大連化物所蛋白質組學研究取得進展
蛋白質甲基化是一種非常重要的翻譯后修飾現象,其甲基供體為S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。由于甲基化可發生在氨基酸殘基的N-,O-和S-中心,并且N-中心甲基化還存在不同狀態,同時甲基化對分離行為影響非常細微,限制了對蛋白質甲基化組的解析。常規基于抗體的研究策略僅捕獲了部分N-中心甲基化的信息。中國科學院大連化學物理研究所研究員趙宗保和鄒漢法提出了“同位素標記SAM甲基化”研究新策略,深入解析了模式生物釀酒酵母的蛋白質甲基化組,首次對蛋白質甲基化實現全覆蓋,研究成果最近發表在Journal of Proteomics (2015, 114, 226)上。 該成果成功鑒定了43種甲基化蛋白,包括分布在64個甲基化中心的68個甲基化事件,其中超過90%的甲基化事件是首次發現。分析表明:(1)超過2.6%的酵母蛋白質存在甲基化;(2)甲基化發生在氨基酸殘基的順序為Lys >> Arg > Asp > Glu ≈......閱讀全文
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前,復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展,相關成果發布在《分子細胞》上,該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾,參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》(影響因子:
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能,這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能輕松的變廢為寶,竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章,你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作為最新的國自然熱點受到
甲基化研究新思路
????????組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向,然而傳統甲基化研究一般分四步走:尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制,上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
新研究揭示水稻組蛋白甲基化調控根系核心菌群
根系微生物組與植物的養分吸收、抗病抗逆等生長發育過程密切相關,其在植物根系的定殖和組裝受環境和植物遺傳途徑等因素的影響。表觀遺傳調控是調節染色體行為和基因表達的重要機制,探究表觀遺傳途徑與植物根系微生物的關系能夠更系統地揭示植物生長發育過程。表觀遺傳調控與宿主微生物組的關系已在動物模型中得到研究
羅氏甲基化捕獲試劑創新甲基化研究方法
自2004年美國批準Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治療以來,通過改變致病基因的表觀遺傳學特征進行疾病治療的方法,為人們帶來了疾病的新治療策略。然而,由于表觀遺傳檢測方法的局限,要確定基因的堿基在何處以何種程度被甲基化一直以來困擾著研究者,從而難以確定基
RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。
RNA甲基化研究深度剖析(一)
一、聽說最近?RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達?17?篇。 圖:RNA甲基化近期高
線粒體DNA甲基化研究進展
DNA 甲基化是表觀遺傳修飾的重要方式之一. 線粒體是真核細胞內的關鍵細胞器, 線粒體DNA(mtDNA)編碼部分線粒體基因, 其 mtDNA 的甲基化修飾可能引起所編碼基因的異常表達, 從而參與調節生理和病理過程. 近期來自西安交通大學生命科學與技術學院的研究人員就目前 mtDNA 甲基化及其
“RNA-甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
研究揭示擬南芥組蛋白去甲基化酶JMJ13的結構功能
3月21日,《自然-通訊》(Nature Communications)雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組和河北師范大學孫大業研究組合作完成的題為The Arabidopsis H3
表觀遺傳研究熱點:RNA-甲基化(m6A)研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入,組蛋白修飾(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存
表觀遺傳研究熱點:RNA-甲基化(m6A)研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入,組蛋白修飾(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和?DNA?甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存在可逆的表觀遺
精氨酸甲基化調控細胞凋亡研究
遺傳與發育生物學研究所楊崇林實驗室以秀麗線蟲為模式,探索蛋白質精氨酸甲基化這一重要的蛋白質翻譯后修飾方式在調控DNA損傷誘導的細胞凋亡方面的作用機制。?通過研究發現哺乳動物II型蛋白質精氨酸甲基轉移酶PRMT5在線蟲中的同源物,即線蟲的PRMT-5,參與調控DNA損傷引起的細胞凋亡。在prmt-5基
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中,DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說,全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
甲基化領域重要研究成果解讀!
本文中,小編整理了近年來科學家們在甲基化研究領域取得的重要研究成果,與大家一起學習! 【1】Science:重大進展!揭示DNA甲基化增強基因轉錄機制 doi:10.1126/science.aar7854 DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不
m6A-RNA甲基化識別蛋白YTHDF1參與記憶的形成研究(一)
目前來說,調控m6A修飾過程的閱讀蛋白共有9種功能,今天不會大家一一來講,而是主要講參與蛋白編碼過程的YTHDF1蛋白,它主要通過與mRNA的m6A位點結合,在腦神經發育[1],多巴胺分泌[2]和突觸形成[3]等過程中起重要作用。文章導讀:2018年10月31日,美國芝加哥大學何川團隊,上海科技大學
m6A-RNA甲基化識別蛋白YTHDF1參與記憶的形成研究(二)
接著,作者對同類型樣本進行了m6A CLIP測序,對三個樣本分別進行motif分析后,發現三者共有將近有11,000個序列為GGACU的peaks(圖5?c)。將peak分別于轉錄本和基因組比對后,發現與YTHDF1 CLIP的結果十分類似(圖5 d,e)。對兩次CLIP實驗的peaks
2018國自然研究熱點二:-RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。 圖:
RNA-m6A甲基化修飾研究相關研究的應用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和組織中收集的R
組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系
在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,目前仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白—
DNA甲基化研究方法的回顧與評價
摘要: DNA甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。隨著對甲基化研究的不斷深入,各種各樣甲基化檢測方法被開發出來以滿足不同類型研究的要求。這些方法概括起來可分為三類:基因組整體水平的甲
科學研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化學修飾,這種修飾發生在 DNA 序列的數百萬個位置上。直到現在,科學家們相信這種表觀遺傳學的現象減少了一些基因的表達。 近日,來自UNIGE大學的研究團隊們,發現 DNA 甲基化在基因調節中扮演著積極和消極的角色。 DNA 序列的變異性與基因表達之間的關系也
蛋白質DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干擾分析法—甲基化
實驗方法原理在甲基化干擾實驗中,探針通過將鳥嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)進行甲基化而產生。這些甲基化的堿基可被哌啶特異性切割。實驗材料含有蛋白質結合位點的DNA片段試劑、試劑盒TE 緩沖液 pH 7.5 ?8.0硫酸二甲酯(DMS)DMS反應緩沖液DMS終止緩沖液10 mg m
兩篇PNAS:蛋白納米孔檢測DNA甲基化
兩個獨立的研究團隊利用通道蛋白實現納米孔測序,成功鑒別了5-甲基胞嘧啶和5-羥甲基胞嘧啶。這兩篇文章發表在同一期的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 基因組所蘊含的編碼信息,包括DNA序列和核苷酸修飾兩個部分。其中,動態的DNA甲基化模式,是基因表達的重要調控者,與細胞分化、胚胎發育和癌癥
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日,中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》(Nature Biotechnology)上發表,這是中國科學家
DNA甲基化研究方法的回顧與評價(圖)
摘要: DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。隨著對甲基化研究的不斷深入,各種各樣甲基化檢測方法被開發出來以滿足不同類型研究的要求。這些方法概括起來可分為三類:整體水平的甲