gDNA 的數量和完整性SureSelectQXT WGS 方案需要高質量的 DNA 樣品,以獲得最佳性能和 gDNA 起始材料的精確定量結果。按照該方案使用配有 dsDNA BR 分析試劑盒的 Qubit 儀器進行系列定量分析。將相同的樣品在 4200 TapeStation 系統和 NanoDrop 中均進行6次重復基因組 DNA ScreenTape 分析。圖2顯示了獲自 4200 TapeStation 系統、Qubit 和 NanoDrop 的數據,說明了基因組 DNA ScreenTape 分析法適用于對 gDNA 起始材料進行定量分析。采用UV 光譜法測定 gDNA 所得的量常會過高,這是由于其他緩沖液成分在 UV 光譜中也可能有吸收[4]。此外,基因組 DNA ScreenTape 分析法可在同一 QC 步驟中客觀評價樣品完整性。樣品完整性由 TapeStation 分析軟件的 DNA 完整......閱讀全文
近年來,新一代測序(NGS)技術的應用日益廣泛。隨著測序技術的不斷改進,制備核酸和構建NGS文庫的方法也在改進。對于各種文庫制備方法,我們該如何選擇?近日,美國斯克里普斯研究所的研究人員在《Biotechniques》上發表文章,比較了各種文庫制備策略。 總的來說,在NGS分析之前,制備R
隨著精準醫學和個性化醫療從概念走向實踐,從夢想走進現實,基因組學研究和基因檢測技術也在不斷走向高精尖,單細胞測序無疑已經成為基因組學前沿研究領域的“新寵”。 在第二十屆全國臨床腫瘤大會暨2017年CSCO學術年會上,BD作為全球二代測序配套設備和耗材的優質生產商,攜其全新的“分子標簽”核心技術
中華病理學雜志2017年3月第46卷第3期 近年二代基因測序(next-generation sequencing,NGS)技術快速發展,其應用已進展至臨床檢測,如遺傳疾病、實體腫瘤、血液腫瘤、感染性疾病、人類白細胞抗原分析及非侵襲性產前篩查等。國內外有關學會已出臺相關共識與指南以推動其在臨床
2016年度的基因組生物學技術進展大會(AGBT)于上周在美國奧蘭多舉行。Illumina的CEO Jay Flatley在大會上宣布了其半導體測序平臺,即Firefly計劃的更多細節。 Flatley表示,Firefly將打開新的市場,因為它是如此簡單。最終目標是制成這樣一種設備,輸入的是
1.1.3.2 模板制備程序完全的體外大規模模板制備工作是達成高通量、低價格測序技術的前提。已廣泛使用的乳液PCR擴增技術就是一種很好的方法。不過,由于很難在熱循環測序反應中保證乳液微滴的穩定性,因此最開始實驗的模板擴增方法是恒溫擴增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助細菌的幫助就能擴增
摘要 本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案,介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完
本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案,介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完整性信息的可
本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案,介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完整性信息的可
隨著十三五規劃和國家健康2030綱要的陸續出臺,我國政府也在不斷加大對精準醫療的支持力度。P4 China國際精準醫療大會在十三五規劃國家精準醫療計劃開啟元年隆重舉辦,旨在匯聚政、產、學、研、資各方力量,并將政策、監管、資本、技術、應用、商業整合在一個平臺,進一步探討從系統生物學研究、精準診斷的
如今,癌癥研究人員的手頭又有了一件讓人激動不已的新工具:循環游離DNA(ccfDNA)——只需通過侵入性極小的液體活檢即可采集得到。與從存檔的FFPE腫瘤標本中采集的靜態DNA相比,ccfDNA可提供原發和轉移性腫瘤的實時突變信息。這將大大改善治療決策和監控,對癌癥及其他疾病的生物標志物的檢測和
近年來,新一代測序(NGS)平臺在甲基化研究中開始嶄露頭角。它們帶來了非常靈敏的DNA甲基化圖譜,以單分子分辨率覆蓋整個CpG島。然而,對于時下熱門的5-hmC研究,似乎還缺乏專門的樣品制備工具。為此,Zymo Research公司近日推出兩款新的NGS文庫制備試劑盒,適用于全基因組范圍的5
在上周舉行的實驗室自動化和篩查學會(SLAS)第二屆年會上,PerkinElmer公司展示了一系列新產品,包括表觀遺傳學生化工具箱、JANUS? NGS Express?液體處理工作站和Sciclone? NGSx Workstation?平臺。 表觀遺傳學新品 表觀遺傳學生化工
上周,基因組生物學技術進展年會(AGBT) 在佛羅里達州馬可島舉行,Thermo Fisher Scientific公司在會上發布了Ion Torrent測序技術的最新進展情況。 在周六召開的公司工作會議上,Ion Torrent 研發副總裁Allan Williams提前預告公司正在籌備Io
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligat
對于新一代測序(NGS)而言,樣品制備的重要性不言而喻。每次測序的成本可不低,若樣品制備得不好,則實驗就會徹底糊掉。在此,五位專家就如何改善NGS的樣品制備過程,提出了他們的寶貴建議。 歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的技術人員Ferris Jung: 你需要密切留意起始材料的質量。無論樣品
我們體內生活著不計其數的微生物,它們組成的生態系統就是微生物組。近年來人們發現這些微生物對人體健康有著重要的影響,微生物組研究因此受到了極大的重視,甚至被稱為是人體的“第二基因組”。 微生物組參與了許多重要的機體功能,比如消化食物、合成營養物質和抵御疾病。許多人類疾病都與微生物組失衡有關。科學
在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR
在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹
摘要本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案,介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完整性
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其專利核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其專利核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
【摘要】2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀,從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕,讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間,驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代測序
2.454企業: Roche推出時間: 2005年主流型號: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)樣品要求: 5 μg of DNA,濃度≥300 ng/μL測序原理:焦磷酸測序在測序時,使用了一種叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它
摘要RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評估標準 RNA 測序的樣品完整性的可靠且可重現的指標。由于 RNA 降解以及樣品體積有限,從福爾馬
Eva Graf 安捷倫科技有限公司 Waldbronn, Germany 摘要 RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評
檢測一管血液或尿液,通過其中的標志物來幫助診斷或治療疾病,這個新思路讓人們激動不已。不過,盡管RNA測序(RNA-seq)越來越多地用于小片段RNA的分析,但文庫制備方法的準確性和重復性還是存在問題。 密歇根大學的Muneesh Tewari教授認為:“不同的人采用不同的方法來測序小RNA,有
2018年9月8日,在華大基因集團19周年慶前夕,華大智造首次向業內公開華大智造測序儀文庫構建核心序列,致敬華大基因集團。華大智造成立于2016年,一直致力于研發和生產基因測序設備。如行業內小伙伴們所知,華大智造已擁有四款高通量測序儀——BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2
3、可逆化學阻斷技術測序 利用邊合成邊測序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標記的dNTP。這些核苷酸是“可逆終止子”,因為3’羥基末