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三、一級結構的測定 （一）一級結構 蛋白質的一級結構是指肽鏈的氨基酸組成及其排列順序。氨基酸序列是蛋白質分子結構的基礎，它決定蛋白質的高級結構。一級結構可用氨基酸的三字母符號或單字母符號表示，從N-末端向C-末端書寫。采用三字母符號時，氨基酸之間用連字符（－）隔開。 （二）測定步驟 測定蛋白質的一級結構，要求樣品必須是均一的（純度大于97％）而且是已知分子量的蛋白質。一般的測定步驟是： 1.通過末端分析確定蛋白質分子由幾條肽鏈構成。 2.將每條肽鏈分開，并分離提純。 3肽鏈的一部分樣品進行完全水解，測定其氨基酸組成和比例。 4.肽鏈的另一部分樣品進行N末端和C末端的鑒定。 5.拆開肽鏈內部的二硫鍵。 6.肽鏈用酶促或化學的部分水解方法降解成一套大小不等的肽段，并將各個肽段分離出來。 7.測定每個肽段的氨基酸順序。 8.從第二步得到的肽鏈樣品再用另一種部分水解方法水解成另一套肽段，其斷裂點與第五步不同。分離肽段并測序。比較兩套肽段......閱讀全文
一種生物體的基因組規定了所有構成該生物體的蛋白質，基因規定了組成蛋白質的氨基酸序列。雖然蛋白質由氨基酸的線性序列組成，但是，它們只有折疊成特定的空間構象才能具有相應的活性和相應的生物學功能。了解蛋白質的空間結構不僅有利于認識蛋白質的功能，也有利于認識蛋白質是如何執行其功能的。確定蛋白質的結構對于生物
這種方法是一種用物理化學方法進行二級結構預測的方法，或稱為立體化學方法。在蛋白質中，氨基酸的理化性質對蛋白質的二級結構影響較大，因此在進行結構預測時考慮氨基酸殘基的物理化學性質，如疏水性、極性、側鏈基團的大小等，根據氨基酸殘基各方面的性質及殘基之間的組合預測可能形成的二級結構。“疏水性”是氨基酸的一
瑞士洛桑聯邦理工學院的科學家日前人工合成出一種氨基酸，能塑造活性多肽的結構并增強其療效。實驗顯示，將這種氨基酸插入具有生物活性的多肽，能將其活性提高40倍以上。借助此項成果有望開發出一系列全新的藥物。相關論文發表在《自然·化學》雜志上。 目前我們常用的藥物主要由兩類物質制成，一種是天然存在的多
瑞士洛桑聯邦理工學院的科學家日前人工合成出一種氨基酸，能塑造活性多肽的結構并增強其療效。實驗顯示，將這種氨基酸插入具有生物活性的多肽，能將其活性提高40倍以上。借助此項成果有望開發出一系列全新的藥物。相關論文發表在《自然·化學》雜志上。 目前我們常用的藥物主要由兩類物質制成，一種是天然存在的多
就在幾個月前，DeepMind推出了AlphaFold系統，這個被稱為生物界“AlphaGo”的系統能夠預測并生成蛋白質3D結構。而近日，來自MIT的研究人員開發了一個新的研究模型，能夠直接預測氨基酸鏈片段是如何決定蛋白質功能的。這一發現可以幫助研究人員設計和測試新的蛋白質，從而用于藥物研發和生
計算方法一直在蛋白質設計中發揮重要作用。本工作主要集中在搜索蛋白質序列空間，以找到一條或數條與已知結構和功能相容的蛋白質序列。在期望的功能和結構限制下，概率性計算方法為所容許的氨基酸變化范圍提供信息。本實驗來源「現代蛋白質工程實驗指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒編著。實驗步驟蛋白質設計中的概
采用計算方法的組合式蛋白質設計策略 實驗步驟 蛋白
實驗步驟 蛋白質設計中的概率性方法是提供在一個特定的蛋白質結構中對某氨基酸（出現）在一指定位點的概率估計。這里，我們討論幾種估計這些概率的方法并將重點放在直接解出這些概率的基于熵的自洽公式。2.1 關聯序列的比對蛋白質結構的序列可變性可用序列和結構數據庫來探討。已知折疊為非常相似結構的序列可以從蛋白
半胱氨酸側鏈巰基反應性高： （1）二硫鍵(disulfide bond) 半胱氨酸在堿性溶液中容易被氧化形成二硫鍵，生成胱氨酸。胱氨酸中的二硫鍵在形成蛋白質的構象上起很大的作用。氧化劑和還原劑都可以打開二硫鍵。在研究蛋白質結構時，氧化劑過甲酸可以定量地拆開二硫鍵，生成相應的磺酸。還原劑如巰
華盛頓大學蛋白質設計研究所的分子工程師3月1日在《Science》發文告訴我們，人類可以從頭開始創建和定制復雜的跨膜蛋白了，甚至制造自然界中沒有的跨膜蛋白來完成特定任務。圖片來源于網絡 在生命世界里，跨膜蛋白是嵌在所有細胞和細胞器膜中的一類蛋白，它們是細胞與外界的交互門禁，一些跨膜蛋白還參與細
汪一帆1） 尉萬聰2） 周鳳娟1）** 薛照輝1）**(1)天津大學農業與生物工程學院,天津,300072; 2)清華大學生物科學與技術系，北京，100084) 摘要 太赫茲（THz）輻射是一種新型的遠紅外相干輻射源，近年
Chou-Fasman方法是一種基于單個氨基酸殘基統計的經驗參數方法，由Chou和Fasman在20世紀70年代提出來。通過統計分析，獲得的每個殘基出現于特定二級結構構象的傾向性因子，進而利用這些傾向性因子預測蛋白質的二級結構。每種氨基酸殘基出現在各種二級結構中傾向或者頻率是不同的，例如Glu主要出
Rice大學物理學家最近獲得了一種研究蛋白折疊詳細過程的新途徑，可用于探測折疊過程需要多少能量，在蛋白折疊科學領域有廣泛的應用性。由于發現阿爾茨海莫氏癥、帕金森氏癥等疾病與蛋白的錯誤折疊有重要相關性，因此蛋白折疊科學在過去的十年中積累了大量數據。這一成果將刊登于最新一期《Physical Revie
蛋白質是組成人體一切細胞、組織的重要成分。機體所有重要的組成部分都需要有蛋白質的參與。一般說，蛋白質約占人體全部質量的18%，最重要的還是其與生命現象有關。蛋白質（protein）是生命的物質基礎，是有機大分子，是構成細胞的基本有機物，是生命活動的主要承擔者。沒有蛋白質就沒有生命。氨基酸是蛋白質的基
7月29日，國際學術期刊RNA在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所王恩多課題組的最新研究成果，解析了人胞質亮氨酰-tRNA合成酶的CP發卡結構域在酶催化過程中的功能和機制。 亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)催化亮氨酸和對應tRNALeu之間的酯化反應。亮氨酸和
蛋白質是一種復雜的有機化合物，舊稱“朊”。蛋白質這一概念最早是由瑞典化學家永斯·貝采利烏斯于1838年提出，但當時人們對于蛋白質在機體中的核心作用并不了解。1926年，詹姆斯·B·薩姆納揭示尿素酶是蛋白質，首次證明了酶是蛋白質。第一個被測序的抗原肽蛋白質是胰島素，由弗雷德里克·桑格完成，他也因此獲得
世界衛生組織（WHO）將一種新型冠狀病毒命名為“2019年新型冠狀病毒（2019-nCoV）”。它是最近于2019年12月初在中國湖北省武漢市開始的肺炎疫情的罪魁禍首。這次疫情與一家大型的海鮮和動物市場有關，目前正在開展調查以確定這種病毒感染的來源。迄今為止，中國已經確診了成千上萬例人類感染病例
氨基酸結構和分類 （一）基本氨基酸 組成蛋白質的20種氨基酸稱為基本氨基酸。它們中除脯氨酸外都是α-氨基酸，即在α-碳原子上有一個氨基。基本氨基酸都符合通式，都有單字母和三字母縮寫符號。 按照氨基酸的側鏈結構，可分為三類：脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和雜環氨基酸。 1.脂肪族氨基酸 共15種
冠狀病毒主要引起呼吸道和胃腸道感染，并且在遺傳學上被分為四個主要的病毒屬：甲型冠狀病毒（Alphacoronavirus）、乙型冠狀病毒（Betacoronavirus）、丙型冠狀病毒（Gammacoronavirus）和丁型冠狀病毒（Deltacoronavirus）。前兩個屬主要感染哺乳動物
組成及特點蛋白質是由C（碳）、H（氫）、O（氧）、N（氮）組成，一般蛋白質可能還會含有P（磷）、S（硫）、Fe（鐵）、Zn（鋅）、Cu（銅）、B（硼）、Mn(錳)、I（碘）、Mo（鉬）等。這些元素在蛋白質中的組成百分比約為：碳50% 氫7% 氧23% 氮16% 硫0~3% 其他微量。（1）一切蛋白質
長期以來，手性氨基酸都被認為對淀粉樣蛋白（Amyloid beta peptide, Aβ）結構和功能有調控作用。然而，這背后的分子機制并不是十分清晰。2019年11月6日，美國威斯康星大學麥迪遜分校李靈軍課題組（第一作者李功玉）在Nature Communications雜志上發表了一篇題為“
一、蛋白質的元素組成 單純蛋白質的元素組成為碳50～55%、氫6%～7%、氧19%～24%、氮13%～19%，除此之外還有硫0～4%。有的蛋白質含有磷、碘。少數含鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬等金屬元素。 各種蛋白質的含氮量很接近，平均為16%。由于體內組織的主要含氮物是蛋白質，因此，只要
蛋白質是以氨基酸為基本單位構成的生物大分子。蛋白質分子上氨基酸的序列和由此形成的立體結構構成了蛋白質結構的多樣性。蛋白質具有一級、二級、三級、四級結構，蛋白質分子的結構決定了它的功能。 一級結構：蛋白質多肽鏈中氨基酸的排列順序，以及二硫鍵的位置。 二級結構：蛋白質分子局區域內，多肽
你也許想象不到，細胞中大約30%的蛋白質是膜蛋白。這些蛋白對細胞功能至關重要，特別是在細胞通訊和轉運通路。不過，膜蛋白的研究卻困難重重，這是因為其疏水性導致結構研究難以開展。 一旦從細胞膜中提取，蛋白質需要懸浮在疏水性與細胞膜類似的去垢劑中，才能成為水溶性的。然而，這些去垢劑十分昂貴，也并非普
蛋白質二級結構的預測開始于20世紀60年代中期。二級結構預測的方法大體分為三代，第一代是基于單個氨基酸殘基統計分析，從有限的數據集中提取各種殘基形成特定二級結構的傾向，以此作為二級結構預測的依據。第二代預測方法是基于氨基酸片段的統計分析，使用大量的數據作為統計基礎，統計的對象不再是單個氨基酸殘基，而
來自美國加州大學舊金山分校藥理化學系，得克薩斯農工大學（Texas A&M University），Albert Einstein 醫學院的研究人員利用一種變通的分子對接方法（一種用來尋找潛在藥物的計算機輔助的模擬方法），設計出一種根據結構來預測某種具有未知活性的酶的功能的方法。如果這一新方
蛋白質為生物高分子物質之一，具有三維空間結構，因而執行復雜的生物學功能。蛋白質結構與功能之間的關系非常密切。在研究中，一般將蛋白質分子的結構分為一級結構與空間結構兩類。 一、蛋白質的一級結構 蛋白質的一級結構(primary structure)就是蛋白質多肽鏈中氨
2019年上半年很快就結束了，iNature盤點了中國學者在Cell，Nature及Science發表的成果，我們發現總共有86篇（截至2019年6月24日），具體介紹如下： 4-6月發表的文章 【1】2019年6月21日，西北工業大學王文，中科院昆明動物研究所/BGI 張國捷及丹麥哥本哈根
截至2019年12月13日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了105篇文章（2019年的Cell已經全部更新完畢，而對于Nature及Science只剩下了一期，將分別會12月19日及20日進行更新），小編對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了30
截至2019年12月31日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了186篇文章，其中生命科學領域有109篇，材料學有30篇，物理學有20篇，化學有12篇，地球科學有15篇。iNature團隊對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了31篇，Nature 發