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  • 華中農大:利用I型及III型CRISPRCas系統實現基因組編輯

    CRISPR-Cas系統廣泛存在于細菌和古細菌中,近年來科學家們針對它們的分子機制開展研究促使開發出了基于II型系統的一些基因編輯技術(延伸閱讀:中科院Cell發表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而,卻未有研究報道利用I型及III型系統來實現基因組編輯。 來自華中農業大學的研究人員報告稱,他們開發出了一種利用I型和III型CRISPR進行基因組編輯的方法,實現了對冰島硫化葉菌 (Sulfolobus islandicus)的遺傳操控。這項研究發布在10月13日的《Nucleic Acids Research》雜志上。 華中農業大學的佘群新(Qunxin She)教授和梁運祥(Yun Xiang Liang)教授是這篇論文的共同通訊作者。博士生李英俊(Yingjun Li)為論文第一作者。 CRISPR-Cas在原核生物抗病毒防御中發揮重要功能,分別存在于90%和40%的古細菌及細菌基因組中。當前,CRISPR-......閱讀全文

    Nature子刊:基因編輯揭開細菌基因組秘密

      由美國伊利諾伊大學香檳分校化學和生物分子工程系的趙惠民教授(音譯,Huimin Zhao)帶領的一個研究團隊指出,他們利用一種創新的DNA工程技術,發現了隱藏在細菌基因組中的潛在的、有價值的功能。這項研究成果發表在12月5日的Nature Communications雜志上。   每種

    谷峰:PAM序列可影響CRISPR/Cas9介導的基因組編輯效率

      9月26日,由生物谷主辦的2014基因組編輯研討會在上海好望角大飯店隆重舉行。溫州醫科大學附屬眼視光醫院的谷峰教授參加了此次大會并發表了題為"PAM序列對CRISPR/Cas9介導的基因組編輯的影響及AAV-CRISPR/Cas9對人類胚胎干細胞的基因組編輯"的精彩報告。   谷教授基于GFP

    體內基因組編輯介紹

    這應該是最受期待的基因治療方法,即使用基因編輯技術直接修改體內突變的靶DNA,消除致病基因,恢復身體功能。這種方法的優點是可以治愈這種疾病。例如,在亨特綜合征或血友病A患者中,尿酸-2-硫酸酯酶(IDS)或凝血因子-8在體內沒有正常表達。如果將IDS或八因子基因插入基因組,它可以終身正常表達;缺點是

    解析現代月季基因組序列

    科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然

    基因組序列草圖的概念

    中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定  義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)

    山東大學構建dsDNA重組工程的細菌多元基因組編輯方法

      近日,微生物技術國家重點實驗室卞小瑩教授和張友明教授團隊在微生物基因組編輯技術領域取得突破。相關研究成果以“Improved dsDNA recombineering enables versatile multiplex genome engineering of kilobase-scale

    首次測定玉米蛇基因組序列

      在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動

    概述釀酒酵母的基因組序列

      1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10]  在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定

    細菌DNA序列可作信息“存儲器”

      阿根廷科學家近日成功將該國國歌旋律以人工基因編碼形式植入某種細菌染色體中。這一方法不僅可以用來存儲音樂旋律,還可能發展為一種擁有巨大應用潛力的信息存儲方式。   據阿根廷媒體報道,主持研究的阿根廷信息生物學家費德里克·普拉達介紹說,生物的DNA(脫氧核糖核酸)由四種脫氧核苷酸組成,即腺嘌呤、胸

    Science解析熱點基因組編輯工具

      近來,Cas9酶作為一種有力的新基因組編輯工具,引起了人們極大的研究熱情。現在加州大學伯克利分校的研究人員,首次成像了這種酶的精細三維結構,這一成果無疑會進一步提高Cas9的應用價值。文章于二月六日發表在Science雜志上。   加州大學的生化學家Jennifer Doudna和生物物理學家

    人類基因組編輯指南

    ? ? 人類基因組編輯在研究和治療方面不斷取得進展,同時也在世界各地的科學家中引發了倫理問題。? ? 一方面,技術進步可以使醫生能夠修改那些包含在精子和卵子中的種系基因,防止后代罹患毀滅性的遺傳疾病。但與此同時,基因編輯改變人類遺傳的可能性,也警示著許多科學家,促使他們認為應該無限期禁止種系編輯。?

    馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布

    中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成   9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。

    -震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!

    ?震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!   隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低,全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源,但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用,使得基因組數據面臨很多問題。  近日,約翰霍

    胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出

      來自美國的一個研究小組稱,他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序,繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱,這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程,對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。   胡蘿卜和生菜

    白菜甘藍油菜全基因組序列測定

     ? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。   研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該

    新軟件按需組裝無縫基因組序列

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?(記者張夢然)美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具,用于組裝來自各種物種的真正完整(即無縫)的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭

    《Genome-Research》:根據基因組序列預測MRSA毒性

      微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型,與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性,破壞宿主細胞膜和粘附的能力,粘附到人體組織的能力,是許多細菌病原體的主要毒力因子,包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。   金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌,自從上世紀40

    牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成

    牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物  牡蠣養殖  近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,

    草魚全基因組序列圖譜繪制完成

      近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。  據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一

    中國新型冠狀病毒的基因組序列

      《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列(論文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示,該病毒與此前在

    四篇Science文章公布最新基因組序列

      小麥是全球最重要的糧食作物之一,提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖,但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上,兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列,以及小麥染色體3B基因組序列,另外兩個研究小組

    史上最全小麥基因組序列圖集問世

    ??據最新一期《自然》雜志報道,加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中,對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因,從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥

    Nature子刊:為基因組編輯保真

      有時生物學很殘酷,在健康和致命疾病之間,往往只有一個遺傳密碼的差異。盡管人們一直在研究這些微小改變引發的疾病,但在人類干細胞中對其進行重現依然頗具挑戰。   現在,Gladstone研究所的科學家們開發了一個新技術,能夠幫助人們對人類基因組進行有效的單堿基編輯,文章發表在近期的Nature

    Science:新技術實現精確基因組編輯

      麻省理工學院、布洛德研究所以及洛克菲勒大學的研究者開發出了一種新穎的技術,可以通過添加或去除基因來對活細胞的基因組進行修改。研究者表示,這種技術易于操作且成本低,可以用于對產生物燃料的生物將進行基因工程操作,設計用于人類疾病研究的動物模型,開發新的疾病療法,以及其他的潛在應用

    Nature子刊:基因組編輯終結貧血

       澳大利亞新南威爾士大學的研究人員發現,改變紅細胞中DNA的單個堿基,可提高它們生產攜氧血紅蛋白的能力。這項成果于5月14日在線發表在《Nature Communications》上,有望帶來鐮狀細胞貧血及其他血液疾病的治療。  研究人員利用TALENs基因組編輯技術,將一個有益的、天然存在的遺

    Science:人類基因組編輯指南

      人類基因組編輯在研究和治療方面不斷取得進展,同時也在世界各地的科學家中引發了倫理問題。  一方面,技術進步可以使醫生能夠修改那些包含在精子和卵子中的種系基因,防止后代罹患毀滅性的遺傳疾病。但與此同時,基因編輯改變人類遺傳的可能性,也警示著許多科學家,促使他們認為應該無限期禁止種系編輯。  來自麥

    Science發表CRISPR基因組編輯重要成果

      利用兩種互補的分析方法,Whitehead研究所和麻省理工學院-哈佛大學Broad研究所的科學家們,第一次在人類基因組中鑒別出了人類細胞系或培養人類細胞生存及增殖必需的基因宇宙。  他們的研究結果和在該研究中開發出的材料,不僅為全球科研團體提供了寶貴的資源,還可應用于發現各種人類癌癥藥物可靶向的

    -Nature:鼓勵討論編輯人類胚胎基因組

      上月,科學家成功編輯人類胚胎基因組的消息不出所料讓人們大吃一驚。這項研究之所以如此引人矚目,是因為它改變了人類生殖細胞;這也意味著,該技術如果在可存活的胚胎中實現,編輯后的基因變化會遺傳給所有的后代。社會該對此作何反應?該如何看待其他當前正在進行的,或是未來可預見的類似實驗?又該如何應對呢?  

    Nature子刊:基因組編輯新技術

      許多的實驗室都在利用近期發現的一種細菌和古細菌天然防御機制作為基因組編輯工具。與真核生物的RNA干擾過程相似,這一CRISPR-Cas系統通過序列特異性切割外源核酸,保護了原核生物免受病毒攻擊。而CRISPR-Cas系統有可能發生非特異性靶向,導致基因組別處突變,也引起了人們越來越多的關注。

    基因組編輯為罕見病帶來希望

      對于患有重癥聯合免疫缺陷(SCID)的嬰幼兒來說,一個簡單的感冒或耳部感染都可能是致命的。他們出生時就具有一個不完整的免疫系統,也被稱為“泡泡男孩”或“泡泡寶寶”,即使很最溫和的細菌他們也不能抵御。他們通常生活在無菌的、孤立的環境以避免感染,即便這樣,大多數患者都不會活過一年或兩年。這

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