一種可以詳細描繪人體細胞蛋白質圖譜的新工具
共同第一作者Christopher Go使用192種已知存在于特定細胞器中的蛋白質標記物對人類細胞景觀進行了調查,這些細胞器可以“標記”同一隔間中相鄰的蛋白質。 西奈衛生研究院的研究人員發表了一項研究,對人類活細胞的組織進行了超詳細的研究,提供了一種新的工具,可以幫助世界各地的科學家更好地了解疾病期間發生的情況。 發表在《Nature》雜志上的這項新研究是由多倫多大學分子遺傳學系教授、Lunenfeld-Tanenbaum研究所(LTRI)高級研究員Anne-Claude Gingras博士的實驗室進行的。 共同第一作者Christopher Go和James Knight博士使用192種已知存在于特定細胞器中的蛋白質標記物對人類細胞景觀進行了研究,這些細胞器可以“標記”同一隔間中相鄰的蛋白質。 Go說:“人類細胞圖譜能夠預測活細胞中所有隔間中的4000種蛋白質的定位。我們對人類細胞的所有主要細胞器進行采樣,并使用創......閱讀全文
首張腫瘤細胞蛋白質圖譜繪就
日前繪制的首張癌癥蛋白質相互作用圖譜涵蓋了以前被忽視的突變,而這些突變可能成為治療的目標。 美國加州大學圣地亞哥分校的Trey Ideker和同事完成的這幅圖譜,研究了幾十種常見癌癥蛋白質在乳腺癌和頭頸癌中的相互作用。“癌癥基因并不是單獨起作用的。”Ideker說,“就像任何機器的部件一樣,它們
《自然》發布重要單細胞RNA圖譜:首張小腸細胞圖譜
我們腸道上皮是人體內多樣性最高,最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一,組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能,還有影響它的疾病,麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞,完成了一
腸道細胞綜合圖譜面世
腸道是人體重要的消化器官,腸道由不同的解剖區域組成,這些區域發育速度不同,在消化、營養吸收、代謝和免疫調節中也發揮著不同的作用。正確認識腸道細胞的分化過程對于腸道疾病的研究至關重要。 近期,英國桑格研究所的研究團隊發布了人體腸道細胞綜合圖譜。相關研究在《Nature》發表,題為:Cells o
人體細胞圖譜問世
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505110.shtm
一種可以詳細描繪人體細胞蛋白質圖譜的新工具
共同第一作者Christopher Go使用192種已知存在于特定細胞器中的蛋白質標記物對人類細胞景觀進行了調查,這些細胞器可以“標記”同一隔間中相鄰的蛋白質。 西奈衛生研究院的研究人員發表了一項研究,對人類活細胞的組織進行了超詳細的研究,提供了一種新的工具,可以幫助世界各地的科學家更好地了解
蛋白質組學牛人利用新技術分析蛋白質圖譜
蛋白質組(proteomics)分析是針對不同條件下細胞中蛋白的功能和特性進行研究的統稱,這一領域的研究一直以來都落后于基因組研究,后者在技術創新方面取得了不少成果,一些令人眼花繚亂的快速基因組圖譜繪制技術,還有無需借助核心實驗室設備就能完成實驗的技術,都令我們印象深刻。 但是與基因組研究
《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個
-科學家繪制世界最大蛋白質圖譜
科學家已經發現了上萬種新的蛋白聯結,約占蛋白聯結總量的四分之一。為了揭示蛋白質是如何構建細胞與機體,來自多個國家的科學家組成的研究團隊篩選了不同生物的細胞,這些細胞從變形蟲到蠕蟲到老鼠到人類,來源十分廣泛。 這項蛋白質科學的壯舉,是來自七個國家的三個研究小組合作的結果,由多倫多大學唐納利中心的
Cell重要成果:繪制凋亡蛋白質組圖譜
斯克里普斯研究所的科學家們同時繪制出了細胞中兩種最重要的蛋白質修飾類型的圖譜,揭示了在凋亡這一重要細胞過程中它們之間廣泛的協同作用。相關論文發表在7月20日的《細胞》(Cell)雜志上。 磷酸化(Phosphorylation)和蛋白質水解(proteolysis)幾乎總是被獨立開展研究。
中國人腎透明細胞癌蛋白質基因圖譜繪制成功
中國是腎癌大國,其中40%的腎癌患者在初診或隨訪過程中出現轉移,從而導致治療效果不佳。其中,遺傳異質性高、缺乏精準有效治療靶點是腎癌治療效果差的主要原因。復旦大學附屬腫瘤醫院教授葉定偉團隊攜手復旦表型研究院教授丁琛團隊和上海交通大學醫學院附屬新華醫院教授趙健元團隊,成功繪制出中國人腎透明細胞癌蛋白質
首個肺癌全息細胞圖譜問世
肺癌是發病率和死亡率增長最快、對人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一。近年來,肺癌患者有更加年輕化的趨勢,治愈較為困難。雖然目前科學家在肺癌治療方面已取得了巨大進展,但對其細胞層面上的科學認識仍難盡如人意。近日,著名學術期刊《自然—醫學》推出史上最完整的肺癌細胞圖譜,這將是科學家們在細胞層面深入
首個果蠅細胞衰老圖譜公布
了解身體如何衰老是一個重要的研究領域。美國貝勒醫學院、斯坦福大學等機構研究人員在《科學》雜志上發表了首個果蠅細胞衰老圖譜(AFCA),詳細描述了果蠅中163種不同細胞類型的衰老過程。 分析表明,體內不同細胞的年齡不同,每種細胞類型的衰老過程都遵循特定的模式。AFCA為衰老研究提供了寶貴的資源,
Science繪制細胞藥物反應圖譜
為什么對于同一種藥物人們會有不同的反應?研究人員第一次解開了與藥物反應相關的遺傳和環境因素,使得我們朝著預測出藥物將會對我們造成的影響又近了一步。 來自英屬哥倫比亞大學的研究人員將6,000種酵母菌株暴露于3,000種藥物之中。他們對酵母菌株進行了改造使得能夠測量這些酵母的反應。研究人員發
PNAS:單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表文章,介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法,他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型,并確定神經元的亞型。他們還觀察了
Nature:科學家再構建蛋白質-“遺傳圖譜”
《自然》雜志發表了一項由劍橋大學和默沙東的科學家領導完成的重要成果:他們成功創建出人類蛋白質的第一個詳細遺傳圖譜。這一突破性研究有望增進我們對各種疾病的了解,并有助于新藥的開發。 DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2 這項研究描述了人類血漿“蛋白質組”(pro
Nature:科學家再構建蛋白質-“遺傳圖譜”
6月6日,《自然》雜志發表了一項由劍橋大學和默沙東的科學家領導完成的重要成果:他們成功創建出人類蛋白質的第一個詳細遺傳圖譜。這一突破性研究有望增進我們對各種疾病的了解,并有助于新藥的開發。 DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2 這項研究描述了人類血漿“蛋
圖譜研究揭示蛋白質間交互作用鏈
圖譜揭示上萬種蛋白質之間存在相互作用 一國際研究團隊通過大規模蛋白圖譜研究發現,有機生物細胞內的不同蛋白質間具有較深聯系,正是它們間的相互作用促進了細胞和生物體的構建。而蛋白圖譜的繪制,或可幫助科學家探尋導致人類錯綜復雜的各種疾病的根源。 這項研究由加拿大多倫多大學的安德魯·艾米莉教授和美國
Nature:科學家再構建蛋白質-“遺傳圖譜”
6月6日,《自然》雜志發表了一項由劍橋大學和默沙東的科學家領導完成的重要成果:他們成功創建出人類蛋白質的第一個詳細遺傳圖譜。這一突破性研究有望增進我們對各種疾病的了解,并有助于新藥的開發。 DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2 這項研究描述了人類血漿“蛋白質組
多學科交互,深度繪制細胞圖譜
大多數人類疾病實質上是細胞故障的產物。但要了解細胞的哪些部分出錯會導致疾病,科學家首先需要對細胞有完整的了解。美國加州大學圣地亞哥分校醫學院的研究人員及其合作者在24日發表于《自然》雜志上的論文中,介紹了尺度集成細胞(MuSIC)技術,這是一種結合了顯微鏡、生物化學和人工智能的技術,揭示了以前未
腦脊液細胞學分類及圖譜
1.免疫活性細胞:均由淋巴細胞(圖1)衍生而來,包括?小淋巴細胞:為正常人腦脊液中的主要細胞,無特殊的病理意義,占細胞總數75%。①轉化型淋巴細胞(圖2)和淋巴樣細胞:提示局部的體液或細胞介導的免疫反應。臨床意義:提示病毒性腦炎、結核性腦膜炎、腦膿腫、多發性硬化等。②漿細胞(圖3):亦名抗體細胞,它
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為肺
泛癌癥T細胞單細胞圖譜-相關成果發表
北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心(ICG)張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院,在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
水生所完成模式硅藻的蛋白質組精細圖譜
硅藻是一類重要的單細胞光合真核生物,分布廣泛,提供了地球上約20%的初級生產力,對整個地球生物圈意義重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物,其基因組序列于2008年公布,但目前基因組的注釋仍很不完善。蛋白基因組學(Proteogenomics)
第一張人類器官蛋白質組圖譜
在廣州南方醫科大學舉行的第五屆中國蛋白質組學大會暨首屆粵港蛋白質組學學術交流會上,由中國科學家領銜的“人類蛋白質組計劃”有望實現肝癌診治突破性進展。 據了解,該計劃實施3年來,圍繞人類肝臟蛋白質組的表達譜等九大科研任務,我國科學家成功測定出6788個高可信度的中國成人肝臟蛋白質,系統構建了國際上
Cell重磅:人類病毒蛋白質相互作用圖譜面世
圖片來源:《寄生蟲》海報 近日,一部豆瓣評分9.2的韓國電影《寄生蟲》廣受大家的好評。故事也正如片名一樣,講述了一個貧困家庭“寄生”于富人家庭的故事。說到寄生,其實人體內的寄生事件更是數不勝數,最常見的便是病毒的感染。 病毒是一種比真菌和細菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必須找到合適的活體
Nature:人類細胞圖譜研究先鋒Aviv-Regev
Aviv Regev是一位生物分析專家。現在,她正致力于繪制人體的每一個細胞。 計算生物學家Aviv Regev喜歡做一些看似不可能完成的任務。2011年,她與分子遺傳學家Joshua Levin合作,測試了RNA測序的幾種方法。科學家們在測試幾種技術的極限,以查看哪種方法表現最佳。他們用降解
科學家構建人類發育細胞圖譜
目前,發育生物學的研究主要基于模式生物。由于實踐上存在的挑戰,人類的胚胎發育(從受精卵到胎兒出生)仍是一個知之甚少的“黑匣子”。近期,來自多國研究機構的一項聯合研究闡述了人類發育細胞圖譜及妊娠期參考圖譜構建的路線圖,相關成果發表在《Nature》雜志,標題為“A roadmap for the
建立莖尖細胞特異基因表達圖譜
基因差異表達是細胞分化和不同細胞類型形式特異功能的基礎。細胞特征的轉錄圖譜對于了解不同類型細胞如何生長發育、響應環境至關重要。但植物細胞由細胞壁固著,不易分離,很難獲得細胞類型特異的轉錄數據。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所焦雨鈴研究組在之前的工作中建立了器官邊界區的細胞特異表達圖譜 (Ti