質粒載體和外源DNA的連接反應
實驗概要掌握DNA體外連接的基本技能，了解連接反應的注意事項。實驗原理DNA片段之間的連接是通過DNA連接酶的催化實現的。DNA連接酶催化具有平末端或互補粘性末端的DNA片段間相鄰堿基通過3’,5’磷酸二酯鍵連接起來，該反為需能反應，通常需要加入ATP或NADH，DNA連接酶對粘性末端的連接效率要遠高于對平末端的連接效率。在基因基因工程實驗中，最常用的來源于T4噬菌體的T4DNA連接酶。對于平末端或互補的粘性末端可直接進行連接反應。一個片段是平末端，另一片段為粘性末端或兩個片段都是粘性末端但不配對，則需要通過各種方式使其可一匹配或通過平末端進行連接。通常采用末端補平、加同聚物尾、加接頭等方式是目的片段之間能夠匹配。 進行連接反應時，為了減少片段的自連，通常要進行去磷酸化，去磷酸化可通過堿性磷酸酶完成。比如將目的片段和載體進行時通常要將載體去磷酸化，以減少載體的自連。同要進行連接反應也經常對目的片段進行磷酸化以增強目的片......閱讀全文
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法（雙脫氧鏈終止法）和Maxam（1977）提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組核苷酸都有共同的起點，卻隨機終止于一種（或多種）特定的殘基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶： 1．大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題：①Klenow片段的持續合成能力較
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同
DNA重組技術(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切與連接（1）酶切反應：同質粒DNA 的鑒定，只不過是質粒DNA 換為載體DNA 。若大量酶切，則成比例增加。（2）加2倍體積的預冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻，-20℃2h以上。（3）15000rpm離心15min，棄上清。（4）加入75%乙醇洗滌2次，離心棄
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定2
（1）CaCl2處理以后的轉化: 當細菌處于0℃、二價陽離子（如Ca2+、Mg2+等）低滲溶液中時，細菌細胞膨脹成球形，處于感受態；此時轉化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羥基-鈣磷酸復合物粘附于細胞表面，重組DNA在42℃短時間熱沖擊后吸附在細胞表面，在豐富培養基中生長數小時后，球狀細胞恢復原
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體2
二、噬菌體載體作為細菌寄生物的噬菌體，大多數具有編碼多種蛋白質的基因，能利用宿主細胞的蛋白質合成體系，進行生長和增殖。構建的噬菌體載體，以λ噬菌體、M13和粘粒最為常用。㈠ λ噬菌體載體野生型λDNA是一種基因組為4.8 kb的線性雙鏈DNA，全部序列已知，共編碼50多個基因。其中約一半基因參與
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定1
重組DNA是在體外用限制性內切酶，將不同來源的DNA分子進行特異地切割，獲得的目的基因或DNA片段與載體重新連接，從而組成一個新的DNA雜合分子。重組的DNA分子能夠通過一定的方式進入相應的宿主細胞，在宿主細胞中進行無性增殖，獲得大量的目的基因或DNA片段，此過程稱基因克隆。重組的DNA分子也能夠在
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體3
在作為載體時，這些噬菌體有一個很大的優點，即克隆到M13mp載體的外源DNA片段（雙鏈），在子代噬菌體便成為了單鏈形式。故應用M13mp進行克隆，可方便地分離到大量含有外源DNA某一單鏈的DNA分子。這種單鏈DNA可在下列工作中作模板：①主要用作雙脫氧鏈終止法進行DNA序列測定的模板；②制備僅有一條
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定3
當多克隆位點有外源DNA片段插入時，破壞此酶的N端閱讀框架，產生無α互補功能的N端片段，因此在帶有外源DNA片段的細菌在含有IPTG/X-gal的培養基上呈白色，見圖7-11 。如果外源DNA插入片段相當短，不破壞β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的閱讀框，有時產生的重組體菌落不呈白色而是呈淺藍色。4
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體1
載體（vector）是攜帶靶DNA（目的DNA）片段進入宿主細胞進行擴增和表達的運載工具。常用的載體是通過改造天然的細菌質粒、噬菌體和病毒等構建而成。目前已構建成的載體主要有質粒載體、噬菌體載體、病毒載體和人工染色體等多種類型，亦可根據其用途不同分為克隆載體和表達載體二類。載體的構建和選擇應考慮以下
DNA合成（DNA－synthesis－）技術介紹
蛋白質概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照預定核苷酸的順序，將脫氧核苷酸逐個進行人工連接合成DNA鏈的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚體支持物上從3′端延伸核苷酸，可自動化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亞磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
DNA－指紋的概念高變區DNA與DNA指紋
人的衛星DNA?或稱隨體DNA?是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重復所構成的。重復片段的組成和拷貝數在不同的個體及基因組的不同位置上不一樣。提取不同個體的基因組DNA 后，用其切點能識別序列為4 個堿基而又不切割該重復片段的限制性內切酶在重復片段的兩側切割基因組DNA ，然后將樣品進行
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“衛士”
“垃圾DNA”的概念是在上世紀70年代提出來的，用來形容那些基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，而在學術上被稱為非編碼DNA序列。 由于當時的科學家普遍認為有生物學意義的蛋白質才是決定生物性狀的關鍵，而且也沒有一種好的理論和技術手段來解釋這些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”這一觀念便形
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“保鏢”
"垃圾DNA"的概念源自上世紀70年代，用來形容基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，在學術上被稱為非編碼DNA序列。 非編碼DNA"開關說"究竟是個啥？ 科學家們發現，人類基因組中包含多達400萬個基因開關和功能調節因子，它們的載體便是"垃圾DNA"。這強烈地沖擊了"DNA序列=生物性
DNA－Fingerprinting,－DNA－Barcoding,－and－Next－Generation－Sequencing－...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become
DNA－Immunoprecipitation－for－the－Determination－of－DNABinding－Specificity
Andrea J. Gossett?and?Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho
DNA連接酶(DNA－ligase)介紹
DNA連接酶是1967年在三個實驗室同時發現的。它是一種封閉DNA鏈上缺口酶，借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA鏈的5'-PO4與另一DNA鏈的3'-OH生成磷酸二酯鍵。但這兩條鏈必須是與同一條互補鏈配對結合的(T4DNA連接酶除外)，而且必須是兩條緊鄰DNA鏈才能被DNA
DNA重組（DNA－recombination）技術：工具酶
一、限制性內切酶限制性內切酶（restriction endonucleases，RE）是其中最重要的工具酶之一。它是一類核酸水解酶，能識別和切割雙鏈DNA分子中的特定核苷酸序列。（一）命名原則限制性內切酶大多從細菌中發現，根據來源進行命名，限制酶的第一個字母（大寫，斜體）為宿主菌的屬名，第二、第三
DNA提取方法洗滌－DNA（或－RNA）
當裂解物通過硅膠膜進行離心分離,現在所提取的 DNA 或 RNA 應該與柱子結合,雜質、細胞蛋白和多糖應該已經通過了。?但是,膜仍然被殘留的細胞蛋白質和鹽弄臟。如果樣品來自植物,仍然會有多糖,也許一些色素留在膜上,或者如果樣品是血液,膜可能會被染成棕色或黃色。洗滌步驟用于去除這些雜質。通常有兩次洗滌
DNA提取方法DNA－提取后純化：將－DNA－與色譜柱結合
離液鹽對于裂解至關重要,而且對于將 DNA(或 RNA)與色譜柱結合也是如此。此外,為了增強和影響核酸與二氧化硅的結合,還添加了酒精。大多數情況下這是乙醇,但有時可能是異丙醇。乙醇百分比和體積有很大的影響。太多,你會帶入大量降解的核酸和小物種,這會影響 A260 讀數并降低你的一些產量。太少,可能難
DNA測序
實驗方法原理 ABI ?PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀)，采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳，應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法)，因此通過單引物PCR測序反應，生成的PCR產物則是相差1個堿基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈DN
DNA定量
Characterization of dnaLEVEL IMaterialsDNA sampleSSC bufferUV spectrophotometer?3?and quartz cuvettesProcedureDissolve a small quantity of your extrac
DNA－Electrophoresis
What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. DNA is a negatively
Phage－DNA
IntroductionThe phage lysate from the plate contains bacterial DNA and RNA, as well as phage DNA encased in the phage coat. The following procedure, d
electrophoresis－of－DNA
Agarose?Gel?Electroporesis?of?DNA Making?the?gel: 1.? Place?casting?platform?with?well?former?sideways?in?gel?stand?where?you?wish?to? pour?
DNA測序
DNA測序（主要內容如下）·?????????Sequencing Gel Preparation·?????????Preparation of Templates?·?????????DNA Sequencing by the Dideoxy Method·?????????DNA Sequen
DNA克隆
DNA克隆（主要內容如下）·?????????General Procedure·?????????PCR Cloning·?????????Subcloning·?????????ET Cloning·?????????Vector Preparation·?????????Ligation Re
DNA標記
DNA標記（主要內容如下）??DNA Labeling by Nick Translation??Random Primed Labeling??End-Labeling??Purification of Labeled DNA??Non-isotopic Labeling??OthersDNA L
DNA轉染
DNA轉染·?????????Transfection of Mammalian Cells Using Lipofectamine (LTI)·?????????Guide to Eukaryotic Transfections with Cationic Lipid Reagents?(PDF)
DNA－Laddering
I. Protocol1. Harvest cellsOptional: wash plate with 37°C PBS (gently, so as not to lose cells); check on microscope,after aspirate PBS or mediaPlace