計算方法一直在蛋白質設計中發揮重要作用。本工作主要集中在搜索蛋白質序列空間,以找到一條或數條與已知結構和功能相容的蛋白質序列。在期望的功能和結構限制下,概率性計算方法為所容許的氨基酸變化范圍提供信息。本實驗來源「現代蛋白質工程實驗指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒編著。實驗步驟蛋白質設計中的概率性方法是提供在一個特定的蛋白質結構中對某氨基酸(出現)在一指定位點的概率估計。這里,我們討論幾種估計這些概率的方法并將重點放在直接解出這些概率的基于熵的自洽公式。2.1 關聯序列的比對蛋白質結構的序列可變性可用序列和結構數據庫來探討。已知折疊為非常相似結構的序列可以從蛋白質數據庫或結構比對數據庫中鑒別出來 [48] 。如果一個序列的結構已知,具有足夠序列相似性的 [ 如序列同一性(identity) 大于 40% ] 可以認為共享同一結構。對這樣結構相似蛋白質的多序列比對可以把氨基酸位點特異的概率簡單地估計為比對中每一位置(出現)每......閱讀全文
來自中科院上海藥物研究所,美國萊斯大學的研究人員報道了最新研究成果,在可藥性蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)界面預測與識別計算方法發展方面取得重要進展。這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上,文章的通訊作者是上海藥物研究所蔣華良研究員,以及萊斯大學José N. Onuchic博
翻譯后修飾蛋白質的定性和定量實驗 實驗步驟
采用計算方法的組合式蛋白質設計策略 實驗步驟 蛋白
實驗步驟一、化學法和酶法細胞裂解微量的細胞裂解經常通過化學法或酶法或二者共同采用來完成。例如, 超聲和弗式細胞壓碎器 (Frenchpress 均質機) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培養液的情況,而且應用這些機械的方法經常會遇到過度的產熱和樣品被氧化等問題。微量細胞裂解的簡化方面的重大進
實驗步驟 一、化學法和酶法細胞裂解 微量的細胞裂解經常通過化學法或酶法或二者共同采用來完成。例如, 超聲和弗式細胞壓碎器 (Frenchpress 均質機) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培養液的情況,而且應用這些
據此前報道,浙江大學27歲的陸盈盈獲評教授引起輿論紛爭,最后浙江大學網站將她的頭銜從教授改為“特聘研究員”。對于網絡上的紛爭,華中科技大學教授薛宇在自己的博客上發表了一篇文章,歷數了那些年輕的教授們,表示這一事件并不應該大驚小怪。觀察者網編輯查詢發現,薛宇教授出生于1980年,2007年成為中國
2014年7月3日,全國生物質譜學術報告會--生物質譜前沿技術邀請報告會在上海復旦大學隆重召開。此次活動旨在積極促進我國生物質譜技術的發展和應用,加強國內外相關研究領域的專家學者之間的交流與合作,特邀瑞士蘇黎世聯邦技術學院分子系統生物學
在發明蛋白質印跡法(Western Blot)出現了30多年之后,這項技術仍然是獲取特定蛋白可靠鑒定的關鍵。許多近期涌現的產品利用各種方法來提高蛋白質印跡實驗的可重復性、敏感性、定量性以及速度。 有三個人都被認為發展了蛋白質的免疫印跡方法,但其中只有一人才算得上是“Western
在發明蛋白質印跡法(Western Blot)出現了30多年之后,這項技術仍然是獲取特定蛋白可靠鑒定的關鍵。許多近期涌現的產品利用各種方法來提高蛋白質印跡實驗的可重復性、敏感性、定量性以及速度。 有三個人都被認為發展了蛋白質的免疫印跡方法,但其中只有一人才算得上是“Western B
2014年12月28日,“北京市繼續教育-質譜沙龍2014報告會”在首都醫科大學附屬北京朝陽醫院舉行。本次質譜沙龍活動由首都醫科大學附屬北京朝陽醫院、AB SCIEX公司主辦,北京艾米諾醫學研究有限公司、分析測試百科網、默沙東
關于包涵體的純化是一個令人頭疼的問題,包涵體的復性已經成為生物制藥的瓶頸,關于包涵體的處理一般包括這么幾步:菌體的破碎、包涵體的洗滌、溶解、復性以及純化,內容比較龐雜 一、菌體的裂解 1、怎樣裂解細菌? 細胞的破碎方法 1.高速組織搗碎
《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc
常用生物軟件(windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。 ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件,不僅可以進行圖像分析,還可以進行數據處理,方便protocol的管理功能強大,商業版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0
大規模基因組測序計劃的實施已改變生命科學的重心,在相當短的時期內,一些原核生物和某些低等真核生物的基因組序列已被測定. 1995年,流感嗜血桿菌基因組序列首次被破譯,在此后不到兩年的時間,近50個細菌的基因組序列已被完成. 然而,這僅僅是理解有機物功能的一個起點. 在基因組時代,許多DNA序列信息僅
褚福亮,王福生, 中國人民解放軍第302醫院全軍艾滋病與病毒性肝炎重點實驗室 北京市 100039項目負責人 王福生, 100039 ,北京市豐臺路26號, 中國人民解放軍第302醫院全軍艾滋病與病毒性肝炎重點實驗室. fswang@public.b
一、概述 前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交
一、概述 前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交
一、雜交通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交可在DNA與DNA、RNA與RNA或RNA與DNA的
2018年10月20日,第二十屆全國分子光譜學學術會議暨2018年光譜年會開幕式暨40周年慶典在青島舉辦(相關報道:慶祝中國光譜40年 構建中國光譜新時代)。在第一天的大會報告之后(相關報道:古人學問無遺力 今有分子光譜百家鳴),組委會也安排了精彩分會報告。分析測試百科網作為合作媒體為您帶來拉曼
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿
分析測試百科網訊 拉曼光譜是一種分析分子結構的有用工具。拉曼光譜特征峰位置、強度和線寬可以提供分子振動、轉動方面的信息,反映出不同的化學鍵或官能團。拉曼光譜作為一種無損、非接觸的快速檢測技術,已吸引廣大科研人員的關注,并被應用于各行各業中。 由于拉曼樣品用量很少,不需要對生物樣品進行固定、脫水
數據處理,驗證,標準和蛋白質定量都是2007年10月在韓國舉行的第六屆人類蛋白質組組織(HUPO)世界年度會議的主題討論內容。 HUPO成立于2001年2月,即人類基因組首張草圖公布的同一周。現在,該組織的委員會有來自19個國家的48名成員,總部位于加拿大的麥吉爾大學以及蒙特利爾的基因組魁北克創新
2017年6月,世界經濟論壇與《科學美國人》雜志的專家委員會聯合選出了2017年度全球十大新興技術榜單,其中腫瘤的無創診斷技術成功入選并榮膺榜首。腫瘤無創診斷技術即液體活檢(liquid biopsies)的出現,標志著人類在攻克腫瘤的道路上又前進了一大步。與傳統的組織活檢相比,液體活檢具備實時
分析測試百科網訊 2018年5月5日,中國化學會第31屆學術年會在浙江省杭州市杭州國際博覽中心盛大開幕。 在全國化學工作者的支持和積極參與下,中國化學會學術年會規模不斷擴大,影響力不斷提升,已經成為化學及相關領域門類最全、規模最大、水平最高的學術交流平臺。中國化學會第 31 屆學術 年會設
每年12月,《科學》雜志都會公布年度突破及入圍成果。以下為今年的10大突破和贏家,排名不分先后。 1.時空漣漪撼動科學界 今年發現時空漣漪(即引力波)撼動了科學界。它完成了阿爾伯特·愛因斯坦在100年前完成的一項預測,為40年來尋找這種無窮小的漣漪畫上了句號。但這個故事并未結束,科學家將此次
摘要:綜述了RAPD技術的一些理論性問題,包括RAPD與其它分子標記技術相比的優點,影響結果重復性的因素,顯性標記產生的原因,條帶取舍的標準等。提出在實驗中解決這些問題的一些方法:嚴格控制反應條件,采用單倍體和單劑量標記,系統學研究中要結合其它方法進行分析,定位基因時要選用合適的群體等。
在免疫療法時代,癌癥生物學家依靠新一代工具來了解腫瘤和免疫細胞之間的相互作用是如何影響疾病進程的。 雖然Sean Bendall是一名病理學家,但最近卻成了一名圖譜制作者,他使用尖端的蛋白質繪圖技術來描繪出腫瘤組織的變幻莫測的景觀。 這項技術由Bendall在加州斯坦福大學(Stanford
2009年12月11日上午9時許,由北京理化分析測試技術學會色譜學會主辦的2009年北京色譜年會在京東賓館第一會議室隆重召開。來自全國色譜界專家、廠商技術專家、青年研究者和學生300余人參加了會議。 2009年北京色譜年會會場 中科院化學所 劉國詮教授 &
Triple TOF 5600 在生物標志物發現中的應用 郭立海博士作了題為《Triple TOF 5600 在生物標志物發現中的應用》的報告,主要介紹了蛋白質組發展趨勢及其對質譜技術的要求,Triple TOF 5600分析蛋白質的三種應用,Triple TOF 5600獨特的設計支持了同時定性
分析測試百科網訊 近日,按照《中華人民共和國國民經濟和社會發展第十三個五年規劃綱要》、《“十三五”國家科技創新規劃》、《“健康中國2030”規劃綱要》等總體部署,為加快推進中醫藥科技創新發展,科技部特制定《“十三五”中醫藥科技創新專項規劃》: “十三五”中醫藥科技創新專項規劃 中醫藥蘊含著