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    我科學家引入信息論刷新基因測序精度

    自從Alpha Go成了圍棋界的No.1,“智能”的潛力被廣而周知,尤其對于大量的重復性工作,寫個“算法”讓電腦“跑”,得出的結果說不定比人強。 科學家不僅有足夠大的腦洞,還有著非凡的執行力。這次是生物學者,他們借鑒了信息學科的思維,發明了基因測序的新方法。日前,一篇名為《基于信息理論來修正錯誤的高準確度熒光產生DNA測序方法》的論文在《自然·生物技術》上在線發表。研究者來自北京大學黃巖誼教授帶領的團隊。 “這個設計很巧妙,”東南大學教授陸祖宏說,“或許在信息科學里是‘小伎倆’,但在生物學研究中是一種思維方式的突破,而且奏效了。” 測序精準是“王道” 和體育界的“更快、更高、更遠”類似,基因測序界的“金標準”是“更快、更長、更正確、還不貴”。 大名鼎鼎的“人類基因組計劃”基于1代測序技術,耗時十余年測出一套完整的人類基因組密碼,而利用現有的2代測序技術,這個時間可以縮短到半天內。 “2代測序技術,又叫......閱讀全文

    北大7位學者歷時7年刷新DNA測序精度

       日前,北京大學黃巖誼教授帶領的團隊在《自然—生物技術》期刊上在線發表《基于信息理論來修正錯誤的高準確度熒光產生DNA測序方法》,這標志著我國學者已成功刷新DNA信息解讀的精確程度,從根本上提高了測序方法本身的精度,打破了國外在基因測序領域的技術壟斷,極大推動了我國生命科學與醫學的研究發展,同時

    周曉光:MALDI誕生30年小記

      基質輔助激光解吸電離(也就是通常所說的MALDI)于1987年首次由Hillenkamp 及Karas提出,如今已經30年。從那時起,通過應用這一“軟電離”技術與飛行時間質譜(MALDI -TOF MS)的結合,成功地實現了為生物大分子提供快速和高度可靠檢測手段的目的,同時也為生命科學領域提供了

    楊輝組/高彩霞組發現單堿基編輯系統存在嚴重脫靶效應

      2016年,David Liu團隊在 Nature 期刊上首次報道了基于胞嘧啶脫氨酶APOBEC1(能催化C脫氨基變成U,而U在DNA復制過程中會被識別成T)和尿嘧啶糖基化酶抑制劑UGI(能防止尿嘧啶糖基化酶將U糖基化引起堿基切除修復)的單堿基編輯工具(BE3)首次實現可以在不引入DNA雙鏈斷裂

    北京大學7位學者歷時7年刷新DNA測序精度

      北京大學黃巖誼教授帶領的團隊在《Nature Biotechnology》期刊上在線發表《基于信息理論來修正錯誤的高準確度熒光產生DNA測序方法》,這標志著我國學者已成功刷新DNA信息解讀的精確程度,從根本上提高了測序方法本身的精度,打破了國外在基因測序領域的技術壟斷,極大推動了我國生命科學與醫

    用新一代測序尋找罕見變異 需謹慎

      新一代測序引入的誤差,使得我們很難檢測到罕見變異,而這些罕見變異在癌癥等疾病中發揮著重要的作用。在Biotechniques最近的一篇新聞中,Janelle Weaver報道了科學家們在描繪這些誤差以及開發策略提高精度方面所取得的進步。  美國國家心臟、肺和血液研究所外顯子組測序項目的研究人員,

    Biotechniques:如何降低下一代測序1%的堿基錯誤識別?

      為什么復雜疾病的全基因組關聯研究都是失敗的?  下一代測序帶來的誤差,使得我們很難檢測到罕見變異,而這些罕見變異在癌癥等疾病中發揮著重要的作用。  在Biotechniques最近的一篇新聞中,Janelle Weaver報道了科學家們在描繪這些誤差以及開發策略提高精度方面所取得的進步。  美國

    “精準”技術誕生的人類嬰兒:謝曉亮和北大的故事

    第一位MALBAC寶寶周歲照(左:謝曉亮;右:陸思嘉)  1、女明星與被拒的申請  2013年,有關個體化醫療最大的新聞之一是女星安吉麗娜·朱莉宣布自己已“預防性”地切除了雙側乳腺,原因是她攜帶一種“錯誤”的基因——BRCA1,這種基因會極大增加攜帶著罹患乳腺癌和卵巢癌的可能性——她大概會有87%的

    上半年,這些科學新成果或改變你我生活

    科技創新驅動改革發展,創新成果改變你我生活。2018年上半年,我國在科學領域取得不少新突破和新發現,這些新成果不斷刷新公眾的科技感知力,也正在改變你我的生活。   世界首個體細胞克隆猴在我國誕生 重大腦疾病治療有了新前景  

    “智慧”的基因測序儀,造一個有多難?

    自從AlphaGo成了圍棋界的No.1,“智能”的潛力被廣而周知,尤其對于大量的重復性工作,寫個“算法”讓電腦“跑”,得出的結果說不定比人強。科學家不僅有足夠大的腦洞,還有著非凡的執行力。這次是生物學者,他們借鑒了信息學科的思維,發明了基因測序的新方法。日前,一篇名為《基于信息理論來修正錯誤的高準確

    我國科學家引入信息論 刷新基因測序精度

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    Nature子刊“大發現”:CRISPR可引發數百種“意外突變”!

      問世短短幾年的CRISPR儼然已成為生命科學領域最耀眼的“明星”之一。除了作為常規的科研工具,這一被稱為“魔剪”的基因編輯工具還被寄予了用于疾病治療的厚望。目前,來自全球各國的科學家們正在開展CRISPR用于多種疾病治療的研究,包括癌癥、艾滋病、失明、免疫缺陷病癥、杜氏肌營養不良癥、鐮狀細胞病等

    2016年中國、世界十大科技進展新聞揭曉

       由中國科學院、中國工程院主辦,中國科學院學部工作局、中國工程院辦公廳、中國科學報社承辦,中國科學院院士和中國工程院院士投票評選的2016年中國十大科技進展新聞、世界十大科技進展新聞,2016年12月31日在京揭曉。  入選新聞囊括了一年來最重要的科學發現和技術突破。  入選的2016年中國十大

    賽默飛在ASMS 2019:領創前行,“質”能譜動

      分析測試百科網訊 每年的ASMS大會,賽默飛總會以炫目的新產品帶給大家驚喜,今年也不例外,2019 ASMS上兩款新產品再次刷新了Orbitrap的記錄,一款是體積小巧但性能超強的Orbitrap ExplorisTM 480質譜儀,一款是再次刷新性能極限的Orbitrap EclipseTM三

    1100學者齊聚杭州 第二屆質譜大會開幕

      分析測試百科網訊 2015年10月17日,第二屆全國質譜分析學術報告會(質譜大會)在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕,本次大會由中國化學會、國家自然科學基金委員會主辦,中國化學會質譜分析專業委員會、浙江大學化學系承辦。浙江大學副校長羅建紅教授、南京大學陳洪淵院士、中

    哈佛遺傳學大神George Church談基因技術:人類增強還是人類異化?

      George Church:分子技術專家,DNA研究領域的領軍人物,哈佛大學遺傳學教授,哈佛醫學院基因組研究中心主任。他于1985年參與到人類基因組計劃,也是這個計劃的負責人。他發明的新方法開創了個人基因組研究的時代。基于他發明的直接基因組測序的方法,自動測序軟件被成功開發,并在1994年第一次

    2016年度國際十大醫學科技新聞

      植入微電極陣列幫癱瘓患者恢復運動能力  美國學者在《自然》雜志上發表的一項神經科學研究報告稱,借助大腦運動皮層記錄信號,首次成功地讓一名癱瘓患者恢復多個手指、手和手腕的運動能力。  研究團隊在一位24歲四肢癱瘓的男性被試者的運動皮層中,植入了微電極陣列,隨后使用機器學習算法來解碼神經元的活動,并

    納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述

      RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大

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      RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大

    基因測序科技突飛猛進

      最新一期的美國《福布斯》于2010年12月底正式出刊,本期封面文章標題為“基因測序科技突飛猛進”。文章對基因創業企業家Jonathan Rothberg和他發明的功能強大的基因測序儀器做了介紹。文章認為,這項發明可能會在醫藥、食品、能源,甚至消費產品上的一場革命,由此形成規模可達100

    CRISPR/Cas9應用近期重大進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    Leroy Hood:系統生物學將揭開后基因組時代新篇章

      加利福尼亞理工學院教授,美國系統生物學研究所所長,美國科學院、美國工程院和美國醫學院院士,美國總統科學顧問。Leroy Hood教授是國際系統生物學創始人,也是國際人類基因組計劃倡導者之一。他多年從事分子免疫學、生物技術以及基因組學的研究,先后發表文章600多篇,獲得專利14項。

    《細胞》:世界首個女性個人遺傳圖譜繪制完成

    對人類卵子的兩個極體進行高通量測序 第一個人類女性個人遺傳圖譜 極體基因組測序結果指導異常胚胎篩選   2013年12月20日,著名學術期刊《細胞》雜志發布世界上首個人類女性個人遺傳譜圖。   在這篇題為“Genome Analyses of single human oocytes”

    云健康開啟Illumina HiSeq X Ten全基因組測序時代

      1月20日,滬上百余位知名媒體人及社會各界名流云集悅達889廣場6樓云健康醫療科技集團總部(Cloud Health Medical Group,Ltd),共同見證航母級健康平臺——云健康的上海首度公開亮相。當天云健康宣布啟動 Illumina HiSeq X Ten 全基因組測序,同時旗下云健

    新測序技術將加快植物抗病育種

      最近,英國劍橋大學塞恩斯伯里實驗室(TSL)和基因組分析中心(TGAC)的一個科學家小組,開發出一種新方法,可加速植物抗病基因的分離。該研究小組也在龍葵(Solanum americanum,馬鈴薯的一個野生近緣種)中發現了一個全新的枯萎病抗性基因。  植物病原體(如晚疫病)能夠快速進化以戰勝宿

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      最近,英國劍橋大學塞恩斯伯里實驗室(TSL)和基因組分析中心(TGAC)的一個科學家小組,開發出一種新方法,可加速植物抗病基因的分離。該研究小組也在龍葵(Solanum americanum,馬鈴薯的一個野生近緣種)中發現了一個全新的枯萎病抗性基因。  植物病原體(如晚疫病)能夠快速進化以戰勝宿

    2017年5月CRISPR/Cas亮點盤點

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    細胞治療類產品可按藥品進行注冊上市

      為貫徹落實中共中央辦公廳、國務院辦公廳《關于深化審評審批制度改革鼓勵藥品醫療器械創新的意見》(廳字〔2017〕42號)和《國務院關于改革藥品醫療器械審評審批制度的意見》(國發〔2015〕44號),國家食品藥品監督管理總局組織對《藥品注冊管理辦法》進行了修訂,起草了《藥品注冊管理辦法(修訂稿)》,

    創世界紀錄!深企新技術1分鐘解碼基因

      導讀: 伴隨著基因測序技術的快速發展,基因數據的生成呈現指數級增長,對檢測速度和分析能力也提出更高要求。近日,深圳承啟生物云計算平臺,搭載自主研發的FANSe三代算法,在全世界刷新了一個記錄,首次實現一分鐘解析一個人近兩萬個基因信息,比以往的同類技術快了數十倍,準確度更是有了驚人的提升。  伴隨

    The Scientist Magazine評出2015年生命科學領域創新產品Top 10

      分析測試百科網訊 近日,The Scientist Magazine評選出了2015年度生命科學領域十大創新產品,包含了7個基因組學、1個蛋白組學和2個代謝組學進入該名單。該獎項旨在表彰對科學和醫學領域產生巨大影響的

    Nature Methods:2016年最值得關注的八大技術

      《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc

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