新研究在番茄基因組庫中添加近5000個基因
現在，來自農業研究局（ARS）和Boyce Thompson研究所（BTI）的科學家們在剛剛發表的《Nature Genetics》一文中，重點討論了這個問題。 位于紐約伊薩卡的ARS植物、土壤和營養研究實驗室的分子生物學家James Giovannoni和BTI生物信息學科學家Zhangjun Fei完成了栽培番茄及其野生親緣植物的泛基因組（pan-genome）構建，繪制了近5000個以前未記錄的基因。 基因組是生物體基因及其功能的生物學圖譜。但是一個基因組通常代表一個單一的品種，然后作為其他物種的參考基因組。這個泛基因組包含了725個不同栽培和近緣野生番茄的所有基因，并提示有4873個基因在原始參考基因組中缺失。 雖然栽培番茄有廣泛的物理和代謝變異，但在其馴化和育種過程中存在著幾個嚴重的瓶頸。這意味著今天的番茄遺傳基礎很窄。泛基因組有助于確定哪些超出參考范圍的附加基因可用于作物育種和改良。 在現代，育種家主要關......閱讀全文
我國構建世界首個番茄超泛基因組，或大幅提升番茄產量
近日，由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭，聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位，成功構建了國際首個番茄超泛基因組。相關科研成果已于4月6日以《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》為題在線發表于國際學術期刊《自然·遺傳》。超泛基因組是指在一個基因組序列內涵
我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日，由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭，聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位，在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
番茄基因組作圖與分子育種
摘要：? ?? ? The cultivated tomato, Lycopersicon esculentum, is the second most consumed vegetable worldwide and a well-studied crop speciesin terms of g
人類泛基因組首個草圖發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日，《自然》發表了人類泛基因組參考的初稿，這一集合旨在最終代表整個人類物種中盡可能多的DNA序列。該項研究組合的人群遺傳物質來自47個遺傳多樣化個體，為人類基因組提供了更完整的
基因組學出手－尋找番茄舊時味
近日，《科學》雜志以封面報道形式介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 小小番茄之所以獲得如此高的關注度，源于這種果實既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，又是植物生物學家的最愛之一，堪稱植物遺
基因組學出手助番茄復“味”
以《更好吃的番茄》為題，1月27日的《科學》雜志用封面報道介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 《科學》和《自然》雜志如此重視這小小番茄的原因在于，番茄既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，根
泛基因組：賦能未來作物育種的基石
?繪圖：黃怡可 泛基因組（Pan-genome）是一個物種內所有基因組信息的總和，它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來，科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
我國率先構建野生大豆泛基因組
中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作，在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組，為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。 項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹，大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。
全球首個牧草圖形泛基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495404.shtm?3月3日，四川農業大學（以下簡稱四川農大）草業科技學院教授黃琳凱團隊在國際權威學術期刊《自然—遺傳學》（Nature Genetics）在線發表了題為《美洲狼尾草泛基因組構建、結構變
《自然》發表首個人類泛基因組草圖
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500364.shtm 該研究為當前的人類參考基因組（GRCh38）增加了1.19億個堿基對（指在DNA雙螺旋結構中的兩個互補配對的堿基）和1115個基因重復，并由此得到了兩個新發現。未來，該計劃旨在觀
《自然》發表首個人類泛基因組草圖
當地時間5月10日，人類泛基因組參考聯盟（Human Pangenome Reference Consortium）發表了首個人類泛基因組草圖。相關的四篇論文均已發布，其中三篇發布在《自然》（Nature）雜志，一篇發布在《自然-生物技術》（Nature Biotechnology）雜志。
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日，華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文，公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
新研究在番茄基因組庫中添加近5000個基因
現在，來自農業研究局（ARS）和Boyce Thompson研究所（BTI）的科學家們在剛剛發表的《Nature Genetics》一文中，重點討論了這個問題。 位于紐約伊薩卡的ARS植物、土壤和營養研究實驗室的分子生物學家James Giovannoni和BTI生物信息學科學家Zhangju
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
我國科學家首提“人類泛基因組”
人類基因組存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因 經過不懈研究和攻關，我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進展――發現人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因。科研人員還首次提出了“人類泛基因組”的概念。 由深圳華大基因研究院領銜，華南理工大學參與的研
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
水稻泛基因組研究方面取得突破性進展
近日，廣東省農業科學院水稻研究所分子育種團隊在水稻泛基因組研究方面取得突破性進展。相關研究發表于基因組學研究知名雜志Genome Biology。該論文第一單位為廣東省農業科學院水稻研究所，王健博士為第一作者，楊武副研究員為共同第一作者，胡海飛博士和趙均良副研究員為通訊作者，澳大利亞莫道克大學教
首個玉蜀黍屬超級泛基因組助力玉米遺傳改良
?玉蜀黍屬超級泛基因組特征 ? ?受訪者供圖8月24日，《基因組生物學》（Genome Biology）在線發表華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室和洪山實驗室玉米團隊最新研究成果。該團隊利用721份玉蜀黍屬材料的基因組數據，構建了首個玉蜀黍屬“超級泛基因組（super pan-genome）”圖
“人類泛基因組項目”將極大促進疾病防治
科技日報北京4月21日電 （記者劉霞）一個國際科學家聯盟在20日出版的《自然》雜志上發表論文稱，十多家研究機構正在合作開展“人類泛基因組項目”，該項目旨在創建一個囊括全球各人種遺傳多樣性的參考基因組。研究人員表示，“這是人類遺傳學的未來”，有望應用于疾病預防與治療等多領域。這項工作由美國國家人類基因
遺傳發育所參與的番茄基因組成果2012年最受關注
由“番茄基因組研究國際協作組”(中科院遺傳與發育生物學研究所研究員李傳友、薛勇彪、程祝寬、左建儒、凌宏清組成的團隊負責第3號染色體測序工作)完成的番茄基因組研究成果被美國《科學家》雜志評為2012年最受科學家關注的基因組。 《科學家》雜志對該成果評述如下：“經過14個國家的科學家們9年的不
中國科研人員揭秘全球首個牧草領域圖形泛基因組
記者3日從四川農業大學獲悉，該校草業科技學院黃琳凱教授團隊構建了全球首個牧草領域圖形泛基因組——美洲狼尾草圖形泛基因組，并揭示了狼尾草耐熱的分子機制。 這一研究成果于北京時間3日以《Pangenomics identifies structural variation associated w
我國科研人員揭秘全球首個牧草領域圖形泛基因組
記者3日從四川農業大學獲悉，該校草業科技學院黃琳凱教授團隊構建了全球首個牧草領域圖形泛基因組——美洲狼尾草圖形泛基因組，并揭示了狼尾草耐熱的分子機制。 這一研究成果于北京時間3日以《Pangenomics identifies structural variation associated wi
我國科學家參與番茄全基因組研究獲重大進展
由來自中國、美國、荷蘭、以色列等14個國家的300多位科學家組成的“番茄基因組研究國際協作組”，歷時8年多的艱苦努力，于近日完成了對栽培番茄全基因組的精細序列分析。今天，國際權威學術期刊《自然》以封面文章發表了這項重大科學成果。 番茄是研究果實發育的經典模式植物，我國科學家在這項國際番茄基
番茄的概述
番茄（拉丁學名：Lycopersicon esculentumMill.），早期稱做狼桃，別稱為番柿、西紅柿，是茄科茄屬植物。[1] 番茄體高0.6-2米，全體生粘質腺毛，有強烈氣味，莖易倒伏，葉羽狀復葉或羽狀深裂，肉質而多汁液，種子黃色，花果期夏秋季。原產南美洲，[1]全世界廣泛栽培。番茄含
番茄的簡介
番茄（拉丁學名：Lycopersicon esculentumMill.），早期稱做狼桃，別稱為番柿、西紅柿，是茄科茄屬植物。[1] 番茄體高0.6-2米，全體生粘質腺毛，有強烈氣味，莖易倒伏，葉羽狀復葉或羽狀深裂，肉質而多汁液，種子黃色，花果期夏秋季。原產南美洲，[1]全世界廣泛栽培。番茄含
番茄的介紹
番茄（拉丁學名：Lycopersicon esculentumMill.），早期稱做狼桃，別稱為番柿、西紅柿，是茄科茄屬植物。[1] 番茄體高0.6-2米，全體生粘質腺毛，有強烈氣味，莖易倒伏，葉羽狀復葉或羽狀深裂，肉質而多汁液，種子黃色，花果期夏秋季。原產南美洲，[1]全世界廣泛栽培。番茄含
透過大規模基因組分析推出－泛癌癥圖譜－開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院（NIH）資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析，這個被稱為泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結果收錄了 27 篇論文，并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組
科學家繪就全球首張家蠶超級泛基因組圖譜
家蠶是重要的經濟昆蟲和新興模式生物，10月9日，西南大學發布最新科研成果：家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊完成家蠶大規模種質資源基因組解析，在全球首次繪就家蠶超級泛基因組圖譜，并率先創建“數字家蠶”基因庫，將我國家蠶基因研究推向設計育種階段。對于家蠶基因的研究，之前僅有單一參考基因組及部分重測序數
超級泛基因組助水稻種質資源遺傳變異挖掘利用
?水稻泛NLRs家族基因的共線性位點（左）；基于全基因組SNPs的水稻系統發生樹（右）。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所與國內多家高校、科研單位合作，組裝了251份高質量的水稻基因組，構建了目前植物中群體規模最大、基因組充分注釋、稻屬中最為系統的超級泛基因組。該圖譜