開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀DNA連登Nature，Cell!），它極大的豐富了腫瘤異質性的研究內容，為液體活檢、腫瘤耐藥以及腫瘤微環境討論指明了新的方向。eccDNA在腫瘤環境中可以借助多樣的成環方式、開放的高級結構以及多個調控元件的輔助，強有力的推動原癌基因的轉錄，顛覆了科研人員對原癌基因在腫瘤發生發展當中的傳統認知。染色質是動態的！eccDNA也是動態的！ 雖然eccDNA的討論內容多數圍繞腫瘤環境，那eccDNA是否是腫瘤學的專屬明星分子？并非如此，非疾病狀態下的細胞核同樣擁有豐富的eccDNA。云序生物今天帶來的文章將讓大家感受到，eccDNA在正......閱讀全文
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
染色體外環狀DNA（eccDNA）
1. eccDNA成環的整體統eccDNA測序結果充分體現了基因組水平成環的多樣性。eccDNA來源十分豐富，同一個基因有可能會產生非常多的環狀，同樣一個環狀也不僅僅只會包含一個外顯子。TTN基因就是一個非常典型的例子。該基因長度達到了0.3Mb，而這樣一個基因竟然能衍生得到130個eccDNA，是
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA（eccDNA）
實驗方法：環狀DNA-seq,?RNA-seq（云序生物提供以上服務）1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構，作者通過環狀DNA-seq（云序生物提供以上服務）方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外，并且
eccDNA新型生物標志物的多種應用
文章導讀 新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（一）
1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界，一時之間，將人們的目光都吸引到這個科研界的新寵
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
?1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生
Nature重磅新星eccDNA的物種發現史（一）
文章導讀隨著高通量測序技術的發展，人類基因組中的神秘面紗被一層層的揭開。eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作為染色體外的環狀DNA的研究也隨著國際頂 級學術期刊中《Nature》和《Cell》相繼發表的關于eccDNA在腫 瘤的發生和
研究者首次發現孕婦染色體外環狀DNA
人血漿中細胞游離的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人們廣泛研究的領域。在懷孕期間，觀察到胎兒血漿DNA（主要是胎盤來源）是線性DNA片段，比母體來源（主要是造血來源）DNA短。有研究報道了人和鼠血漿中存在染色體外環狀DNA（eccDNA）。但是，尚無有關孕婦血漿中eccDNA的公開數據。
Nature重磅新星eccDNA的物種發現史（三）
6.染色體外環狀DNA來源于植物基因組（擬南芥和短毛菊）的串聯重復序列發表期刊：The Plant Journal影響因子：5.786發表時間：2007.12.3??文章鏈接：Extrachromosomal circular DNA derived from tandemly repeated g
Nature－Genetics揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重..
1.?神經母細胞瘤eccDNA整體統計研究人員聯合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服務）技術，與開創性的生物信息學算法相結合，首次在神經母細胞瘤（一種主要發生在兒童的致命腫瘤）中進行詳細的環狀DNA序列分析。本研究中分析了93名兒童的神經母細胞瘤組織樣本，結果顯示，每個組織樣本平
Nature重磅新星eccDNA的物種發現史（二）
3.非洲爪蟾染色體外環狀DNA的形成與端粒DNA相關發表期刊：EMBO reports影響因子：8.383發表時間：2002.10.15文章鏈接：Formation of extrachromosomal circles from telomeric DNA in Xenopus laevis端粒D
Nature重磅新星eccDNA的物種發現史（四）
10.酵母菌老化過程中轉錄誘導的染色體外環狀DNA的形成發表期刊：PLOS Biology影響因子：7.076發表時間：2019.10.31文章鏈接：Transcription-induced formation of extrachromosomal DNA during yeast ageing
科學家首次解析腫瘤染色體外DNA的環狀結構與功能
早期研究認為腫瘤中大量擴增的原癌基因存在于染色體上。2017年，來自美國加州大學圣迭戈分校的Paul Mischel教授團隊在Nature雜志上指出，它們是以染色體外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的結構和功能一直缺乏直接的證據。 201
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...2
3.與線性DNA相比，ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現，在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而，DNA CN歸一化后，環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為
染色體外DNA的定義
中文名稱染色體外DNA英文名稱extrachromosomal DNA定 義存在于染色體外的DNA。包括線粒體DNA、葉綠體DNA和質粒DNA等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
染色體外DNA的定義
中文名稱染色體外DNA英文名稱extrachromosomal DNA定 義存在于染色體外的DNA。包括線粒體DNA、葉綠體DNA和質粒DNA等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
研究發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構
近日，紀念斯隆?凱特林癌癥中心等科研機構的研究人員在Nature Genetics上發表了題為“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，發現染色體外環狀DNA驅動神
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（三）
小編在這兒也給大家整理了eccDNA表達譜的研究思路，如下圖。?（2）生物標志物eccDNA優于線性DNA的生物穩定性以及獨特的分子結構特征，為迅速發展的無創活檢道路增添了新的方向，如果有較多的臨床樣本，它非常適合做生物標志物的研究。下面這篇文章是eccDNA在液體活檢方面探索的先驅文章，小編帶大家
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（二）
(3)?形成特征早期的研究發現eccDNA是基因擴增的產物，是基因組不穩定性的一種表現形式。腫瘤基因擴增往往以兩種方式，一種是在染色體上進行基因的擴增，另一種則是形成eccDNA。目前關于腫瘤中eccDNA的形成機制還沒有定論。早期的研究認為短重復序列是介導eccDNA形成的因素，主要通過基因重組機
細胞化學詞匯染色體外DNA
中文名稱：線粒體DNA外文名稱：Mitochondrial DNA,mtDNA定?????? 義：線粒體DNA是線粒體中的遺傳物質，線粒體能為細胞產生能量（ATP），是在細胞線粒體內發現的脫氧核糖核酸特殊形態。線粒體是為細胞提供能量（ATP）的細胞器。一個線粒體中一般有多個DNA分子。
細胞化學詞匯染色體外DNA
中文名稱：染色體外DNA英文名稱：extrachromosomal DNA定 義：存在于染色體外的DNA。包括線粒體DNA、葉綠體DNA和質粒DNA等。應用學科：生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
染色體外DNA的基本信息
中文名稱染色體外DNA英文名稱extrachromosomal DNA定 義存在于染色體外的DNA。包括線粒體DNA、葉綠體DNA和質粒DNA等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
腫瘤細胞中ecDNA新機制在斯坦福大學致癌基因研究應用1
文章導讀eccDNA是染色體外的一種特殊的環狀DNA，從它的出現至今已長達數年，但在起初的很長一段時間里并未得到人們的重視。隨著高通量技術的發展，eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作為染色體外的環狀DNA的研究也進一步深入。在國際學術
腫瘤細胞中ecDNA新機制在斯坦福大學致癌基因研究應用2
（5）EcDNA hubs調控兩個癌基因位點的分子互作上述研究證明ecDNA hubs可能促進分子間增強子-啟動子相互作用。為了驗證這些相互作用，作者對人類胃癌細胞系中兩種類型的ecDNA進行了研究，一種ecDNA包含來自8號染色體的MYC擴增子，另一種包含來自10號染色體的FGFR2擴增子。用