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  • 揭示DNA甲基化與基因沉默的關系

    DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日,加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene silencing through the J-domain protein SILENZIO”的研究論文,該研究描述了兩種擬南芥甲基-CpG 結合域蛋白 MBD5 和 MBD6,它們通過識別 CG 甲基化被招募到染色質,并在不影響 DNA 甲基化水平的情況下冗余抑制基因和轉座子的子集。 這些甲基閱讀器招募了一種 J 結構域蛋白 SILENZIO,它在功能喪失和功能獲得實驗中充當轉錄抑制因子。J 域蛋白通常作為 HSP70 的共同伴侶。事實上,該研究發現 SILENZIO 的保守 J 域基序是其與 HSP70 相互作用及其沉默功能所必......閱讀全文

    揭示DNA甲基化與基因沉默的關系

      DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。  2021年6月3日,加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s

    杰青朱冰團隊發現CSE1L的表達影響DNA甲基化基因沉默機制

      2018年4月10日《PNAS》雜志在線發表了朱冰課題組的研究論文“Roles of the CSE1L-mediated nuclear import pathway in epigenetic silencing”。該研究發現CSE1L作為細胞中經典入核轉運途徑中的重要蛋白,是維持部分甲基化

    沉默轉基因的激活不依賴于拷貝數和DNA過甲基化的變化

      轉基因表達的穩定性在種苗商業化生產中具有重要作用,然而基因沉默現象影響著這種穩定性的產生與維持。  中國科學院華南植物園區永祥團隊長期致力于多基因定點疊加技術的研發以加快分子育種進程。要獲得定點疊加的多基因材料并非易事,在煙草中的實驗結果表明,其效率約為5%,可是在這些留下的材料中,卻有1/3存

    基因組DNA甲基化分析方法

    早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基

    RNAi基因沉默方法

    大約在十年前,2006年諾貝爾生理/醫學獎得主CraigMello和AndrewFire發現,他們能夠將短RNA 分子插入到線蟲中并沉默特定基因的表達。今天,研究人員也常常使用這種強大的RNA 干擾方法來研究哺乳動物系統中的特定基因功能。為了進行這種基因沉默實驗,研究人員通常需要依賴化學合成的RNA

    基因沉默的概念

    基因沉默是指在真核生物(植物、動物、真菌)中保守的由雙鏈RNA誘導的鑒定和破壞其細胞質中異常變異或過表達的RNA的一種機制。

    什么是基因沉默?

    基因沉默是指在真核生物(植物、動物、真菌)中保守的由雙鏈RNA誘導的鑒定和破壞其細胞質中異常變異或過表達的RNA的一種機制。

    在基因組范圍定位DNA甲基化

      DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。   盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技

    與基因沉默相關特殊基因

    奧地利格雷戈爾·門德爾植物分子生物學研究所日前宣布,一個包括該研究所、中國同濟大學、美國加利福尼亞大學等機構科學家在內的國際科研小組發現了一種特殊基因,沒有它,植物細胞內其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英國《自然》雜志網絡版發表了這個國際科研小組的論文。這一科研小組發現的特殊基因名為RDM1,它

    著名學者朱健康Cell子刊表觀遺傳研究新文章

      來自中國科學院上海生命科學研究院和普渡大學的研究人員證實,甲基化CpG結合蛋白MBD7促進DNA主動去甲基化,限制了DNA高度甲基化以及轉錄水平的基因沉默。這一重要的研究發現發表在2月12日的《分子細胞》(Molecular cell)雜志上。  任職于中科院上海生命科學研究院和普渡大學的朱健康

    上海生科院發現植物去甲基化調控的新機制

      2月12日,國際權威學術期刊《分子細胞》(Molecular Cell)在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組的研究論文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat

    RNAi及基因沉默原理

    RNA 干擾(RNAinterference,RNAi)是由雙鏈RNA (double-strandedRNA,dsRNA) 引發的轉錄后基因靜默機制。其原理是:RNaseIII 核酶家族的Dicer,與雙鏈RNA 結合,將其剪切成21 - 25nt 及3'端突出的小干擾RNA (small

    基因沉默的主要類型

    基因沉默,主要有轉錄前水平的基因沉默(TGS)和轉錄后水平的基因沉默(PTGS)兩類:TGS是指由于DNA修飾或染色體異染色質化等原因使基因不能正常轉錄;PTGS是啟動了細胞質內靶mRNA序列特異性的降解機制。有時轉基因會同時導致TGS和PTGS。

    沉默等位基因定義

    中文名稱沉默等位基因英文名稱silent allele定 ?義通常不表達,但在腫瘤細胞中呈現轉錄活性的基因。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

    DNA分析系統:基因甲基化研究的最佳工具

    甲基化研究對于基因的 調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中,基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后,這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化,把健康人的大便

    線蟲基因組中存在DNA甲基化現象

      2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN

    簡述與基因沉默相關特殊基因

      奧地利格雷戈爾·門德爾植物分子生物學研究所日前宣布,一個包括該研究所、中國同濟大學、美國加利福尼亞大學等機構科學家在內的國際科研小組發現了一種特殊基因,沒有它,植物細胞內其他一些基因就只能保持沉默。  最新一期英國《自然》雜志網絡版發表了這個國際科研小組的論文。這一科研小組發現的特殊基因名為RD

    與基因沉默相關特殊基因介紹

    奧地利格雷戈爾·門德爾植物分子生物學研究所日前宣布,一個包括該研究所、中國同濟大學、美國加利福尼亞大學等機構科學家在內的國際科研小組發現了一種特殊基因,沒有它,植物細胞內其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英國《自然》雜志網絡版發表了這個國際科研小組的論文。這一科研小組發現的特殊基因名為RDM1,它

    與基因沉默相關特殊基因介紹

    奧地利格雷戈爾·門德爾植物分子生物學研究所日前宣布,一個包括該研究所、中國同濟大學、美國加利福尼亞大學等機構科學家在內的國際科研小組發現了一種特殊基因,沒有它,植物細胞內其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英國《自然》雜志網絡版發表了這個國際科研小組的論文。這一科研小組發現的特殊基因名為RDM1,它

    關于組蛋白修飾—DNA甲基的基本內容介紹

      在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白甲基化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白— 2

    組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系

    在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,目前仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白—

    染色質重塑因子PKL在RNA介導的DNA甲基化中的功能

      5月31日,《基因組生物學》(Genome Biology)雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心張蘅研究組題為The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation

    著名學者朱健康院士Cell-Research發表表觀遺傳學研究成果

      生物通報道:轉座子通常是通過表觀遺傳學機制(包括DNA甲基化)保持沉默的。12月9日,在《Cell Research》雜志上發表的一項研究中,來自中科院上海生命科學研究院、美國普渡大學以及中科院遺傳與發育生物學研究所的研究人員,在擬南芥中將一對Harbinger轉座子衍生蛋白(HDPs)——HD

    DNA甲基化分析

    The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive

    DNA甲基化預測

    實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測,并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有:GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究

    上海生科院揭示擬南芥DNA主動去甲基化調控新機制

      12月9日,《細胞研究》(Cell Research)雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c

    NIBS何新建連發Plant-Cell、PLOS-Genetics

      北京生命科學研究所的何新建博士帶領的課題組,主要利用模式植物擬南芥為研究材料,運用遺傳學研究方法,結合蛋白、生化和分子生物學手段,研究DNA甲基化和組蛋白修飾的分子機理,并研究它們在基因表達調控和生長發育等方面的作用。近期,何新建博士帶領的兩項重要學術成果,分別發表在國際權威學術期刊《Plant

    升級了!CRISPR可在不改變DNA序列情況下開關基因

      《細胞》雜志9日在線發表的一篇論文表示,美國懷特黑德研究所喬納森·魏斯曼等人設計了一種名為CRISPRoff的新基因編輯技術,可以在不改變DNA序列的情況下使某些基因“沉默”,從而以高特異性控制基因表達。這種“升級版”的基因編輯技術為研究表觀遺傳機制、重大疾病治療以及研發新冠病毒疫苗等提供了有力

    Pyrosequencing-DNA分析系統:基因甲基化研究的最佳工具

    甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中,基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后,這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化,把健康人的大便與結腸癌患

    基因組直接測序法檢測DNA的甲基化

    基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應

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