2年Science基因組學文章引用次數高達100
據The Scientist報道,一篇發表在Science雜志上的基因組學文章成為基因組學領域熱門的文章,從2007年發表后,總的引用次數高達100次。 這篇文章即是:V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector,” Science, 316:1718–23, 2007. (Cited in 100 papers)。 這篇文章是繼5年前,科學家首次公布岡比亞按蚊基因圖譜后的第二張蚊子的基因圖譜文章。這篇文章公布的是埃及伊蚊的基因組圖譜,埃及伊蚊是傳播黃熱病和登革熱的媒介。有了兩種蚊子的基因組圖譜,將有助科學家研究蚊子的行為模式和傳播病原的模式。 除了這兩種蚊子的基因圖譜外,科學家們最近還對其他3種人類疾病傳播者進行了測序,分別是,Culex quinquefasciatus; Pediculus hum......閱讀全文
什么是基因組作圖?
中文名稱基因組作圖英文名稱genome mapping;genomic mapping定 義確定界標或基因在構成基因組的各條染色體上的位置,以及染色體上各個界標或基因之間的相對距離,繪制遺傳連鎖圖或物理圖。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)
表觀基因組的概念
中文名稱表觀基因組英文名稱epigenome定 義全基因組的甲基化圖譜。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
基因組DNA的定義
中文名稱基因組DNA英文名稱genomic DNA定 義組成生物基因組的所有DNA。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
功能基因組的定義
表達一定功能的全部基因所組成的DNA序列,包括編碼基因和調控基因。
細胞核基因組
每條染色體含1個DNA分子,1個細胞的全部遺傳信息(基因)都編碼在線狀的DNA分子上。由于每個體細胞中有2套染色體(2n),故所含的DNA是由兩個基因組(genome)構成。每個單倍體基因組約含3.2×109bp.人類基因的平均長度為1~1.5kb,所以基因組以足以編碼1.5×106蛋白質,但實
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
北京基因組所等解析NK細胞白血病功能基因組
侵襲性NK細胞白血病(ANKL)起源于NK細胞異常增殖,病情進展迅速,多數患者在極短時間內發生多器官衰竭,部分患者會出現吞噬血細胞的現象,病情兇險。ANKL患者即使積極接受正規治療,平均生存時間也僅有幾個月。目前,臨床上ANKL的治療面臨兩大問題:患者對傳統化療方案不敏感,醫學界沒有統一的治療標
研究發現人類合子基因組激活起始于父源基因組
表觀遺傳修飾包括DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質可及性和染色質高級結構等,在基因的表達調控中發揮重要作用。人類精子和卵細胞的染色質表觀修飾狀態存在較大差異。在受精后的早期胚胎里,來自精子的父源染色質和來自卵細胞的母源染色質會經歷劇烈的表觀遺傳修飾重編程,最終達到兩者類似的模式。人類胚胎的合子基因
北京基因組所開發出比較群體基因組學新算法
隨著基因組測序技術的發展,物種和群體水平基因組數據呈指數增長。這些數據為在基因組水平鑒定和解析自然選擇機制提供了機遇。然而,目前的分析方法面臨著技術瓶頸和挑戰。其中,關鍵問題是如何高效準確地檢測作用于非編碼區的自然選擇效應。同時,能夠高效、高性能地分析多物種大樣本數據,成為方法學方面的迫切要求。
Nature:全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日,一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中,來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析,結果發現了4種不同的亞型,這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式,該技術可以幫助
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium,簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥,加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
Nature-Biotechnology定義病毒基因組標準:何謂高質量基因組
據說,地球上的微生物總量超過了銀河系中的恒星數量,而且病毒總量也要比之前預計的多得多。 在最新的Nature Biotechnology雜志上,美國能源部(DOE)聯合基因組研究所(JGI)構建了重要的病毒序列數據庫,同時提出了病毒基因組標準,指出了三類基因組質量的分級。 目前雖然許多病毒未
北京基因組所等解析NK細胞白血病功能基因組
侵襲性NK細胞白血病(ANKL)起源于NK細胞異常增殖,病情進展迅速,多數患者在極短時間內發生多器官衰竭,部分患者會出現吞噬血細胞的現象,病情兇險。ANKL患者即使積極接受正規治療,平均生存時間也僅有幾個月。目前,臨床上ANKL的治療面臨兩大問題:患者對傳統化療方案不敏感,醫學界沒有統一的治療標
基因組所發布表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS-Open-Platform
近日,由中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)國家基因組科學數據中心(NGDC)開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
中國啟動十萬人基因組計劃:繪制國人精細基因組圖譜
科學家們希望通過繪制中國人精細基因組圖譜,來研究疾病健康和基因遺傳的關系。 此次啟動的“中國十萬人基因組計劃”覆蓋地域包含我國主要地區,涉及人群除漢族外,還將選擇人口數量在500萬以上的壯族、回族等9個少數民族。 基因是DNA上有遺傳效應的片斷,人類的生、老、病、死等都與基因有關。而基因組和
破譯對蝦基因組-獲國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊,與國內外多家單位共同合作,歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組,獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜,研究成果于1月21日在《自然-通訊》(Nature communications)在線發表,為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
《基因組生物學》:一種超級細菌的基因組測序完成
最近,英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作,研究結果顯示,這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術,其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境,從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日,中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作,證實界面極化
中國大豆基因組公布并發現該基因組組裝錯誤
大豆是重要的糧食經濟作物,為人類提供了主要的油料和蛋白資源。大豆起源于中國,古稱“菽”,約在5000年前由其野生種馴化而來,隨后廣泛傳播于世界各地。大豆在引種和改良過程中產生了遺傳瓶頸效應,使來自不同主產區的大豆品種間具有顯著的遺傳變異。目前,我們廣泛采用的大豆參考基因組來源于美國品種“Will
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
海洋所成功破譯對蝦基因組并獲得國際首個基因組圖譜
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊,與國內外多家單位共同合作,歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組,獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜,研究成果于1月21日在《自然-通訊》(Nature communications)在線發表,為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
血基因組DNA提取實驗——血基因組DNA-試劑盒提取法
血基因組DNA提取可用于:(1)從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細胞、培養細胞、病毒和線粒體中提取DNA;(2)用于后續測序、遺傳信息學等研究。實驗方法原理采用特殊的細胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。實驗材料抗凝全血試劑、試劑盒血基因組DNA 試劑盒儀
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者: 種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae) 基因組:~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
The-Scientist:最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI,現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙,后又轉變為一本每月出版的雜志,同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息,并幫助科學家分析研究的,以協助決策影響他們的
測序基因組勘探食品污染
上周,兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠(Blue Bell Creameries)已確認有少量食品原料已感染李斯特菌,目
基因組學分析揭示
英國《自然》雜志18日在線公開的一篇基因組學論文顯示,來自西伯利亞阿爾泰山脈東部尼安德特人的祖先,和現代人祖先的相遇與交融繁殖可能比原先認為的更早。已有證據顯示,尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向現代人貢獻了遺傳物質。這項新研究還顯示,大約在10萬年前,現代人和尼安德特人之間
基因組分析的代表方法
基因組分析的代表方法 - end -上期回顧“二次元”基因第一回(1)“二次元”基因第一回(2)“二次元”基因第一回(3)“二次元”基因第二回(1)
基因組的改變過程
生物體所有細胞都源自同一個單細胞,因此它們應該具有相同的基因組。但是,在某些情況下,細胞間會出現差異。細胞分裂期間的DNA復制和環境誘變劑的作用都可導致體細胞發生突變。在某些情況下,這種突變會導致癌癥,因為它們會導致細胞更快地分裂并侵入周圍組織。?在減數分裂期間,二倍體細胞分裂兩次以產生單倍體生殖細
真核基因組的特點
真核基因組的特點之一就是存在多基因家族(multi gene family)。多基因家族是指由某一祖先基因經過重復和變異所產生的一組基因。
細胞化學詞匯前基因組
中文名稱:前基因組英文名稱:pregenome定 義:某些病毒基因組DNA進入細胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下產生的一條作為遺傳信息載體的信使核糖核酸(mRNA)。可以通過逆轉錄形成雙鏈的病毒基因組DNA。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)