2016國家自然科學基金：納米孔測序技術
來自國家自然科學基金委員會的消息，8月17日國家自然科學基金委員會公布了2016年國家自然科學基金申請項目評審結果，其中面上項目16934項、重點項目612項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16112項、地區科學基金項目2872項、海外及港澳學者合作研究基金項目135項、重點國際（地區）合作研究項目105項、國家重大科研儀器研制項目（自由申請）85項、部分聯合基金項目（NSAF聯合基金、天文聯合基金和鋼鐵聯合研究基金）116項，合計37409項。 接二連三個人基因組圖譜的陸續完成，基因組測序對各個研究領域的深刻影響，都說明了第二代測序技術的強大力量，但隨著技術需求的不斷發展，新一代測序方法也應運而生，這種被稱為下下一代的測序（next-next-generation sequencing）的直接測序方法，是基于納米孔（nanopore）的單分子讀取技術，不同于之前的兩代技術（需要熒光......閱讀全文
研究提出面向糖鏈的納米孔單分子分析方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498132.shtm
Small－Structures：基于固態納米孔的單分子光電檢測技術
將快速、高效、精準和低廉的單分子探測手段運用于體外診斷領域，將大幅推動我國在大數據時代下精準醫療的實現，造福于人類健康生活的方方面面。固態納米孔傳感器作為一種新興的單分子探測手段，正在受到越來越多的關注。目前普遍采用的納米孔技術檢測分子穿過納米孔時引起的電脈沖，獲得的電信號分辨率較為有限；且缺乏分子
我所提出面向糖鏈的納米孔單分子分析方法
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202303/t20230331_6722610.html 近日，我所生物技術研究部生物分離與界面分子機制研究組（1824組）卿光焱研究員團隊與本草物質科學研究室中藥科學研究中心（2800組）梁鑫淼研究員團隊合作，在糖鏈結
科學家繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜
體細胞突變是腫瘤發生的標志，可用于癌癥的無創診斷。美國約翰·霍普金斯大學醫學院繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜，用于癌癥無創檢測。該研究成果于近日發表在《Nature Genetics》雜志上，題為：Single-molecule genome-wide mutation profile
單分子閥門－實現納米通道中的單分子流動
科學界設想利用微小的分子作為構建物體的基礎元素，類似于我們用機械部件組裝東西的方式。然而，挑戰在于分子非常小，大約是一個壘球大小的一億分之一，而且它們在液體中會隨機移動，使得控制和操縱它們成為一種單一的形式很困難。為了克服這一障礙，能夠通過非常狹窄的通道（尺寸類似于百萬分之一根吸管）輸送分子的"納米
英研發第三代基因測序技術－用納米孔單分子讀取
基于納米孔的單分子讀取技術，英國牛津納米孔公司成功研發出第三代基因測序技術。該測序技術讀取數據更快、有望大大降低測序成本，改變個人醫療的前景。 當前，基因測序工作費時且昂貴，測序時，分子必須進行多次復制(這一步被稱為擴增)，同時進行熒光示蹤標記，這一過程會帶來錯誤，因此，一個基因要被測序多
逐步完善糖分子指紋圖譜的全方位繪制，有望實現納米孔糖測序
糖是一類具有重要生物學功能的大分子，具有高度復雜的化學結構。目前，糖的結構解析依賴于傳統的色譜法、質譜法和核磁法等結構表征手段。雖然這些方法相對成熟，但存在檢測步驟復雜、無法實時動態檢測等局限性，無法滿足糖基礎和應用科研需求。與另一類生物大分子核酸已實現高通量測序相比，糖的結構解析技術滯后。生物
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日，華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文，公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
真核基因組的組裝，有納米孔就夠了
生物通報道 農業生物技術公司KeyGene近日只利用納米孔測序儀MinION生成的序列，組裝了立枯絲核菌（Rhizoctonia solani）的基因組。立枯絲核菌是一種農業害蟲，感染一些重要的經濟作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv網站的預印本上，KeyGene的Martin de
山蒼子基因組圖譜揭秘精油合成分子機制
山蒼子，是我國南方家喻戶曉的一種香樹，其果實有香氣，無毒，可治療急性肺炎，有抗病毒抗菌消炎作用。山蒼子精油還是高級化妝品紫羅蘭酮的原料。山蒼子花 陳炳華攝 4月3日，《自然—通訊》在線發表中國林業科學研究院亞熱帶林業研究所（以下簡稱亞林所）研究員汪陽東團隊的重要成果。該團隊成功組裝全球首個染色
單分子測序輕松升級參考基因組
現代基因組學的最大需求之一，就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前，人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序，取得了許多重要的研究成果。 不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap，就目前的數據來說，各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的
納米孔測序技術
測序長度和準確率的快速提升使得納米孔測序有望顛覆DNA測序市場。紐約威爾康奈爾醫學院的計算生物學家Christopher Mason喜歡在會議上表演一個“絕活”：他和同事先從志愿者手機上收集DNA樣本，然后就能在一個小時內現場進行譜系分析，甚至敘述志愿者一天的生活細節。“我們能從留在手機上的DNA信
單鏈DNA編碼金納米粒子法實現動態“納米”分子反應
近日，中國科學院上海高等研究院光源科學中心物理生物學研究室、中國科學院上海應用物理研究所和上海交通大學合作發展了一種用單鏈DNA編碼金納米粒子的方法，并實現了動態“納米”分子反應。該方法通過設計一條多嵌段的單鏈DNA序列，可以賦予金納米粒子類似原子的離散價態和正交價鍵。這些“納米”原子則可通過D
單分子測序改善微生物基因組組裝
美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章，介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為，單分子測序數據能降低測序費用，并帶來更多完整的基因組，改善微生物基因組數據庫的質量。 隨著測序費用的不斷下降，測序項目的數量也在不斷上升。G
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
中國科學家繪就谷子基因組單倍型圖譜
由中國農科院作物科學研究所、中科院上海生科院國家基因研究中心、中科院遺傳與發育生物學研究所等8家單位組成的科研團隊，在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和47個主要農藝性狀的全基因組關聯分析。相關成果6月23日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據介紹，谷子為二倍體，基因組小、自花
國內首個菊花腦基因組測序納米孔測序再發高分論文
菊屬植物種類繁多，又含多種栽培種，兼具觀賞和藥用價值，且染色體組結構從2n=18到8n=72之間，十分復雜，多年來難以攻破。 中藥所所長陳士林研究員、副研究員宋馳博士等利用ONT平臺解析了可能代表栽培菊屬祖先基因組的二倍體菊花腦基因組，分析表明其演化受重復序列爆發和近期WGD事件的驅動，該基因
牛津納米孔收購加拿大Northern－Nanopore－擴張固態納米孔領域
近日，牛津納米孔技術公司（Oxford Nanopore）表示收購加拿大生物技術初創公司Northern Nanopore Instruments（NNi），這家公司開發了一種固態納米孔制造技術。 本次收購沒有披露財務條款。 據Oxford Nanopore介紹，NNi專門從事低成本、精確的
首個納米級單分子質量實時測定系統問世
這一成果有效簡化了現有分子質量測量程序 美國加州理工學院近日開發出僅有百萬分之一米大小的納米電子機械系統(NEMS)諧振器，可實時測定單個分子的質量。該成果刊登在最近一期的《自然—納米技術》雜志上。 過去，科學家一直依靠現有質譜分析技術測量分子的質量，程序十分繁瑣。首先要將
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前，由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
單分子遇上基因組學：會擦出什么火花
當單分子遇上基因組學，它們會擦出什么樣的火花?著名華人學者謝曉亮(Sunney Xie)博士圍繞這個話題，在《美國醫學會雜志》(JAMA)上發表了文章。謝博士現任哈佛大學化學及化學生物學系教授，也任北京大學生物動態成像中心主任。 謝博士寫道，單分子成像和操作的進步導致了單分子生物學的出現。由于
謝曉亮：當單分子遇上基因組學
當單分子遇上基因組學，它們會擦出什么樣的火花？著名華人學者謝曉亮（Sunney Xie）博士圍繞這個話題，在《美國醫學會雜志》（JAMA）上發表了文章。謝博士現任哈佛大學化學及化學生物學系教授，也任北京大學生物動態成像中心主任。 謝博士寫道，單分子成像和操作的進步導致了單分子生物學的出現。由于
納米孔ZL之爭落下帷幕
美國國際貿易委員會近日發布文件稱，Illumina公司和英國牛津納米孔公司的官司已經庭外和解。納米孔公司同意不再出口或售賣包含氨基酸序列納米孔的產品，并銷毀目前庫存的產品。但該文件也明確表示，這些限制不會影響牛津納米孔對CsgG的使用。CsgG是相關訴訟開始后不就，牛津納米孔發布的另一種新孔，基于全
詳解牛津納米孔測序儀
?牛津納米孔測序儀在美國人類遺傳學學會年會上公布技術參數 2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行，有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示，技術之創新，令人震驚!21日下午，牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會，講解了納米孔的
詳解牛津納米孔測序儀
2014年的ASHG年會于10月18日開始在圣地亞哥舉行，有幸親眼目睹了牛津納米孔公司MinIon的現場演示，技術之創新，令人震驚!21日下午，牛津納米孔公司特地在旁邊的Hardrockho舉行了一個小型的封閉式的技術說明會，講解了納米孔的測試結果。 尺寸 MinION的尺寸之小，大大出乎我的
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子進行測序，而目前市場上的主流測序
兩大牛人攜手發布新測序技術
經濟高效的單分子測序平臺能為人們提供很大的幫助，比如破解完整基因組序列、確定單倍型和鑒定mRNA可變剪接。為此，哥倫比亞大學的車靖岳（Jingyue Ju）和哈佛大學的George Church教授合作開發了基于納米孔的單分子邊合成邊測序（SBS）系統。 他們給四種核苷酸分別標記上不同的聚合物