“組學國標”項目結碩果:最精準的mRNA測序與蛋白質組質譜
二代測序、蛋白質組質譜,這些“高大上”的組學手段早已不是稀罕事,使人們對生命和疾病的理解進入了一個嶄新的時代。這些組學技術大量用于科研的同時,在應用領域卻陷入了巨大的困境。 蛋白質組質譜技術和RNA測序目前幾乎沒有任何值得一提的臨床應用,即便是在臨床應用得相對較多的DNA測序,也飽受重復性差、準確性差的詬病。雖然組學技術看上去有“一網打盡”的優點,但如果重復性差、準確性差,結果的可靠性就無法保證。在科研領域會造成大量的浪費,甚至被不可靠的結論誤導后續的研究;在臨床應用領域甚至可能危及生命,或因為精度太低而造成信噪比低,導致分子標記物不能有效地被測定。 DNA的應用多為定性(突變檢測),而RNA和蛋白質的應用多為定量。RNA和蛋白質的定量組學技術能差到什么程度?以RNA-seq為例,通常高豐度mRNA的定量重現性(技術重復)以CV(變異系數,等于標準差除以平均值)計,能做到10%已經很好了,30~40%也是常有的事;中低豐......閱讀全文
“組學國標”項目結碩果:最精準的mRNA測序與蛋白質組質譜
二代測序、蛋白質組質譜,這些“高大上”的組學手段早已不是稀罕事,使人們對生命和疾病的理解進入了一個嶄新的時代。這些組學技術大量用于科研的同時,在應用領域卻陷入了巨大的困境。 蛋白質組質譜技術和RNA測序目前幾乎沒有任何值得一提的臨床應用,即便是在臨床應用得相對較多的DNA測序,也飽受重復性差、
解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983
全轉錄組測序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA
1. 文章主題:環狀RNA通過靶向miRNA調控的信號傳導促進結直腸癌的轉移發表期刊:Journal of pathology影響因子:5.942發表時間:201906實驗方法:全轉錄組測序實驗樣本:結直腸癌組織肝轉移是結直腸癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全轉錄組測序在CRC肝轉移的小鼠模
Science:宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來,對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
當代謝組學技術遇到單細胞測序技術
代謝組的狀態是對遺傳因素、外部環境和治療干預等信息的綜合反映,因此是一個跟蹤和了解上述因素對表型影響的理想研究目標。代謝組可做多種樣品類型、結果富含各種信息、可作為連接其他組學數據與表型之間的橋梁。過去20年,組學研究飛速發展,處于中心法則末端的代謝組學雖然起步較晚但是發展很快。很多組學研究目前已進
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術,并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
《PLoS生物學》:老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上,美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后,研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
攻克基因組測序難題 探究茶樹生物學奧秘
我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載:“神農嘗百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地,在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里,與全球多元文化邂逅交融,發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎,除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋
illumina測序是轉錄組測序嗎
轉錄組測序屬于測序應用的一種,Illumina測序屬于測序技術的一種,兩者沒有包含于被包含關系,只能說Illumina測序可以做轉錄組測序。
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術,將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq,也就是轉錄組測序,可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括:正常組織與腫瘤組織;藥物治療前后的表達差異;發育過程中,不同發育階段,不同組織的表達