概述RNA剪接的類型
RNA剪接及其機制的研究,不僅解決了不連續基因“連續”轉錄產物的問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至整個生命起源與進化等問題,均產生極大的推動作用,另外,由此發現了核酸分子的催化功能,進一步拓寬了對于酶的認識。不連續基因中的介入序列稱為內含子；被內含子隔開的基因序列稱為外顯子(exon)。一個基因的外顯子和內含子都轉錄在一條原初轉錄物RNA分子中,然后把內含子切除而把外顯子連接起來,才能產生成熟的RNA分子,這個過程叫做RNA剪接(RNA splicing)。內含子上游方向的一個剪接點稱為5’剪接點或左剪接點,內含子下游方向的一個剪接稱為3’剪接點或右剪接點。Davies等人于1982年設定了“中部核心結構”(central structure)在內含子剪接中的作用,組成這種中部核心結構的是4個10~12堿基的保守序列,并構成相應的二級結構。但并非所有的內含子都含有這樣的二級結構和保守序列。......閱讀全文
概述RNA剪接的類型
RNA剪接及其機制的研究,不僅解決了不連續基因“連續”轉錄產物的問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至整個生命起源與進化等問題,均產生極大的推動作用,另外,由此發現了核酸分子的催化功能,進一步拓寬了對于酶的認識。不連續基因中的介入序列稱為內含子；被內含子隔開的基因序列稱為外顯子(exon)。一個
RNA－剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子，連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
關于RNA剪接的簡介
大多數脊椎動物基因的編碼序列,無論是編碼多肽的基因還是編碼除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非編碼的間隔序列(內含子)分隔為各個外顯子部分。這些基因的外顯子和內含子都轉錄在一條初級RNA轉錄分子中,接下來,此初級RNA轉錄分子要經過RNA剪接,此過程包括一系列的加工反應：RNA的內含子部分
關于RNA剪接的基本介紹
RNA剪接 （RNA splicing）是指從DNA模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子,并將外顯子連接起來形成一個連續的RNA分子的過程。RNA剪接機制的研究,是80年代生物化學和分子生物學領域中最有生機的研究課題之一,它不僅解決不連續基因轉錄產物的剪接問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至
關于RNA剪接的定義介紹
RNA剪接是真核細胞基因表達中非常重要的一個生物過程,通過RNA剪接,可以產生許多具有功能的,帶有編碼信息的mRNA,它對生物的發育及進化至關重要。所以RNA剪接識別是正確理解基因表達過程的重要一步,而剪接的識別的關鍵是依賴于剪接位點的判定。真核細胞pre-mRNA的剪接位點處存在一定的序列保守
關于RNA剪接第Ⅱ類內含子的自我剪接介紹
第Ⅱ類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列多為…外顯子…↓GUGCG…內含子…嘧啶堿AU↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,在離3’剪接點上游6-12bp有一段比較保守的序列,一致序列為CUCAC,在這一保守序列A的兩側各有一段3~5核苷酸的短序列能與上游方向的核苷酸互補,而A總是不包含在這
RNA剪接為什么會出錯
“這項研究不僅提出了用小分子藥物治療維斯科特-奧爾德里奇綜合征的新目標，而且為RNA剪切的基礎生物學提供了新的線索，這是一個重要的但尚未完全被理解的過程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte說，他是Salk基因表達實驗室的教授和Roger Guillemin主席。患
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析,所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析,來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
PNAS：RNA剪接調控研究方面新的進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪
Nature：針對RNA轉錄和剪接的新觀點！
細胞通常產生區室來控制重要的生物功能。細胞核就是一個很好的例子；它被核膜包圍著，容納著基因組。然而，細胞還含有未被膜包圍的較為短暫存在的封閉室，就像水中的油滴。在過去兩年中，這些稱為液滴狀“凝聚物（condensates）”的封閉室已越來越多地被認為是控制基因的主要參與者。如今，在一項新的研究中
簡述RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必
環形RNA可變反向剪接和可變剪接表達圖譜被系統繪制
6月30日，國際學術期刊Genome Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于環形RNA研究的最新進展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
RNA病毒類型介紹
病毒的核酸包括雙鏈DNA（dsDNA）、單鏈DNA（ssDNA）、雙鏈RNA（dsRNA）、正單鏈RNA（+ssRNA）、負單鏈RNA（-ssRNA）五種不同類型。病毒顆粒中的組成成分有簡有繁，有的用顆粒自帶專門用于病毒復制的核酸酶，有的則無。有些RNA病毒的RNA并不僅有一個分子，如流感病毒有8條
RNA編輯主要類型
①簡單編輯，單堿基轉變的轉錄后調節；②插入編輯，插入單個核苷酸或少量核苷酸的丟失，其機制是轉錄鏈的跳格；③泛編輯，插入或缺失多個尿嘧啶核苷酸或轉錄后插入多個胞嘧啶，其機制是編輯序列由外源反義引導RNA（ gRNA）提供，gRNA在編輯體（editosome）核蛋白顆粒中與前編輯mRNA配對，鑒別作為
上海生科院揭示反向剪接RNA成環與RNA轉錄的偶聯機制
4月19日，國際學術期刊Cell Reports 發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組與計算生物學研究所楊力研究組最新合作研究論文。此工作深入研究了環形RNA生成與RNA轉錄的偶聯機制，揭示了環形RNA在神經分化過程中表達上調原理。 環形RNA是一類通過反向
METTL16介導通過阻礙對剪接位點的識別從而抑制RNA剪接
RNA m6A修飾是目前RNA表觀遺傳領域研究的熱點，對于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能詳。事實上，大名鼎鼎的METTL3僅能結合約22%的m6A位點，這提示還有其他m6A甲基化酶。確實，在METTL3之后，METTL16也被鑒定為m6A甲基化酶，但是它的底物遠不如METTL3
Cell－Systems：構建RNA結合蛋白的剪接調控作用預測模型
基因組研究結果顯示，人體內超過90%的基因存在選擇性剪接(alternative splicing)。該過程在不同組織以及不同生理階段受到嚴格的調控，其失調會導致多種疾病的發生。選擇性剪接的體內調控主要由前體mRNA中的順式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
RNA病毒類型提取方法
試劑準備1、 TROzlo試劑、氯仿、75%乙醇（0.1% DEPC配制）。2、 塑料器皿需用0.1% DEPC水浸泡。3、 0.1%DEPC水：100ml dd水中加入DEPC0.1ml，充分振蕩，37℃孵育12h以上，121℃高壓滅菌20min，于4℃保存。操作步驟1、 樣品處理（1） 組織：5
營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
GUT揭示癌癥治療靶點調控RNA可變剪接的分子機制
來自浙江大學基礎醫學院，中國藥科大學等處的研究人員發表了題為“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
常興研究組發現RNA剪接基因編輯的新方法
2018年10月5日，國際知名學術期刊《分子細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院（營養與健康研究院）常興研究組題為“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。證明可
概述微RNA的作用
人類基因組計劃結束后，人們發現編碼蛋白質的基因只占總基因組的約2%。而占人類基因組95%的非編碼序列竟是產生大量非編碼RNA的源泉，這些非編碼RNA主要充當調控者的角色，在細胞分化凋亡、生物發育、疾病發生等方面均起重要作用。 其實，RNA比DNA更為古老，它組成了地球上最早的生命。生命起源初期
概述RNA干擾的特點
1.高效性：Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的，只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大，只有當濃度降低到0.05 nmol/L時，沉默的效果才消失。Holen等也
概述轉運RNA的結構
轉運RNA分子由一條長70~90個核苷酸并折疊成三葉草形的短鏈組成的。上圖中有兩種不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA鏈的兩個末端在圖上方指出的L形結構的末端互相接近。氨基酸在箭頭示意的位置被連接。在這條鏈的中央形成了L形臂，如圖《tRNA的三葉草結構
概述RNA編輯的現象
RNA編輯（RNA editing）是新發現的在mRNA水平上遺傳信息改變的過程。由于RNA編輯使mRNA中的編碼序列與它的基因中的編碼序列不一致。研究證明，mRNA中個別堿基的取代和加減，造成mRNA的堿基序列與它的基因的堿基序列不一致，使其仍能參與翻譯，所有這一系列的改變不是發生在基因水平上
概述引物RNA的作用
復制的引發(Priming)階段包括DNA復制起點雙鏈解開，通過轉錄激活步驟合成RNA分子，RNA引物的合成，DNA聚合酶將第一個脫氧核苷酸加到引物RNA的3'-OH末端復制引發的關鍵步驟就是前導鏈DNA的合成，一旦前導鏈DNA的聚合作用開始，滯后鏈上的DNA合成也隨著開始，在所有前導鏈
Nature：首次發現RNA剪接與衰老之間存在因果關系
生物通報道：衰老是各種破壞性慢性疾病的一個重要危險因素，但是，隨著時間推移生物學因素如何影響“細胞何時以及多快的衰老”，在很大程度上仍然是未知的。現在，由哈佛大學T.H. Chan公共衛生學院帶領的一個研究小組，將細胞機器——其在一個稱為“RNA剪接”的過程中切割和重新連接RNA分子——的一個核
研究揭示甘蔗花葉病毒干擾RNA剪接促進侵染
近日，中國農業大學植物保護學院教授周濤課題組在甘蔗花葉病毒（SCMV）相關研究上獲得了新進展。研究發現，SCMV侵染改變了玉米八氫番茄紅素合成酶基因（ZmPSY1）的轉錄本可變剪接模式，因此促進病毒侵染。相關成果發表于《植物生理學報》。 SCMV是我國和非洲玉米生產上的一種主要病原，廣泛分布于世