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短讀長cDNA測序短讀長已經成了在整個轉錄組范圍內對基因進行檢測和定量的事實方法(de facto method)，部分原因是這種方法比芯片成本更低，操作更方便，但是其主要原因還是因為這種方法能生成更全面，更高質量的數據，這種方法能夠 對整個轉錄組中的基因表達水平進行定量。使用Illumina短讀長測序平臺進行DGE分析的核心步驟包括：RNA提取、cDNA合成、接頭連接、PCR擴增、測序和數據分析(FIG1)。在這個過程中，存在打斷片段，片段長度選擇和基于磁珠的文庫純化這些操作，因此這種方法產生的cDNA片段通常都是在200bp以下。RNA-seq文庫的測序讀長分配到每個樣本上的話，每個樣本會測到平均20-30 million條讀長(reads)（也就是常說的20-30M條讀長），數據經過處理后，使用這些讀長對每個基因或轉錄本進行定量，最后再用統計學方法來統計基因的差異。短讀長RNA-seq方法很穩健，并且通過對短讀長測序技術的......閱讀全文
全外顯子組測序（WES）和全基因組測序（WGS）對于罕見的孟德爾遺傳病的檢測能力最高只能達到50%，基于這兩種手段，我們對于遺傳多樣性帶來具體生物學功能差異和臨床疾病病因的解釋能力是十分有限的。Cummings課題組曾使用RNA測序（RNAseq）對肌肉疾病進行了準確的檢測，證實了RNAseq在
2020年3月19日，諾禾致源公司正式宣布面向全球推出高通量測序（NGS）領域首個多產品并行的柔性智能交付平臺Falcon。此次多產品柔性化智能產線的發布，突破了傳統的NGS測序方式。同時，伴隨智能交付平臺的投產使用，也將有助于進一步定義行業內NGS測序標準，推動行業生態健康有序的發展。并為客戶
腫瘤壞死因子相關凋亡誘導配體（TNF-related apoptosis-inducing ligand，TRAIL）是一種抗腫瘤蛋白，臨床試驗證明其具有潛在抗癌作用。但是，這種藥物有血清半衰期短、穩定性差、成本高和生物分布受限等缺點。賓州Hershey癌癥研究所的Allen JE等人在2013
分析測試百科網訊 2020年9月 布魯克公司宣布收購Canopy Biosciences，LLC。后者是用于免疫學，免疫腫瘤學和細胞療法的高多重生物標志物成像領域的領導者。此次收購將為布魯克公司在靶向多組學和基于熒光的成像技術方面的產品競爭力帶來顯著提升。同時，布魯克也將幫助Canopy在全球范
2.1.3 剪切后的短片段作圖軟件包要將RNA的逆轉錄片段cDNA重新定位到基因組當中需要更加復雜的專業化算法。要將不同外顯子經過剪切拼接之后生成的RNA短片段重新定位到基因組中和將一個外顯子生成的RNA短片段重新定位到基因組中是完全不一樣的（圖14）。在RNA逆轉錄產物cDNA的定位操作中用到的諸
近年來，m6A RNA修飾的研究已成為當今生命科學領域最前沿最熱門的研究方向之一，不斷有CNS的文章問世，m6A RNA修飾的催化、去除以及識別的分子機理研究越來越清晰，而人們更關心的似乎是m6A RNA修飾與重大疾病例如腫瘤之間的相關性。表觀遺傳的改變極大得促進了人類癌癥的發展，近期Hepat
腸道神經系統被稱為人類的“第二大腦”，其由極為復雜的神經網絡組成，不僅可支配腸道節律運動、分泌等生理性功能，還參與維持黏膜免疫系統的穩態。然而在炎癥性腸病（IBD）中，受限于技術手段，腸道神經系統的病理變化及其意義卻始終未能明確。劉杰教授課題組長期致力于神經免疫調控及診療新策略研究，近年來著
近年來，過繼細胞免疫治療（adoptive cell transfer，ACT）取得了重大的發展，成為繼手術和放化療等常規腫瘤治療手段外新興的治療方法。嵌合抗原受體T細胞（chimeric antigen receptor T cells，CAR-T）治療是ACT中最具應用前景的治療方法之一1。
近日，迄今為止最全面的人類大腦基因組分析工作宣告完成，來自15個機構的多學科研究人員對大腦的發育分子機制以及自閉癥、精神分裂癥、雙向情感障礙等神經精神疾病與基因的關聯進行了深入分析，成功繪制了人腦基因組圖譜。12月13日~14日，10篇相關研究成果分別發表在 Science、Science Tr
肺癌是發病率和死亡率增長最快、對人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一。近年來，肺癌患者有更加年輕化的趨勢，治愈較為困難。雖然目前科學家在肺癌治療方面已取得了巨大進展，但對其細胞層面上的科學認識仍難盡如人意。近日，著名學術期刊《自然—醫學》推出史上最完整的肺癌細胞圖譜，這將是科學家們在細胞層面深入
最新研究顯示，科學家們通過迄今為止對人類大腦進行的最全面的基因組分析，揭示了大腦發育過程中所經歷的變化，出現的個體差異，以及自閉癥譜系障礙和精神分裂癥等神經精神疾病的根源。 這項龐大的研究完成了近2000個大腦的分析，解析了大腦發育和功能的復雜機制，由多個機構完成，相關成果公布在12月14日S
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中，轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本，可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時，cDNA測序也極大
胃癌是一種常見的癌癥類型，也是癌癥相關死亡中第二大類型，盡管目前已經在胃癌治療方面取得很大進展，但胃癌病人的預后情況仍不樂觀，如何提早診斷及時治療并能夠防止癌癥復發是治療胃癌的重大難題。 代謝紊亂是胃癌的一個顯著特征，在最近發表在國際學術期刊Oncogene上的一項研究中，來自香港中文大學的研
玩轉數據庫，助你發牛文！癌癥研究究竟有多難？讓我們來捋一下基本思路：首先，要有一定數量的高質量腫瘤臨床樣本；其次……等一下，是不是在“首先”這一步就卡住了？癌癥研究中的高質量的腫瘤樣本不但要有切除適當的腫瘤瘤體和癌旁組織，還需要每個病人的各項病理指征、家族病史、治療手段、療效以及對病人不間斷的隨訪信
最新研究顯示，科學家們通過迄今為止對人類大腦進行的最全面的基因組分析，揭示了大腦發育過程中所經歷的變化，出現的個體差異，以及自閉癥譜系障礙和精神分裂癥等神經精神疾病的根源。 這項龐大的研究完成了近2000個大腦的分析，解析了大腦發育和功能的復雜機制，由多個機構完成，相關成果公布在12月14日S
唇形科（Lamiaceae）香茶菜屬（Isodon）植物是我國民間廣泛使用的草藥，具有清熱解毒、抗菌消炎、舒筋活血、抗腫瘤等功效。該屬植物富含結構變化多樣的對映-貝殼杉烷類二萜化合物（ent-kauranoids）。最近，中國科學院昆明植物研究所普建新研究組從兩種該屬植物中發現了兩個具有潛在開發
今日，羅氏（Roche）公司舉行了的“羅氏醫藥日”（Roche Pharma Day）活動。這是羅氏公司每年一度向投資者闡明公司未來研發重點，更新研發管線后期項目最新進展，以及介紹該公司熱點項目的重要投資者活動。在本年度的“羅氏醫藥日”上，羅氏的高管們不但介紹了研發管線的最新進展，而且分享了對醫
在EdgeBio，我們一直關注如何提高效率，降低成本，并為我們的客戶提供整體上更優質的服務。隨之而來的是大量的R&D和新技術開發(NTD)費用。一個很好的例子是我們近期發布的一系列技術白皮書(共五篇)，是關于定向重測序應用的，包括外顯子組。您可以在這里找到。今天我將與大家分享一些使用Il
大多數醫學疾病在組織，器官和體液中都有明確的物理特征。但是，精神疾病并不是由這種病理所定義的，它們是由行為所決定的。這就造成了精神障礙如精神分裂癥和自閉癥的定義特征一直存在爭議。 加州大學洛杉磯分校的一項研究通過分析來自患有自閉癥，精神分裂癥，雙相性精神障礙，嚴重抑郁癥或酒精中毒的已故受試者大
一國際研究小組最新發表在《神經細胞》雜志上的論文稱，他們使用一種最新測序技術，首次成功描繪出小鼠大腦基因活性的完整圖譜。該圖譜覆蓋了整個基因組的所有基因，十分詳細地顯示了小鼠大腦皮層各層次的基因活性情況。研究人員指出，該研究成果不僅有助于科學家進一步理解哺乳動物大腦的組織結構情況，
在農業生產中，性狀相關的基因定位對于科學育種十分重要，傳統的遺傳重組定位具有指導意義和實用價值，但傳統方法周期長、耗費大。隨著二代測序的發展，DNA測序速度大大加快、成本大大降低，使得通過測序法進行的基因定位（mapping-by-sequencing）成為越來越多動植物研究的主要手段。對合適的樣本
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中，轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本，可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時，cDNA測序也極大
導讀近年來，m6A RNA修飾的研究已成為當今生命科學領域最前沿最熱門的研究方向之一，不斷有CNS的文章問世，m6A RNA修飾的催化、去除以及識別的分子機理研究越來越清晰，而人們更關心的似乎是m6A RNA修飾與重大疾病例如腫瘤之間的相關性。表觀遺傳的改變極大得促進了人類癌癥的發展，近期Hepat
美國的《Science》雜志由愛迪生投資創辦，是國際上著名的自然科學綜合類學術期刊，與英國的《Nature》雜志被譽為世界上兩大自然科學頂級雜志。Science雜志主要發表原始性科學成果、新聞和評論，許多世界上重要的科學報道都是首先出現在Science雜志上的，比如艾滋病與人類免疫缺陷病毒之間的
眾所周知，三陰性乳腺癌（Triple-negative breast cancer，TNBC）是具有高轉移性的惡性腫瘤，并且沒有可用的分子靶點。2018年11月，來自西班牙圣地亞哥大學醫學院等多個研究機構的學者在《International Journal of Cancer》上發表研究成果，首
在一項新的研究中，來自美國南加利福尼亞大學多尼斯夫文學藝術科學學院（Dornsife College of Letters, Arts and Sciences）的研究人員發現了一類全新的離子通道。這些通道讓質子（氫離子）進入細胞，在內耳平衡中發揮著重要的作用，并且存在于對酸味作出反應的味覺細胞
4．轉錄組、蛋白組揭示miR-137調控底物。蛋白組結果發現：Mir137–/–組versus Mir137+/+組, Mir137+/–組versus Mir137+/+組, and Mir137–/–組versus Mir137+/–組，分別篩選到417、94和76個差異表達蛋白。這些蛋白與
魯汶大學和VIB等機構的研究人員采集了數千個健康和癌變肺細胞，創建了第一個完整的肺癌細胞地圖。《Nature Medicine》報道了這項研究，結果表明腫瘤比科學家們認為的更復雜，竟然包含52種具有明顯差異的不同細胞類型。 盡管抗癌工作已經取得巨大進展，但是，我們對腫瘤的最基本單位——細胞的科
基因水平的研究發現miR-137與多種神經精神疾病存在相關性。同時，miR-137在正常的神經發生與神經發育過程中也具有重要作用。但是，miR-137的體內功能與作用機制仍然不清楚。為了揭示miR-137的功能，該研究構建了miR-137 KO動物，并對KO動物的突觸可塑性、學習能力等多種神經功
2018年，拓展質譜流式應用方向的文獻頻出。5月斯坦福大學Alex J. Kuo實驗室將質譜流式研究引入表觀修飾領域和衰老領域的熱潮還未過去，8月瑞典皇家理工學院Petter Brodin實驗室就實力搶鏡，在Cell上發表其研究“Stereotypic Immune System Develop