預測小分子抗癌活性有了新算法
記者從中科院昆明動物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導下，開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，并成功應用于預測小分子的抗癌活性。近日，該研究發表在頂級計算生物學雜志《生物信息學》上。 據李功華介紹，開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例，現在已知的小分子化合物超過了1000萬個，因此，直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此，建立一個高效、可靠、準確的抗癌藥物的計算生物學篩選系統對發掘新的抗癌藥物具有重要意義。 為建立抗癌藥物活性的計算生物學預測系統，李功華開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，通過交叉驗證發現其預測的線下面積達到了0.878，顯示該算法能很好地預測藥物小分子的抗癌活性。 同時，李功華還開發了一個簡便易用的預測抗癌藥物活性的網頁服務器，使該算法能被不同......閱讀全文
預測小分子抗癌活性有了新算法
記者從中科院昆明動物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導下，開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，并成功應用于預測小分子的抗癌活性。近日，該研究發表在頂級計算生物學雜志《生物信息學》上。 據李功華介紹，開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗
Cancer－Cell:科學家發現新型抗癌小分子
約翰霍普金斯大學科學家在培養細胞體系中發現一種小分子具有破壞癌細胞分裂，防止癌細胞生長的功能。相關報道發表在近期的Cancer Cell雜志上。 該研究是由Marikki Laiho博士領導的研究團隊完成的。科學家發現小分子BMH-21能夠破壞RNA聚合酶POL I轉錄通路，阻斷癌
分子生物學實驗小技術
當找到可能的重組質粒且條帶清晰時可直接切下含DNA 的凝膠條帶，用膠回收DNA 的方法回收質粒并進行酶切鑒定，如果DNA 量太少則需重提質粒。 用QIAprep Miniprep Spin 小量提質粒注意以下事項可提高得率A．用含抗生素的培養基培養細菌會有較高的得率。B．收菌時用tips吸干凈殘余的
計算小RNA分子的單細胞測序新法
最近，卡羅林斯卡學院的研究人員開發出了一種單細胞程序，測量了單個胚胎干細胞中短的非編碼RNA序列的絕對數量。這種新方法可以加深我們對于“基因是如何被調節、不同的細胞類型如何發展”的理解。相關研究結果發表在10月31日的《Nature Biotechnology》。當我們基因中的信息被使用時――例如構
分子生物學實驗小技術（二）
1 、 各供應商送貨時往往會提供冰袋，在室溫下將化凍的大冰袋平整的一面整齊地插入1.5ml 或0.5ml 、0.2ml 的廢棄離心管；或將幾個化凍后的小冰袋填料塞入一個小泡沫盒中壓實，再插入各種大小的試管，放在-20 攝氏度下凍24小時后取出，拔出插入的廢管（可加點熱水以助拔管）即可做成一個
小分子藥物研發亟需顛覆性創新
【新聞事件】：今天LifeSciVc的Michael Gladstone撰文展望今年轉化醫學領域的主要事件。ECHO301將是今年最大的不成功則成仁試驗，但他估計無論成敗IDO領域的工作都只是開始，因為適應癥、人群、劑量、藥物選擇性等細節不會因為一個試驗結果全部弄清。活性極高、所以窗口狹小的細胞
小分子藥物研發亟需顛覆性創新
【新聞事件】：今天LifeSciVc的Michael Gladstone撰文展望今年轉化醫學領域的主要事件。ECHO301將是今年最大的不成功則成仁試驗，但他估計無論成敗IDO領域的工作都只是開始，因為適應癥、人群、劑量、藥物選擇性等細節不會因為一個試驗結果全部弄清。活性極高、所以窗口狹小的細胞
小分子藥物與miRNA關聯圖首次構建
哈爾濱醫科大學科研人員基于基因芯片數據、利用生物信息學方法，首次構建了人類癌癥中小分子化合物與miRNA(微小核糖核酸)的關聯圖。近日，相關成果《基于轉錄反應識別人類癌癥中小分子和miRNA關聯》由Nature子刊《科學報道》在線發表。 miRNA是一種單鏈的非編碼RNA，參與多種與人類癌
小分子藥物單克隆抗體制備
在單克隆抗體制備中，首先進行的就是抗原的設計與合成，這是制備單抗成功與否的關鍵。因為產生抗體的特異性與親合性是與抗原密切相關的，合成的抗原如果可以將所需要的抗原決定簇充分暴露出來，那么機體更容易識別抗原決定簇，從而免疫的動物所產生的抗體自然會在特異性和親合力上最大程度的與抗原決定簇擬合。所以，在制備
新的根除癌癥干細胞小分子抗癌藥被發現
托萊多大學的科學家們在對一種常用化療藥物的進行改進時發現了一類全新的抗癌藥物，有望根除癌癥干細胞。 盡管目前的研究在癌癥預防和早期檢測方面取得了重大進展，但是許多腫瘤僅在它們擴散到遠處器官后才被發現，這為臨床治療帶來巨大的難題。 事實上，對人類某些腫瘤分析已表明，擴散可能很早就已經發生。但是
利用人工智能和計算生物學方法－尋找到17個活性藥物分子
近日，中國科學院深圳先進技術研究院醫藥所計算機輔助藥物設計中心袁曙光課題組帶領團隊，利用人工智能和計算生物學的方法從158萬個化合物中尋找到了17個嗅覺受體蛋白Olf73的活性藥物分子。該工作為基于嗅覺受體蛋白的藥物發現與設計提供了有力的理論基礎和依據。該成果以Computational mod
核酸與小分子識別理論計算研究取得進展
中國科學院長春應用化學研究所電分析化學國家重點實驗室研究員汪勁和副研究員晏致強，提出了核酸—小分子識別特異性的理論計算方法并開發了一套全新的核酸—小分子相互作用能量打分函數SPA-LN。該研究成果發表在Nucleic Acids Research上。 研究表明，核酸（nucleic acids
預測抗癌藥物活性方面獲進展
癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過720萬人。而在中國，每年因癌癥死亡的人口也超過了 170萬。因此，開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。但直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例，現在已知的小分子化合物超過了1000萬個，
昆明動物所在預測抗癌藥物活性方面獲進展
癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過720萬人。而在中國，每年因癌癥死亡的人口也超過了170萬。因此，開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。但直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例，現在已知的小分子化合物超過了100
小分子褐藻糖膠對生長訊號傳遞機制的抗癌調節效用
小分子褐藻糖膠具備多種不同的生物與藥學活性，例如抗癌／抗腫瘤、抗增生、抗發炎與免疫調節功能[1-3]，并且與小分子褐藻糖膠相關膳食補充品和營養醫學食品近年愈來愈獲重視。上海市科林臨床生物信息學研究所長期投入各項小分子褐藻糖膠在輔助性療法的轉化醫學應用，在2019年由上海市科林臨床生物信息學研究所
小分子藥物可預防致命性輻射病
大規模輻射接觸，如切爾諾貝利和福島第一核電站災難之后的那類輻射接觸，仍是一個全球性的公共衛生顧慮及軍事威脅。在小鼠中從事研究的科研人員表示，一類新的研發用于治療其它疾病的藥物可能會在發生輻射事故時幫助挽救生命。這些藥物被稱作PHD抑制劑，它們似乎能保護機體免于輻射誘發的胃腸道綜合征，這種疾病通常
新型小分子藥物促進肝臟腸道皮膚修復再生
近期，廈門大學兩個科研團隊聯合攻關，研制出一種能促進受損的肝臟、腸道及皮膚等器官修復與再生的重要小分子藥物，并在小鼠實驗中取得了優異的治療效果。也許未來的某一天，人們只需通過服藥，便可實現受損肝臟、腸道和皮膚的修復與再生。這被認為為再生醫學領域帶來了新的“曙光”。 8月18日，這項研究成果發表
OpenSPR助力JAK/Stat信號通路抗癌藥物分子機制研究
宮頸癌是女性第二常見的惡性腫瘤，近年來其發病有年輕化的趨勢。基于塔斯品堿及其衍生物的化學結構所設計合成的同分異構化合物TAD-1822-7-F2 (F2)和TAD-1822-7-F5 (F5)可以有效抑制HeLa細胞的增殖。西安交通大學的研究人員使用OpenSPR的表面等離子共振(SPR)技
超分子囊泡實現抗癌藥物細胞內轉運
超分子囊泡的形成以及pH調控的抗癌藥物釋放 在過去的二十年里，伴隨著納米技術的迅速發展，研究人員一直致力于開發能夠顯著提高藥物的生物利用度的新型藥物納米載體或藥物轉運系統。這些藥物納米載體或藥物轉運系統需具備“智能性”，即不僅需要構筑規整有序的結構骨架實現高效地負載治療藥物，而且可以在人體內病
OpenSPR助力JAK/Stat信號通路抗癌藥物分子機制研究
宮頸癌是女性第二常見的惡性腫瘤，近年來其發病有年輕化的趨勢。基于塔斯品堿及其衍生物的化學結構所設計合成的同分異構化合物TAD-1822-7-F2 (F2)和TAD-1822-7-F5 (F5)可以有效抑制HeLa細胞的增殖。西安交通大學的研究人員使用OpenSPR的表面等離子共振(SPR)技
基因組所抗癌藥物分子機制研究獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員雷紅星及其研究組開展的“抗癌藥物的分子機制研究”取得階段性進展，其研究論文Early stage intercalation of doxorubicin to DNA fragments observed in mol
一些分子生物學實驗小技術2
5．有關融合蛋白表達載體的克隆 在構建融含蛋白表達載體時除了要注意插入片段的方向、讀碼框架與載體保持一致外，注意以下問題可能會減少一些不必要的麻煩，當外源片的插入載體起始密碼的后面，另一個基因的前面時，注意檢查插入后基因的兩端是否引入了新的終止密碼，特別是用到Klenow mung bean
關于犬小孢子菌的分子生物學介紹
分子生物學在各醫學領域中的廣泛應用推動了人們對微觀世界的認識，同時也為廣大真菌學工作者提供了新的研究方法。不少真菌學家已開始在分子水平上研究犬小孢子菌的生物學和基因特征，以了解犬小孢子菌的分子生物學特征與致病機制的關系并為臨床快速確診提供實驗室依據。就較新研究論述如下： Papini將從70只
一些分子生物學實驗小技術匯編
1．保存菌種保存菌種或長時間放置的培養板應先劃板活化菌種，挑取分隔良好的單 克隆接種于2-10 ml ＬＢ中（如菌種含質粒則應加抗生素）３７攝氏度快搖 ８小時，按0.1%-0.5% 比例轉種，培養基的量不應超過錐瓶的0.25容量，以 保證足夠的通氣。用O.D.600 測菌密度時，讀數值在0.1-0.
一些分子生物學實驗小技術1
1．保存菌種保存菌種或長時間放置的培養板應先劃板活化菌種，挑取分隔良好的單 克隆接種于2-10 ml ＬＢ中（如菌種含質粒則應加抗生素）３７攝氏度快搖 ８小時，按0.1%-0.5% 比例轉種，培養基的量不應超過錐瓶的0.25容量，以 保證足夠的通氣。用O.D.600 測菌密度時，讀數值在0.
全球銷售額－Top－20－的小分子藥物及藥物設計思路
根據美國Arizona大學的Jon Njardarson課題組整理的小分子藥物銷售額數據（https://njardarson.lab.arizona.edu/content/top-pharmaceuticals-poster），筆者總結了2021年全球銷售額top 20的小分子藥物的分子結構、靶
小分子RNA
RNA一度被認為僅僅是DNA和蛋白質之間的“過渡”，但越來越多的證據清楚的表明，RNA在生命的進程中扮演的角色遠比我們早前設想的更為重要。RNA 干擾（RNA interference）的發現使得人們對RNA調控基因表達的功能有了全新的認識，更因為可以簡化/替代基因敲除而成為研究基因功能的有力工具，
小分子療法
小分子療法 15日，PTC Therapeutics公布了一項針對DMD和貝克肌營養不良（BMD）患者的最新研究結果，顯示從常規療法轉為Emflaza（deflazacort）治療后6個月的平均隨訪期內，大部分患者顯示病情改善。>>閱讀更多 16日，羅氏（Roche）旗下基因泰克（Genet
“黑馬”分子成抗癌藥物新靶點－將變革癌癥療法
據物理學家組織網8月13日(北京時間)報道，澳大利亞的研究人員確定一種名為白細胞介素-11的分子，在癌細胞的生長擴散中發揮著重要作用，能夠成為抗癌療法的新靶點。此前研究中，該分子的作用一直被忽視，而今這匹“黑馬”極有可能為包括腸癌和胃癌在內的多種癌癥帶來全新的治療途徑。相關論文在線發表在《癌細胞
輝瑞114億美元拿下靶向小分子藥物公司Array
輝瑞公司（紐約證券交易所股票代碼：PFE）和Array BioPharma Inc.（納斯達克股票代碼：ARRY）在6月17日宣布，輝瑞將以每股48美元、總企業價值約為114億美元的現金收購Array。在并購完成之后，雙方將專注于靶向小分子藥物的發現，開發以及商業化，用以治療癌癥和其它疾病。