研究發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構
近日，紀念斯隆?凱特林癌癥中心等科研機構的研究人員在Nature Genetics上發表了題為“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構。圖片來源于網絡 染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)產生于染色體上的序列，在起源上有較高的異質性，可以影響細胞生命活動，促進腫瘤細胞演進和適應性進化，是腫瘤的重要基因組特征。然而，對于染色體外環狀DNA的結構、組成和全基因組頻率仍然缺乏較為廣泛而深入的研究。科研人員結合基因組學和轉錄組學的方法分析了神經母細胞瘤（一種起源于兒童期的由交感神經系統原始細胞產生的腫瘤）中的染色體外環狀DNA的圖譜，鑒定并表征了廣泛來源于體細胞的和未被報道的體外染色體環狀D......閱讀全文
染色體外環狀DNA（eccDNA）
1. eccDNA成環的整體統eccDNA測序結果充分體現了基因組水平成環的多樣性。eccDNA來源十分豐富，同一個基因有可能會產生非常多的環狀，同樣一個環狀也不僅僅只會包含一個外顯子。TTN基因就是一個非常典型的例子。該基因長度達到了0.3Mb，而這樣一個基因竟然能衍生得到130個eccDNA，是
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA（eccDNA）
實驗方法：環狀DNA-seq,?RNA-seq（云序生物提供以上服務）1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構，作者通過環狀DNA-seq（云序生物提供以上服務）方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外，并且
研究者首次發現孕婦染色體外環狀DNA
人血漿中細胞游離的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人們廣泛研究的領域。在懷孕期間，觀察到胎兒血漿DNA（主要是胎盤來源）是線性DNA片段，比母體來源（主要是造血來源）DNA短。有研究報道了人和鼠血漿中存在染色體外環狀DNA（eccDNA）。但是，尚無有關孕婦血漿中eccDNA的公開數據。
環狀DNA的結構特點
超螺旋，DNA雙螺旋本身進一步盤繞稱超螺旋，超螺旋有正超螺旋和負超螺旋兩種。當盤旋方向與DNA雙螺旋方向相同時，其超螺旋結構為正超螺旋，反之則為負超螺旋，負超螺旋的存在對于轉錄和復制都是必要的。
細胞化學詞匯環狀DNA
中文名稱：環狀DNA分?????? 類：環狀單鏈DNA和環狀雙鏈環狀DNA也有兩種，環狀單鏈DNA和環狀雙鏈，一般存在于病毒、細菌和真核生物的線粒體和葉綠體中， 環狀DNA一般比線性DNA結合更緊密更穩定，儲存的遺傳信息更多（重復序列）。原核生物的擬核是大型環狀DNA。定?????? 義：超螺旋，D
科學家首次解析腫瘤染色體外DNA的環狀結構與功能
早期研究認為腫瘤中大量擴增的原癌基因存在于染色體上。2017年，來自美國加州大學圣迭戈分校的Paul Mischel教授團隊在Nature雜志上指出，它們是以染色體外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的結構和功能一直缺乏直接的證據。 201
研究發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構
近日，紀念斯隆?凱特林癌癥中心等科研機構的研究人員在Nature Genetics上發表了題為“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，發現染色體外環狀DNA驅動神
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
環狀染色體的概念和特點
若斷裂發生于染色體的二個末端，那么斷裂下來的兩個斷片彼此可以粘合成無著絲粒碎片，而帶著絲粒的部分可通過兩斷端的粘合形成環狀染色體。不帶著絲粒的碎片往往消失，而帶著絲粒的部分能繼續進行有絲分裂。如慢性粒細胞白血病患者向急性方向轉化時，常可見到環狀染色體。（1）真核類生物中的一種異常染色體，為沒有末端的
環狀DNA的類型和分布
環狀DNA也有兩種，環狀單鏈DNA和環狀雙鏈，一般存在于病毒、細菌和真核生物的線粒體和葉綠體中， 環狀DNA一般比線性DNA結合更緊密更穩定，儲存的遺傳信息更多（重復序列）。原核生物的擬核是大型環狀DNA。
當外泌體遇上環狀RNA（一）
文章導讀外泌體是細胞分泌的大小為30-200nm的盤狀囊泡，它在人體體液中分布廣 泛。2013年，科學家通過研究外泌體細胞囊泡調控機制獲得諾貝爾獎，這使外泌體開始被廣 泛關注，隨著研究的深入，人們發現外泌體可作為細胞間信息交流的橋梁，在細胞間往來穿梭進行信息傳遞。另外，外泌體與疾病的發生尤其
當外泌體遇上環狀RNA（三）
2. 外泌體circSHKBP1通過調控miR-582-3p/HUR/VEGF過程以及抑 制HSP90降解來促進胃ai發展發表期刊：Molecular Cancer影響因子：15.302發表時間：2020.6.29文章鏈接：Exosomal circSHKBP1 promotes gastric
當外泌體遇上環狀RNA（五）
（6）circSHKBP1直接HSP90相互作用并抑 制其降解在HGC27細胞中用circSHKBP1探針的RNA pull-down和蛋白質譜結果顯示兩個差異表達蛋白HSP90β和HSP90α（HSP90的異構體）在過表達circSHKBP1的GC細胞中富集。RIP實驗顯示，circSHKBP1能
當外泌體遇上環狀RNA（六）
3. 外泌體circPACRGL通過miR-142-3p/miR-506-3p- TGF- cm1過程驅動大腸ai的惡化發表期刊：Molecular Cancer影響因子：15.302發表時間：2020.7.27文章鏈接：Exosomal circPACRGL promotes progressio
當外泌體遇上環狀RNA（七）
（3）circPACRGL作為海綿分子結合miR-142-3p和miR-506-3p作者使用生物信息學數據庫預測發現circPACRGL同時具有miR-142-3p和miR-506-3p的結合位點，雙熒光素酶報告實驗檢測也證實miR-142-3p和miR-506-3p可與circPACRGL直接結合
當外泌體遇上環狀RNA（二）
（4）circUHRF1通過miR-449c-5p相關途徑來抑 制NK細胞功能作者利用生物信息學預測了14個miRNA，在NK-92細胞中進行circUHRF1-RIP以及qPCR，結果表明miR-449c-5p是NK-92細胞中一個與circUHRF1相互作用的miRNA。在NK-92細胞中進行抗
當外泌體遇上環狀RNA（四）
（3）GC來源的外泌體circSHKBP1在體外能促進GC細胞的增殖、遷移和侵襲為了探索circSHKBP1是否影響GC細胞的生物學過程，分析了circSHKBP1在4種人GC細胞系（BGC823、HGC27、AGS和MGC803）和正常胃上皮細胞系GES1中的表達水平。結果表明，circSHKBP
帶切口環狀DNA的結構特點
中文名稱帶切口環狀DNA英文名稱nicked circular DNA定 義雙鏈環狀DNA分子中一條單鏈上帶有一個或多個裂口。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
分子遺傳學詞匯環狀DNA
中文名稱：環狀DNA分????類：環狀單鏈DNA和環狀雙鏈定義：超螺旋，DNA雙螺旋本身進一步盤繞稱超螺旋，超螺旋有正超螺旋和負超螺旋兩種。當盤旋方向與DNA雙螺旋方向相同時，其超螺旋結構為正超螺旋，反之則為負超螺旋，負超螺旋的存在對于轉錄和復制都是必要的。
細胞化學詞匯帶切口環狀DNA
中文名稱：帶切口環狀DNA英文名稱：nicked circular DNA定 義：雙鏈環狀DNA分子中一條單鏈上帶有一個或多個裂口。應用學科：生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）
Nature－Nanotechnology：DNA環狀分子的自主復制
生物系統中存在很多的自主復制的例子。然而，人工制造這樣的生物系統的自主復制系統卻是相當困難，這是因為生物系統很復雜。在其他領域，人類可以創造某些自我復制系統，比如磁場系統以及模塊化機器人等等。我們很少將這些人造的自我復制系統和生物系統中的自我復制系統進行比較。因而，如果能從理論上將人工的自主復制
程序外DNA合成試驗
基本方法是測定S期以外3H-胸苷摻入胞核的量，這一摻入量可反映DNA損傷后修復合成的量。由于此種合成發生在DNA正常復制合成主要時期以外，故稱為程序外DNA合成(unschedule DNA synthesis UDS)試驗或DNA修復合成試驗。一般使用人淋巴細胞或嚙齒動物肝細胞等不處于正在增殖
外源DNA的定義
外源DNA，是通過基因工程技術或病毒感染等途徑引入靶細胞中的DNA序列。
概述環狀混合痔的外剝內扎改良術
1、分段齒形結扎術1982年丁澤民采用分段齒形結扎術治療環狀混合痔，此法采用放射狀切口，使痔核下端分離及結扎頂點的連線均呈曲線，不在同一水平面上，以保證內痔脫落后的創面呈齒形，由于保留了肛管皮橋、黏膜橋，進行了齒形分離結扎，這對避免肛門狹窄、肛門松弛、黏膜外翻等后遺癥有重要作用，但不能很好地解決
關于環狀混合痔的外剝內扎術介紹
外剝內扎術最早由miles在1919年提出，1937年英國圣·馬克醫院的milligan和morgan對該手術方式進行了改良，一般稱為milligan?morgan手術，是臨床上常用的手術方式之一。該手術要點是在痔下端皮膚與黏膜交界處作尖端向外的v 形切口，沿內括約肌表面向上剝離到內痔頂端，在痔
細胞化學詞匯共價閉和環狀DNA
中文名稱：共價閉和環狀DNA英文名稱：covalently closed circular DNA;cccDNA定 義：兩條多核苷酸鏈是完全連續的環狀雙鏈DNA分子。由于鏈上沒有裂隙可以釋放內部張力，所以可以形成超螺旋結構。天然狀態下某些病毒、細菌的染色體DNA，質粒、線粒體和葉綠體的DNA具有這
共價閉和環狀DNA的結構特點
中文名稱共價閉和環狀DNA英文名稱covalently closed circular DNA;cccDNA定 義兩條多核苷酸鏈是完全連續的環狀雙鏈DNA分子。由于鏈上沒有裂隙可以釋放內部張力，所以可以形成超螺旋結構。天然狀態下某些病毒、細菌的染色體DNA，質粒、線粒體和葉綠體的DNA具有這種結構
外源DNA的基因特點
基因有兩個特點，一是能忠實地復制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能夠“突變”，突變絕大多數會導致疾病，另外的一小部分是非致病突變。非致病突變給自然選擇帶來了原始材料，使生物可以在自然選擇中被選擇出最適合自然的個體。含特定遺傳信息的核苷酸序列，是遺傳物質的最小功能單位。除某些病毒的基因由核糖核酸（
外源DNA的基本特點
基因有兩個特點，一是能忠實地復制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能夠“突變”，突變絕大多數會導致疾病，另外的一小部分是非致病突變。非致病突變給自然選擇帶來了原始材料，使生物可以在自然選擇中被選擇出最適合自然的個體。含特定遺傳信息的核苷酸序列，是遺傳物質的最小功能單位。除某些病毒的基因由核糖核酸（