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    TheScientist熱議:出人意料的甲基化

    DNA甲基化是基因組中重要的表觀遺傳學標志,在大多數生物的生命周期中基因組的甲基化模式都相對穩定。然而近期發表在Genome Biology雜志上的兩篇文章顯示,有的生物在一生中不斷累積著甲基化,有的生物則可能通過甲基化去除大量DNA。 吉林大學劉明遠教授所領導的研究團隊首次在線蟲中發現了基因組甲基化現象,他們還發現旋毛形線蟲Trichinella spiralis會隨著時間推移累積甲基化標簽。劉明遠教授在接受The Scientist采訪時表示,“我非常驚訝,在我們分析的是一種線蟲中,T. spiralis是唯一擁有DNA甲基化的,而且它的甲基化模式如此獨特。” T. spiralis會感染包括人類在內的多種哺乳動物。一旦這種寄生蟲到達小腸,幼蟲就會成熟并交配。新生線蟲進入血流,在肌肉組織安家,并被包裹在囊包內休眠,至到它們再次進入新宿主腸道而蘇醒 劉明遠教授的研究團隊與華大基因合作,篩查......閱讀全文

    Nature 表觀遺傳學進展將遺傳學、環境與疾病聯系了起來!

      21世紀,表觀遺傳學的研究得到了快速發展,同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西,當然了,這其中也存在一些大肆宣傳的成分,本文中,我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的,同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展;我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用,以及表觀

    孫方霖:表觀遺傳學 后基因組時代的領舞者

    DNA雙螺旋的解碼者、諾貝爾獎獲得者Watson說:“你可以繼承DNA序列之外的一些東西。這正是現在遺傳學中讓我們激動的地方。” 不久前,美國國立衛生研究院利用由“路標計劃”管理的新基金,啟動了表觀基因組學研究計劃,一批表觀遺傳學項目和研究人員將獲得數百萬到上千萬美元的經費支持。幾乎在同時

    達爾文加拉馬克,可能才是完整的進化論

      隨著科學的進一步發展,達爾文理論也顯示出了一些不足之處。  所謂物競天擇,適者生存,現代生物學的許多主流研究方向都以查爾斯·達爾文(Charles Darwin)“自然選擇”的進化論為基礎:只有最能適應環境的生命體才能在物種演化的洪流中獲得生存和繁衍的權利。這個自然選擇的過程也被稱為適應,而最容

    表觀遺傳學分子生物學軟件——DNA甲基化分析工具

    第一類:基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP)和重亞硫酸鹽測序(bisulfite sequencing, BS)引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性,使常規的分子生物學

    程曉東《自然》文章揭示表觀遺傳學研究的新線索

    來自美國Emory大學華裔教授程曉東(Xiaodong Cheng)領導的研究組發現了小鼠基因組中DNA序列的一種特殊模式,該模式在DNA分子調節基因表達的方式中起到基礎性作用。該研究組與來自德國Jacobs大學的同事在8月22日的的《自然》雜志網絡版上公布了這些發現。 自從科學家破解了構成人類

    表觀遺傳學關于DNA甲基化

    表觀遺傳學是研究表觀遺傳變異的遺傳學分支學科從目前的研究來看,X 染色體劑量補償、DNA 甲基化、組蛋白密碼、基因組印記、表觀基因組學和人類表觀基因組計劃等問題都是表觀遺傳學研究的內容。其中甲基化是基因組DNA 的一種主要表觀遺傳修飾形式,是調節基因組功能的重要手段。在脊椎動物中,CpG二核

    ChIP-Chip技術的介紹與應用

    人類基因組計劃的完成開啟了一個新的紀元——功能基因組時代來臨,與基因信息相比較,人們更關注于基因的功能、調控網絡與信號通路等信息。表觀遺傳學研究與核內蛋白因子的功能分析成為基因表達調控研究的重要組成部分。結合了染色質免疫共沉淀與基因芯片技術的ChIP-chip技術的浮現使得全基因組范圍內DNA與蛋白

    2015國家自然科學基金:表觀遺傳學什么是重點

      來自國家自然科學基金委員會的消息,8月18日國家自然科學基金委員會公布了2015年國家自然科學基金申請項目評審結果,其中面上項目16709項、重點項目624項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16155項、地區科學基金項目2829項、海外及港澳學者合作研究基

    DNA甲基化研究方法的回顧與評價

    摘要: DNA甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。隨著對甲基化研究的不斷深入,各種各樣甲基化檢測方法被開發出來以滿足不同類型研究的要求。這些方法概括起來可分為三類:基因組整體水平的甲

    壽命能推算嗎?加州大學科學家提出“預測方法”

      從古至今,從國內到國外,從煉丹術到現代科學,長生不老似乎一直是人類樂此不疲的追求。  但若要延緩衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大學洛杉磯分校(UCLA)生物統計學家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)發現了一種預測一個人生命周期的方法:基于300~500個DNA甲基化標記,

    PNAS首次評估表觀遺傳學突變率

      Groningen大學的科學家們在重要模式生物擬南芥中,精確評估了表觀遺傳學標志出現或消失的頻率,有助于深入理解表觀遺傳學改變在植物進化中的重要性。這項研究發表在五月十一日的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。  表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下影響基因的活性。大多數動物(包括人類)的

    Science解讀甲基化組新觀點

      在真核生物中,DNA甲基化通常發生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不會改變DNA序列,它被視為一種表觀遺傳學標志。DNA甲基化可以在細胞分裂過程中延續到子代細胞,這一機制現在已經相當明確。而這種繼承性使DNA甲基化成為儲存表觀遺傳學記憶的潛在途徑,這種記憶包括環境或發育過程中的基因調控。不過要證實

    精準醫療:再吸金€6.7億,4篇Nature奠定臨床新技術

      近年來,隨著基因組學技術在醫療領域的廣泛應用,全球范圍內對疾病的診療能力有了很大的提高,各國政府也紛紛制定了相關的醫療計劃,并投入大量的資金。近日法國首次宣布啟動《法國基因組醫療2025》計劃,精準醫療再度吸來重金。疾病診療技術是精準醫療得以實現的關鍵,6月27日,Nature平臺連發四篇文章證

    Nature子刊:熱點蛋白解決表觀遺傳爭議

          近二十年來,科學家開始逐漸認識到DNA中的遺傳密碼只代表了生命藍圖中的一部分信息。遺傳信息還來自于DNA結構上的特殊化學標簽模式,這些表觀遺傳學標簽決定了DNA包裝的緊密程度以及特定基因的開關。   隨著越來越多的表觀遺傳學標簽被發現,

    生活環境和生活方式會影響你的表觀基因組

      法國巴斯德研究所和CNRS領導的一項基因組研究,首次證實生活環境和生活方式能夠影響我們的表觀基因組。表觀基因組控制著我們基因的表達,但不影響基因的序列。  研究人員發現,從森林遷移到城市對人類免疫應答的表觀遺傳學模式有深遠的影響。而生活方式(定居耕種或游牧狩獵)主要影響較為持久的機能,比如發育相

    新的基因編輯領域突破口—表觀遺傳調控

      幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白

    新的基因編輯領域突破口—表觀遺傳調控

      幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白

    新的基因編輯領域突破口——表觀遺傳調控(一)

    幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白修飾

    人類基因組DNA甲基化數據分析

      近期來自電子科技大學,清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發,闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法,并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法,以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。  DNA甲基化是表觀

    《PLOS Genetics》:表觀遺傳學可解釋2型糖尿病

      2型糖尿病,原名叫成人發病型糖尿病,多在35~40歲之后發病,占糖尿病患者90%以上。2型糖尿病患者體內產生胰島素的能力并非完全喪失,有的患者體內胰島素甚至產生過多,但胰島素的作用效果較差,因此患者體內的胰島素是一種相對缺乏,可以通過某些口服藥物刺激體內胰島素的分泌。大約8%的美國人和全球超過3

    獲得諾獎的干細胞技術或能延緩衰老速度

      “長生不老”是歷代君王的夢想,而如何延緩衰老帶來的不良影響,維護老年人群的健康,是當代醫藥工作者試圖攻克的重要課題。近年來的研究表明,一項獲得諾貝爾獎的科學技術可能成為緩解衰老速度的關鍵!  罕見的成人早衰癥  而揭示這一諾獎技術抗衰老潛力的研究,源于對早衰癥患者的研究。這些患者的身體高速衰老,

    PNAS發布人類胎盤甲基化組

      甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究,揭示了人類胎盤的甲基化組,文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現,37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD),這與大多數人體組織不同,在大多數人體

    PNAS發布人類胎盤甲基化組

      甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究,揭示了人類胎盤的甲基化組,文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現,37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD),這與大多數人體組織不同,在大多數人體

    表觀遺傳學研究揭示拉美人長壽之謎

      加州大學洛杉磯分校UCLA的研究人員首次證實,拉美人(Latinos)的衰老速度的確比其他民族的慢。這項研究發表在本期的Genome Biology雜志上,有望幫助科學家們找到適合所有人的抗衰老途徑。  “盡管拉美人患糖尿病和其他疾病的比例較高,但他們的壽命比高加索人長。這被科學家們視為一種難以

    GenomeResearch:雙生子表觀基因組研究

      基因決定了人生命中的方方面面,不過環境也能對基因產生強烈的影響,這種影響在人出生前就已產生,而且其造成的影響將會伴隨人的一生。日前,研究人員首次展示了子宮內環境對新生兒表觀遺傳學圖譜的影響,即我們出生時就帶有的DNA化學修飾,這項研究將為人們提供寶貴的疾病風險信息。文章發表在7月16日的Geno

    DNA甲基化研究方法的回顧與評價(圖)

    摘要: DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。隨著對甲基化研究的不斷深入,各種各樣甲基化檢測方法被開發出來以滿足不同類型研究的要求。這些方法概括起來可分為三類:整體水平的甲

    甲基化領域重要研究成果解讀!

      本文中,小編整理了近年來科學家們在甲基化研究領域取得的重要研究成果,與大家一起學習!  【1】Science:重大進展!揭示DNA甲基化增強基因轉錄機制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不

    癌癥、糖尿病和生活方式有多大關系?表

      不管是否研究生物,孟德爾這個名字對于讀者朋友們一定不會陌生,估計他應該是很多朋友們中學時代在生物學科上的一個噩夢吧。  孟德爾是偉大的生物學家,他用豌豆奠定了自己“遺傳學之父”的地位。和他相比,另一位搞遺傳學的科學家拉馬克則可以說是光景慘淡。在19世紀初,拉馬克大膽地提出了“用進廢退,獲得性遺傳

    Nature Genetics:單細胞全基因組DNA甲基化組新發現

      北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心,北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法,首次在單細胞分辨

    Nature:不容忽視的表觀基因組

      肥胖有可能不僅寫在基因之中,也寫在基因之上。迄今為止最大型的一項探討人類表觀基因組(epigenome)的研究發現,某些表觀遺傳標記與身體質量指數(body mass index,BMI)相關。   在上個月的《柳葉刀》(The Lancet)雜志上,科學家們報告稱在2500多人的血液

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