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  • 數學院等調控網絡數學建模揭示干細胞分化關鍵轉錄因子

    近期,國際學術期刊《細胞-干細胞》(Cell Stem Cell)在線發表了由中國科學院數學與系統科學研究院和美國斯坦福大學科研人員合作的干細胞分化的基因調控網絡建模成果。這一成果提出了利用匹配的基因表達和染色質可及性數據刻畫轉錄因子和調控元件結合調控下游基因表達的數學模型,構建了描繪細胞狀態轉化的染色質調控網絡,通過網絡分析鑒定出TFAP2C和p63分別為表面外胚層起始和角質形成細胞成熟的關鍵因子,并揭示了譜系定型過程中TFAP2C-p63對表觀遺傳轉換的反饋調節機制。 干細胞為人類疾病治療帶來了希望,然而如美國國家衛生研究院國立普通醫學科學研究所干細胞生物學基金監管人Marion Zatz說:“干細胞研究中面臨的最大挑戰之一就是如何調控干細胞轉變為一種特異的細胞類型”。針對這一重要的科學問題,數學院研究員王勇與斯坦福大學統計系教授Wing Hung Wong、醫學院皮膚系教授Anthony Oro、Howard Cha......閱讀全文

    胚胎干細胞轉錄因子NANOG的新發現

      在胚胎干細胞的自我更新中,轉錄因子Nanog 具有關鍵性的作用,這一因子也一直是近年來研究的熱點。最近,西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)的科學家們發現,NANOG也調控成體生物分層上皮細胞的細胞分裂,分層上皮細胞是皮膚表皮的組成部分,或者覆蓋在食管和陰道表面。相關研究結果發表在最近的《自然通訊

    輔助轉錄因子

    中文名稱輔助轉錄因子英文名稱ancillary transcription factor定  義協助RNA聚合酶同啟動子結合,并促進已結合的RNA聚合酶啟動轉錄速率的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)

    CCAAT轉錄因子

    中文名稱CCAAT轉錄因子英文名稱CCAAT transcription factor定  義可與啟動子中的CCAAT元件發生特異性相互作用的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)

    轉錄因子組成

    真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分:亞基RNA聚合酶的亞基,它們是轉錄必須的,但并不對某一啟動子有特異性。復合物某些轉錄因子能與RNA聚合酶結合形成起始復

    轉錄因子活性ELISA

    轉錄因子活性ELISA是建立在ELISA基礎上的高靈敏度的檢測方法,比EMSA的靈敏度高l0倍,在5h內就能完成。不涉及放射性和凝膠電泳,安全簡便,而且這種微孔板的形式能同時檢測1—96個樣品。ArrayStarTM轉錄因子活性ELISA試劑盒可以快速、靈敏地檢測細胞核提取物中轉錄因子的DNA結合活

    轉錄因子和轉錄因子之間可以有相互作用嗎

    可以轉錄因子真核生物轉錄起始十分復雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與RNA聚合酶Ⅱ形成轉錄起始復合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與RNA聚合酶Ⅱ共同組成轉錄起始復合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除TFⅡD以外,還發現TFⅡA,TFⅡ

    轉錄因子的轉錄調控區的介紹

      同一家族的轉錄因子之間的區別主要在轉錄調控區。  轉錄調控區包括轉錄激活區(transcription activation domain)和轉錄抑制區(transcription repression domain)二種。近年來,轉錄的激活區被深入研究。它們一般包含DNA結合區之外的30-10

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    轉錄因子KLF5參與小鼠乳腺干細胞維持及乳腺發育

      乳腺癌是女性中發病率最高的癌癥。近年來的研究表明,轉錄因子KLF5在乳腺癌的發生發展過程中發揮重要作用;前期的研究表明,KLF5在乳腺癌干細胞的自我更新和維持過程中發揮關鍵的促進作用(Theranostics, 2016; 6(4): 533-544);另外也有研究顯示KLF5在胚胎干細胞的維持

    關于轉錄因子的轉錄抑制區的介紹

      也是轉錄因子調控表達的重要位點,但是對其作用機理研究尚不深入。可能的作用方式有三種:1)與啟動子的調控位點結合,阻止其它轉錄因子的結合;2)作用于其它轉錄因子,抑制其它因子的作用;3)通過改變DNA的高級結構阻止轉錄的發生。  轉錄因子必須在核內作用,才能起到調控表達的目的。因此,轉錄因子上的核

    通用轉錄因子的定義

    通用轉錄因子(general transcription factors, GTFs)?? 。真核生物中有效的和啟動子特異性的起始過程中需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子。

    概述轉錄因子的組成

      真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分:  1、亞基  RNA聚合酶的亞基,它們是轉錄必須的,但并不對某一啟動子有特異性。  2、復合物  某些轉錄因子能

    轉錄終止因子的定義

    中文名稱轉錄終止因子英文名稱transcription termination factor定  義輔助具有RNA聚合酶活性的轉錄復合體特異性地識別轉錄終止信號的蛋白質因子(如ρ因子等),其作用導致轉錄終止。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    依賴ρ因子的轉錄終止

    ρ因子是一種分子量為46kDa的蛋白質,以六聚體為活性形式。

    簡述轉錄因子的作用

      是通過和順式因子的互作來實現的。這段序列可以和轉錄因子的DNA結合域實現共價結合,從而對基因的表達起抑制或增強的作用。  目前,人工轉錄因子(Artificial Transcription Factor,ATF)的構建已用于轉錄因子的生物學功能研究中起到重要作用。ATF是指將不同的DNA結合結

    通用轉錄因子的定義

    通用轉錄因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和啟動子特異性的起始過程中需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子

    研究人員發現促進間充質干細胞骨形成的新型轉錄因子

      成骨分化是由細胞內信號和外部微環境信號共同調控的復雜生物學過程。在適當的刺激下,間充質干細胞(mesenchymal stem cells,MSCs)通過多個轉錄因子驅動的多步調控過程向成骨細胞分化,其特征是大量骨特征蛋白的表達。近日,來自意大利和西班牙的研究人員共同發現了小鼠體內一種新的轉錄因

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    人類干細胞模型中發現LINE1轉錄因子新功能1

    干細胞是人體內一種尚未分化的細胞,具有極強的分化和再生能力。通過研究人類干細胞模型,可幫助研究疾病的治療。Aicardi-Goutieres綜合征(AGS)是一種罕見但致命的遺傳性自身免疫性疾病,其臨床特征包括炎癥標志物和其他炎癥反應增加,類似于嬰兒在子宮內獲得的出生前病毒感染。早期研究表明,

    人類干細胞模型中發現LINE1轉錄因子新功能2

    ?研究人員發現,TREX1功能不正常后所有細胞模型都出現了多余的染色體外DNA,它們主要來自LINE1 (L1)逆轉錄因子。L1是一類重復DNA序列,可在人類基因組中自發地“復制-粘貼”自己,在過去它們被稱為“垃圾基因”,它們在細胞內的功能很大程度上仍然未知。在Muotri實驗室創造的一些A

    轉錄激活因子的定義

    定義1:一個轉錄因子家族,通過識別和結合環腺苷酸應答元件而激活基因表達。環腺苷酸應答元件存在于很多病毒和細胞的基因啟動子中。 所屬學科:生物化學與分子生物學(一級學科);基因表達與調控(二級學科)定義2:與特定DNA序列結合以促進基因轉錄的因子。 所屬學科:遺傳學(一級學科);分子遺傳學(二級學科)

    PNAS:“打了就跑”的轉錄因子

      細胞核中的調控蛋白,在活化基因時采取了一種“打了就跑”(hit-and-run)的策略。美國國家科學院院刊PNAS雜志上發表的一項最新研究,深入解析了這種高效的轉錄模式。  “就像馬克吐溫筆下闖了禍就跑的湯姆·索亞一樣,轉錄因子結合啟動子并激活轉錄之后就會立即離開,讓小伙伴們去繼續自己未完成的工

    通用轉錄因子的相關介紹

      在真核生物中有效的和啟動子特異性的起始需要幾個起始因子,這些起始因子稱為通用轉錄因子。通用轉錄因子共同執行

    基因轉錄因子的相關介紹

      轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態,RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄,只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后,基因才開始表達。轉錄因子的結合位點

    轉錄起始因子的定義

    中文名稱轉錄起始因子英文名稱transcription initiation factor定 ?義參與轉錄起始作用的因子。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

    轉錄終止因子的概念介紹

    中文名稱轉錄終止因子英文名稱transcription termination factor定  義輔助具有RNA聚合酶活性的轉錄復合體特異性地識別轉錄終止信號的蛋白質因子(如ρ因子等),其作用導致轉錄終止。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    轉錄激活因子的定義

    定義1:一個轉錄因子家族,通過識別和結合環腺苷酸應答元件而激活基因表達。環腺苷酸應答元件存在于很多病毒和細胞的基因啟動子中。 所屬學科:生物化學與分子生物學(一級學科);基因表達與調控(二級學科)定義2:與特定DNA序列結合以促進基因轉錄的因子。 所屬學科:遺傳學(一級學科);分子遺傳學(二級學科)

    動物所發現轉錄因子Fev在造血干細胞發育中起到重要作用

      中科院動物研究所劉峰研究員領導的血液與心血管發育研究組以斑馬魚和人臍帶血為研究模型,應用遺傳學、細胞生物學和分子生物學等多種研究手段,發現 ETS家族轉錄因子Fev在造血干細胞發育中起到重要作用。在斑馬魚中敲低Fev導致造血干細胞及T細胞數量明顯減少。應用TALEN技術得到的該基因遺傳突變體

    玉米轉錄因子ZmMADS47和籽粒轉錄因子Opaque2-調控醇溶蛋白

      玉米(Zea mays)原產于墨西哥和中美洲地區,是一種由古印第安人(Indians)在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍(Euchlaenamexicana)(現存在于墨西哥和尼加拉瓜)雜交而來的品種。但是,作為一類重要的糧食作物,天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有

    玉米轉錄因子和籽粒重要轉錄因子互作協同調控醇溶蛋白

    玉米(Zea mays)原產于墨西哥和中美洲地區,是一種由古印第安人(Indians)在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍(Euchlaenamexicana)(現存在于墨西哥和尼加拉瓜)雜交而來的品種。但是,作為一類重要的糧食作物,天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有的文獻報道,玉米籽粒

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