單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定三
經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子質量分布圖(圖 3),根據單抗的氨基酸序列理論分子質量進行計算,將觀察到的質譜峰進行歸屬,可以初步推斷該單抗藥物存在多種形式的糖鏈結構,主要包括 G0、G0F、G1F 和 G2F,該結論與常見的單抗組成基本一致,同時根據質譜峰的峰強度信息,我們還可以計算得到不同糖型單抗的相對定量信息,如圖 3 中藍色數字所示。 圖 3. LTQ-Orbitrap Elite 質譜采集的單抗原始質譜圖經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子質量分布圖(G0、G0F、G1F 和 G2F 表示不同類型的糖型,藍色數字表示質譜峰所對應的峰強度和相對定量信息。) 3.2 氨基酸序列測定經過 LTQ-Orbitrap Elite 質譜數據采集和 Proteome Discoverer 1......閱讀全文
單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定-三
經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子質量分布圖(圖 3),根據單抗的氨基酸序列理論分子質量進行計算,將觀察到的質譜峰進行歸屬,可以初步推斷該單抗藥物存在多種形式的糖鏈結構,主要包括 G0、G0F、G1F 和 G2F,該結論與常見的單抗組成基本
單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定-二
質譜分析條件:具體見表 4;?表 3. 氨基酸序列測定的色譜分析條件表 4. 氨基酸序列測定的質譜分析條件?2.2.3 數據分析方法采用 Proteome Discoverer 1.3 軟件對原始譜圖進行數據庫搜索,具體搜庫參數為:包含單抗氨基酸序列的數據庫;半胱氨酸(C)烷基化(+57.021
單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定-一
1. 前言單抗藥物主要是由兩條重鏈和兩條輕鏈通過鏈內和鏈間二硫鍵以及非共價鍵組成,分子質量大約在 150 kD 左右,每條重鏈和輕鏈在 N 端都包含一個可變區域,在 C 端都包含一個恒定區域,并且在每條重鏈上還存在一個 N 糖基化位點,該位點含有不同的糖鏈結構,如圖 1 所示。目前,在生
ADC-單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以...(三)
經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子量分布圖如下所示(圖 4),根據單抗的氨基酸理論序列分子量進行計算,將觀察到的質譜峰進行歸屬,從圖中我們觀察到,該 ADC 單抗分子之間存在 956 Da 左右的質量增加,由此推斷該單抗分子結合了不同數目的
ADC-單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以...(四)
3.2 糖基化位點確定ADC 單抗蛋白與其他單抗蛋白相同,也都包含 N-糖基化修飾,一般發生在保守序列 NXS 或 NXT 中(X 為除脯氨酸外的任意氨基酸)。在糖鏈完整的情況下,直接進行 trypsin 酶解,我們在搜庫時進行 G0F 糖基化可變修飾設定,可以直接獲得該 N 糖基化位點:重
ADC-單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以...(一)
ADC 單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以及ADC 藥物結合位點鑒定1. 前言單克隆抗體藥物是具有高度特異性的靶向藥物,能夠特異性作用于腫瘤細胞,被譽為治療惡性腫瘤的“生物導彈”。ADC 抗體藥,則是在抗體蛋白的特定天然氨基酸上非定點偶聯具有抗腫瘤作用的化療藥物(或稱小分子藥物),以增加
ADC-單抗藥物的分子量、氨基酸序列、糖基化位點以...(二)
2.1.3 數據分析方法采用 Protein Deconvolution 2.0 軟件對原始質譜圖進行去卷積處理,得到完整的蛋白質分子量信息。?2.2 氨基酸序列、糖基化位點和 ADC 藥物結合位點測定?2.2.1 儀器和試劑質譜儀器:Q-Exactive(賽默飛世爾科技,美國);色譜儀器:Acce
序列標簽位點的定義
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
序列標簽位點的簡介
任何DNA序列,只要知道它在基因組中的位置,都能被用作STS標簽。作為基因組中的單拷貝序列,是新一代的遺傳標記系統,其數目多,覆蓋密度較大,達到平均每1kb一個STS或更密集。這種序列在染色體上只出現一次,其位置和堿基順序都是已知的。在PCR反應中可以檢測出STS來,STS適宜于作為人類基因組的一種
液相色譜耦聯Q-Exactive-臺式軌道阱質譜儀分析利...(七)
??圖 11. 將利妥昔抗體還原、烷基化、胰蛋白酶切后,酶切后肽段的基峰色譜圖。??圖 12. 利妥昔單抗輕鏈和重鏈的氨基酸序列。黑色字母顯示的氨基酸代表通過二級質譜圖鑒定到的部分。綠色顯示的序列是僅通過完整肽段一級全掃描數據鑒定到的。紅色顯示的是重鏈部分的兩個氨基酸(AK),他們既不能用一級也
什么是序列標簽位點?
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
序列標簽位點圖的定義
中文名稱序列標簽位點圖英文名稱sequence tagged site map定 義標明序列標簽位點在基因組上位置的物理圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
質譜技術在抗體藥物分析中的應用
質譜技術是抗體藥物分析最重要的技術手段之一。本文簡述了抗體藥物的發展和質譜技術的原理。對于質譜技術在抗體藥物的分析中應用進行了歸類整理,主要分為在一級結構和高級結構分析中的應用。抗體類藥物是指含有抗體片段的蛋白類藥物,所以在惡性腫瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、感染和器官移植排斥等重大疾病上得到了快
質譜技術在抗體藥物分析中的應用
質譜技術是抗體藥物分析最重要的技術手段之一。本文簡述了抗體藥物的發展和質譜技術的原理。對于質譜技術在抗體藥物的分析中應用進行了歸類整理,主要分為在一級結構和高級結構分析中的應用。抗體類藥物是指含有抗體片段的蛋白類藥物,所以在惡性腫瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、感染和器官移植排斥等重大疾病上得到了快
最輕松的糖肽鑒定——PLGS、BiopharmaLynx糖肽分析
糖基化蛋白質參與了幾乎所有重要的生命過程,糖鏈的組成和結構對糖基化蛋白質的構象、功能以及與其它分子的相互作用都具有巨大的影響。許多蛋白類藥物都是糖基化蛋白質,如免疫球蛋白IgG等。蛋白糖基化一級結構的研究內容包括:糖鏈的糖型結構、糖基化修飾的氨基酸位點、以及兩者間的對應關系。這些信息都集中于糖肽結構
關于糖基化的基本概念介紹
指在糖基轉移酶作用下,非糖生物分 子與糖共價結合的過程或反應。根據連接方式可將 糖基化分為D連接糖基化和Ⅳ-鏈糖基化。上市的重組單克隆抗體(單抗)藥物除不含Fc段的 5個片段抗體為非 糖基化抗體外,其余全部為N-連接糖基化單抗,Fc 融合蛋白(如Etanercept等)還存在有連接糖基 化。N-
糖基化的概念和舉例
指在糖基轉移酶作用下,非糖生物分 子與糖共價結合的過程或反應。根據連接方式可將 糖基化分為D連接糖基化和Ⅳ-鏈糖基化。上市的重組單克隆抗體(單抗)藥物除不含Fc段的 5個片段抗體為非 糖基化抗體外,其余全部為N-連接糖基化單抗,Fc 融合蛋白(如Etanercept等)還存在有連接糖基 化。N-糖基
重組DNA蛋白制品的特性分析
研發階段以物理、化學和生物學方法對重組DNA蛋白制品的理化特性、生物學活性、免疫學特性、純度和雜質等進行嚴格的特性分析鑒定是確保產品安全有效,建立并確定制品質量標準的基礎。需采用廣泛的分析技術來展示目標分子的理化性質(分子大小、電荷、等電點、氨基酸組成、疏水性等),以及對糖基化等各種翻譯后修飾進
解析糖基化修飾及位點分析
經常聽到糖基化修飾,今天帶大家一探究竟。什么是糖基化修飾呢?糖基化是在糖基轉移酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發生于內質網和高爾基體。糖基化修飾是一類非常重要的翻譯后修飾,大部分膜蛋白和分泌蛋白均為糖蛋白,糖基化修飾不僅影響蛋白質的空間構象、活性、運輸和定位,同時在信號轉導、分子識別,
Nature:解析寨卡病毒結構并鑒定藥物靶向位點
在一項新的研究中,來自杜克-新加坡國立大學醫學院(Duke-NUS)的研究人員在理解寨卡病毒(ZIKV)結構方面取得重要突破。相關研究結果于2016年4月19日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Structure of the thermally stable Zika virus”。
9405糖蛋白的糖基化分析指導原則解析,SCIEX助力糖基化精準分析
概述日前,國家藥監局、國家衛生健康委聯合發布《中國藥典》(2020年版)第一增補本,將于2024年3月12日起施行。其中增加了《9405 糖蛋白的糖基化分析指導原則》,本指導原則詳細闡述了糖蛋白糖基化分析的理念、方法及應用和驗證的相關要求,適用于糖蛋白產品結構與穩定性的表征、批次放行檢測和過程控制檢
我國學者揭示SUVH家族的CHG位點甲基化序列分子基礎
8月28日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組和美國加州大學洛杉磯分校Steven Jacobsen研究組合作完成的題為Mechanistic insights into plant SUVH
糖蛋白糖基化
已上市的蛋白藥物中,治療性糖蛋白藥物數量眾多,糖基化是最常見的蛋白翻譯后修飾。2020版《中國藥典》第一增補版中,正式發布9405糖蛋白的糖基化分析指導原則。賽默飛能為糖基化分析提供業內最全方案,可根據糖蛋白的復雜性、與藥物安全有效的相關性以及生產監控策略的總體設計等,為糖基化提供完整糖蛋白、糖
血小板/T細胞活化抗原1
1985年Burns等以活化T細胞為免疫原制備了抗活化T細胞表面抗原的單克隆抗體,并將其中1株單克隆抗體Leo-A1識別的抗原命名為人T細胞系特異性活化抗原1(T lineage-specific activation antigen1, TLiSA1),實驗證實TLiSA1參與了CTL
上海交大朱建偉:自主創新是生物藥物研發的根本道路
生物類藥物發展現狀 自2000年以來,生物藥物市場平均每年以10%以上的增長率發展,這一趨勢將持續到2020年甚至到更長的時間。最近生物藥物市場最暢銷的前10種藥物中,大概有7~8個是生物類藥物,其中大部分是抗體藥物。由此可知,生物類藥物(抗體藥物)主導了藥物發展趨向。 從最近15年中國單抗
細胞培養條件對蛋白質糖基化的影響
糖基化可能會影響蛋白質的半衰期、免疫原性、結合活性和穩定性。蛋白糖基化是一個復雜的過程,包括碳水化合物部分的連接,以及可能通過蛋白質結構中的天冬酰胺(N-連接)或絲氨酸/蘇氨酸(O-連接)氨基酸連接的位置。在哺乳動物細胞培養過程中,使用不同的細胞系培養可能會在可能發生的糖基化類型上產生重大差異。糖基
解析為何純化蛋白與人血清蛋白分子量不一樣
蛋白質作為生命活動中起重要作用的生物大分子,與一切揭開生命奧秘的重大研究課題都有密切的關系。蛋白質是人類和其他動物的主要食物成分,高蛋白膳食是人民生活水平提高的重要標志之一。以下針對純化蛋白與人血清蛋白分子量不一樣作分析:客戶問:用大腸桿菌表達純化的蛋白,和人血清中這種蛋白的分子量不同,wester
Pepfinder軟件對單克隆抗體進行肽圖分析(一)
1前言在蛋白質藥物產品的質控要求中,肽圖分析是其中重要的一環。肽圖分析包括對蛋白氨基酸序列進行確證及相關修飾的鑒定和定量。根據蛋白藥物質譜分析特點和生物制藥應用的特殊需求,Thermo Fisher與Amgen聯合開發了PepFinderTM 軟件。?PepFinder不僅具有最基本的肽段序列確證、
利用新工具優化CHO細胞系,制造生物制劑藥物
中國倉鼠卵巢細胞(CHO細胞)經常被用來制造生物制劑,即基于蛋白的藥物,可用來治療癌癥、自身免疫疾病以及很多其他的疾病。如今,市場上一半以上最為暢銷的生物制劑是由CHO細胞產生的。舉幾個例子來說,阿達木單抗(Humira)、貝伐單抗(Avastin)和利妥昔單抗(Rituxan)。 盡管得到廣
α微管蛋白:新的藥物結合位點
微管(Microtubule)是抗腫瘤藥物研發的重要靶點。微管是“細胞的骨架”主要成分之一,在許多細胞重要事件中起著關鍵作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)異二聚體可逆地組裝成而成的線性管裝結構(圖1)。 圖1:微管蛋白已知的六個結合位點及微管蛋白組裝形成微管示意圖 目前,微管