最新基因組測序成果盤點
近來，各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點，以饗讀者。 種屬：野鴨，綠頭鴨(Anas platyrhynchos) 基因組：約13 billion bp 鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人員測序了一只北京雌鴨的基因組，并將其與其他鳥類和哺乳動物基因組進行比較。研究顯示，鴨基因組中的免疫相關基因與雞類似，差不多是哺乳動物的一半。 研究人員通過深度轉錄組分析，在鴨基因組中，鑒定了應答禽流感病毒的基因。大多數情況下，鴨在感染流感病毒之后并不表現出癥狀。研究人員發現，鴨的β-防御素基因多樣性很高，賦予這種水鳥獨特的病毒防御機制。他們還分別研究了，感染H5N1高致病菌株和弱毒株的鴨子，并在此基礎上闡明了與病毒免疫有關的基因。(詳見：北京鴨基因組研究或助力抗擊“禽流感”) Y. Huang et al., “The duc......閱讀全文
斑馬魚
一、概述斑馬魚是生長在印度、巴基斯坦淡水河流中的一種硬骨魚（鯉魚），成年魚全身僅長4－5厘米，因全身橫向分布著一道一道褐色的斑馬線而得名。斑馬魚很容易在實驗室飼養，一般3個月就可以達到生殖成熟期，雌魚每次產卵200枚左右，一生可產卵數千枚，斑馬魚所產之卵經24小時即可胚胎發育成熟，仔魚期只有1個月。
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
斑馬魚出生就識數！
意大利科學家發現，斑馬魚幼魚在孵化后96小時里可以識別不同數量的黑條，研究者表示這一發現表明數字能力可能在新生斑馬魚中是與生俱來的。相關研究3月24日發表于《通訊—生物學》。 過去的研究表明，人類新生兒和新孵化的孔雀魚、小雞（孵化時腦已經高度發育的物種）具有數學能力。但在此之前，人們對新生時處
斑馬魚基礎研究
近期，我們收到了很多小伙伴提交的文獻獎勵申請，其中，有2篇成功吸引了小編的注意，這2篇文章的內容都是斑馬魚研究相關的。我們都知道，斑馬魚是一種常見的模式生物，但是市面上針對斑馬魚的抗體卻非常少，我們不僅有一百多種斑馬魚抗體，而且還可以根據客戶需求來進行定制生產。下面來看看這2篇文章吧。01標題：Sa
斑馬魚顯微CT實驗
斑馬魚作為傳統的脊椎動物模型已經廣泛應用于人類疾病和胚胎發育過程的研究，斑馬魚全基因已經完全清楚，與人類基因組有85%同源性，這意味著在斑馬魚身上進行的實驗，其結果很多都適用于人類。斑馬魚與其他實驗常用動物相比，具有較高的繁殖率和生長速率，并且其胚胎發育過程是在體外進行的，科研人員通過顯微鏡直接觀察
基因組學突破性成果：斑馬魚序列解析
人類發育，生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體，但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里，斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。在《自然》雜志網站發表的兩篇文章里1,2，報道了斑馬魚參考基因組序列和完成超過10,000個蛋白編碼基因的斷裂性突變體的鑒
斑馬魚基因編輯技術介紹
斑馬魚又叫藍條魚，因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類，同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小，成魚體長約4-6厘米，而且成魚常年產卵且產卵量大，可達300-1000粒，還是體外受精并發育，因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。斑馬魚這種原
斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
轉基因斑馬魚的構建
實驗概要本實驗對斑馬魚導入含 EGFP的質粒，觀察其在動物體內的表達情況，在斑馬魚體內，綠色熒光蛋白從原腸胚到出苗期均能在熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光。主要試劑EGFP、綠色熒光蛋白基因、pEGFP-N2載體、E.coli主要設備試管、試管架、可調式微量加樣器、電泳儀、電泳槽、染色缸、42℃恒溫水浴箱
斑馬魚胚胎DNA的制備
材料和試劑1.????????蛋白酶K（羅氏03115836001）2.??????? 1M的Tris，pH值8.33.??????? 氯化鉀4.??????? 吐溫20（10％，EMD4 biosciences，655207）5.??????? NP40（10％，Merck，492018）設備1.
水生所發布高質量AB品系斑馬魚參考基因組
斑馬魚是生命科學、健康科學和環境科學等研究領域的重要模式生物之一。常見的兩種實驗室斑馬魚品系分別是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑馬魚被國內外很多實驗室作為研究對象。然而，卻缺乏一個高質量的AB品系斑馬魚參考基因組。 由于不同品系斑馬魚來源不同，各品系之間存在著大量基因序列上的
北大、加大等聯手探索斑馬魚全基因組突變新技術
來自北京大學生命科學學院、美國國立人類基因組研究所和加州大學生物系的研究人員，最近在利用逆轉錄病毒插入法引發斑馬魚全基因組范圍內基因突變的研究中取得重大進展。文章刊登于7月18日在線版《PNAS》。 研究人員采用其研制的一組技術，用假性逆轉錄病毒（pseudotyped retroviruses）
斑馬魚色素細胞如何形成條帶
一項研究發現，斑馬魚的特征條帶反映了這種動物的皮膚上的色素細胞的運動和它們之間的相互作用。盡管科研人員長久以來就注意到了數學模型可以準確地重現動物界的許多特征條帶和斑點，動物圖案背后的生物過程在很大程度上尚未得到解釋。為了更好地理解這些過程，Hiroaki Yamanaka 和Shigeru
斑馬魚人類疾病模型的構建
斑馬魚是唯一的經過大規模遺傳篩選的脊椎動物物種。許多斑馬魚的哺乳動物同源基因已經被克隆，并且發現有相似的功能，證實了斑馬魚作為人類疾病模型的可行性。通過Tol2轉座子技術、基因突變（插入誘變、ENU化學誘變）、基因敲除（TALEN,CRISPER）等技術，構建在特點靶點標記熒光蛋白的轉基因品系及
基因組學研究成果讓斑馬魚研究“快馬加鞭”
基因組學研究成果讓斑馬魚研究快馬加鞭（Genomics: Zebrafish earns its stripes）作者：謝訓衛人類發育，生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體，但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里，斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。
定向基因編輯改寫斑馬魚的DNA
斑馬魚是基因研究中一種常用的模式生物。現在科學家可以對它們的基因組進行定向的編輯。 據Nature近日報導，在對脊椎動物和人類疾病的研究中，斑馬魚是一種重要的模式生物。它的卵是透明的，在體外孵化，它的繁殖周期很短，生長速度快，這些都意味著，很適合在生物生存的條件下對它的胚胎進行密切研究。而
斑馬魚造血干細胞生成機理
法國家日前通過對斑馬魚胚胎進行即時監控，發現了其造血的生成機理。這一成果為醫學界研究白血病療法提供了新思路。該研究由法國國家中心和巴斯德研究所共同完成。研究人員在最新一期英國雜志上報告說，他們采用即時成像對斑馬魚的胚胎進行了觀察。結果發現，斑馬魚胚胎主動脈的部分內皮細胞先是發生卷曲，隨后蜷縮成一團，
斑馬魚平臺助力HSP發病機理研究
遺傳性痙攣性截癱（HSP）又稱家族性痙攣性截癱，是一種神經系統退行性變性疾病。其病理改變主要是脊髓中雙側皮質脊髓束的軸索變性或脫髓鞘，以胸段最重。 臨床表現為雙下肢肌張力增高，腱反射活躍亢進，病理反射陽性，呈剪刀步態。2018年5月11日，中國國家衛生健康委員會等5部門聯合制定了《第一批罕見病目錄》
方案27.6－斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
武漢研究斑馬魚揭示器官再生之謎
身長約4厘米，具暗藍與銀色縱條紋 基因與人類的相似度達87% 心臟能再生 約2000種人類疾病能出現在其身上 胚胎在體外發育，且完全透明 一種經濟實惠的實驗動物，一對斑馬魚一次可生產300只“魚寶寶” “斑馬魚的基因與人類相似度高達87%，人類無法長出第二個心臟，而斑馬魚的心臟卻能再生
解鎖電鰻發電之謎，讓斑馬魚發電
研究人員證實，他們發現的基因控制區只控制肌肉中鈉通道基因的表達，而不控制其他組織。電魚和電鰻一樣，可以根據種類、性別、甚至個體來區分其他電魚，這要歸功于它們的電器官，它還允許它們傳輸和接收類似于鳥叫聲的信息。最近發表在《科學進展》(Science Advances)上的一項研究描述了微小的基因改變是
研究揭示斑馬魚“自我定位”神經回路
斑馬魚幼魚能夠弄清它們在哪里，去過哪里，以及如何回到原來的位置。幼體斑馬魚在被洋流推離航道后如何追蹤自己的位置并導航呢？科學家發現，這與一種多區域的大腦回路有關。相關研究近日發表于《細胞》。 “我們研究了一種行為，在這種行為中，斑馬魚幼魚必須記住過去的位移，以準確地保持它們的位置，因為水流可能把
斑馬魚研究全套裝備配置清單
斑馬魚由于養殖方便、繁殖周期短、產卵量大、胚胎體外受精、體外發育、胚體透明等特點，已成為生命科學研究的新寵，是最受重視的脊椎動物發育生物學模式之一。你的實驗室在做斑馬魚研究嗎？斑馬魚研究需要哪些工具？你知道斑馬魚研究的最強裝備嗎？服務全球科學家48年歷史，WPI為您供全套的斑馬魚研究工具，包括斑馬魚
The－scientist：2013年度最熱基因組
新的一年即將來臨，The scientist雜志盤點了2013年度的高引基因組研究，讓我們看看今年又有哪些新解碼的基因組受到熱捧。 斑馬魚基因組 種屬：Zebrafish, Danio rerio 基因組大小：~1.41 billion base pairs 斑馬魚(Da
Dev－Cell：轉基因斑馬魚的彩色皮膚
美國杜克大學的研究人員，利用基因工程改造的方法，造成單個的皮膚細胞可以產生70種不同顏色的熒光。該研究發表在最近的《Developmental Cell》上。 該團隊并非是為了好玩才做成這樣五彩斑斕的斑馬魚，實際上，他們希望通過顏色標記來研究斑馬魚皮膚的愈合。利用顏色來標記細胞，可以讓斑馬魚皮
敲降斑馬魚基因的方法學比較
一、基因敲降的前期準備工作相同 1.1 生物信息學分析目標基因在斑馬魚早期胚胎發送過程中是否有表達。 1.2 收集斑馬魚早期發育胚胎（通常為48 hpf前的胚胎），提取總RNA，然后進行體外轉錄（RT）。 1.3 設計檢測目標基因表達的PCR引物，以1.2獲得的cDNA為模板，
斑馬魚基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的設計方案 1.1 基因的基本信息 確認斑馬魚基因的基本信息，包括名稱ID號等，一般會在NCBI等查詢。 1.2 分析基因結構、氨基酸序列等做生物學信息的分析 1.3分析蛋白質的保守結構功能域 通過綜合考慮，設計最佳的KO靶點。 1.4
斑馬魚基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的設計方案 1.1 基因的基本信息 確認斑馬魚基因的基本信息，包括名稱ID號等，一般會在NCBI等查詢。 1.2 分析基因結構、氨基酸序列等做生物學信息的分析 1.3分析蛋白質的保守結構功能域 通過綜合考慮，設計最佳的KO靶點。 1.4
斑馬魚如何長出新的神經元
研究人員已經發現了使得斑馬魚的大腦能夠在其受到創傷性損害之后再生的機制。與哺乳動物不同，這些在淡水中生長的小鰷魚因為腦部損傷所致的炎癥會伴有新神經元的產生。 如今，Nikos Kyritsis及其同事展示，在損傷反應中，斑馬魚腦部的炎癥會激活特定的信號傳導分子及神經膠質細胞，后者可促進
寄生蟲感染或破壞斑馬魚實驗
研究人員表示，一種感染實驗室斑馬魚的常見寄生蟲可能令多年的行為實驗結果產生混淆。不過，批評者認為，這個案例仍有待證實。 和小鼠一樣，斑馬魚被用在全球的實驗室中，以研究從藥物療效到諸如精神分裂癥和自閉癥等遺傳性疾病和障礙的所有事情。由于斑馬魚和人類都具有高度社會性，因此研究人員認為，和嚙齒類動物
