發表論文的捷徑？線粒體測序論文太多
David Roy Smith是來自加拿大韋仕敦大學的一位生物學助理教授，近期他在The Scientist雜志上發文，指出目前涌現了太多線粒體基因組測序論文，2014年GenBank中新增的線粒體基因組序列信息多達上千條，這幾乎比上一年激增了15%。 Smith指出，很少有人會質疑這些線粒體DNA (mtDNA)作為一種遺傳標記的有效性，但是顯而易見，mtDNA測序已經成為了通過同行評審發表論文的一種捷徑。這些關于線粒體基因組的論文的意義何在？mtDNA序列能直接進入GenBank嗎？從線粒體基因組數據中我們還能獲得哪些新的觀點，重大的發現？ 線粒體DNA的重要性 1981年首個非病毒基因組測序完成，這就是人類線粒體DNA（mtDNA），由此促進了核基因組項目的構建。之后到九十年代初期，科學家們又完成了幾十個其它生物，如陸地植物和原生生物的線粒體DNA測序，這也推動了比較基因組學這一新興領域的出現。 隨著Sange......閱讀全文
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
線粒體基因組的簡介
線粒體是真核細胞的一種細胞器，有它自己的基因組，編碼細胞器的一些蛋白質。除了少數低等真核生物的線粒體基因組是線狀DNA分子外(如纖毛原生動物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及綠藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等)，一般都是
線粒體基因組的簡介
線粒體是真核細胞的一種細胞器，有它自己的基因組，編碼細胞器的一些蛋白質。除了少數低等真核生物的線粒體基因組是線狀DNA分子外(如纖毛原生動物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及綠藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等)，一般都是一個
線粒體基因組的原理
線粒體基因組能夠單獨進行復制、轉錄及合成蛋白質，但這并不意味著線粒體基因組的遺傳完全不受核基因的控制。線粒體自身結構和生命活動都需要核基因的參與并受其控制，說明真核細胞內盡管存在兩個遺傳系統，一個在細胞核內，一個在細胞質內，各自合成一些蛋白質和基因產物，造成了細胞核和細胞質對遺傳的相互作用；但是
線粒體基因組的簡介
線粒體是真核細胞的一種細胞器，有它自己的基因組，編碼細胞器的一些蛋白質。除了少數低等真核生物的線粒體基因組是線狀DNA分子外(如纖毛原生動物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及綠藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等)，一般都是
線粒體基因組的概念
線粒體是真核細胞的一種細胞器，有它自己的基因組，這些基因組統稱為線粒體基因組。線粒體內的DNA，可參與蛋白質的合成，轉錄，與復制，具有較高的研究價值。
《PLoS生物學》：乳齒象線粒體基因組測定完成
這的確有些不可思議。德國科學家利用一顆遠古牙齒化石，成功確定了乳齒象完整的線粒體基因組，這也是迄今為止科學家得到的最古老的線粒體基因組。該研究成果有望加深科學家對于象類分化的理解。相關論文發表在的7月24日的《PLoS生物學》上。?2800萬年前出現的乳齒象是現代大象的近親，它們大約有3米高，有和猛
線粒體基因組的原理簡介
線粒體基因組能夠單獨進行復制、轉錄及合成蛋白質，但這并不意味著線粒體基因組的遺傳完全不受核基因的控制。線粒體自身結構和生命活動都需要核基因的參與并受其控制，說明真核細胞內盡管存在兩個遺傳系統，一個在細胞核內，一個在細胞質內，各自合成一些蛋白質和基因產物，造成了細胞核和細胞質對遺傳的相互作用；但是
人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域
J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標 美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”，計劃于今年夏季啟動，終極目標
人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域
J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標。 美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”，計劃于今年夏季啟動，終極目
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
單分子測序改善微生物基因組組裝
美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章，介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為，單分子測序數據能降低測序費用，并帶來更多完整的基因組，改善微生物基因組數據庫的質量。 隨著測序費用的不斷下降，測序項目的數量也在不斷上升。G
基因組測序揭示多細胞生物進化之謎
最近，研究人員通過對各種綠藻進行基因組測序，已經接近于解開了“引起多細胞生物的遺傳變化”的謎團。 從單細胞生物到多細胞生物的過渡，是地球上生命進化的關鍵進步；在不同的系統發育譜系中，這種改變已經獨立地發生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因，對單細胞祖先成為多細胞來說是必要的”，是一個有趣的
全基因組重測序的生物信息分析內容
1．數據量產出總堿基數量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads統計，測序深度分析。2．一致性序列組裝與參考基因組序列（Reference genome sequence）的比對分析，利用貝葉斯統計模型檢測出每個堿基位點的最大可能性基因型，并組裝出該個體
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
線粒體基因組的DNA相關介紹
與細胞核DNA相比，mtDNA作為生物體種系發生的“分子鐘”(molecular clock)有其自身的優點：①突變率高，是核DNA的10倍左右，因此即使是在近期內趨異的物種之間也會很快地積累大量的核苷酸置換，可以進行比較分析；②因為精子的細胞質極少，子代的mtDNA基本上都是來自卵細胞，所以m
線粒體基因組的基本性質
與核基因組相比，線粒體基因組有如下性質：所有的基因都位于一個單一的環狀DNA分子上。遺傳物質不為核膜所包被。DNA不為蛋白質所壓縮。基因組沒有包含那么多非編碼區域（調控區域或“內含子”）。一些密碼子與通用密碼子不同。相反，與一些紫色非硫細菌相似。一些堿基為兩個不同基因的一部分（重疊基因）：某堿基作為
線粒體基因組的大小解釋
已知的是哺乳動物的線粒體基因組最小，果蠅和蛙的稍大，酵母的更大，而植物的線粒體基因組最大。人、小鼠和牛的線粒體基因組全序列已經測定，都是16．5 kb左右。每個細胞里有成千上萬份線粒體基因組DNA拷貝。果蠅和蛙的細胞里有多少個線粒體以及每個線粒體有多少份DNA拷貝，還沒有準確的數字。估計線粒體DNA
線粒體基因組的疾病關系簡介
人線粒體DNA（mtDNA），共包含37個基因，這37個基因中有22個編碼轉移核糖核酸（tRNA）、2個編碼核糖體核糖核酸（12S和16S rRNA)，13個編碼多肽。 對于可疑線粒體病的患者來說，理想的遺傳學診斷方法是發現導致線粒體結構和功能缺陷的相關基因突變。這些基因突變可能在mtDNA上
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
全球微生物模式基因組測序計劃獲進展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在線發表了國家微生物科學數據中心（中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心）關于全球模式微生物基因組數據庫gcType的論文。gcType是由我國牽頭的全球模式微生物基因組測序計劃的重要成果。 模式菌株（t
攻克基因組測序難題－探究茶樹生物學奧秘
我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載：“神農嘗百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地，在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里，與全球多元文化邂逅交融，發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎，除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
北京基因組所揭示線粒體基因組氧化損傷修復分子機制
線粒體是真核生物細胞主要的能量代謝場所，其中呼吸鏈氧化磷酸化過程伴隨有高水平的氧自由基（ROS）的產生。線粒體基因組缺乏組蛋白結合保護，所以容易受到ROS攻擊而發生損傷，其突變的累積已證實與多種人類疾病（如神經退行性病變、糖尿病、心血管疾病和癌癥等）的發生密切相關。有關核基因組DNA損傷修復分子
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”－對所有真核生物測序
在美國斯密森尼生物多樣性基因組學項目組與中國華大基因公司近日聯合主辦的生物基因組學會議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學戴維斯分校基因組學家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學家張國捷等組成的科研團隊聯合倡議，全球科學家合作開啟另一項與人類基因組計劃（HGP）類似的項目——地球生
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和