英國將測序萬人基因組用于疾病研究
近日,在英國倫敦的科學博物館,維康基金會(Wellcome Trust)宣布了英國10K(UK10K)項目,即英國將在接下來的三年內測定10000個人的基因組序列。英國10K項目的負責人Richard Durbin表示,這項宏偉的計劃將得到生物醫學慈善會約1000萬英鎊的支持,10K項目旨在找出與肥胖和精神分裂癥等疾病相關的罕見基因變異。 研究人員將測定已加入長期研究計劃的4000名英國人的全基因組序列,其中一半的研究是針對英國的雙胞胎來進行的,另一半則是針對父母與子女來開展。Durbin在英國維康基金會桑格研究所工作,他表示該項目將尋求發現每個人基因組中插入和缺失的位點,以便將這些突變位點與其不適的癥狀聯系起來。他強調說,許多人都是自愿加入到研究計劃,從出生起,他們就被研究人員所跟蹤觀察,許多生理指標也都經過了反復的測量。 另外的6000個人則只是測定其外顯子序列,即編碼蛋白的那部分基因。Durbin表示,參與......閱讀全文
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定
-震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!
?震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤! 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低,全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源,但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用,使得基因組數據面臨很多問題。 近日,約翰霍
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?(記者張夢然)美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具,用于組裝來自各種物種的真正完整(即無縫)的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱,他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序,繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱,這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程,對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道,加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中,對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因,從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一,提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖,但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上,兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列,以及小麥染色體3B基因組序列,另外兩個研究小組
《Genome-Research》:根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型,與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性,破壞宿主細胞膜和粘附的能力,粘附到人體組織的能力,是許多細菌病原體的主要毒力因子,包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌,自從上世紀40
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列(論文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示,該病毒與此前在
首個完整人類基因組序列公布
? 由美國國家人類基因組研究所、加利福尼亞大學圣克魯斯分校、華盛頓大學等機構研究人員領銜的國際科研團隊3月31日公布了首個完整、無間隙的人類基因組序列。與這項重大成果相關的6篇論文當天發表在美國《科學》雜志上。美國國家人類基因組研究所在一份公報中表示,人類基因組含有約30億個DNA(脫氧核
《自然》:美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日,深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜,這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后,我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只,這一研究成果將對于挽救和保護朱
科學家完成辣椒全基因組序列測定
由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文,今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表,標志著辣椒基因組序列成功解碼,我國辣椒基礎性研究取得重大進展,進入分子育種階段。 美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學
科學家破譯“純種馬”基因組序列
馬有90多種遺傳疾病與人類的遺傳疾病相似??? ? ?一個國際科研小組11月5日報告說,他們破譯了“純種馬”的基因組序列。這項研究成果將刊登在6日出版的新一期《科學》雜志上。??? ? ?報告中所指的“純種馬”最早是300多年前英國培育的一種名貴賽馬品種,后被一些歐美和亞洲國家引進,主要用于賽馬和馬
蠶“姑娘”終于有了完整的基因組序列
西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列,并揭示鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化的新機制。日前,相關研究成果在線發表于《科學進展》。雌蠶。課題組供圖雄蠶。課題組供圖在昆蟲中,性染色體組成以XX/XY系統為主,而鱗翅目昆蟲性染色體組成與大部分昆蟲不同,
三篇Nature-Methods:定位基因組的調控序列
科學家們利用染色質對DNase消化和Tn5轉座的敏感性,對基因組的調控序列進行定位和解讀。 近來越來越多的證據顯示,許多遺傳學差異并非直接影響基因,而是改變控制基因開/關的調控序列。近期Nature Methods雜志上發表了三篇文章,介紹了在基因組中定位調控序列的新技術,闡述了進行數
首次測定南極抗凍魚基因組序列
近,包括美國東北大學H. William Detrich教授在內的一個國際研究小組,首次測定了南極抗凍魚(Antarctic notothenioid fish)的基因組序列。他說,這一突破性成果,將闡明動物對寒冷水域獨特的進化適應性,將有助于揭示魚類如何應對海水溫度上升,由于氣候變化,預計接下
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
我國自主完成首個果樹作物基因組序列圖譜
華中農業大學今天透露,該校科研人員經過一年多努力,已繪制完成甜橙的全基因組序列圖譜。這是我國自主完成的第一個果樹作物基因組序列圖譜。這一農業科技基礎研究成果,將對加快我國柑橘品種改良,改變柑橘品種大量依賴進口的狀況,提升我國柑橘產業的核心競爭力起到重要作用。 據悉,柑橘是世界栽培面積
我國首次完成寨卡病毒全基因組序列測定
2月22日,記者從軍事醫學科學院獲悉,該院與廣州市第八人民醫院、出入境檢驗檢疫系統相關單位密切合作,在獲得從委內瑞拉歸國患者臨床標本后,采用高通量測序技術,于2月21日直接從尿液中獲得病毒全基因組序列。 寨卡病毒屬黃病毒科,是一種主要由伊蚊傳播的蟲媒病毒。1947年首次在烏干達寨卡叢林中的恒河
螞蟻基因組序列被破譯-有助探究人類衰老根源
美國科學家8月30日表示,他們首次繪制出了兩種螞蟻的全基因組序列圖。此舉可為科學家更好地了解人類衰老以及行為表現提供幫助。 該研究項目的負責人、紐約大學蘭貢醫療中心的生化學教授丹尼·賴因伯格說:“螞蟻是絕對的社會動物,螞蟻個體的生存要依靠螞蟻群體,這與我們人類非常相似。無論是工蟻、兵
我國科學家開發高效基因組序列分析工具
類的疾病易感性和生理特征等常見性狀的差異,往往由DNA序列變化造成,這些DNA片段缺失、增加、異位等變化被統稱為遺傳變異。全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通過比對大量人群的遺傳信息,利用統計學檢測遺傳變異和性狀之間關聯性的方法。西湖大學的
我國完成世界首張西瓜基因組序列圖譜
我國主導完成世界首張西瓜基因組序列圖譜的繪制與破譯,相關研究成果于北京時間11月26日凌晨在國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》上在線發表。 西瓜是全球重要的經濟作物和夏季消暑水果,但就是這樣一種常見的水果,人們卻始終未能從內到外了解它。過去,各國科學家雖然知道栽培西瓜遺傳多樣性狹窄是制約西瓜
遺傳發育所等解析鹽芥全基因組序列
鹽芥是十字花科鹽芥屬的一種鹽生植物,與雙子葉植物研究中所常用的模式植物擬南芥親緣關系較近。鹽芥具有作為模式植物的一系列良好特征,如個體較小、生活周期短、自花授粉、種子量大、基因組較小,而且易于轉化。最重要的是,鹽芥具有對高鹽、干旱和低溫等非生物脅迫極高的耐受能力,這使其成為研究植物耐受非生物脅迫