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  • mBio:揭秘新型冠狀病毒

    今年早些時候,首先出現在沙特阿拉伯的一種新型冠狀病毒已經陸續導致三人致病,其中一人死亡。這無疑又給全球醫療衛生機構敲響了警鐘。十一月二十日美國微生物學會旗下的mBio雜志發表了一項新研究,將這種新型病毒與蝙蝠體內的病毒聯系起來。研究人員對HCoV-EMC/2012病毒進行了測序研究,分析了該病毒與其他病毒的關系及其潛在來源。這一測序分析的結果將有助于人們對這一新興病毒進行治療。 “該病毒與亞洲蝙蝠體內的病毒親緣關系最近,與已知人類病毒并不相關。”該研究的領導者,荷蘭Erasmus醫療中心的Ron Fouchier說,“因此,我們推測它來源于動物。” 早前感染這一新病毒的60歲沙特阿拉伯老人,經歷了急性肺炎和腎衰竭并最終死亡,這不禁讓人們聯想起了以往的冠狀病毒疫情,2002年SARS病毒最終導致超過900人死亡。在此之后,又有兩位患者受到了類似病毒的感染,自此HCoV-EMC/2012病毒引發了人們的高度關注。......閱讀全文

    中國疾控中心已完成測序MERS病毒基因組

      中國疾控中心近日透露,該中心病毒病所與廣東省及惠州市疾控中心合作,已完成我國首例MERS病例的病毒全基因組序列測定。  6月10日信息顯示,韓國目前中東呼吸綜合征(MERS)確診病例為108人,死亡9人,死亡率在7%左右。韓國病例數僅次于沙特,列世界第二。近期MERS在韓國連續報告多例病例,被隔

    Science:人巨細胞病毒病毒基因組測序

      人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,感染約50-100%的成人,但通常沒有不良影響,并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的,發展中國家感染人數比發達國家人數多。   該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統受損,可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發展有關聯。這項新的研究分析了病毒的蛋

    新冠病毒基因組測序的方法有哪幾種?

    新冠病毒基因組測序的方法有宏基因組測序和靶向測序。

    mBio:揭秘新型冠狀病毒

      今年早些時候,首先出現在沙特阿拉伯的一種新型冠狀病毒已經陸續導致三人致病,其中一人死亡。這無疑又給全球醫療衛生機構敲響了警鐘。十一月二十日美國微生物學會旗下的mBio雜志發表了一項新研究,將這種新型病毒與蝙蝠體內的病毒聯系起來。研究人員對HCoV-EMC/2012病毒進行了測序研究,分析了該病毒

    輸入性MERS病例病毒基因測序完成

      6月5日,中國疾病預防控制中心在網站上發布信息稱,該中心病毒病所與廣東省及惠州市疾控中心合作,已完成我國首例輸入性中東呼吸綜合征(MERS)病例的病毒全基因組序列測定。結果表明,目前病毒傳染性并未增強。   據悉,5月29日1時40分,中國疾控中心病毒病所收到廣東省疾控中心送檢的病例咽拭子標本,

    關于病毒基因組的基本介紹

      病毒是最簡單的生物,完整的病毒顆粒包括外殼蛋白和內部的基因組DNA或RNA(有些病毒的外殼蛋白外面有一層由宿主細胞構成的被膜(envelope),被膜內含有病毒基因編碼的糖蛋白。病毒不能獨立地復制,必需進入宿主細胞中借助細胞內的一些酶類和細胞器才能使病毒得以復制。外殼蛋白(或被膜)的功能是識別和

    病毒基因組的結構特點介紹

      1.病毒基因組大小相差較大,與細菌或真核細胞相比,病毒的基因組很小,但是不同的病毒之間其基因組相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也較小,只能編碼4種蛋白質,而痘病毒的基因組有300kb之大,可以編碼幾百種蛋白質,不但為病毒復制所涉及的酶類編碼,甚至為核苷酸代謝的酶類編碼,因此

    利用現有技術,如何鑒定一個全新的病毒2

    wuguojun680510網友的觀點是:單純憑分子生物學技術鑒定一個新的病毒是不可能的,只能得知可能是一個新病毒,鑒定一種新病毒還必需從經典途徑走起。????? 1、純化病毒。????? 2、大小、形態鑒定。????? 3、對稱形式確定????? 4、核酸類型確定????? 5、細胞嗜性鑒定???

    -英公開埃博拉病毒基因測序數據

      一個英國科研團隊成功完成了對埃博拉病毒的基因測序,并已將數據在網上公開發布,免費提供給全球科研人員使用。這有助于各國研發更高效的治療藥物和疫苗。  劍橋大學3日發布公告稱,2014年埃博拉疫情在西非暴發后,來自該校及英國多個科研機構的研究人員開始在塞拉利昂采集病毒樣本,并利用美國一家公司開發的新

    基因組測序

    如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的

    SARS病毒基因組復制機制研究獲突破

      近日,武漢大學生命科學學院教授郭德銀領導的研究組以選擇冠狀病毒特有的多個RNA加工酶作為主要研究目標,通過酵母菌系統的功能篩選和體外生物化學分析,發現SARS病毒基因組1b區編碼的一種非結構蛋白nsp14同時具有兩種RNA加工酶活性,一是參與RNA 5’-端加帽的N7-甲基轉移酶,二是進行RNA

    酵母還能快速“重建”新冠病毒基因組?

      據《自然》雜志6日發表的一項合成生物學研究,瑞士一個研究團隊開發出一種可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人員開發診療方法和疫苗,同時,擁有合成能力也被認為是未來防治相關疫情的重要一環。  在實驗室重建病毒,是一種有效的研究疾病暴發所涉病原體的方法。發生疫情時,將病毒樣本送至研究機構可

    牛乳頭瘤病毒基因組結構和功能

      乳頭瘤病毒(papillomavirus)是感染人和動物皮膚、粘膜并引起乳頭狀瘤病變的一種DNA病毒,屬于乳多空泡病毒(papovavirus)科。根據病毒感染的宿主不同可以分為牛乳頭瘤病毒(BPV),人乳頭瘤病毒(HPV)等。已發現的乳頭瘤病毒基因組都具有相似的結構。下面以BPV為例說明乳頭瘤

    Nature重大成果:揭示125000個病毒基因組

      在地球的內部、地球之上以及地球的周圍,微生物的數量達到了10^30,估計超過了銀河系中的星星。微生物已知在調控碳固定,維持全球氮、硫、磷和其他營養素的循環中起至關重要的作用,但目前大多數的微生物仍然是無法培養和未知的。美國能源部正以這一“微生物暗物質”作為目標,更好地了解地球微生物的多樣性,收集

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      在地球的內部、地球之上以及地球的周圍,微生物的數量達到了10^30,估計超過了銀河系中的星星。微生物已知在調控碳固定,維持全球氮、硫、磷和其他營養素的循環中起至關重要的作用,但目前大多數的微生物仍然是無法培養和未知的。美國能源部正以這一“微生物暗物質”作為目標,更好地了解地球微生物的多樣性,收集

    Nature-Biotechnology定義病毒基因組標準:何謂高質量基因組

      據說,地球上的微生物總量超過了銀河系中的恒星數量,而且病毒總量也要比之前預計的多得多。  在最新的Nature Biotechnology雜志上,美國能源部(DOE)聯合基因組研究所(JGI)構建了重要的病毒序列數據庫,同時提出了病毒基因組標準,指出了三類基因組質量的分級。  目前雖然許多病毒未

    70種節肢動物中發現112種全新病毒-負鏈RNA病毒危害最大

      中國疾控中心張永振研究員帶領的人獸共患病研究團隊,在70種節肢動物中發現了112種從未被報道過的全新病毒,并命名了一個全新病毒科。該研究成果日前發表在生命科學領域的頂級期刊eLife雜志上。  張永振介紹,該研究在我國的湖北、浙江、新疆等地采集了昆蟲綱、蛛形綱、唇足綱、軟甲亞綱的70種節肢動物,

    解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序

      “桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、   有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983

    基因組測序儀簡介

      基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。  技術指標  個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。  主要功能  樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。

    PNAS:甜瓜基因組測序

      甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。   聯合國糧農組織2009年

    認識泛基因組測序

    什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

    關于全基因組測序的測序指標介紹

      一、全基因組測序的測序指標— 深度  測序深度(Sequencing depth)是指測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體,如果采用的是雙末端或Ma

    454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目

      一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當

    加拿大完成流感病毒基因測序-疫苗最早11月問世

      新華網渥太華5月6日電 加拿大衛生官員6日在渥太華舉行的新聞發布會上宣布,加科學家已經完成對3個甲型H1N1流感病毒樣本的基因測序工作,這是世界上首次完成對這種新病毒的基因測序,將為研制疫苗打下基礎。   加拿大國家微生物學實驗室科學家在新聞發布會上介紹說,完成基因測序可以使科學家掌握甲型H1

    盤點最新基因組測序成果

      the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者:  種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae)  基因組:~2.86 billion bp  人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年

    中國蓮基因組測序完成

      繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后,近日,中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作,順利完成中國蓮的基因組測序,構建了首張中國蓮全基因組圖譜,相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。   “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎,也標志著我國相關研究將對生物進

    我國完成小麥A基因組測序

    本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和

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    ?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和

    測序解讀基因組,真的好嗎?

    測序解讀基因組,真的好嗎?   “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。”  雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但

    測序基因組勘探食品污染

       上周,兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠(Blue  Bell Creameries)已確認有少量食品原料已感染李斯特菌,目

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