AgilentmiRNA芯片在各類樣本中的應用(三)
其他案例:大腸癌血漿miRNA標志物:Wang S, Xiang J, Li Z, Lu S, Hu J, Gao X, Yu L, Wang L, Wang J, Wu Y, Chen Z, Zhu H. A plasma microRNA panel for early detection of colorectal cancer. Int J Cancer. 2013 Mar 2. 先兆子癇miRNA標志物:Wu L, Zhou H, Lin H, Qi J, Zhu C, Gao Z, Wang H. Circulating microRNAs are elevated in plasma from severe pre-eclamptic pregnancies. Reproduction. 2011 Dec 20. ● 血清樣本:利用血清樣本來篩選疾病的miRNA標......閱讀全文
RNA修飾相關酶PCR芯片
應用場景:通過關鍵酶/蛋白的RNA表達變化,確定樣品表型與特定RNA 修飾的聯系 優勢:預制的PCR板,覆蓋68個針對不同RNA修飾的Writers/Erasers/Readers基因。精心優化的引物Tm值均一,并經過了嚴格的預實驗驗證,無須摸索引物設計和測試。工業化生產的高度均一的PCR
單核RNA測序的芯片現已上市
高通量的單核RNA測序方法——DroNc-Seq才剛剛在《Nature Methods》上發表。一轉眼,相應的芯片已經上市。Dolomite Bio公司針對DroNc-Seq推出一款新的芯片,可實現高通量的單核RNA-Seq分析。 DroNc-Seq方法在Broad研究所的張鋒(Feng
聚焦芯片到RNA-seq的轉型之路
自二十世紀九十年代中期以來,芯片就一直是基因組表達分析的中堅力量。在這一技術最輝煌的時期,準備研究基因表達模式的人都會想到使用芯片。不過隨著測序成本的直線下降,RNA測序(RNA-seq)成為了越來越受歡迎的轉錄組分析方法。 DNA芯片上排列著大量的核酸探針,可以代表生物的整個基因組或部分基因
DNA芯片技術和RNA測序有啥不同?
?日本推理小說家東野圭吾的作品《白金數據》中描述了這樣一個未來世界:日本政府秘密建立名為“白金數據”的數據庫。該庫搜集了全國人民的DNA數據,通過對犯罪分子留在現場的毛發、體液等證物進行比對,警方可以高效、快速、準確鎖定真兇。借助“白金數據”的幫助,一個檢舉率100%、冤案率0%的理想法制社會構建完
新型微流控芯片識別RNA的小片段
CRISPR / Cas技術不僅可以改變基因:根據弗萊堡大學的一項研究,通過使用所謂的基因剪刀,可以更好地診斷癌癥等疾病。 在這項研究中,研究人員介紹了一種微流控芯片,該芯片可識別RNA的小片段,從而比目前可用的技術更快,更準確地指示特定類型的癌癥。該結果最近發表在科學雜志“ Advanced
基因芯片與RNA-seq的比較分析
最近幾年二代測序(又叫NGS)很火,而且價格越來越便宜,原來都用芯片檢測mRNA、miRNA、LncRNA表達量的,好像不少都換用RNA-seq了。那么,到底選擇哪種更好呢?今天就來回答下這個問題。一句話—— 看研究目的。 常見誤區一: 測序的準確性高,獲得的信息更豐富 對,但又不對。
基因芯片與RNA-seq的比較分析
基因芯片 vs RNA-seq哪個好 ?最近幾年二代測序(又叫NGS)很火,而且價格越來越便宜,原來都用芯片檢測mRNA、miRNA、LncRNA表達量的,好像不少都換用RNA-seq了。那么,到底選擇哪種更好呢?今天就來回答下這個問題。一句話——?看研究目的。常見誤區一:測序的準確性高,獲得的信息
抗甲基化干擾的小分子RNA芯片研究取得新進展
小分子RNA,包括siRNA(small interfering RNA)、miRNA(microRNA)、piRNA(piwi- interacting RNA)等,多次被美國《科學》雜志評為“十大科技突破”和“十大科學進展”,是當前生命科學研究的前沿熱點。大量實驗證據表明,這些小分子
Dolomite微流控芯片成功用于高通量單細胞DNA/RNA測序
隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序通過對單個細胞進行測序,解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。 2011 年,《自然方法》雜志( Nature Methods )將單細胞測序列為年
研究比較芯片和測序在分析無細胞胎兒RNA轉錄組上的能力
來自GenomeWeb的消息——美國塔夫茨醫學中心(Tufts Medical Center)的一組研究人員最近評估了芯片和新一代測序在分析無細胞胎兒RNA中基因表達的能力,這些胎兒RNA來自羊水上清。 他們發現,表達芯片帶來了基因表達的更廣泛視圖,特別是對低濃度或降解的樣品,而在這一方面,R
生物芯片技術芯片分類
根據芯片上的固定的探針不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白質芯片、細胞芯片、組織芯片,另外根據原理還有元件型微陣列芯。表達譜基因芯片是用于基因功能研究的一種基因芯片。是目前技術比較成熟,應用最廣泛的一種基因芯片。
生物芯片是納米芯片么
生物芯片和納米這百個概念貌似扯不上邊,唯一有點關系的是,它上面點制的核酸或蛋白等探針大小是以納米級度別的。生物芯片目前主要做科研用,成熟的臨床應用的芯片應該博奧生物做過不少工作但基本被埋沒了,雖然是很實用的產品問,但一方面是找不到對應的市場或者說根本答就沒人去推廣,另一方面是生物芯片是新生事物專,國
簡述Lifespan組織芯片-生物芯片
Lifespan組織芯片是生物芯片技術的一個重要分支,與基因芯片、蛋白質芯片及細胞芯片等一樣,屬于一種特殊、新型的生物芯片,是一種新型的高通量、多樣本的研究的工具。組織芯片組織芯片,也稱組織微陣列(tissue microarrays),是將數十個甚至上千個不同個體組織標本以規則陣列方式排布于同一固
生物芯片的芯片制備方法
包括原位合成和預合成后點樣。原位合成:適用于寡核苷酸,通過光引導蝕刻技術。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突變的基因芯片。預合成后點樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因組DAN等通過特定的高速點樣機器人直接點在芯片上。該技術優點在于相對簡易低廉,被國內外廣泛
生物芯片中芯片制備方法
包括原位合成和預合成后點樣。原位合成:適用于寡核苷酸,通過光引導蝕刻技術。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突變的基因芯片。預合成后點樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因組DAN等通過特定的高速點樣機器人直接點在芯片上。該技術優點在于相對簡易低廉,被國內外廣泛
生物芯片技術的芯片分類
根據芯片上的固定的探針不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白質芯片、細胞芯片、組織芯片,另外根據原理還有元件型微陣列芯。表達譜基因芯片是用于基因功能研究的一種基因芯片。是目前技術比較成熟,應用最廣泛的一種基因芯片。
生物芯片的芯片制備方法
包括原位合成和預合成后點樣。原位合成:適用于寡核苷酸,通過光引導蝕刻技術。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突變的基因芯片。預合成后點樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因組DAN等通過特定的高速點樣機器人直接點在芯片上。該技術優點在于相對簡易低廉,被國內外廣泛
讓芯片更“新”——器官芯片技術
最近,我剛剛為大家介紹過“芯片實驗室”這一前沿技術。顧名思義,芯片實驗室也就是將實驗室搬到了芯片上,它可以將多種實驗室操作,例如樣品制備、生化反應、檢測分析,集成于一塊幾平方厘米的芯片上,從而對于細菌、病毒、污染物、生物標記物等進行檢測和分析,幫助監測人體健康狀況。今天,我們要介紹的創新成果,仍然是
組織芯片的制備——冰凍組織芯片
實驗材料新鮮組織試劑、試劑盒OCT 包埋劑切片黏合劑儀器、耗材1 mm 孔徑針載玻片實驗步驟將每個需要制備 TMA 的新鮮組織,不經固定包埋在 OCT 包埋劑中, -20℃ 中凍成塊。另外,再將 OCT 包埋劑倒在長 3 cm×寬 1.5 cm×高 lcm 的模具中, -20℃ 中凍成塊。用特制的
組織芯片
組織芯片(tissue chip),也稱組織微陣列(tissue microarrays),是生物芯片技術的一個重要分支,是將許多不同個體組織標本以規則陣列方式排布于同一載體(使用載玻片最多)上,進行同一指標的原位組織學研究。該技術自1998年問世以來,以其大規模、高通量、標準化等優點得到大范圍
RNA干涉(RNA Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由
RNA干涉(RNA Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育
RNA干擾技術(RNA interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
生物芯片技術的芯片制備方法
包括原位合成和預合成后點樣。原位合成:適用于寡核苷酸,通過光引導蝕刻技術。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突變的基因芯片。預合成后點樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因組DAN等通過特定的高速點樣機器人直接點在芯片上。該技術優點在于相對簡易低廉,被國內外廣泛
生物芯片與與電子芯片的比較
生物芯片和電子芯片有什么區別呢?其實電子芯片和生物芯片有著既遠又近的關系。“它們相同的地方在于,都用很小的元件,儲藏很大的信息量,輸入輸出也很大。”楊洪波說。所謂的生物芯片輸出,就是在平方厘米大的芯片上,用特制的掃描儀掃出1百萬個化學分子的反應信號,“一行一行地掃,小到0.5微米的地方也全部會被掃到
組織芯片的制備——石蠟塊組織芯片
實驗方法原理首先制作模具蠟塊(受體,recipient)。從供體蠟塊(donor)上取樣,取樣針分別有 0.6 mm、1.0 mm、1.5 mm 和 2.0 mm 幾種,在 1 個大小 45 mm×20 mm 的模具蠟塊上,以 0.6 mm 取樣針間隔 0.1 mm,可排列 1000 余個位點,如取
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
蛋白芯片制作與應用(4)-液態芯片
液態芯片原理編碼微球:分別用不同配比的兩種熒光染料將直徑5.6μm的聚苯乙烯微球(Beads)染成不同的熒光色,從而獲得多達100種經熒光編碼的微球。?交聯探針、抗體或抗原:把針對不同檢測物的核酸探針、抗體或抗原以共價方式結合到特定熒光編碼的微球上。?檢測反應:先把針對不同檢測物的、用不同熒光色編碼
microRNA 芯片與表達譜芯片的聯合應用
microRNA 芯片與表達譜芯片的聯合應用——探究胃癌細胞株的原發性耐藥的分子機制藥物耐受是腫瘤治療領域的一大難題,一般分為兩種類型:其一為原發性耐藥,即先前未經治療的腫瘤細胞天生就對某種藥物不敏感;其二是獲得性耐藥,指經過治療的腫瘤細胞再次接受該藥物治療時變得不敏感。 目前, 國際上許多科研