RNA提取與RTPCR(2)
融解RNA一般使用TE。 保存RNA應該盡量低溫。為了防止痕量RNase的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的 RNA需要貯存在甲醛中以保存高質量的RNA,對于長期貯存更是如此。從大鼠肝臟中提取的RNA,在水中貯存一個星期就基本降解了,而從大鼠脾臟中提取的 RNA,在水中保存3年仍保持穩定。另外,長度大于4kb的轉錄本對于痕量RNase的降解比小轉錄本更敏感。為了增加貯存RNA樣品的穩定性,可以將 RNA溶解在去離子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存RNA的甲酰胺一定不能含有降解RNA的雜物。來源于胰臟的RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。當準備使用RNA時,可以使用下列方法沉淀RNA:加入NaAc至0.3M,12,000×g離心5分鐘。 1.6RNA抽提新方法 -TRIZOL法 TRIZOL試劑是直接從細胞或組織中提取總RNA的試劑。它在破碎和溶解細胞時能保持RNA的完整性。加入氯仿......閱讀全文
RNA提取和RTPCR
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是
RNA提取和RTPCR
真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA?PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟的mRNA
RNA提取與RTPCR
1.RNA的提取 RNA的提取其實原理很簡單:通過變性劑破碎細胞或者組織,然后經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉淀,洗滌,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。 1.1分離高質量RNA 成功的cDNA合成來
RNA提取與RTPCR(1)
在做Northern等雜交實驗、構建cDNA文庫、獲取能夠編碼真核生物蛋白的基因、獲得RNA病毒基因時,會用到RNA提取和RT-PCR技術。 真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋
RNA提取與RTPCR(2)
融解RNA一般使用TE。 保存RNA應該盡量低溫。為了防止痕量RNase的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的 RNA需要貯存在甲醛中以保存高質量的RNA,對于長期貯存更是如此。從大鼠肝臟中提取的RNA,在水中貯存一個星期就基本降解了,而從大鼠脾臟中提取的 RNA,在水
RNA提取與RTPCR(4)
2.8 小量RNA檢測方法的提高 當僅有小量RNA時,RT-PCR尤其具有挑戰性。在RNA分離過程中加入的作為載體的糖元有助于增加小量樣品的產量。可以在加入Trizol的同時加入無RNase的糖元。糖元是水溶性的,可以同RNA保持在水相中以輔助隨后的沉淀。對于小于50mg的組織或106個培養細胞
RNA提取與RTPCR(3)
2.3 RT-PCR的引物設計 RT-PCR引物設計和一般PCR引物設計可以遵循同樣的原則。細心地進行引物設計是PCR中最重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。設計理想的引物都有以下共同的特點,而設計失敗的引物則各有各的缺
RNA-提取策略及RT-PCR技術
第一部分RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常見
細胞RTPCR的經驗(偏向RNA提取)
做RT也做了幾次,有成功也有失敗,在園子中受益良多,把我自已的一個流程放上來,供大家參考.細胞RT-PCR操作流程實驗流程一 、取RNA:1、 處理細胞:(1) 貼壁細胞:先用無菌DEPC水配制的PBS洗細胞兩次,棄盡PBS后,直接向培養瓶中加入1ml Trizol,通過溶解細胞,通過移液管分次移出
RT-PCR技術及RNA提取策略3
成功的RT PCR的要素1、高質量RNA 成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)選擇性分離poly(A)+RNA。不管起始模
RT-PCR技術及RNA提取策略2
一般的瓊脂糖凝膠電泳,注意不要用甲醛變性電泳(又不是做northern,實在沒有必要)。電泳槽注意一定不要用DEPC處理,一定要保證電泳體系中有少量的RNAase存在。分別在加樣孔中加入1,2,3μlRNA抽提溶液。在旁邊加入DNA marker。1%瓊脂糖凝膠,10V/cm的電壓,電泳10
RT-PCR技術及RNA提取策略1
第一部分 RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常
線蟲總RNA提取及RTPCR實驗方法
C. elegans RNA Isolation and RT-PCRReagents Needed:M9 (common stock)Trizol (stored at 4oC)chloroform2-propanol70% EtOHRNase-free H2OiScript cDNA Synth
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
總RNA提取(Trizol提取)
在收集到生物材料之后,最好能即刻進行RNA 制備工作。若需暫時儲存,則應以液氮將生物材料急速冷凍后,儲存于-80℃冷凍柜。在制備RNA 時,將儲存于冷凍柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破細胞,不可以先行解凍,以避免RNase 的作用。1. 提取組織RNA 時,每50~100mg 組織用1ml
RNA提取原理
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一種總RNA抽提試劑,內含異硫氰酸胍等物質,能迅速裂解細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進行提取組織或細胞中的RNA。Trizol作用原理:在勻質化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細胞及溶解細胞成
RNA提取原理
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一種總RNA抽提試劑,內含異硫氰酸胍等物質,能迅速裂解細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進行提取組織或細胞中的RNA。Trizol作用原理:在勻質化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細胞及溶解細胞成
RNA的提取
【實驗原理】Trizol 試劑是直接從細胞或組織中提取總RNA 的試劑。它在破碎和溶解細胞時能保持RNA 的完整性。加入氯仿后離心,樣品分成水樣層和有機層。RNA存在于水樣層中。收集上面的的水樣層后,RNA 可以通過異丙醇沉淀獲得。【實驗儀器】1. 勻漿機2. 低溫離心機3. 渦旋器【試劑及配制】1
RNA的提取
一、準備試劑:氯仿,異丙醇,75℅乙醇,無RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC處理過的水配制)。二、操作步驟:1. 勻漿處理:a. 組織 將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol,用勻漿儀進行勻漿處理。樣品體積不應超過TRIzol體積10℅。b. 單層培養細胞
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
核酸提取——RNA提取與DNA的提取
核酸分為兩大類:一類為核糖核酸(RNA),另一類為脫氧核糖核酸(DNA)。核酸的分子量極大,從數萬到億萬。核酸是兩性化合物,在一定的等電點溶于水,其水溶液呈酸性,不溶于乙醇等有機溶劑。細胞內的核酸常和蛋白質結合成核蛋白。核糖核蛋白和脫氧核糖核蛋白在不同濃度的電解質溶液中 的溶解度有顯著區別,在一定濃
核酸提取——RNA提取與DNA的提取
核酸分為兩大類:一類為核糖核酸(RNA),另一類為脫氧核糖核酸(DNA)。核酸的分子量極大,從數萬到億萬。核酸是兩性化合物,在一定的等電點溶于水,其水溶液呈酸性,不溶于乙醇等有機溶劑。細胞內的核酸常和蛋白質結合成核蛋白。核糖核蛋白和脫氧核糖核蛋白在不同濃度的電解質溶液中 的溶解度有顯著區別,在一定濃
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA為單鏈RNA,并且其極性與mRNA極性相同,植物病毒RNA提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。? 一、材料? 提純TMV病毒液(10mg/ml)。? 二、設備? 冷凍臺式離心機,低溫真空干燥儀,電泳儀,電泳槽。? 三、試劑? TE-飽和酚:氯仿(1:1),氯仿
病毒RNA提取實驗
病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯
病毒RNA提取實驗
TE-飽和酚/氯仿提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲
總RNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一些公司推出的總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統采用兩種著名的RNA 酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的
TRIzol-RNA提取方法
(一)試劑準備1.TRIzol試劑。2.氯仿3.異丙醇4.75%乙醇(DEPC H2O配制)5.DEPC H2O(二)操作步驟1. 樣品處理:(1)培養細胞:收獲細胞1-5×107,移入1.5ml離心管中,加入1ml Trizol,混勻,室溫靜置5min。(2)組織:取50-100mg組織(新鮮或-
真菌RNA提取實驗
液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
TRIzol-RNA提取方法
研究基因的表達和調控時常常要從組織和細胞中分離和純化RNA。TRIzol RNA提取方法:(1)操作簡單的,提取方便,回收率高; (2)提取的RNA的質量高,對cDNA庫,RT-PCR和Northern?Blot等分子生物學實驗起著很重要的影響。實驗方法原理Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,采