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    從RNA抽提到電泳鑒定2

    逆轉錄(RT)一,準備工作1, 實驗器具與材料:(1)移液槍:200ul、10ul(2)吸頭:200ul、20ul(3)EP 管1.5ml、100ul(4)水浴箱2,實驗器具的處理與準備塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個浸泡于 1‰DEPC水中(必要時小槍頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時左右烘干),試驗前將槍頭放入吸頭臺。3,試劑配制和準備:(1)DEPC水:泡實驗器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時后備用。逆轉錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶內裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,送至高壓,后分裝到幾個1.5mlEP管中,-20℃中保存備用。(2)RT中所需要的各種試劑(3)引物濃度計算方法: (新合成的引物的稀釋) 假如終濃度為X uM(pmol/ul) 加DE......閱讀全文

    RNA足跡和修飾干擾分析實驗

                實驗方法原理 RNA 足跡和修飾干擾分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用來研究 RNA 與蛋

    RNA足跡和修飾干擾分析實驗

    RNA 足跡和修飾干擾分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用來研究 RNA 與蛋白質相互作用的技術。RNA 測序及其結構分析的原理是 RNA 足跡試驗的理論基礎,它們都是建立在變性、半變性或自然條件下采用堿基特異性

    RNA足跡和修飾干擾分析實驗

    實驗方法原理 RNA 足跡和修飾干擾分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用來研究 RNA 與蛋白質相互作用的技術。RNA 測序及其結構分析的原理是 RNA 足跡試驗的理論基礎,它們都是建立在變性、半變性或

    RNA 提取策略及RT-PCR技術

    第一部分RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常見

    分子生物學常用實驗技術(page 3)

    分子雜交技術    互補的核苷酸序列通過Walson-Crick 堿基配對形成穩定的雜合雙鏈分子DNA 分子的過程稱為雜交。雜交過程是高度特異性的,可以根據所使用的探針已知序列進行特異性的靶序列檢測。雜交的雙方是所使用探針和要檢測的核酸。該檢測對象可以是克隆化的基因組DNA,也可以是細胞總DN

    RT-PCR技術及RNA提取策略-1

    第一部分 RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常

    miRNA克隆實驗

                實驗方法原理 在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起

    miRNA克隆實驗

    在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起著非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 維持著基因的表達,還有一部分則起著調控基因表達的作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主

    miRNA 克隆實驗

    實驗方法原理 在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起著非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 維持著基因的表達,還有一部分則起著調控基因表達的作用。實驗材料 寡核

    分子生物學常用實驗技術(page 2)

    一、RNA 制備   模板mRNA 的質量直接影響到cDNA 合成的效率。由于mRNA 分子的結構特點,容易受RNA 酶的攻擊反應而降解,加上RNA 酶極為穩定且廣泛存在,因而在提取過程中要嚴格防止RNA 酶的污染,并設法抑制其活性,這是本實驗成敗的關鍵。所有的組織中均存在RNA 酶,人

    分子雜交技術 -1

    互補的核苷酸序列通過Walson-Crick堿基配對形成穩定的雜合雙鏈分子DNA分子的過程稱為雜交。雜交過程是高度特異性的,可以根據所使用的探針已知序列進行特異性的靶序列檢測。  雜交的雙方是所使用探針和要檢測的核酸。該檢測對象可以是克隆化的基因組DNA,也可以是細胞總DNA或總RNA。根據使用的方

    凝膠遷移實驗(EMSA)——凝膠遷移

    凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA)可以:(1)研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。實驗方法原理一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術最初

    差異顯示技術(DD)實驗

                實驗材料 無菌玻璃器皿 無菌 Eppendorf試 管 Eppendorf槍頭 無菌 falcon離心管

    異顯示技術(DD)實驗

    D D 由 Liang和 Pardee在 1992年首次提出。至今有大約1700篇 與 DD相關的文章發表,可見其影響巨大。許多與神經變性和凋亡相關的基因也通過DD 的方法得以鑒定。 .DD的原理基于對cDNA分子進行隨機擴增和隨后按大小進行的分離。

    哺乳動物細胞體外剪接分析實驗

                實驗方法原理 剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體

    RNA制備的問題與解答

    1、塑料制品、玻璃和金屬物品的處理(a)塑料制品:盡可能使用無菌,一次性塑料制品。已標明RNase-Free 的塑料制品,如沒有開封使用過,通常沒有必要再次處理。對于國產塑料制品,原則上都必須處理方可使用。處理方法如下:(1)在玻璃燒杯中注入去離子水,加入DEPC使DEPC的終濃度為0.1%。注意:

    mRNA 的 PCR 差異顯示實驗

    實驗方法原理 實驗材料 人的細胞總 RNA 或 poly(A)+ RNA試劑、試劑盒 人胎盤 RNase 抑制劑DNase ITris·ClKClMgCl23:1 (V V) 苯酚 氯仿乙酸鈉乙醇DEPC 處理的水簡并錨定 oligo(dT) 引物組合MoMuLV 逆轉錄酶緩沖液DTT4dN

    凝膠遷移實驗(EMSA)

    實驗方法原理 凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白,目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列

    RT-PCR技術及RNA提取策略-2

    一般的瓊脂糖凝膠電泳,注意不要用甲醛變性電泳(又不是做northern,實在沒有必要)。電泳槽注意一定不要用DEPC處理,一定要保證電泳體系中有少量的RNAase存在。分別在加樣孔中加入1,2,3μlRNA抽提溶液。在旁邊加入DNA marker。1%瓊脂糖凝膠,10V/cm的電壓,電泳10

    EMSA實驗問題與解答

    以下問題是以Promega公司試劑盒為例。凝膠遷移實驗1)什么是凝膠遷移或電泳遷移率實驗?凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA)是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白,目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互

    哺乳動物細胞體外剪接分析實驗

    實驗方法原理 剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體聚合酶體外轉錄的方法來制備。實驗材料 前體 mRNA 底物試劑、試劑盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇

    哺乳動物細胞體外剪接分析實驗

    剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物補充 SR 蛋白或粗提取物的部分純化組分,最常使用的是 HeLa 細胞的提取物。前體 mRNA 底物通常采用噬菌體聚合酶體外轉錄的方法來制備。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理剪接反應的典型做法是使用核提取物,即 S10

    分子生物學常用實驗技術(page 1)

    第一章質粒DNA 的分離、純化和鑒定 第二章DNA 酶切及凝膠電泳 第三章大腸桿菌感受態細胞的制備和轉化 第四章RNA 的提取和cDNA 合成 第五章重組質粒的連接、轉化及篩選 第六章基因組DNA 的提取 第七章RFLP 和RAPD 技術 第八章聚合酶鏈式反應(PCR)擴增和擴增產物克隆 第九章分

    Real-time PCR實驗注意事項

    實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到最大計量的位置,防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱,切記切記多和大家討論,同時多關注別人討論的經驗,這幾乎是最快提高的捷徑了所有的試劑都自己配,出了問題才好找原因防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器

    mRNA 的 PCR 差異顯示實驗

                實驗方法原理 實驗材料 人的細胞總 RNA 或 poly(A)+ RNA

    RACE-PCR克隆基因的幾點建議

    摘 要:  RACE是一種快速克隆cDNA末端的方法,目前, 該方法被廣泛應用于未知堿基序列基因的克隆,尤其是SMART RACE技術更為人們所青睞。本文總結了我們實驗室用SMART RACE技術克隆基因的一些心得體會,希望對用RACE方法克隆基因的同行有些幫助。關鍵詞: RACE; RN

    用于檢測植物組織RNA的原位雜交法

    用于檢測植物組織RNA的原位雜交法(一)組織切片制備l      植物組織的甲醛固定和包埋1.將植物組織切成小塊,立即放入一個裝有10~50ml固定劑溶液的燒杯中,把燒杯放到真空脫水機內。調節真空度以形成一個溫和的真空,然后慢慢恢復常壓。微量便于固定

    Real-time PCR實驗注意事項

    Real-time PCR實驗注意事項實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到zui大計量的位置,防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱,切記切記多和大家討論,同時多關注別人討論的經驗,這幾乎是zui快提高的捷徑了所有的試劑都自己配,出了問題才好

    mRNA 的 PCR 差異顯示實驗

    對應于 mRNA 的 DNA 序列,可以被回收、克隆、測序,可以用作雜交或篩庫的探針。來源:《精編分子生物學實驗指南(第五版)》實驗材料人的細胞總 RNA 或 poly(A)+ RNA試劑、試劑盒人胎盤 RNase 抑制劑DNase ITris·ClKClMgCl23:1 (V V) 苯酚 氯仿乙酸

    常用的分子生物學基本技術

    核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性,它已成為分子生物學中最常用的基本技術,被廣泛應用于基因克隆的篩選,酶切圖譜的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下(適宜的溫室度及離子強度等)可按堿基互補原成雙鏈。雜交的

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