401 條可信的磷酸化肽,占譜圖庫磷酸化肽總數(6505 條)的 98.4%(圖 5)。磷酸化肽的豐度和離子化效率普遍較低,本實驗如此高的解析成功率表明,基于 Orbitrap 的 DIA 數據具有極高的譜圖質量和出色的靈敏度。??圖5. DIA可
精確修飾位點譜圖庫的建立與磷酸化蛋白質組的-DIA-解析1
引言 數據非依賴采集(Data-Independent Acquisition, DIA)是當前最熱門的質譜采集技術之一,它以非目標的方式將質量范圍分為若干窗口,依次并循環采集窗口內所有母離子的二級碎片[1,2]。DIA 與 SRM 類似,也是基于子離子(transition)定量,相比
精確修飾位點譜圖庫的建立與磷酸化蛋白質組的-DIA-解析2
2. 磷酸化樣本的 DDA 鑒定、可信度篩選和譜圖庫建立磷酸化樣本信息和色譜質譜參數見實驗條件部分。3 針 DDA 數據按磷酸化檢索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 軟件搜庫鑒定(S/T/Y+79.966 Da),并使用 ptmRS 模塊對位點打分(圖 2-1)。搜庫完成
基因翻譯后調控的過程
翻譯后修飾(PTM)是對蛋白質的共價修飾。像RNA剪接一樣,它們有助于使蛋白質組更加豐富多樣。這些修飾通常由酶催化。此外,諸如氨基酸側鏈殘基的共價添加這樣的修飾過程通常可以被其它酶逆轉。但蛋白水解酶對蛋白質骨架的水解切割是不可逆轉的 。PTM在細胞中發揮著許多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失活
基因表達的翻譯后調控的簡介
翻譯后修飾(PTM)是對蛋白質的共價修飾。像RNA剪接一樣,它們有助于使蛋白質組更加豐富多樣。這些修飾通常由酶催化。此外,諸如氨基酸側鏈殘基的共價添加這樣的修飾過程通常可以被其它酶逆轉。但蛋白水解酶對蛋白質骨架的水解切割是不可逆轉的。PTM在細胞中發揮著許多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失