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    組蛋白修飾分工調控基因表達水平和基因表達噪音

    基因表達過程依賴于轉錄因子、染色質調控因子和染色質等生物大分子在布朗運動過程中的隨機碰撞,因此,即使是基因型和分化類型完全相同的細胞在相同環境下也存在基因表達的差異,被稱為基因表達噪音。研究基因表達噪音,對研究干細胞增殖分化、個體發育、病原菌的抗藥性以及農作物的穩產有著重要的意義,而其在人類早期胚胎發育過程中的調節機制仍不清楚。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組計算分析了人類胚胎的單細胞轉錄組數據,發現多種組蛋白修飾分別調控了基因表達水平和基因表達噪音。富集在啟動子附近的組蛋白修飾,如H3K4甲基化,主要調節基因的平均表達水平;而富集在基因編碼區的組蛋白修飾,如H3K79甲基化,可以降低基因表達噪音,即提高同類細胞間基因表達的一致性。敲除酵母細胞中H3K79甲基化酶,降低了H3K79甲基化修飾水平,同時觀察到靶基因在細胞間的表達差異升高。與以上發現相一致,對基因表達水平敏感的基因(如信號通路中的基因,必須基因,......閱讀全文

    LncRNA:從“轉錄噪聲”到科研高地的逆襲

      2002年日本學者Okazaki在對小鼠cDNA文庫進行測序時,第一次發現并鑒定了一類較長的轉錄產物,并將其命名為長鏈非編碼RNA,也就是我們所知的LncRNA。然而在這種非編碼RNA被發現后的很長時間里,由于它不參與蛋白質的編碼,當時認為不具有生物學功能,科學家們都普遍認為lncRNA僅僅是基

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    表觀遺傳學修飾對軸突再生調控作用的研究進展

      軸突是神經沖動傳遞過程中結構與功能的基本單位。無論在中樞抑或是周圍神經系統損傷后,誘導有效的軸突再生過程是改善神經功能的基礎。現已證實,脊髓損傷后軸突能否再生不僅取決于其固有的生長能力,還取決于軸突所處的環境。神經系統損傷后,神經細胞對軸突再生相關基因的表達動員能力及細胞骨架原料的形成能力是決定

    年終盤點:2016年國內不容錯過的重磅生物研究

      時間總是過得很快,2016年馬上就要過去了,迎接我們的將是嶄新的2017年,2016年,我國有很多優秀科研機構的科學家們都做出了意義重大、影響深遠的研究成果,發表在國際頂級期刊上。本文中小編盤點了2016年我國科學家發表的一些重磅級研究,以饕讀者。   --結構生物學 --  1.清華大學 施一

    組蛋白研究進展速覽!

      本文中,小編盤點了多篇研究報告,共同解析科學家們在組蛋白研究上取得的新成就,與大家一起學習!圖片來源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示組蛋白標記H3K36me2招募DNMT3A并影響基因間DN

    選擇重組蛋白表達的合適方法

    重組蛋白是研究生物學過程的重要工具。需要使用表達系統來對其進行制備。合適表達系統的選擇取決于重組蛋白的特性、重組蛋白的預期應用以及該系統能否生產足夠量的蛋白質。作者: 伯吉斯等,主譯:陳薇,本實驗來自「蛋白質純化指南」實驗步驟一、引言選 擇 合 適 醜 組 蛋 白 表 達 方 法 對 于 能 否 及

    選擇重組蛋白表達的合適方法

    實驗步驟 一、引言 選 擇 合 適 醜 組 蛋 白 表 達 方 法 對 于 能 否 及 時 獲 取 所 需 數 量 和 質 量 的 重z組蛋白非常關鍵。選 擇 了 錯 誤 的表達宿主可 能 導 致 蛋 白 質錯 誤 折 疊 或

    2015國家自然科學基金:表觀遺傳學什么是重點

      來自國家自然科學基金委員會的消息,8月18日國家自然科學基金委員會公布了2015年國家自然科學基金申請項目評審結果,其中面上項目16709項、重點項目624項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16155項、地區科學基金項目2829項、海外及港澳學者合作研究基

    2019中國生命科學領域CNS盤點:曹雪濤 顏寧 施一公上榜

      截至2019年12月23日,中國學者在Cell,Nature及Science在線發表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已經全部更新),iNature團隊對于這些文章做了系統的總結:  按雜志來劃分:Cell 發表了31篇,Nature 發表了44篇,Scie

    2012國家自然科學基金評審結果名單之復旦大學(生物類)

      來自國家自然科學基金委員會的消息,國家自然科學基金委員會公布了2012年度面上項目、重點項目、重大國際(地區)合作研究項目、青年科學基金項目、地區科學基金項目、海外及港澳學者合作研究基金項目、科學儀器基礎研究專款項目等方面的評審結果。有關評審結果將通知相關依托單位,其科研管理人員可登錄

    表觀遺傳修飾家族又添新成員 組蛋白丁酰化新功能詮釋

      近年來,芝加哥大學趙英明教授課題組運用高分辨質譜技術發現了多種組蛋白密碼,極大豐富了表觀遺傳修飾調控機制。在剛剛上線的國際知名期刊Molecular Cell上,該課題組又同時報道了三項最新研究成果。其中第一項研究首次發現了一種跟酮體代謝密切相關的表觀遺傳新修飾——組蛋白三羥基丁酰化[1];第二

    新的基因編輯領域突破口——表觀遺傳調控(一)

    幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白修飾

    Nature 表觀遺傳學進展將遺傳學、環境與疾病聯系了起來!

      21世紀,表觀遺傳學的研究得到了快速發展,同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西,當然了,這其中也存在一些大肆宣傳的成分,本文中,我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的,同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展;我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用,以及表觀

    高紹榮實驗室《Nature》發文揭示表觀遺傳學研究重大突破

      9月15日,同濟大學高紹榮實驗室在《Nature》雜志在線發表題為 “Distinct features of H3K4me3 and H3K27me3 chromatin domains in pre-implantation embryos” 的文章。首次從全基因組水平上揭示了小鼠植入前胚胎

    ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的藥物聯用實驗中的應用

    上海交通大學附屬瑞金醫院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應用ChIP-seq聯合分析揭示了聯用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研究成果于月發表在血液科權威雜志《Haematologica》(影響因子7.7)上。(ChIP-seq及mRNA-

    “干細胞及轉化研究”等6個重點專項2018年項目申報發布

      5月22日,科技部官網發布了《關于對國家重點研發計劃干細胞及轉化研究等6個重點專項2018年度項目申報指南征求意見的通知》,其中,“干細胞及轉化研究”重點專項、“蛋白質機器與生命過程調控”重點專項、“納米科技”重點專項 與生物醫學領域相關。  關于對國家重點研發計劃干細胞及轉化研究等6個重點專項

    2019年中國學者發表CNS統計,誰是CNS發表之王?

      【51/52】2019年4月4日,清華大學柴繼杰課題組、中科院遺傳發育所周儉民課題組和清華大學王宏偉課題聯合同期背靠背發表兩篇重量級Science文章,完成了植物NLR蛋白復合物的組裝、結構和功能分析,揭示了NLR作用的關鍵分子機制,是植物免疫研究的里程碑事件。兩篇文章分別是: "Li

    Science:梳理患兒腫瘤細胞的基因組尋求答案

      組蛋白翻譯后修飾方式出現異常,以及組蛋白修飾位置出現異常都會導致腫瘤發生。   高通量DNA測序技術的快速擴張讓我們能夠以前所未有的速度和精細度對人體疾病展開遺傳學分析,尤其是對罕見的小兒疾病進行全基因組測序(whole-genome sequencing)更是有助于我們對兒童發育,以及多

    染色質,解鎖癌癥表觀遺傳學的鑰匙

      表觀遺傳學指基因序列不變化的前提下,基因表達發生了可遺傳的變化,包括DNA甲基化、染色質改型、基因沉默、RNA編輯、組蛋白修飾(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色質改型調控基因表達的過程,涉及多種導致DNA和組蛋白組成變化、染色質構象變化的蛋白質。  眾多研究已經證明,染色體畸變和染色質異

    【盤點】定量蛋白組學將在未來10年飛速發展

      人類基因組計劃的成功實施,我們已初步掌握了自身的遺傳信息。但闡明人類基因組整體功能的功能基因組學仍任重而道遠。蛋白質作為生命活動的"執行者",自然成為生命科學研究的新"寵兒"。幾乎在所有生命科學領域內,科學研究工作者都需要對細胞、組織或完整生物體的蛋白進行定性描述或定量檢測。對一種細胞、組織或完

    蛋白質修飾研究現狀與未來

      蛋白質的修飾與降解,和生命活動以及各種人類疾病密切相關,這一領域已成為全球生物醫學界關注的焦點。蛋白質的糖基化修飾、磷酸化修飾、乙酰化修飾、泛素化修飾、亞硝基化修飾等,是蛋白在生物代謝過程中的重要裝備,對研究疾病具有重要意義。蛋白質的正確的修飾對于蛋白降解也非常重要,從而保證生命活動的正常循環。

    帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA

    長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究

    2006年中國植物科學若干領域重要研究進展

    3  蛋白質組學、功能基因組學與基因進化 蛋白質組學分析  北京大學朱玉賢研究組利用 2-DE、 MALDI-TOF MS 和 ESI-MS/MS 等蛋白質組學的方法研究了擬南芥中的 cp29A 和 cp29B 蛋白。cp29A 和 cp29B 是擬南芥8個葉綠體核糖核蛋白

    蛋白質組學概念的起源和發展

      蛋白質組學的誕生和發展,離不開多學科和技術的逐漸交叉融合。這些學科技術包括(但不限于)基因組學、生物化學、分析化學、自動化、基于電磁場的精密質譜儀、信號處理、數理統計和計算機科學。近年來,分子醫學、大數據技術和人工智能的發展,進一步加速推動了蛋白質組學的成長,使之在精準醫療領域展示出越來越大的應

    巴豆酰輔酶A水合酶CDYL調控組蛋白巴豆酰化影響精子發生

      組蛋白修飾是表觀遺傳學研究的重要方向,其影響了基因的表達調控,和眾多生理、病理過程有密切的聯系。除了研究較充分的組蛋白乙酰化、甲基化外,景杰生物的科學顧問,芝加哥大學趙英明教授課題組近年來鑒定了八種新型修飾,極大地增加人們對組蛋白修飾的認識,開辟了表觀遺傳調控的新領域。之后的一系列后續研究表明,

    大躍進 | 中國學者CNS發表超過100篇生命科學領域研究成果

      【50】2019年4月12日,中科院上海藥物所徐華強,王明偉,浙江大學張巖及匹茲堡大學醫學院Jean-Pierre Vilardaga共同通訊在Science發表題為“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

    清華大學3月連續發文 破譯“組蛋白密碼”識別新機制

              清華大學醫學院基礎醫學系和結構生物學中心李海濤課題組日前在國際權威學術期刊《自然》(Nature, 2014年3月2日)和《基因與發育》(Genes & Dev,2014年3月3日)在線發表兩篇論文

    5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據

    文章導讀2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。m6A甲基化與mRNA關聯分析案例一:非洲爪蟾睪丸組織中m6A甲基化圖譜發表

    達爾文加拉馬克,可能才是完整的進化論

      隨著科學的進一步發展,達爾文理論也顯示出了一些不足之處。  所謂物競天擇,適者生存,現代生物學的許多主流研究方向都以查爾斯·達爾文(Charles Darwin)“自然選擇”的進化論為基礎:只有最能適應環境的生命體才能在物種演化的洪流中獲得生存和繁衍的權利。這個自然選擇的過程也被稱為適應,而最容

    桿狀病毒-昆蟲細胞表達系統

    實驗步驟 一、桿狀病毒表達載體 最簡單的經典桿狀病毒表達載體是一個重組的桿狀病毒,其基因組含有一段外源核酸序列,通常為編碼目標蛋白質的dDNA,在多角體蛋白啟動子控制下進行轉錄。這個嵌合的基因由多角體蛋白啟動子和外源蛋白編碼序列組成

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