斑馬魚為何作為高內涵篩選HCS的模式動物?
有兩種有效的篩選方法,廣泛用于早期藥物發現中的化合物分選。這些方法包括高通量篩選 (HTS) 和高內涵篩選 (HCS)。雖然前者從大量新藥候選藥物中快速有效地分選有用的化合物,但HCS使用基于成像的多參數分析來鑒定可能影響這些藥物療效的化合物。 在本文中,您將了解什么是HCS,使用的不同方法以及常見做法。我們還將討論如何將斑馬魚納入高內涵篩選過程。讓我們開始吧!什么是高內涵篩選?高內涵Screening是一種成熟的方法,更常用于細胞事件的多參數分析。它專門用于藥物發現過程中的生物研究和毒性篩選。因此,HCS技術可用于確定候選藥物是否改變病程,高內涵篩選主要識別改變細胞形態和表型的微分子,如肽或RNAi。形態和表型狀態的這些變化可以誘導細胞產物(如蛋白質)合成的增加或減少,以及細胞視覺外觀的變化。在高內涵篩選中,首先用選擇的基于體外的測定方法孵育物質或化合物,然后研究細胞的分子成分和結構。最常見的研究包括用熒光......閱讀全文
斑馬魚為何作為高內涵篩選HCS的模式動物?
有兩種有效的篩選方法,廣泛用于早期藥物發現中的化合物分選。這些方法包括高通量篩選 (HTS)?和高內涵篩選 (HCS)。雖然前者從大量新藥候選藥物中快速有效地分選有用的化合物,但HCS使用基于成像的多參數分析來鑒定可能影響這些藥物療效的化合物。?在本文中,您將了解什么是HCS,使用的不同方法以及常見
高內涵篩選HCS市場概況
高內涵篩選(HCS)也稱為細胞組學。它是一種用于藥物發現和生物學研究以發現新候選藥物的方法。高內涵篩選系統主要基于數字顯微鏡和流式細胞術,結合用于存儲和分析生物數據的IT系統。高內涵篩選技術已被證明對制藥業臨床前藥物的表征非常有用。該技術通常與藥物開發等各種其他應用相結合。將HCS與化學遺傳學相結合
高內涵篩選的HCS的概念
HCS是指在保持細胞結構和功能完整性的前提下,同時檢測被篩樣品對細胞形態、生長、分化、遷移、凋亡、代謝途徑及信號轉導各個環節的影響, 在單一實驗中獲取大量與基因、蛋白及其他細胞成分相關的信息, 確定其生物活性和潛在毒性的過程。同時, 也是一種應用高分辨率的熒光數碼影像系統,旨在獲得被篩樣品對細胞產生
高內涵篩選的HCS的優勢
高內涵篩選的篩選結果是多樣化的,它以多指標多靶點共同作用為主要特點,涉及的靶點包括胞內成分、細胞的膜受體、細胞器等。從篩選載體上看,高內涵藥物篩選與高通量藥物篩選并沒有顯著的區別,也在微孔板上進行。其優點是它的檢測體積并未因檢測指標增加而增高,操作步驟同樣簡單可行、自動化。更重要的是, 獲取信息是以
高內涵篩選平臺
高內涵分析系統可以對大量細胞進行快速、高通量成像檢測和定量分析。CellInsight CX7 LZR高內涵分析系統的Z軸層掃、快速掃描和共聚焦功能使其成為3D細胞培養高通量成像分析的理想平臺。相比于LED系統,CX7 LZR采用激光器作為光源,可以減少光散射、滲透更深、有效改善信噪比,其配套的HC
術語解析和區別:高內涵成像、高內涵篩選和高內涵分析
本文淺析了高內涵成像(HCI)、高內涵篩選(HCS)、高內涵分析(HCA)等術語間的區別,將這些基于圖像的自動化高通量技術逐漸用于生成數據,可對臨床前研究和下游Go/No-go決策提供支持。引言顯微鏡技術在過去幾十年所取得的驚人進步,使得HCI(高內涵成像,High content imaging)
高通量研究脊椎動物多維表型的方法(二)
??3.顱面畸形三維重建與評估:每條斑馬魚幼體,記錄高達320幀的圖像,通過三維重構技術,形象化展示了斑馬魚幼體軟骨復雜表型。圖像顯示的層析效果圖充分顯示了三種不同藥物處理后的5dpf斑馬魚幼體的顱面骨骼變化。三種藥物是:retinoic acid(視黃酸)、cyclopamine(環巴胺)和flu
模式生物高通量多維表型研究方法概述(二)
3.顱面畸形三維重建與評估:每條斑馬魚幼體,記錄高達320幀的圖像,通過三維重構技術,形象化展示了斑馬魚幼體軟骨復雜表型。圖像顯示的層析效果圖充分顯示了三種不同藥物處理后的5dpf斑馬魚幼體的顱面骨骼變化。三種藥物是:retinoic acid(視黃酸)、cyclopamine(環巴胺)和flu
-Nat-Commun:斑馬魚可用于癲癇藥物篩選
化學藥物Clemizole在“Dravet綜合癥”的一個斑馬魚模型中能有效防止癲癇類發作。在Nature Communications上發表的這一發現確認了一個新方法,后者有可能被用來識別癲癇病的另類療法。 “Dravet綜合癥”是一種從嬰兒時期開始的嚴重癲癇,以嚴重的、自發的和復發的
斑馬魚
一、概述斑馬魚是生長在印度、巴基斯坦淡水河流中的一種硬骨魚(鯉魚),成年魚全身僅長4-5厘米,因全身橫向分布著一道一道褐色的斑馬線而得名。斑馬魚很容易在實驗室飼養,一般3個月就可以達到生殖成熟期,雌魚每次產卵200枚左右,一生可產卵數千枚,斑馬魚所產之卵經24小時即可胚胎發育成熟,仔魚期只有1個月。
高通量研究脊椎動物多維表型的方法(一)
Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475?Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo
全自動高內涵篩選和分析系統
高內涵細胞學篩選分析技術(High Content Screening, HCS)是Thermo Cellomics公司開創的細胞組學研究的整體解決方案(Total Solution)。此項ZL技術是在不破壞細胞整體結構的條件下,對細胞進行多通道、多靶點的熒光掃描檢測,由冷CCD成像技術捕獲圖像信息
什么是高通量篩選技術?什么是高內涵藥物篩選?
【導讀】高通量篩選是指以分子或和細胞水平的實驗方法為基礎,采用不同密度的微孔平板作為實驗載體和自動化工具操作實驗步驟,通過快速靈敏的檢測裝置在同一時間內對海量樣品進行生物活性測定、采集實驗數據和數字化分析處理,并以相應的信息管理軟件支持整個系統正常運轉的技術體系。高內涵篩選是指在保持細胞結構和功能完
國內外大型藥企追捧斑馬魚新藥篩選平臺
可別小看這幾厘米長的小不點,斑馬魚基因與人類基因同源性高達85%,信號傳導通路基本相似。這意味著在其身上做藥物實驗所得到的結果在多數情況下也適用于人體。“比如癲癇、關節炎、脂肪肝、癌癥等常見人類疾病模型,都可以通過斑馬魚進行新藥篩選。”據環特生物科技有限公司負責人介紹,目前斑馬魚可以承
高內涵篩選的基本原理和應用
高通量藥物篩選( high throughput screening,HTS)是20世紀80年代中期產生的為尋找先導物針對大量樣品進行藥理活性評價分析的一種技術手段,在創新藥物的研究和開發中發揮了重要作用。近年來在藥物發現領域又出現了一個新概念—高內涵藥物篩選( high content scree
使用人類疾病模型生物斑馬魚的高通量成像實驗
為什么使用斑馬魚進行篩選? 目前,基于斑馬魚的篩選由于花費,通量和倫理原因作為一種哺乳動物篩選的替代受到歡迎。斑馬魚由于其與人類的高度生物相似性,成為一種有用的藥物開發模型。在個體學和器官形成研究中體現了其主要器官系統與人類極其相似,且斑馬魚和人類的相似度高達 70 - 80%。斑馬魚由于其繁殖力強
模式生物高通量多維表型研究方法概述(一)
摘要:動物個體內,多數由基因突變與生物活性分子所引發的復雜生理應答機制,無法使用細胞培養模型進行預測,而動物水平研究卻進展緩慢。本研究中,我們利用微米分辨率的高通量光學投影層析成像系統,結合高效的大顆粒流式分選系統(Union Biometrica),實現了脊椎動物的整體多維度掃描。系統以前
斑馬魚出生就識數!
意大利科學家發現,斑馬魚幼魚在孵化后96小時里可以識別不同數量的黑條,研究者表示這一發現表明數字能力可能在新生斑馬魚中是與生俱來的。相關研究3月24日發表于《通訊—生物學》。 過去的研究表明,人類新生兒和新孵化的孔雀魚、小雞(孵化時腦已經高度發育的物種)具有數學能力。但在此之前,人們對新生時處
斑馬魚顯微CT實驗
斑馬魚作為傳統的脊椎動物模型已經廣泛應用于人類疾病和胚胎發育過程的研究,斑馬魚全基因已經完全清楚,與人類基因組有85%同源性,這意味著在斑馬魚身上進行的實驗,其結果很多都適用于人類。斑馬魚與其他實驗常用動物相比,具有較高的繁殖率和生長速率,并且其胚胎發育過程是在體外進行的,科研人員通過顯微鏡直接觀察
斑馬魚基礎研究
近期,我們收到了很多小伙伴提交的文獻獎勵申請,其中,有2篇成功吸引了小編的注意,這2篇文章的內容都是斑馬魚研究相關的。我們都知道,斑馬魚是一種常見的模式生物,但是市面上針對斑馬魚的抗體卻非常少,我們不僅有一百多種斑馬魚抗體,而且還可以根據客戶需求來進行定制生產。下面來看看這2篇文章吧。01標題:Sa
高內涵篩選在生命科學研究中的應用
【摘要】過去的幾十年來,成像作為一種基于細胞的檢測模式,在現有的和正在開發的生物模型中,開啟了一個測量“終點表型” 的全新世界。這些“高內涵”方法結合了多種細胞生理學的測量手段,不管它是來源于亞細胞組分、多細胞結構還是模式生物。 這樣產生的多層面的數據可以幫助人們對很多復雜現象產生新的認知,這些現象
高內涵篩選技術的原理及其在生態毒理學的應用
隨著現代工業進步,人類合成、使用和間接產生的化合物的數量和種類在不斷增長,其中包括了化工原料、阻燃劑、農藥、增塑劑、食品添加劑、藥物、天然化合物及衍生物、飲用水消毒副產物和化學合成副產物等多個類別[1-2]。然而由于在對化合物毒性作用方面認識的不足,絕大多數的化合物缺乏有效監管,部分化合物因此能夠以
斑馬魚基因編輯技術介紹
斑馬魚又叫藍條魚,因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類,同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小,成魚體長約4-6厘米,而且成魚常年產卵且產卵量大,可達300-1000粒,還是體外受精并發育,因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。斑馬魚這種原
斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
斑馬魚胚胎DNA的制備
材料和試劑1.????????蛋白酶K(羅氏03115836001)2.??????? 1M的Tris,pH值8.33.??????? 氯化鉀4.??????? 吐溫20(10%,EMD4 biosciences,655207)5.??????? NP40(10%,Merck,492018)設備1.
轉基因斑馬魚的構建
實驗概要本實驗對斑馬魚導入含 EGFP的質粒,觀察其在動物體內的表達情況,在斑馬魚體內,綠色熒光蛋白從原腸胚到出苗期均能在熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光。主要試劑EGFP、綠色熒光蛋白基因、pEGFP-N2載體、E.coli主要設備試管、試管架、可調式微量加樣器、電泳儀、電泳槽、染色缸、42℃恒溫水浴箱
高內涵細胞成像分析技術的優勢與應用
高內涵技術優勢高內涵細胞成像分析系統由三個部分組成:全自動高速顯微成像,全自動圖像分析和數據管理。全自動高速顯微成像在短時間內生成大量的圖像,全自動圖像分析從這些圖像中提取大量的數據,數據管理軟件負責建檔存儲、注釋比較、檢索分享這些圖像和數據。高內涵,意味著豐富的信息。這些信息包括:單個細胞圖像和各
新藥研發成功率降低,高內涵篩選能否力挽狂瀾?
研究人員認為,結合機器學習算法的高內涵篩選將廣泛用于藥物的研發。 上個世紀80年代,科研人員開發出了高通量篩選(high throughput screening),這是一種能對大量化合物樣品進行藥理活性評價分析的技術。在過去的幾十年里,高通量篩選曾在新藥的研發中發揮了重要的作用。 但在最近
10億美元高內涵篩選市場-繼續保持10%年增速
據Markets & Markets的報告,全球高內涵篩選(HCS,High Content Screening)市場,將從2017年的5.71億美元增長到2022年的9.99億美元,在預測期間內以10.3%的年復合成長率 (CAGR) 成長。推動高內涵篩選市場增長的主要因素包括:制藥研發的成本控制
一文讀懂|高內涵篩選緣何成為新藥研發的寵兒
眾所周知,新藥研發的成本日益增高,雖然前期篩選多已采用高通量篩選技術,但其檢測模型均建立在單個藥物作用靶分子的基礎上,在后期臨床實驗中仍面臨很高的失敗風險。顯微熒光標記、數碼影像分析以及圖像數據處理技術的快速發展,使以高通量方式對細胞的多個生理環節進行檢測成為可能,有力推動了高內涵篩選(High