從RNA的提取到PCR——RealtimePCR經驗
一 引物的設計引物的設計對于這個實驗至關重要,因為real time pcr的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規PCR,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區分開就可以。real time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。3,引物設計要跨內含子,不能在一個外顯子上(我們的實驗是以cDNA為模板來擴增的,如果有DNA污染的話,因為DNA上含有分子量很大的內含子,不可能完成擴增。這對我們消除整個實驗的誤差起很大的作用)。4,引物設計的時候要盡可能設計在同一退火溫度,方便于以后同時擴增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費模板,浪費管家......閱讀全文
從RNA的提取到PCR——Real-time PCR經驗
一 引物的設計引物的設計對于這個實驗至關重要,因為real time pcr的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特
RNA抽提經驗
對大部分實驗人員來說,RNA 抽提比基因組 DNA 抽提要困難得多。事實上,現有的 RNA 抽提方法/試劑,如果用于從培養細胞中抽提 RNA,比抽提基因組 DNA 更方便,成功率也更高。那為什么同樣的方法用于組織 RNA 的抽提,總會碰到問題呢? ??組織 RNA 抽提失敗的兩大現象是: RNA 降
Real-time PCR
實驗概要The ?exponential amplification via reverse transcription polymerase chain ?reaction provides for a highly sensitive technique in which a very low
Real-time PCR實驗心得和RNA提取心得
并不是所有的實驗都可以做real-time的,技術路線要選好當你的基因表達量少或有些不表達具體就是做普通pcr跑膠條帶比較弱,不是很亮的情況下個人覺得最好不要選擇real,不容易做好,特別是融解曲線用sbgr green染料做的話,引物設計時擴增片斷最好小于250bp,太長了不好擴預實驗先rt-pc
實時定量PCR(Real-time quantitative PCR)
mRNA表達的研究 微小殘留病變的檢測 腫瘤耐藥基因表達的研究 病毒感染的定量監測Vs普通PCR,RT-PCR的優勢 采用封閉的檢測模式,因此擴增產物導致污染的可能性比普通PCR要小得多 。 擴增產物的檢測在PCR擴增過程中同時進行,并且數據的采集、分析全部由 儀器 自動完成,因此整個檢測所 需的時
細胞RT-PCR的經驗(偏向RNA提取)
做RT也做了幾次,有成功也有失敗,在園子中受益良多,把我自已的一個流程放上來,供大家參考.細胞RT-PCR操作流程實驗流程一 、取RNA:1、 處理細胞:(1) 貼壁細胞:先用無菌DEPC水配制的PBS洗細胞兩次,棄盡PBS后,直接向培養瓶中加入1ml Trizol,通過溶解細胞,通過移液管分次移出
RT-PCR實驗方法大全(抽提RNA,RT,PCR)-3
4. 配制的溶液應盡可能的用0.1% DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經 0.22μm濾膜過濾除菌。5. 操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。6. 設置RNA操作專用實驗室,所有器
RT-PCR實驗方法大全(抽提RNA,RT,PCR)-2
關于平臺期和線性期的問題,實際上線性期是指數期,只不過碰巧2的冥和2的倍數是相同的。看上去任何一個時期都可以,實際上是不對的,因為牽涉到酶促動力學的問題,這個我也不懂,有一些專門的文章,好像,涉及到很多化學的東西。我們學醫的,也沒必要知道那些,但是其中主要是因為模板引物酶原料和buffer之間的關系
RT-PCR實驗方法大全(抽提RNA,RT,PCR)-5
室溫下充分混勻,離心10000g×2min。取上層液置另一0.5 ml離心管中,加入100μl氯仿,混勻,離心10000g×2min。將上層液轉移至另一0.5ml 離心管中,再加入3M NaAc 10μl、預冷無水乙醇250μl,混勻后,-20OC靜置30min。4OC離心13500g×10
RT-PCR實驗方法大全(抽提RNA,RT,PCR)-6
可能問題出在標本的保存:一般四小時之內就應處理,分離出細胞說的是套式PCR,可以在你的第一次PCR兩個引物內,再設計一對引物進行第二次PCR就行了如果你的第一次PCR剛好包括目的片段,那只好設計個更長的了第二次的引物設計要求可以低一點以50μl體系為例引物各1μl第一次PCR產物5μl二次PCR和巢