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3.與線性DNA相比，ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現，在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而，DNA CN歸一化后，環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為增強子劫持機制和ecDNA上染色質可及性提高。為了比較環狀擴增和非環狀區域之間控制基因表達的表觀遺傳機制，采用36個樣本(ATAC-seq)圖譜分析了轉座酶可達染色質的重疊分析。經DNA CN水平校正后，環狀和BFB擴增子的染色質明顯比重排列和線性擴增子更容易接近(圖3b)，因此，增加的染色質可及性在ecDNAai基因的失調中扮演了一個重要的角色。與非環狀擴增相比，環狀擴增的轉錄子融合頻率增加了5倍(圖3c)。我們觀察到圍繞環狀擴增子結構的DNA CN，RNA表達和染色質可及性的聚集(圖3d)。圖 3 不同類型擴增子的基因......閱讀全文
再登Nature Genetics-ecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良預后相關文章導讀研究發現，許多擴增的原ai基因，并不只是位于染色體，而且還能變成游離的染色體外DNA（ecDNA），并出現大量拷貝，而且相當高比例的ecDNA是以環狀DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色體外環狀DNA
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
登革熱是目前世界上傳播流行最為廣泛的病毒性傳染病之一。登革病毒由蚊蟲攜帶并且傳播給人。目前，全世界范圍內已有100多個國家及地區出現登革熱的感染流行。據世界衛生組織（WHO）估計，全世界大約由25億人生活在受登革熱感染威脅的區域，每年有3.9億人被登革病毒感染或重復感染，有50-100萬人入院治
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基
二、DNA標記與細胞譜系示蹤發育生物學的重點包括構成器官或生物體的細胞類型的多樣性以及這些細胞的發育譜系歷史。這些方面通常作為一個方向被單獨研究，但最近的四篇新論文報道了一種將單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術與基于CRISPR的譜系示蹤技術相結合來同時解剖轉錄組細胞表型和譜系歷史的方法。近
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基因型-表型關系仍
本期為大家帶來的是腫瘤免疫療法領域的最新研究進展，希望讀者朋友們能夠喜歡。 1. JCI：為何癌癥靶向免疫藥物有時會失效？ DOI: 10.1172/JCI128644 近日，來自俄亥俄州立大學綜合癌癥中心的研究人員做出了一項突破性研究成果，該發現有助于科學家理解為什么某些腫瘤微環境中缺乏
不知不覺，再過天2016年就離我們遠去了，迎接我們的將是嶄新的2017年，那么即將過去的12月里Nature雜志又有哪些亮點研究值得學習呢？小編對此進行了整理，與各位一起學習。 【1】Nature：首次揭示RNA剪接與衰老存在因果關聯 doi：10.1038/nature20789 衰老是
2019年7月28日是第九個“世界肝炎日”，今年世界肝炎日的主題為“積極預防主動檢測 規范治療 全面遏制肝炎危害”，本文中，小編整理了近年來科學家們在肝炎研究領域取得的重要研究成果，與大家一起學習！ 【1】PLoS Biol：中國科學家設計出能抑制甲型肝炎病毒的新藥物 doi：10.1371
今年是遺傳學家、生物統計學家李景均先生著作的英文版《群體遺傳學導論》一書出版70周年。該書是中國現代史上迄今為止極少數在中國出版但在西方某個科技領域產生重大影響的專業書。絕大多數新中國成立后出生的人可能都不知道李景均是誰。在美留學的大陸學生，除非所學專業和人類遺傳學有關，恐怕大多數也不知道李景均是誰
登革熱是目前世界上傳播流行最為廣泛的病毒性傳染病之一。登革病毒由蚊蟲攜帶并且傳播給人。目前，全世界范圍內已有100多個國家及地區出現登革熱的感染流行。據世界衛生組織（WHO）估計，全世界大約由25億人生活在受登革熱感染威脅的區域，每年有3.9億人被登革病毒感染或重復感染，有50-100萬人入院治
如何將潛在的大流行及時扼殺在萌芽階段？對于這個問題，科學家們大開“科學腦洞”，貢獻出以下幾樣“法寶”： 廣譜冠狀病毒疫苗 實驗室培養類器官 繪制病毒分布圖 2020年，新冠疫情讓全世界的人們感受到了致病病毒帶來的恐怖危險。全球科學家爭分奪秒，與病毒賽跑，希望早日終結疫情。與此同時，還有一
茶作為中國的傳統國飲，自炎帝時期就有“神農嘗百草，日遇七十二毒，得荼而解之”的說法，其中的荼就是我們現在所講的茶，唐朝的陸羽著有《茶經》，可謂源遠流長。如今茶與可可、咖啡并稱為當今世界的三大無酒精飲料，每天堅持喝茶會給我們的身體帶來一些非常奇妙的變化，當然包括改善機體的健康。 茶葉中富含微量營
CRISPR基因編輯會導致數以百計意想不到的突變？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章顯示，來自美國哥倫比亞大學等研究機構的科學家確認通過CRISPR基因編輯技術成功修復了導致兩只小鼠失明的基因后，經全基因組測序發現小鼠體內有超過1500個單核苷酸發生突變，并有百個以上的位點發生發生了大片段
來源：Pixbay編者按：CRISPR基因編輯會導致數以百計意想不到的突變？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章顯示，來自美國哥倫比亞大學等研究機構的科學家確認通過CRISPR基因編輯技術成功修復了導致兩只小鼠失明的基因后，經全基因組測序發現小鼠體內有超過1500個單核苷酸發生突變，并有百個
在自然界中，蚊子是多種烈性病毒的主要攜帶者和傳播者。這些蚊媒病毒感染人體后可以引起多種烈性的臨床癥狀，諸如腦炎、腦膜炎、出血熱等，重度感染可以導致非常高的死亡率。蚊媒病毒在宿主和蚊蟲之間傳播循環（圖1）。在這個過程中，蚊子可以通過叮咬吸血從病人的血液中獲取病毒，病毒進入到蚊子體內，感染蚊子中腸的
根據貝勒醫學院圣路易斯華盛頓大學醫學院和不列顛哥倫比亞大學的研究人員的研究，大型基因組分析將某些DNA突變與雌激素受體陽性乳腺癌復發的高風險聯系起來，而其他突變與更好的結果相關聯。 這些知識可以幫助預測哪些患者最有可能患上癌癥，并且可以幫助指導治療決策。它還為新發現的高危突變患者開辟了更積極的
根據貝勒醫學院圣路易斯華盛頓大學醫學院和不列顛哥倫比亞大學的研究人員的研究，大型基因組分析將某些DNA突變與雌激素受體陽性乳腺癌復發的高風險聯系起來，而其他突變與更好的結果相關聯。 這些知識可以幫助預測哪些患者最有可能患上癌癥，并且可以幫助指導治療決策。它還為新發現的高危突變患者開辟了更積極的
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉
馬上就要過年了，吃貨的春天又將來臨，想必大家都已經準備好了上好的食材，時刻準備著磨刀嚯嚯向豬羊。或與家人團圓歡聚，或與朋友把酒言歡，或暢談發小一吐不快，或智斗姑姨險避相親，但是都逃不開一個字兒：吃！那么問題就來了：怎么海吃海喝才能不長肉呢？我們來看看達爾文怎么說：物競天擇，適者生存！這是什么意思
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星，也是國自然申請的大熱點；究其原因，是因為最近一兩年，RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展，病毒感染，神經發育，干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天，我們承接上一期的癌癥篇，為您帶來病毒領域的RNA甲基化研究
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星，也是國自然申請的大熱點；究其原因，是因為最近一兩年，RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展，病毒感染，神經發育，干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天，我們承接上一期的癌癥篇，為您帶來病毒領域的RNA甲基化
【1】Nat Commun：廣譜性流感病毒抗體疫苗新進展 doi：10.1038/s41467-018-05482-0 根據最近來自賓夕法尼亞大學醫學院的研究者們做出的研究成果，一類廣譜的流感病毒疫苗有望保護人們免受世界上大多數流感病毒的感染。 這一疫苗前體的相關研究發表在最近一期的《Na
摘要： 封面故事：細菌為什么會與人共存? 為什么哺乳動物身上會有大量共生細菌生存?這些細菌又是怎樣到它們身上去的?微生物學家正在開 始了解這些問題。但是，將有益細菌與有害細菌區分開來的是什么仍然不大清楚。2005年，研究表明，小腸菌Bacteroides fragilis對哺乳動物免疫系統有深遠
看點預告 ● 浙大繼續“開掛”，拿下今年第9篇CNS ● 昆明理工研究成果登上Nature，同一團隊10月剛完成Science首秀 ● 尋找馬約拉納零能模再下一城，中科院丁洪、高鴻鈞團隊發Science 本周，中國學者在Cell、Nature和Science上共發文6篇。 其中，浙大
在國家自然科學基金項目(項目批準號：81301412，81422028，81571975) 等資助下，清華大學醫學院程功研究員團隊首次發現了登革病毒非結構蛋白NS1在病毒“宿主-蚊”傳播循環過程中的重要作用，闡明了NS1蛋白促進病毒感染蚊蟲的分子機制，回答了“登革病毒如何從宿主傳播到蚊蟲”這一重
肺癌是全球最常見的惡性腫瘤，死亡率居惡性腫瘤之首，如今肺癌已經成為中國主要疾病負擔之一，其發病率和死亡率均高居癌癥首位。據統計，2015年我國新增肺癌患者約為73萬例，每年約有61萬人死于肺癌。此外，與其它癌癥相比，肺癌的5年生存率極低，嚴重危害人民健康，預計到2025年，我國每年肺癌新發病例將